تكمن العقبة الثانية في أن المحكمة الكمبودية ستكون أول محاكمة دولية تتشكل من أغلبية من القضاة المحليين. وهذه الحقيقة تفرض تحدياً من نوع خاص في دولة كان محاموها هدفاً لأحداث العنف العرقي، ولم يمارس سوى عدد قليل من قضاتها تدريباً رسمياً قضائياً، ولم تتعود إلا قليلاً على استقلال القضاء. وعلى هذا، فهناك من الأسباب ما يدعو إلى القلق والتخوف من محاولة استغلال المحاكمات لغايات سياسية من قِبَل بعض أعضاء الحكومة الكمبودية والتي تتضمن أشخاصاً خدموا ذات يوم تحت حكم الخمير الـحُمر .
Cela pose un défi spécifique dans un pays où les hommes de loi furent la cible des violences du génocide, où peu de juges de cour possèdent une formation légale et où l'indépendance du judiciaire n'a pas de long passé. L'inquiétude est grande donc de voir certains membres du gouvernement cambodgien - formé de hauts responsables qui autrefois servirent sous le gouvernement des Khmers rouges - chercher à détourner les procès à des fins politiques.