وتشهد الكتلة الحيوية انبعاثاً جديداً الآن، لأنها تعتبر محايدة في إطلاق ثاني أكسيد الكربون. فالحكمة التقليدية هي أن حرق الخشب يطلق فقط القدر الذي امتصته الشجرة من الكربون أثناء نموها، وبالتالي فإن التأثير المناخي الصافي هو صفر. غير أن عدداً متزايداً من الأصوات تطعن في رجاحة هذا الرأي. حتى أن اللجنة العلمية التابعة لهيئة البيئة الأوروبية وصفت هذا الرأي بأنه "افتراض خاطئ" يستند إلى "خطأ خطير في الحساب"، لأننا إذا قطعنا غابة لحرق أخشابها، فإن الأمر سوف يستغرق وقتاً طويلاً قبل أن يمتص النمو الجديد نفس القدر من انبعاثات ثاني أكسيد الكربون. وقد يكون التأثير المناخي زيادة صافية في الانبعاثات إذا أزلنا الغابات لإنشاء زراعات من محاصيل الطاقة.
被视为二氧化碳中性的生物燃料正在逐步复苏。传统智慧认为树木燃烧时释放的二氧化碳量与其生长时吸入的量相当，因此使用生物燃料不会影响到气候。但对上述观点质疑声却越来越大。欧洲环境署科学委员会已将其定性为“严重计算错误”所导致的“假设错误”，因为如果以烧柴为目的而砍伐树木，要等很久新栽树木才能吸收二氧化碳排放。如果在森林砍伐后种植能源作物，可能产生的气候效果是净排放量增加。