Bien que le terme soit le plus souvent utilisé pour certains halophiles classés dans le domaine archéen, il y a aussi des halophiles bactériens et quelques eucaryotes, comme l'algue Dunaliella salina.
Cependant, certaines bactéries sont aussi halophiles, mais peu d'eucaryotes sont halophiles, mais il y en a quelques-unes, comme l'algue Dunaliella salina.