В резултат на това на практика защита често се търси само в определена част от територията на ЕС, като с това се създават сериозни проблеми от гледна точка на свободното движение на стоки, които са защитени с патент в някои юрисдикции, но могат да бъдат произвеждани безпрепятствено в други.
V praksi se zaradi tega varstvo skuša zagotoviti le na določenem delu ozemlja EU, kar vodi v resne težave z vidika prostega pretoka blaga, ki je v nekaterih sodnih pristojnostih zavarovano, v drugih pa ga je mogoče neovirano izdelovati.