Le 9 janvier 2007, Gwynn a été élue au Temple de la renommée du base-ball. Elle a été sélectionnée sur 532 des 545 bulletins de vote -LRB- 97,61 % -RRB-, le septième pourcentage le plus élevé de l'histoire du vote du Temple de la renommée, et à peine treize voix de moins qu'une sélection unanime.
Gwynn a été élu au Temple de la renommée du baseball en 2007.