Mezi tři otázky centrálních institucí, před nimiž Mezivládní konference stojí, patří otázka budoucího uspořádání Evropské komise a Evropské rady a otázka stanovení role budoucího předsedy Evropské rady.
Межправительственной конференции предстоит решить три основных институциональных вопроса, а именно определить организационную структуру Комиссии и Совета, а также роль будущего президента Европейского Совета.