بيد أن التهديد الأكثر إلحاحاً يتلخص في أن أي نوع من التعديل الوراثي للخط الجنسي البشري قد يؤدي إلى ضرر دائم في الأمد البعيد. وطبقاً لتقرير فريق الخبراء التابع لهيئة التخصيب وعلم الأجنة البشرية في المملكة المتحدة فإن إثبات سلامة تقنيات الميتوكوندريا بالنسبة للمستخدمين الحاليين لا يزال بعيدا. ولا أحد يستطيع أن يجزم ماذا قد تعني هذه التقنيات بالنسبة لذريتهم.
但更迫切的威胁是任何形式的生殖细胞基因改造都有可能造成长期的永久性损害。英国人类受精和胚胎学管理局自身的专家组报告线粒体技术的安全性还远未在当前的使用者身上得到证实。根本没法预测这对他们的后代意味着什么。