Στην Περιφέρεια Κρήτης (πληθυσμός 623.065 το 2011) υπάρχουν τα εξής νησιά (ταξινομημένα ανά νομό)  :

Νήσος Κρήτη (622.911)

Νομός Ηρακλείου (305.490)
Δήμος Αρχανών - Αστερουσίων (έδρα Πεζά)
Θέτις 
Δήμος Φαιστού (έδρα Τυμπάκι)
Μεγαλονήσι (ή Μακρονήσι) 
Μικρονήσι (ή Άγιος Παύλος) 
Παπαδόπλακα 
Τράφος 
Δήμος Χερσονήσου (έδρα Γούρνες)
Αγία Βαρβάρα 
Δία 
Παξιμάδι 
Πεταλίδι (ή Γλαρονήσι)

Νομός Λασιθίου (75.381)
Δήμος Αγίου Νικολάου (έδρα Άγιος Νικόλαος)
Άγιοι Πάντες 
Άγιος Αντώνιος (ή Νικολονήσι ή Νικολός) 
Αυγό *
Βρυονήσι (ή Πρασονήσι) 
Κολοκυθιά 
Μικρόνησος (ή Μικρονήσι) 
Σπιναλόγκα (ή Καλυδών) 

Δήμος Ιεραπέτρας (έδρα Ιεράπετρα)
Αγία Ειρήνη 
Αγριόμανδρα 
Κονίδα 
Μικρονήσι 
Φωτιά 
Χρυσή (ή Γαϊδουρονήσι) (2) 
Ψύλλος 

Δήμος Σητείας (έδρα Σητεία)
Άγιος Νικόλαος 
Γκράντες (ή Γράντες), τρεις νησίδες 
Δασκαλειά 
Διονυσιάδες, τέσσερεις νησίδες 
Γιανυσάδα 
Δραγονάδα 
Παξιμάδα 
Πρασονήσι Σητείας 
Ελάσα 
Ίο 
Καβάλλοι (ή Καβάλοι), τρεις νησίδες 
Αναβάτης 
Καβάλλος 
Κεφαλή 
Καράβι 
Κουφονήσι 
Κυμώ (ή Κούμελη) 
Κυριαμάδι, δύο νησίδες 
Μακρουλό 
Μαυρονήσι 
Μαύρος Βράχος 
Μεγατζέδες 
Περιστερόβραχοι, τρεις νησίδες 
Πρασονήσι Λεύκης 
Προσφορά 
Σίδερος 
Στρογγυλό 
Τράχηλος 
Φτενά Τραχύλια, τέσσερεις νησίδες 
Ψείρα

Νομός Ρεθύμνης (85.609)
Δήμος Αγίου Βασιλείου (έδρα Σπήλι)
Παξιμάδια, δύο νησίδες 
 Παξιμάδια Ένα
 Παξιμάδια Δύο
Πρασονήσι 
Δήμος Μυλοποτάμου (έδρα Πέραμα)
Διαπόρι 
Περιστέρι

Νομός Χανίων (156.585)
Δήμος Χανίων (έδρα Χανιά)
Άγιοι Απόστολοι 
Άγιοι Θεόδωροι (ή Θοδωρού) 
Λαζαρέτα, επτά κύριες νησίδες 
Λέων 
Ξέρα 
Παλαιόσουδα (ή Μαράθι) 
Σούδα 
Δήμος Αποκορώνου (έδρα Βρύσες)
Άγιος Νικόλαος 
Κάργα 
Δήμος Καντάνου - Σελίνου (έδρα Παλαιοχώρα)
Σχιστονήσι 
Δήμος Κισσάμου (έδρα Κίσσαμος)
Άγρια Γραμβούσα (ή Αγριογραμβούσα ή Παλαιογραμβούσα) 
Άρτεμις 
Γραμβούσα (ή Ήμερη Γραμβούσα) 
Ελαφονήσι 
Κουρσάροι, έξι κύριες νησίδες 
Ποντικάκι 
Πεταλίδα 
Πεταλούδα 
Ποντικονήσι 
Πράσο (ή Πρασονήσι) 
Πράσο (ή Πρασονήσι) 
Δήμος Σφακίων (έδρα Χώρα Σφακίων)
Λουτρό 
Φανάρι ?

Νήσος Γαύδος (152)
 
Δήμος Γαύδου (έδρα Καστρί)
Γαϊδουρονήσι 
Γαυδοπούλα 
Πρασονήσι

Σημειώσεις
 Σε παρένθεση αναφέρεται, εφ' όσον κατοικούνται, ο μόνιμος πληθυσμός σύμφωνα με την απογραφή πληθυσμού του 2011 της Ελληνικής Στατιστικής Αρχής (ΕΛ.ΣΤΑΤ.)
  Οι γεωγραφικές συντεταγμένες βασίζονται στην απεικόνιση του δορυφορικού χάρτη του Google Maps. Στις περιπτώσεις κατά τις οποίες δεν υπάρχει απεικόνιση από τον δορυφορικό χάρτη, αλλά από τον εδαφικό χάρτη του προγράμματος Google Maps, τίθεται αστερίσκος (*) πριν από τις αναφερόμενες συντεταγμένες. Εάν, παρ' όλα αυτά δεν υπάρχει καμία απεικόνιση ή η ακριβής τους θέση δεν κατέστη δυνατόν να προσδιοριστεί, τίθεται λατινικό ερωτηματικό (?) πριν από τις αναφερόμενες συντεταγμένες και απλώς σημειώνεται η θέση τους, σύμφωνα με τις ιστοσελίδες GeoNames και SatelliteViews οι οποίες αναπαράγουν τα δεδομένα από το National Geospatial-Intelligence Agency .

Δείτε επίσης
 Κατάλογοι των νησιών ανά περιφέρεια

Πηγές

Χάρτες
 Γενική Στατιστική Υπηρεσία της Ελλάδος, Άτλας 1950 (Τεχνικά Εργαστήρια Γεωγραφικής Υπηρεσίας Στρατού)
 Εθνική Στατιστική Υπηρεσία της Ελλάδος, Άτλας της Ελλάδος (Αθήνα: 1965)
 Εθνική Στατιστική Υπηρεσία της Ελλάδος, Άτλας της Ελλάδος (Αθήνα: 1975)
 Χάρτες Εκδόσεων Road
 Περιοδικό Διακοπές 2007
 Εγκυκλοπαίδεια Δομή (έκδοση 2002-5 σε 32 τόμους)
 Πρόγραμμα Google Earth
 Χάρτες Κυκλάδων, Κρήτης, Επτανήσων

Διοικητική Διαίρεση και πληθυσμός
 Απογραφή μόνιμου πληθυσμού 2011, Ελληνική Στατιστική Αρχή (ΕΛ.ΣΤΑΤ.)
 Διοικητική διαίρεση νομών σύμφωνα με το σχέδιο "Καλλικράτης"
 Περιφέρειες της Ελλάδας 

 
 
Κατάλογοι νησιών της Ελλάδας ανά περιφέρεια