ولكن ظلت هناك مشاكل خطيرة مشتركة بين الجانبين. فقد كانت الحكومة التركية ساخطة بسبب إهمال قوات الاحتلال الأميركية للقواعد العسكرية التابعة للمتمردين الانفصاليين الأكراد في شمال العراق، والذين دخلوا ضد تركيا في حرب دامت 15 عاماً. وعلى نحو أكثر اتساعاً، فإن الحكومة التركية تتهم الولايات المتحدة بأنها لينة الجانب أكثر مما ينبغي فيما يتصل بالتطورات السياسية الكردية، وأنها لا تلقي بالاً إلى قلق تركيا بشأن استقلال الأكراد. ومن جانب الولايات المتحدة فهي غير راضية عن اعتراضات الحكومة التركية على استخدام أميركا لقاعدة إنكيرليك الجوية في جنوب تركيا بلا قيد أو شرط، علاوة على التوترات الأخيرة بين الحكومة التركية وإسرائيل.
El gobierno está irritado por que las fuerzas estadounidenses de ocupación no presten atención a las bases en el Iraq septentrional del PKK, los insurgentes separatistas kurdos que han reñido una guerra de 15 años contra Turquía. Más en general, el gobierno considera a los EE.UU. demasiado complacientes con la evolución de la situación política kurda e indiferentes a las preocupaciones de Turquía por la independencia kurda.