كما تخشى مصر اندلاع حرب أهلية بين حماس وفتح. وعلى الرغم من أن حماس قد استبعدت هذا الاحتمال، إلا أنها لم تبد أي تردد في استخدام القوة الصارمة ضد معارضيها. وعلى نحو مماثل يقول محمود الزهار وزير خارجية حكومة حماس إن أي محاولة لحل الحكومة الحالية أو الدعوة إلى إجراء انتخابات مبكرة من جانب عباس من شأنه أن يؤدي إلى اندلاع حرب أهلية. ولقد كان الخوف من وقوع معارك ساخنة سبباً في دفع العديد من الفلسطينيين إلى محاولة الدخول إلى مصر، فاضطرت الحكومة المصرية بالتالي إلى نشر قواتها على الحدود بهدف السيطرة على أي خروج جماعي.
埃及还担心可能发生的哈马斯与法塔赫的内战。尽管哈马斯排除了这一可能性，但是，它却毫不迟疑地对其反对者使用强力。同样，哈马斯领导的政府外交部长说，阿巴斯解散政府或提前举行选举就是内战。许多巴勒斯坦人由于害怕大规模的作战而逃入埃及，迫使埃及在边境部署军队来控制大规模的逃难。