كما تظل هناك مشكلة المياه الإقليمية المتنازع عليها عند شرق بحر الصين. فعلى الرغم من المشاريع الجديدة المشتركة في مجال كفاءة استخدام الطاقة وحماية البيئة، وهما المجالان اللذان تنظر الصين فيهما إلى اليابان باعتبارها الدولة صاحبة الأداء الأفضل بين الدول الصناعية، إلا أن النزاع يظل قائماً بين البلدين بشأن المياه الإقليمية، التي قد تحتوي تحت قاعها على مخزون ضخم من النفط والغاز والمعادن. وحتى بعد العديد من جولات المحادثات، ما زال التوصل إلى حل في هذا الشأن يُـعَد أمراً بعيد المنال. وليس من المتوقع أن تؤدي زيارة هيو إلى أي تقدم مفاجئ فيما يتصل بهذه القضية.
问题之一是中国东海的争议水域。尽管在能源效率和环境保护领域开展了新的合作项目，而且中国在上述领域里把日本列为工业化国家首选的合作伙伴，但中日双方依然在地区性水域问题上存在着严重的对立，而在中日存在着严重争议的水域，很有可能蕴藏着大量的石油、天然气和其他矿产资源。