On les retrouve aussi dans les milieux biologiques, comme la ramification des arbres, la disposition des feuilles sur une tige, les pousses de fruits d'une ananas, la floraison de l'artichaut, une fougère non ondulante et l'arrangement d'un cône de pin.
Quelques exemples de la séquence de Fibonacci utilisée dans la nature sont les branches d'arbres, le patron des feuilles sur une tige, les fruits d'une ananas, la floraison de l'artichaut, le décrochement d'une fougère et l'arrangement d'un cône de pin.