وكانت إحدى المحاولات الأولى لضبط ومواءمة النظرية بالأدلة هي تلك التي اقترحها زميلي الراحل موتو كيمورا، الذي افترض وجود طفرات محايدة ــ متغيرات جينية ليست نافعة ولا ضارة للفرد، وبالتالي فإنها لا تتأثر بالانتقاء الطبيعي. وقد فحص كيمورا معدل التغير التطوري للبروتينات وعَرَض النظرية الحيادية للتطور الجزيئي في عام 1968. والواقع أن نظريته ــ التي اعتبرت أن التغيرات التطورية على المستوى الجزيئي لا ترجع إلى الانتقاء الطبيعي، بل الانحراف الجيني العشوائي ــ قدمت تفسيراً جيداً للتباين الجيني الذي اكتشفه الباحثون.
L’une des premières tentatives de remise à plat de cette théorie, au moyen de preuves, a été proposée par mon défunt collègue Motoo Kimura, qui a fait valoir l’existence de mutations neutres – à savoir des variations génétiques qui ne seraient ni avantageuses, ni défavorables pour un individu, et qui ne seraient par conséquent nullement influencées par la sélection naturelle. Kimura a examiné le taux de changements protéiniques liés à l’évolution, et a proposé la théorie neutre de l’évolution moléculaire en 1968.