ويتضمن نظام معاهدة أنتاركتيكا ثلاثة اجتماعات سنوية: أحدها يتعامل مع مسألة الإشراف على تنفيذ المعاهدة وإدارتها، ويتعلق الثاني والثالث باتفاقية الحفاظ على الموارد البحرية الحية في القارة القطبية الجنوبية والبروتوكول المتعلق بالحماية البيئية في معاهدة أنتاركتيكا. وفي الأعوام الأخيرة بدأ التفكير في تنفيذ مقترحات تقضي بإنشاء محميات بحرية حول القارة ووضع حد لخطر النُدرة المتزايد أو الاختفاء الصريح لمجموعة متنوعة من الأنواع من الأسماك والثدييات البحرية.
南极条约体系包含三次年会：其中一次涉及条约本身的监督和管理，另两次则与南极海洋生物资源养护委员会和《南极条约环境保护议定书》相关。近年来在大陆周围设立海洋保护区的建议已经被纳入考虑，目的是防止各种鱼及鲸类数量日益减少甚至彻底灭绝。