Charles Doolittle Walcott a trouvé dans le Shale de Burgess neuf fossiles presque complets d'Opabinia regalis et quelques-uns de ce qu'il a classé comme médias d'Opabinia, et a publié une description de tous ces fossiles en 1912.
Sa seule espèce, Opabinia regalis, est connue dans le Shale de Burgess, au Cambrien moyen, en Colombie-Britannique, et le découvreur d'Opabinia, Charles Doolittle Walcott, l'a nommé en l'honneur d'une montagne locale, Opabin Peak, dans les Rocheuses canadiennes.