Les calottes glaciaires ont également laissé derrière le lac Ontario - le lac Ontario - un des cinq Grands Lacs - RRB- d'eau douce, la rivière Genesee avec ses chutes et gorges, la baie Irondequoit, la baie Sodus, la baie Braddock, les étangs Mendon, de nombreux ruisseaux et étangs locaux, la crête et les lacs Finger avoisinants.
Rochester est située sur la rive du lac Ontario, un des Grands Lacs.