Ar hyn o bryd mae’r Cynllun Gweithredu Bioamrywiaeth yn rhestru ychydig dros 30 o gynefinoedd blaenoriaethol, y mae llawer ohonynt yn yr AHNE. Mae rhai o’r rhain yn genedlaethol bwysig megis glaswelltir calchaidd, rhostir, coed deri, coed ynn cymysg yr ucheldir, gwrychoedd hynafol a chyfoethog eu rhywogaethau, dolydd iseldir, corsydd pori, a chynefinoedd arfordirol. Mae eraill, megis pyllau dðr, lleiniau ochr ffordd sy’n rhoi lloches i flodau gwyllt a oedd unwaith yn gyffredin yn y caeau cyfagos, a mannau glas yn ein trefi yn werthfawr yn lleol.