Les controverses sur Opus Dei ont été centrées sur les critiques de son soi-disant secret, de ses méthodes de recrutement, des prétendues règles strictes qui régissent les membres, de la pratique par des membres célestes de la mortification de la chair, de son élitisme et de sa misogynie, de la politique prétendument droite de la plupart de ses membres et de la participation présumée de certains gouvernements d'extrême droite ou d'autoritarisme, en particulier du gouvernement franquiste d'Espagne jusqu'en 1978.
Aujourd'hui, Opus Dei compte environ 85 000 membres dans le monde entier.