وأخيرا فإن الخطر الذي يشكله محاربة الإرهاب على الحريات المدنية يعتبر كبيرا على وجه الخصوص في إفريقيا حيث ما يزال بناء المؤسسات عملية مستمرة. إن بعض الأنظمة غير الديمقراطية يمكن أن تستغل سياسات مكافحة الإرهاب من أجل إستهداف شعوبها كما يوجد هناك الخطر على النسيج الإجتماعي لو أدى الخوف من التطرف الإسلامي إلى تشويه سمعة المسلمين أو تهميشهم.
Enfin, le risque que le combat contre le terrorisme représente face aux libertés civiles est particulièrement aigu en Afrique, où la mise en place d'institutions est toujours un processus en cours. Quelques régimes non-démocratiques risquent de profiter des politiques anti-terroristes pour s'en prendre à leurs propres citoyens.