وكان رفسنجاني في وضع أقوى كثيراً مقارنة بأي رئيس إيراني لاحق في مواجهة خامنئي، الذي كان قد اختير للتو خلفاً للخميني مرشداً أعلى. وكانت مشكلته الأساسية مع معارضيه الأقوياء في الجهاز الأمني الإيراني، الذي كان حريصاً على تخريب مبادراته في السياسة الخارجية بتنظيم وشن هجمات إرهابية في فرنسا وألمانيا والأرجنتين.
Rafsanyaní estaba en una posición mucho más fuerte respecto de Jamenei (que acababa de ser elegido como sucesor de Jomeini para la función de Líder Supremo) que cualquier otro presidente iraní después de él. El problema lo tenía con sus poderosos oponentes en el aparato de seguridad de Irán, que sabotearon sus iniciativas pragmáticas de política exterior organizando atentados terroristas en Francia, Alemania y Argentina.