دوري أندورا الممتاز 1998–99 هو الموسم 4 من  دوري أندورا الممتاز. أقيم خلال الفترة 4 أكتوبر 1998 وحتى 30 مايو 1999، والذي يشرف على تنظيمه اتحاد أندورا لكرة القدم، وكان عدد الأندية المشاركة فيه  12، وفاز فيه .

نتائج الموسم
دوري أندورا الممتاز 1998–99