ومن جانبها، تعاملت الحكومة مع مسألة إنشاء قوات مسلحة وطنية باعتبارها قضية لاحقة. فأثناء الثورة، سرب زعماء المجلس الوطني الانتقالي الموارد والتمويل إلى الألوية الإسلامية التي تتقاسم معها إيديولوجية مشتركة، بدلاً من تمويل الجيش الوطني الليبي الوليد. وبعد أن قام مقاتلون إسلاميون بقتل عبد الفتاح يونس القائد العام للقوات المسلحة المتمردة في يوليو/تموز 2011، تم تهميش المؤسسة العسكرية.
Durante la revolución, en vez de dirigir recursos y financiación al naciente Ejército Nacional Libio (ENL), los líderes del CNT los distribuyeron entre brigadas islamistas cuya ideología compartían. Después de que en julio de 2011 combatientes islamistas mataron al comandante en jefe de las fuerzas rebeldes, Abdul Fatah Younis, al ejército directamente se lo dejó de lado.