ولقد سارع بعض مستشاري كينيدي إلى حثه على شن ضربة جوية وغزو كوبا لتدمير الصواريخ. وبدأ كينيدي بحشد القوات، ولكنه في الوقت نفسه عمل على كسب الوقت من خلال الإعلان عن حصار كوبا بحريا. ثم هدأت الأزمة عندما استدارت سفن سوفييتية تحمل صورايخ إضافية عائدة، ووافق خروشوف على إزالة الصواريخ المنصوبة على الجزيرة. وعلى حد تعبير دين راسك وزير الخارجية الأميركي آنذاك: "كنا وجهاً لوجه، وأظن أن الشخص الآخر طرف بعينه".
肯尼迪某些顾问敦促发动空袭和入侵来销毁导弹。肯尼迪调集了部队，但同时宣布对古巴实施海上封锁来争取时间。携带后续导弹的苏联船只掉头返回后危机逐渐消退，赫鲁晓夫也答应移走岛上已有的导弹。正如时任美国国务卿迪安·腊斯克所言：“双方的相互对峙最终以对方的退缩而告结束。”