فضلاً عن ذلك فإن هاتوياما عازم على فضح اتفاق نووي سري أبرم أثناء الحرب الباردة، وهو الاتفاق الذي فتح الموانئ اليابانية أمام سفن البحرية الأميركية والتي كانت تحمل أسلحة نووية، في انتهاك لمبادئ اليابان الثلاثة فيما يتصل بمنع الانتشار النووي، والتي أرشدت السياسة الرسمية اليابانية منذ ستينيات القرن العشرين. وأخيراً وليس آخراً، يعمل هاتوياما على تأجيل تنفيذ الاتفاق الثنائي مع الولايات المتحدة والذي يقضي بنقل قاعدة سلاح مشاة البحرية الأميركية على جزيرة أوكيناوا، من فوتنينما إلى هينوكو، وبالتالي إرباك الخطة الأميركية الرامية إلى نقل جزء من قواتها المتواجدة على جزية أوكيناوا إلى جوام.
Hatoyama devra en outre faire la lumière sur la question d’un pacte nucléaire secret conclu entre Tokyo et Washington au moment de la Guerre froide qui autorisait les navires américains porteurs d’armes nucléaires à faire escale dans les ports japonais, en violation des « trois principes antinucléaires » au cœur de la politique officielle depuis la fin des années 1960. Enfin et surtout, Hatoyama repousse la date d’application de l’accord bilatéral conclu avec les Etats-Unis sur le redéploiement des troupes stationnées dans l’île d’Okinawa, de Futenma à Henoko, introduisant une certaine confusion dans le projet des Etats-Unis de transférer une partie de ces troupes à Guam.