بيد أن افتراضات أخرى أصبحت مهددة. على سبيل المثال، في تمثيل "شجرة الحياة" التقليدي للتطور، تتباعد الفروع دوما، ولا تندمج أبدا، وهو ما يعني ضمناً أن أصل الأنواع يتبع مساراً خطيا، وأن كل التغيرات النشوئية على طول هذا المسار تحدث ضمن النسب الذي يجري تتبعه. ولكن دراسة الجينوم ــ وبخاصة لدى الميكروبات ــ أظهرت أن الجينات المنتقلة بين كائنات حية بعيدة الصلة تشكل محفزاً مهماً للتغير النشوئي.
Por ejemplo, en el “árbol de la vida”, que es la representación tradicional de la evolución, las ramas siempre se mueven separándose, nunca se acercan fusionándose, lo que implica que la ascendencia de la especie sigue una trayectoria lineal, y que todos los cambios evolutivos a lo largo de este camino se producen dentro del linaje que se está trazando. Pero el examen de los genomas – en particular de los microbios – ha demostrado que los genes que se mueven entre organismos relacionados de manera distante son un importante catalizador del cambio evolutivo.