كأس كرواتيا 1998–99  هو الموسم 8 من كأس كرواتيا. أقيم خلال الفترة 19 أغسطس 1998 وحتى 30 مايو 1999، وأشرف على تنظيمه اتحاد كرواتيا لكرة القدم، وكان عدد الأندية المشاركة فيه 48، وفاز فيه نادي أوسييك.

نتائج الموسم
كأس كرواتيا 1998–99