غير أن اكتشافات حديثة ألقت بظلال من الشك على قيمة مؤشر كتلة الجسم. على سبيل المثال، برغم ارتباط مؤشر كتلة الجسم بكتلة الدهون في الأشخاص البدينين، فإن هذا الارتباط يتضاءل أو ينعدم في الأفراد الطبيعيين أو الذين يعانون من نقص الوزن. ففي أي درجة من مؤشر كتلة الجسم، تتراوح كتلة الدهون على نطاق واسع، وتعمل متغيرات أخرى مثل الجنس أو السن على تشويه النتائج بدرجة أكبر، مع ملاحظة زيادات أكبر في كتلة الدهون عن كل وحدة من مؤشر كتلة الجسم في النساء وكبار السن.
但是，最近的研究成果质疑了体重指数的价值。比方说，尽管体重指数与肥胖人群的脂肪量相关，但与正常或体重偏低者的脂肪量却没有多大关系。任何给定体重指数评分的脂肪量都差别甚大，而且性别或年龄等其他变量也进一步扭曲了研究结果，显示妇女和中老年人的单位体重指数脂肪量有较大的增加。