بيد أن هذا الاستخدام لا يخلو من أوجه قصور خطيرة. فلأن المؤشر يُحسَب استناداً إلى قياسين بيولوجيين (الوزن والطول)، فإن النتيجة الناجمة عنه لا تحمل قيمة بيولوجية في حد ذاتها. وبالتالي فإن دراسات البدانة من الناحية الوراثية والتي تستند إلى العلاقة بين علامات وراثية بعينها ومؤشر كتلة الجسم تصبح أيضاً بلا قيمة.
但这样的用法存在不小的局限。该指数由两项生物学指标（体重和身高）计算得出，因此算出的得分本身并不具有生物学意义。因此，基于特定遗传指标和体重指数关系的遗传学肥胖研究也没有什么意义。