ومنذ البداية، ثارت التشككات في أروقة وزارة الدفاع حين أمر بوتن بضم مسألة إنشاء هيئة لمكافحة الإرهاب إلى جدول الأعمال العسكري. فاقترحت وزارة الدفاع بدلاً من هذا أن يلعب الجيش دوراً ثانوياً في عمليات مكافحة الإرهاب.
Depuis le début, le ministère de la Défense s'est montré sceptique quant à l'ordre de Putin d'inclure l'antiterrorisme au programme militaire. Il a plutôt suggéré de donner un rôle secondaire à l'armée lors d'opérations antiterroristes.