Brenner a fondé le Molecular Sciences Institute à Berkeley, en Californie, en 1996, et est actuellement associé au Salk Institute, à l'Institute of Molecular and Cell Biology, au Singapore Biomedical Research Council et au Janelia Farm Research Campus du Howard Hughes Medical Institute.
Il est actuellement associé au Salk Institute, à l'Institute of Molecular and Cell Biology, au Singapore Biomedical Research Council et au Howard Hughes Medical Institute.