Всъщност Договорът предоставя ново правно основание, посредством което един нов регламент би могъл да замени съществуващата Конвенция за използване на информационните технологии за митнически цели ("Конвенция CIS") - регламент, който би имал пряко влияние върху държавите-членки и който няма да изисква транспониране в националното законодателство, преди да бъде въведен, какъвто понастоящем е случаят с Регламент (ЕО) № 766 от 2008 г. относно административната част на митническата информационна система.
Itse asiassa Lissabonin sopimus muodostaa uuden oikeusperustan, jolloin uusi asetus voisi korvata nykyisen TTJ-yleissopimuksen, asetus, jolla olisi suora vaikutus jäsenvaltioissa ja jota ei tarvitsisi ennen sen voimaantuloa siirtää osaksi kansallista lainsäädäntöä, kuten on asian laita tällä hetkellä tullitietojärjestelmän hallintoa koskevan asetuksen (EY) No 766/2008 suhteen.