دوري سلوفينيا لكرة القدم 1999–2000  هو الموسم 9 من  دوري سلوفينيا لكرة القدم. أقيم خلال الفترة 1 أغسطس 1999 وحتى 20 مايو 2000، والذي يشرف على تنظيمه اتحاد سلوفينيا لكرة القدم، وكان عدد الأندية المشاركة فيه  12، وفاز فيه نادي ماريبور.

نتائج الموسم
دوري سلوفينيا لكرة القدم 1999–2000