Il s'agit du neuvième jeu numéroté de la série Mega Man d'origine : Mega Man 9 est le premier, nouveau jeu de console domestique de la série Mega Man originale depuis Mega Man 8 et Mega Man & Bass, qui ont été sortis au moins une décennie plus tôt.
Il s'agit du premier jeu de la série Mega Man originale à être réalisé depuis la sortie de Mega Man 8 pour la PlayStation en 1996.