يتزايد تعقيد التحديات التي تواجه جوكوي بفعل حقيقة مفادها أن ائتلافه الحاكم فاز بنحو ثلث المقاعد فقط في البرلمان، في حين حصل الموالون لائتلاف منافسه في الانتخابات الرئاسية برابو سوبيانتو ببقية المقاعد. لذا، فيتعين على جوكوي عندما يقدم نمطاً جديداً للحكم، والذي يتجسد في التعيينات الوزارية على أساس الجدارة، أن يتوخى الحذر خشية تنفير النخب السياسية وكبار رجال الأعمال الذين استفادوا لفترة طويلة من إحكام قبضتهم على السلطة.
让佐科维所面临的挑战更加复杂的事实是，他的执政联盟只拥有印尼议会的约三分之一议席，其余议员忠于他在总统选举中的对手普拉博沃·苏毕安托（Prabowo Subianto）的联盟。因此，在引入新的治国风格时——比如根据能力任命内阁成员——佐科维必须小心从事，避免得罪长期从把持权力中获益的政治和商界精英。