Fondé en 1672 pour Bernhard, quatrième fils de Wilhelm, duc de Saxe-Weimar, Saxe-Jena a été réincorporée en Saxe-Weimar sur l'extinction de la ligne de Bernhard en 1690.
Une partie du duché de Saxe-Weimar est donnée à Bernhard, le quatrième fils de Guillaume, duc de Saxe-Weimar en 1672.