Компромисът, постигнат със Съвета, изяснява също взаимните зависимости между ЕЕН ІІ и Европейската агенция за авиационна безопасност, като се взема предвид, че разширяването на пълномощията на агенцията по летищата, УВД/АНО и РВД на практика е елемент от пакета, свързан с безопасността.
Kompromis, ki je bil dosežen s Svetom, pojasnjuje tudi medsebojno odvisnost med SES II in Evropsko agencijo za varnost v letalstvu, pri čemer je treba vedeti, da pristojnosti Agencije na letališčih pri upravljanju zračnega prometa/navigacijskih službah zračnega prometa in kontroli zračnega prometa predstavljajo "varnostni” element v svežnju.