وقد تكون التحديات على مستوى الولايات والمحليات أعظم. فوفقاً لتقارير 23% من الإدارات الصحية المحلية، تم خفض أو حتى إلغاء برامج التأهب في مجال الصحة العامة في عام 2011، في حين ذكرت تقارير 15% أخرى من الإدارات تخفيضات مماثلة في عام 2012. وفي عام 2014 وحده، عانى برنامج استعداد المستشفيات، الذي يربط المستشفيات الإقليمية بالإدارات الصحية المحلية للاستعداد للتصدي لطوارئ الصحة العامة المحتملة، من تخفيضات للميزانية بلغت 100 مليون دولار.
州和地方一级所面临的挑战可能更为严峻。2011年约23%的地方卫生部门反映公共卫生应急计划数量锐减甚至消失。还有15%反映2012年也有过类似的削减开支。仅2014年一年，连接地区医院与地方医疗卫生部门、为潜在公共卫生突发事件做准备的医院应急计划就蒙受了1亿美元的预算损失。