وتحت إدارة بوش الابن ، ظل عدد كبير من نفس الشخصيات القوية يمارس دوره، إلا أن التشوه أصاب النظام الذي يحكم عمل مجلس الأمن القومي، الأمر الذي أدى إلى انقطاع تدفق المعلومات. وكان رئيس هيئة الأركان تحت إدارة وزير الخارجية كولين باول آنذاك، يصف الموقف بأنه مختلس وسري ومموه بسبب العجز الذي أصاب عملية اتخاذ القرار الرسمي. أو طبقاً لكلمات الجنرال العسكري واين داوننغ ، الذي عمل في البيت الأبيض: &quot;بمرور السنوات أصبح النظام بين الهيئات جامداً وعاجزاً عن أداء وظيفته إلى حد كبت قدرة حكومة الولايات المتحدة على تطبيق صلاحياتها وسلطاتها الواسعة في وقت حدوث المشاكل والأزمات. ويستطيع المرء أن يدرك هذا العجز في التنسيق حين ينظر إلى عملياتنا في العراق وأفغانستان، أو يستعرض سياستنا الخارجية أو استجابتنا لإعصار كاترينا&quot;.
Plusieurs de ces personnalités de premier plan étaient de nouveau présentes dans l’administration Bush junior, mais le fonctionnement formel du Conseil de sécurité nationale a été biaisé, produisant un flux d’information dénaturées. Le chef de cabinet du secrétaire d’État Colin Powell a décrit ce procédé comme étant furtif et bien camouflé par les dysfonctionnements et l’inefficacité du processus décisionnaire formel.