وفي عام 1994، بعد ثلاثة أعوام من انهيار الاتحاد السوفييتي، بدأت عمليات إعادة بناء الكاتدرائية. وكان المقصود من هذا المشروع الإيديولوجي الرئيسي للرئيس بوريس يلتسين، والذي اكتمل في عام 2000، محو سنوات الحكم الشيوعي رمزياً وإعادة روسيا إلى الماضي. ولكن الكنيسة الجديدة القديمة لم تتمكن من إعادة الزمن إلى الوراء. فإذا أصبحت رمزاً فهي رمز لروسيا بوتن الجديدة، التي تتسم بمزيج من القومية المتشددة ودين الدولة؛ وبالتالي فإن أي هجوم على معلم تذكاري يجسد وحدة الكنيسة والدولة في عهد بوتن من غير الممكن أن يمر من دون عقاب.
Pero la nueva vieja iglesia no pudo volver el tiempo atrás. Si se convirtió en un símbolo, fue de la nueva Rusia de Putin, con su mezcla de nacionalismo patriotero y religión estatal; de modo que cualquier ataque a un monumento que representa la unidad de la iglesia y del estado bajo el régimen de Putin no podía no ser castigado.