وتعمل أنواع أخرى من المحاصيل المهندسة وراثيا، كتلك المقاوِمة للأمراض والآفات على تحسين كفاءة استخدام المياه بشكل غير مباشر. ولأن قسماً كبيراً من الفاقد في المحاصيل بسبب الأمراض والآفات يحدث بعد نضوج النباتات بالكامل ــ أي بعد حصولها على أغلب المياه اللازمة لنموها ــ فإن مقاومة الأمراض والآفات تعني زيادة الناتج الزراعي عن كل وحدة من المياه المستثمرة. وباختصار، بات بوسع المزارعين أن يزيدوا من إنتاجية محاصيلهم في مقابل كل قطرة مياه.
D’autres types de variétés d’IG, de type résistantes aux maladies et aux nuisibles, améliorent indirectement l’efficience de la consommation d’eau. Dans la mesure où la plupart des pertes liées aux maladies et aux nuisibles surviennent une fois les variétés arrivées à pleine croissance – à savoir lorsque la majeure partie du volume d’eau nécessaire à cette croissance a d’ores et déjà été fournie – cette faculté de résistance signifie un rendement agricole supérieur par unité d’eau investie.