Une autre innovation de Bach a été la création de ce qui est strictement des sonates trio, impliquant un concertante -LRB- obligato -RRB- harpsichord part et un instrument mélodique, donc pour deux joueurs. Les exemples connus sont les six sonates pour clavecin et violon solo -LRB- BWV 1014-1019 -RRB-, trois sonates pour clavecin et viola da gamba -LRB- BWV 1027-1029 -RRB- et les trois sonates pour clavecin et traverso flauto -LRB- BWV 1030-1032 -RRB-
Bach a également écrit des sonates pour un instrument mélodique et un clavecin.