Après la mort de Philippe en 1506, avec Joanna soi-disant mentalement instable, et son fils et celui de Philippe, le futur Charles V, n'avait que six ans, Ferdinand reprit la régence, gouvernant par Francisco JimÃ nez de Cisneros, le chancelier du Royaume.
Après la mort de Philippe en 1506, avec Joanna mentalement instable, et son fils de Ghent et son fils Philippe, Charles de Gand, à peine âgés de six ans, Ferdinand reprend la régence, gouvernant par Francisco Cardinal Jimenez de Cisneros, chancelier du Royaume.