В резултат на това на практика защита често се търси само в определена част от територията на ЕС, като с това се създават сериозни проблеми от гледна точка на свободното движение на стоки, които са защитени с патент в някои юрисдикции, но могат да бъдат произвеждани безпрепятствено в други.
Tämän seurauksena suojaa käytännössä haetaan vain tietylle osalle EU:n alueesta, mikä aiheuttaa vakavia ongelmia tavaroiden vapaalle liikkuvuudelle, koska niillä on patenttisuoja joillakin lainkäyttöalueilla, mutta niitä voidaan vapaasti tuottaa muilla lainkäyttöalueilla.