Патентната система на ЕС обаче страда от много слабости, препятстващи установяването на единна патентна защита, но също и развитието на вътрешния пазар, намалявайки с това правната сигурност за инвеститорите и фирмите, извършващи иновации.
EU:n patenttijärjestelmä on kuitenkin kovin puutteellinen, mikä estää paitsi yhtenäisen patenttisuojan luomisen, myös sisämarkkinoiden kehittymisen, mikä vähentää sijoittajien ja innovatiivisten yritysten oikeusvarmuutta.