ولكن هناك جانب واحد من جوانب هذه الانتخابات يشكل خطورة بالغة إلى الحد الذي قد يجعله سابقاً في الأهمية لأي جانب آخر. ذلك أن المرشح الذي جاء في المرتبة الأولى بعد حصوله على ثلثي الأصوات كان أبو ماهر غنيم ، الذي تزايدت الأحاديث عنه باعتباره خليفة لعباس. إن غنيم متشدد بطبيعته ومعارض صريح لاتفاقية أوسلو، فما بالك بالاتفاق مع إسرائيل على السلام من خلال التفاوض. وإذا أصبح زعيماً لحركة فتح (وبالتالي زعيماً للسلطة الفلسطينية ومنظمة التحرير الفلسطينية)، فإن التوصل إلى أي تسوية مع إسرائيل سوف يصبح ضرباً من الخيال.
而此次选举中还存在一个极其危险的因素，其严重性甚至可能超过其他一切方面，那就是得票数独占鳌头、拿下2/3选票的候选人阿布德·阿尔-马希尔·古奈姆，而认定此人为阿巴斯继承人的言论正愈演愈烈。然而古奈姆是一个顽固的强硬派，他本人就是奥斯陆协议的公开反对者，让他去和以色列谈判签订和平协议更是不可能。如果古奈姆最终当选为法塔赫的领导人，并因此成为巴勒斯坦当局以及巴勒斯坦解放组织领导人的话，那么同以方达成任何形式的妥协方案都只能是无稽之谈了。