وكانت إحدى المحاولات الأولى لضبط ومواءمة النظرية بالأدلة هي تلك التي اقترحها زميلي الراحل موتو كيمورا، الذي افترض وجود طفرات محايدة ــ متغيرات جينية ليست نافعة ولا ضارة للفرد، وبالتالي فإنها لا تتأثر بالانتقاء الطبيعي. وقد فحص كيمورا معدل التغير التطوري للبروتينات وعَرَض النظرية الحيادية للتطور الجزيئي في عام 1968. والواقع أن نظريته ــ التي اعتبرت أن التغيرات التطورية على المستوى الجزيئي لا ترجع إلى الانتقاء الطبيعي، بل الانحراف الجيني العشوائي ــ قدمت تفسيراً جيداً للتباين الجيني الذي اكتشفه الباحثون.
我已故的同事木村本雄最先提出了支撑上述理论的证据，他假定存在对个体既非有利亦非有害的中性基因突变，因此也不受自然选择的管辖。木村研究了蛋白质进化率，并于1968年提出了分子进化的中性学说。他的理论认为导致分子水平进化改变的不是自然选择而是随机的遗传漂变，他的理论很好地解释了研究人员发现的遗传变异现象。