قام ذلك التغيير على نظرية آية الله خوميني فيما يتصل بـِ &quot;الحاكم الفقيه&quot;. ويرى خوميني أن الحاكم الفقيه يستطيع أن يعدل التشريعات الدينية، وفقاً لتفسيره لاحتياجات النظام. ونتيجة لهذا أصبحت الفتوى الدينية ـ التي كانت فيما قبل تشكل وظيفة غير مركزية يتولى القيام بها عدد كبير من المعاهد الدينية ـ حقاً مقصوراً على الزعيم السياسي. وعلى هذا فلم تعد المؤسسة الدينية عبارة عن بنية مدنية تتولى إدارة الشئون الدينية فحسب، بل لقد تطورت إلى حزب إيديولوجي موحد يخدم مصالح النظام.
变化发生在阿亚图拉霍梅尼提出“法学家执政”的理论之后。在霍梅尼看来，执政的法学家可以根据自己对政府需求的理解来修改宗教法律。于是，此前由不同神学院履行的高度分散的职能逐渐被集中到了政治领袖的手中。进而，神学院组织也不再只是管理宗教事务的民间机构，而是演变成了为政府利益服务的统一的意识形态组织。