ويعزو الكثيرون السبب وراء هذه الحرب إلى الكراهية القائمة بين الأغلبية من قبيلة الهوتو والأقلية من قبيلة التوتسي. ولكن هذا لا يفسر السبب الذي دعا إلى نشوء تلك الكراهية الشديدة بين هاتين المجموعتين. إن التجانس الثقافي في بوروندي، والذي نادراً ما يوجد في أفريقيا، يُكذّب وجهة النظر التبسيطية التي تقول إن الكراهية بين الهوتو والتوتسي سببها الاختلاف الكبير بينهما.
Mais ceci n'explique pas pour autant pourquoi ces groupes se haïssent soi-disant autant l'un l'autre. L'homogénéité culturelle et linguistique du Burundi, rare en Afrique, dément la vue simpliste qui veut que les Hutus et les Tutsis se combattent en raison de leur trop grande différence.