من بين مسئولياته المتعددة، يخدم خامنئي كقائد أعلى للمؤسسة العسكرية، ويسيطر على أجهزة الاستخبارات، ويتولى تعيين مديري الأجهزة الإعلامية الوطنية. ويسيطر المعينون من قِـبَله فعلياً على أغلب الوزارات والمدن الرئيسية في إيران.
哈梅内依的还担任军队的总司令，掌控情报机构，任命中央媒体的负责人。被他任命的人有效的控制着大部分部委和伊朗的主要城市。