مجموعه آثار آیت الله شیخ محمد حسین نائیجی  1 ترجمه و شرح مصباح الانس ابن فناری  2 ترجمه دلائل الصدق علامه مظفر 3 ترجمه الشموس الطالعة  4 تقریر دروس اسفار علامه حسن زاده آملی 5 ترجمه و شرح نفس شفا ابن سینا 6 ترجمه و شرح تمهید القواعد ابن ترکه 7 آداب راز و نیاز به درگاه بی نیاز ترجمه و تعلیق عدة الداعی ابن فهد حلی 8 ترجمه و شرح شرح منطق اشارات  ابن سینا  9 ترجمه و شرح منطق حکمة الاشراق شیخ شهاب الدین سهروردی 10 ترجمه و شرح شرح مطالع  11 ترجمه متن فص حکمة عصمتیة فی کلمه فاطمیه علامه حسن زاده آملی  12 صحیفه زمردین ترجمه الصحیفة الزبرجدیة علامه حسن زاده آملی