Par exemple, si la fréquence d'un allèle est de 20 % dans une population donnée, alors parmi les membres de la population, un chromosome sur cinq portera cet allèle.
La fréquence des allèles peut être utilisée pour décrire la diversité génétique d'une population. Si la fréquence d'un allèle est supérieure à 1 %, il est probable que la sélection naturelle la maintienne à ce niveau.