الدوري الويلزي الممتاز 1998–99  هو الموسم 7 من الدوري الويلزي الممتاز. أقيم خلال الفترة 1998 وحتى 1999، وأشرف على تنظيمه اتحاد ويلز لكرة القدم، وكان عدد الأندية المشاركة فيه 17، وفاز فيه نادي باري تاون يونايتد.

نتائج الموسم
الدوري الويلزي الممتاز 1998–99