En janvier 2010, le comité de recherche a nommé le président par intérim et ancien recteur, le Dr Amado Gabriel Esteban en tant que 20e président de l'Université Seton Hall, ancien élève de l'Université des Philippines, premier président laïc de Seton Hall, et premier Philippin à devenir président d'une université américaine.
Le président actuel de l'université est le Dr Gabriel Esteban.