MLH3
出芽酵母"Saccharomyces cerevisiae"でも、マウスと同様、MLH3はMLH1とヘテロ二量体を形成する。減数分裂時の乗換え型組換えには、MLH1-MLH3ヘテロ二量体の作用によるホリデイジャンクション構造の解消が必要である。MLH1-MLH3ヘテロ二量体はエンドヌクレアーゼとして作用し、超らせんを形成した二本鎖DNAに一本鎖切断を導入する。MLH1-MLH3ヘテロ二量体はホリデイジャンクションに特異的な結合を行い、また、減数分裂時にホリデイジャンクション構造のプロセシングを担う、より大きな複合体の一部として作用している可能性がある。MLH1-MLH3ヘテロ二量体（MutLγ）はや（のオルソログ）とともに、出芽酵母における乗換えの大部分を生み出すjoint molecule resolution pathwayを構成しており、哺乳類でも同様の機能を果たしていると推測される。