Son potentiel de béatification et de canonisation fait l'objet d'une opposition de la part de nombreux jésuites, qui considèrent que le conflit entre Savonarola et la papauté est intolérable.
Cependant, de nombreux jésuites s'opposent à sa béatification et à sa canonisation, qui considèrent que les attaques de Savonarola contre la papauté ont été un crime grave.