Toutefois, dans quelques années, la ville sera réinventée comme le centre éducatif de la Sibérie avec la création de l'Université d'État de Tomsk et de l'Université polytechnique de Tomsk.
L'Université d'Etat de Tomsk est la première université de Sibérie - LRB- fondée en 1878, ouverte en 1888 - RRB-. La réserve de livres de la bibliothèque de l'Université d "État de Tomsk est considérée comme l'une des plus riches de la Russie.