Genauso hat Khamenei die Nuklearverhandlungen bisher uneingeschränkt unterstützt. Anders als Ahmadinedschads reformistischer Vorgänger Mohammad Chatami, der mehr wie der Führer der loyalen Opposition als wie ein Regierungschef auftrat, arbeitet Rouhani eng mit Khamenei zusammen.
Contrairement au prédécesseur réformiste d'Ahmadinejad, Mohammad Khatami, qui se comportait davantage en leader d'une opposition loyale qu'en chef de l'exécutif, Rouhani travaille en étroite collaboration avec Khamenei.