En 2006, Landis remporte la première édition de l'Amgen Tour de Californie, avant de terminer la première fois lors du Tour de France 2006, il a été défait de sa victoire du Tour de France et congédié de l "équipe de Phonak après qu'un test de contrôle des drogues eut démontré la présence d'un rapport testostérone / épitestostérone biaisé au cours de la 17e étape.
Le test de dopage après la 17e étape du Tour de France 2006 a montré qu'il avait un ratio testostérone / épitestostérone très élevé.