تكمن العقبة الثانية في أن المحكمة الكمبودية ستكون أول محاكمة دولية تتشكل من أغلبية من القضاة المحليين. وهذه الحقيقة تفرض تحدياً من نوع خاص في دولة كان محاموها هدفاً لأحداث العنف العرقي، ولم يمارس سوى عدد قليل من قضاتها تدريباً رسمياً قضائياً، ولم تتعود إلا قليلاً على استقلال القضاء. وعلى هذا، فهناك من الأسباب ما يدعو إلى القلق والتخوف من محاولة استغلال المحاكمات لغايات سياسية من قِبَل بعض أعضاء الحكومة الكمبودية والتي تتضمن أشخاصاً خدموا ذات يوم تحت حكم الخمير الـحُمر .
El segundo obstáculo se debe a que el de Camboya será el primer tribunal internacionalizado en el que los jueces nacionales constituyan una mayoría, lo que representa un desafío para un país en el que los abogados figuraron entre los objetivos de la violencia genocida, en el que pocos jueces en activo cuentan con la formación jurídica propiamente dicha y que tiene poca tradición de independencia judicial. De modo que preocupa que algunos miembros del gobierno de Camboya -del que forman parte funcionarios que en tiempos sirvieron bajo los jemeres rojos- intenten secuestrar los juicios para fines políticos.