La région de la ville de Carlisle a été colonisée pour la première fois par des colons anglais en 1651, lorsque les terres étaient des parcelles des villes voisines d'Acton, de Billerica, de Chelmsford et de Concord.
En mai 2006, des essais sur l'eau ont révélé la présence de coliformes dans quatre puits à Carlisle.