ثم ظلت تلك الحال بلا تغيير إلى أن ضرب تنظيم القاعدة الذي يتخذ من أفغانستان مقراً له الولايات المتحدة في الحادي عشر من سبتمبر/أيلول 2011. فبعد أن تلقت باكستان رسالة تحذير من إدارة الرئيس جورج دبليو بوش مفادها: "إما أن تكونوا معنا أو ضدنا"، قرر الجنرال برويز مشرف الانحياز إلى جانب الولايات المتحدة، فقطعت باكستان علاقاتها مع نظام طالبان في أفغانستان، الذي كانت قد ساعدت في تنصيبه قبل خمسة أعوام، وسمحت لأميركا باستخدام مجالها الجوي لشن الغارات على أفغانستان.
直到2001年9月11日驻阿富汗的基地组织袭击美国之前，一直维持着这样一种形势。在接到乔治·W·布什总统“要么与我们为友、要么为敌”的最后通牒后，巴基斯坦的穆沙拉夫将军决定和美国站在一起。穆沙拉夫政府切断了五年前建立的与阿富汗塔利班组织的联系，并允许美国使用其空军基地对阿富汗发起攻击。