ومنذ البداية، ثارت التشككات في أروقة وزارة الدفاع حين أمر بوتن بضم مسألة إنشاء هيئة لمكافحة الإرهاب إلى جدول الأعمال العسكري. فاقترحت وزارة الدفاع بدلاً من هذا أن يلعب الجيش دوراً ثانوياً في عمليات مكافحة الإرهاب.
Desde el principio, el Ministerio de Defensa se mostró escéptico ante la orden de Putin de incluir el antiterrorismo en el programa militar. A cambio, propuso que el ejército desempeñara un papel secundario en las operaciones antiterroristas.