ریشه کلاله زعفران یک مثقالی با درصد بالای زعفران ریشه زعفران یا خامه زعفران در واقع قسمت انتهایی کلاله زعفران است که با این نام خوانده می شود پس ریشه اصلی زعفران در زیر خاک قرار دارد ریشه زعفران همانند کلاله ی آن دارای ویتامین های B1 B2 B6 و C عناصر معدنی از قبیل آهن منگنز و کلسیم است اما نسبت به کلاله دارای مقدار کمتری از این مواد است گفتنی است که ریشه برخلاف رشته های سرخ رنگ زعفران دارای مقدار کمتری کروسین است و بخاطر همین رنگدهی پایین تری دارد چون کروسین عامل اصلی رنگ دهی زعفران است برای درمان اختلالات خلقی از جمله 1 افسردگی 2 نشاط آوری و 3 از بین بردن بوی بد دهان 4شادابی پوست 5تقویت قوای جنسی و 6بهبود عملکرد قلب و کبد مورد استفاده قرار گیرد ریشه زعفران همچنین 7مقوی معده و مثانه نیز می باشد