Par l'ordonnance no 3210 du secrétaire en date du 3 décembre 1999, le United States Fish and Wildlife Service a assumé la responsabilité administrative de Navassa, qui est devenue la National Wildlife Refuge Overlay, également connue sous le nom de Navassa Island National Wildlife Refuge.
Le 2 septembre 1999, le U.S. Fish and Wildlife Service a établi la Réserve faunique de l "île Navassa comme superposition.