Les îles ont également été connues historiquement comme les "îles de la Spice" par les Chinois et les Européens, mais ce terme a également été appliqué à d'autres îles en dehors de l'Indonésie.
Bien qu'à l'origine mélanésienne, les populations de nombreux clans insulaires, en particulier dans les îles Banda, sont mortes au XVIIe siècle.