नाइजीरिया में आधिकारिक रूप से स्वीकृत समलैंगिकता के विरोध के वातावरण ने एड्स के खिलाफ लड़ाई में पहले ही अड़चन डाल दी है। 2006 में, एक अध्ययन से पता चला था कि नाइजीरिया में पुरुषों के साथ यौन संबंध रखने वाले पुरुषों ��ें 13% एचआईवी पॉज़िटिव हैं, जबकि इसकी तुलना में कुल नाइजीरियाई व्यक्तियों में से 4.5% एचआईवी पॉज़िटिव हैं। 2012 तक, पुरुषों के साथ यौन संबंध रखने वाले पुरुषों के बीच एचआईवी की दर बढ़कर 17% हो गई। इस बीच, स्वास्थ्य केन्द्रों पर अधिक संख्या में पुरुषों ने बताया कि उन्हें समलैंगिकता के विरोध के वातावरण का सामना करना पड़ रहा है, जिसके कारण इसकी संभावना कम है कि वे मदद प्राप्त करने के लिए आगे आएँगे।
Em 2012, a taxa de VIH entre homens que praticam sexo com homens aumentou para 17%. Entretanto, um número cada vez maior de homens declarou ter enfrentado situações de homofobia em centros de cuidados de saúde, o que implica que a probabilidade de procurarem ajuda seja cada vez menor.