أما منصب القائد الأعلى للقوات الفلسطينية فهو من المفترض أن يضع الأجهزة الفلسطينية العسكرية والأمنية والاستخباراتية المتعددة تحت قيادة زعيم واحد ينتظر منه أن يكفل ويضمن حكم القانون. لكن هذه القوات تعيش الآن حالة من الفوضى الناجمة عن الحاجة الملحة إلى إعادة تنظيم أغلب الأجهزة الأمنية الفلسطينية بعد أربعة أعوام من الجهود المكثفة من جانب إسرائيل لسحق هذه الأجهزة.
巴勒斯坦军队司令的职务理论上把巴勒斯坦军队、安全和情报单位划归一人领导，由他来确保巴勒斯坦的法治进程。但这些部队现在一片混乱，在遭到长达四年的以色列镇压后，绝大多数身着制服的巴勒斯坦安全机构都迫切需要进行重组。