منذ لحظة تولي الحزب الديمقراطي الياباني للسلطة في عام 2009، اعتبر كان ضمنياً خليفة لهاتوياما، وذلك نظراً لكونه آنذاك نائباً لرئيس الوزراء ووزيراً للخزانة. وفي هذين المنصبين كان ناوتو كان حريصاً على تجنب التورط في القضيتين الرئيسيتين اللتين تسببتا في انهيار وزارة هاتوياما: الجدال الدائر بشأن نقل القاعدة الأميركية، والمناقشات الدائرة بشأن خفض الموازنة. وعلى هذا فقد كان بمنأى عن العداوة القائمة بين الحزب الديمقراطي الياباني وكبار الموظفين البيروقراطيين الأقوياء في اليابان، والذين يبذلون محاولات يائسة لحماية النظام البيروقراطي/الوزاري الذي نجح من خلاله الحزب الديمقراطي الليبرالي الذي كان الحزب الحاكم ذات يوم في تمرير القوانين والموازنات التي أعدها كبار الموظفين البيروقراطيين الأقوياء، على نحو شبه متواصل لمدة خمسة عقود (نصف قرن من الزمان).
早在2009年民主党上台之际，菅就被内定为鸠山的继任者，身兼副首相和财务大臣。在其职位上，菅避免了卷入两桩事务：美军基地迁移问题和预算削减讨论，而正是这两个议题迫使鸠山下台。菅也因此免于得罪民主党的宿敌——强势的日本大官僚，他们正试图维持的官僚/内阁体系曾在过去的半个世纪中帮助由官僚起草的法案和预算案得到自民党内阁通过。