بيد أن الفترة التي سبقت المحاكمة كانت مثيرة للجدال والخلاف. ففي التاسع والعشرين من يوليو/تموز، نظمت العديد من المنظمات احتجاجاً حاشداً في ميدان التحرير بالقاهرة لتسليط الضوء على وحدة ثوار مصر (والذين اشتملت مطالبهم على محاكمة علنية للرئيس السابق مبارك). ولكن ما حدث بدلاً من ذلك هو أن الاحتجاج كشف عن الاستقطاب المثير بين الإسلاميين والعلمانيين منذ الإطاحة بمبارك. كما كشف فضلاً عن ذلك عن القدرات الهائلة التي يتمتع بها السلفيون في حشد الأنصار، الذين شكلوا الغالبية الساحقة في ميدان التحرير في ذلك اليوم.
但穆巴拉克的审判过程可能会引起争议。7月29日，不少组织在开罗解放广场举行了示威，以示埃及革命者之间的合作无间（公审穆巴拉克便是他们的要求之一）。但这次示威表明，伊斯兰主义者和世俗派之间在穆巴拉克被废黜后出现了深刻分歧。此外，这次示威还表明，埃及沙拉菲（Salafi）在动员支持者方面具有很大的能量，他们构成了解放广场示威的压倒多数。