وهذا أحد الأسباب التي جعلت بوتن يختار أن يكون واحداً من رؤساء الدول القلائل الذين لم يحضروا جنازة البابا يوحنا بولس. ومع أن الكنيسة الأرثوذكسية أرسلت وفداً لحضور الجنازة، إلا أن البطريرك أليكسي حذر فور انتهاء الجنازة من أن الخلافات بين فرعي المسيحية تمتد إلى جذور أعمق كثيراً من جنسية البابا السابق البولندية، والتي كانت تشكل دوماً منطقة مؤلمة على نحو خاص بالنسبة للسلافيين الأرثوذكس في روسيا.
Esta es una de las razones por las cuales Putin fue uno de los pocos jefes de estado que no asistieron al funeral del Papa Juan Pablo. Aunque la Iglesia Ortodoxa envió una delegación, inmediatamente después del funeral el Patriarca Alexi advirtió que los desacuerdos entre los dos brazos de la Cristiandad son mucho más profundos que la nacionalidad polaca del último Papa, que fue siempre un punto sensible para los eslavos ortodoxos rusos.