Pel que fa a la seva aplicació sanitària, s'ha identificat a Pepper com una eficient eina per comunicar-se amb nens en diferents situacions delicades, com ara quan es troben aïllats per evitar infeccions, quan es troben ingressats en un hospital per una situació delicada, abans i després d'una intervenció quirúrgica, etc. Pepper permet saber en quin estat d'ànim es troba l'infant, animar-lo, mostrar-li casos d'altres infants que han estat en la seva situació i recollir informació d'interès per als professionals.