Chez les plantes, il se présente sous forme de minéral dérivé, parfois en proportions toxiques dans le fourrage - le LRB- certaines plantes peuvent accumuler du sélénium comme moyen de défense contre les animaux, mais d'autres plantes comme le yucca glauque ont besoin de sélénium, et leur croissance indique la présence de sélénium dans le sol -RRB-.
Parfois, le sélénium est concentré dans les plantes.