فطرت در قرآن جلد سوم معارف قرآن این کتاب تنظیم شده تقریرات یازده جلسه درس استاد شهید برای جمعی از طلاب فاضل حوزه علمیه قم در سال های 1356 و 1357 شمسی است کتاب فطرت در قرآن سومین کتاب پس از کتاب های شناخت از نظر قرآن و جامعه و تاریخ در قرآن است که تحت عنوان کلی معارف قرآن منتشر می شود البته بنا بر این بوده است که استاد شهید درس های دیگری را نیز با موضوعاتی مانند خدا در قرآن معاد در قرآن و تدریس نمایند که به علت تقارن زمانی با دوره جدید نهضت اسلامی در سال 1356 این درس ها ناتمام ماند