دوري الدرجة الثانية الإسباني 1998–99  هو الموسم 68 من  دوري الدرجة الثانية الإسباني. أقيم خلال الفترة 29 أغسطس 1998 وحتى 20 يونيو 1999، وأشرف على تنظيمه الاتحاد الملكي الإسباني لكرة القدم، وكان عدد الأندية المشاركة فيه  22، وفاز فيه نادي مالقا.

نتائج الموسم
الدوري الإسباني الدرجة الثانية 1998–99