وبعد ثلاثة أعوام، أصبح أكثر من ثلاثة أرباع الأعضاء والمساعدين الكبار بتنظيم القاعدة محتجزين في السجون أو قتلوا. وما زال أسامة بن لادن فاراً، لكن كثيراً من مساعديه إما وراء القضبان أو ماتوا، كما تقطعت خطوط تمويل التنظيم وتقلصت.
三年后，超过四分之三的基地组织主要成员和合作人被拘捕或消灭。本·拉登本人在四处逃窜，他的很多主要联系人正被法庭审判或已经死亡。他的财务支持条线也被减少。