असरदार टीकों और आसानी से उपलब्ध सस्ती दवाओं की कमी को देखते हुए, इस तरह के रोगों को नियंत्रित करने के लिए सीसी मक्खियों की संख्या को कम करना सबसे कारगर तरीका है। यह काम ट्रैप और टार्गेट यंत्रों (कीटनाशक-सिक्त स्क्रीनों) की मदद से किया जा सकता है जो मक्खियों को ऐसे डिवाइस की ओर आकर्षित करते हैं जो उन्हें एकत्र करता है और/या मारता है।
Учитывая отсутствие эффективных вакцин и недорогих и легкодоступных лекарств, снижение популяций мухи цеце является наиболее эффективным методом предупреждения подобных заболеваний. Этого можно добиться с помощью ловушек и приманок (пропитанных инсектицидом экранов), привлекающих мух к устройству, которое собирает и/или убивает их.