Bien que Windows 2000 soit la dernière version NT de Microsoft Windows qui n'inclut pas l'activation du produit Windows, Microsoft a introduit Windows Genuine Advantage pour certains téléchargements et mises à jour non critiques du Centre de téléchargement pour Windows 2000.
Microsoft a remplacé les produits Windows 2000 Server par Windows Server 2003 et Windows 2000 Professional avec Windows XP Professionnel. Windows Neptune a commencé à se développer en 1999 et devait être l'édition Windows 2000 destinée aux utilisateurs à domicile.