منذ البداية يتعين على المحكمة الخاصة العراقية أن تشكل رمزاً قوياً للسيادة العراقية. لكن ارتباطها الوثيق بالغزو الذي قادته الولايات المتحدة يجعلها عرضة للاتهام بخضوعها لـِ "عدالة المنتصر". وعلى الرغم من إقراره في شهر ديسمبر من عام 2003 من قِـبَل المجلس العراقي الحاكم، إلا أن صياغة قانون المحكمة الخاصة العراقية تمت بالاتفاق مع حكومة الولايات المتحدة وكان التصديق عليه من قِـبَل بول بريمر مدير السلطة الإقليمية للتحالف آنذاك. وتظل الولايات المتحدة تشكل القوة الدافعة وراء إنشاء المحكمة الخاصة العراقية، وتمدها بالخبرات اللازمة. وفي اعتقاد العديد من العراقيين، فمن الصعب النظر إلى المحكمة الخاصة العراقية باعتبارها أي شيء غير التعبير عن إرادة المحتل.
从一开始，IST就必须建立一种伊拉克主权的健全象征。但它与以美国主导下的侵略的密切关联，使其很容易被指责为“胜利者的审判”。虽然在2003年12月得到了“伊拉克管理委员会”的正式批准，但IST的章程是由美国政府按协议制定，并由伊拉克临时权力机构的执行长官L. Paul Bremer批准。美国仍然是IST背后的驱动力，并为其提供智力支持。对许多伊拉克人而言，很难不把IST看作表达占领者意愿的工具。