إن نظام مقايضة الانبعاثات من شأنه أن يفرض مخاطر شديدة على التجارة الدولية. وحتى لو كان لدى كل دولة نظام لمقايضة الانبعاثات وكانت كل هذه الأنظمة تهدف إلى الحد من انبعاث ثاني أكسيد الكربون بنفس النسبة على المستويات الوطنية، فإن أسعار التراخيص الناتجة سوف تتفاوت بسبب الاختلافات الوطنية في المستويات الأولية من انبعاثات ثاني أكسيد الكربون وفي خصائص الإنتاج المحلي. ولأن سعر تراخيص ثاني أكسيد الكربون في دولة ما ينعكس في أسعار المنتجات، فهذا يعني أن نظام مقايضة الانبعاثات يؤثر على قدرة هذه الدولة على المنافسة على المستوى الدولي.
Car même si chaque pays adopte ce système et que tous aspirent à une relative réduction des rejets de CO2 au niveau national, le prix des permis sera différent d’un pays à l’autre puisque chaque pays a de fait un niveau initial de CO2 différent et des caractéristiques de production nationales différentes. Le prix des permis d’émissions de CO2 dans un pays se reflétant dans les prix de ses produits, le système de droit d’émissions affecte sa compétitivité internationale.