الدوري المقدوني الأول لكرة القدم 1998–99 هو الموسم 7 من  الدوري المقدوني الأول لكرة القدم. أقيم خلال الفترة 9 أغسطس 1998 وحتى 29 مايو 1999، والذي يشرف على تنظيمه الاتحاد الأوروبي لكرة القدم، وكان عدد الأندية المشاركة فيه  14، وفاز فيه نادي سلوغا يوغوماغنات.

نتائج الموسم
الدوري المقدوني الأول لكرة القدم 1998–99