En 1982, le Président Ronald Reagan a nommé Thomas Président de la Commission pour l'égalité des chances en matière d'emploi - LRB- EEOC-RRB - et il a occupé ce poste jusqu'en 1990, lorsque le président George H. W. Bush l'a nommé à un siège à la Cour d'appel des États-Unis pour le circuit du district de Columbia.
Clarence Thomas est juge à la Cour suprême des États-Unis.