ولقد دخل جوناثان الحملة الانتخابية مناضلاً ضد الساسة الشماليين المحافظين الأقوياء الذين أصروا على أن الاتفاق غير الرسمي الذي أبرمه حزب الشعب الديمقراطي لتدوير السلطة بين الشمال والجنوب كان يعني ضمناً أن منطقتهم تستحق خمسة أعوام أخرى في تولي المنصب. ولقد زعم هؤلاء الساسة على أية حال أن أولوسيجون أوباسانجو، سلف يارادوا من الجنوب الذي تقطنه أغلبية مسيحية، تولى السلطة الرئاسية لمدة ثماني سنوات من دون انقطاع.
Jonathan entró en la campaña electoral luchando contra poderosos políticos conservadores norteños que insistían en que, conforme al acuerdo oficioso del PPD para que se turnaran en el poder el Norte y el Sur, su región tenía derecho a ocupar el poder durante cinco años más. Al fin y al cabo, según sostenían, Olusegun Obasanjo, predecesor de Yar’Adua y procedente del Sur, mayoritoriamente cristiano, había ejercido el poder presidencial durante ocho años ininterrumpidos.