Alors que les limites des Rubioideae demeurent presque inchangées face aux études moléculaires, les Antirheoideae sont polyphylétiques, alors que les Ixoroideae sont élargis et que les Cinchonoideae se rétrécissent ; les genres sont répartis en tribus et ceux-ci sont placés dans l'une des trois sous-familles reconnues.
Il y a trois sous-familles : Rubioideae, Cinchonoideae et Ixoroideae.