Във връзка със структурните фондове, когато се прави сравнение с анализите на Сметната палата за периода 2000-2006 г., се вижда, че системите за управление и наблюдение и контрол за периода 2007-2013 г. предвиждат по-строги разпоредби и гарантират по-голяма надеждност и прозрачност по отношение на разходите, както и по-добра отчетност от страна на държавите-членки.
V primerjavi z analizo Sodišča za obdobje 2000-2006 so zaradi sistemov upravljanja in nadzornih sistemov za obdobje 2007-2013 v zvezi s strukturnimi skladi predpisi strožji ter zanesljivost in preglednost odhodkov večja, večja pa je tudi odgovornost držav članic.