Avant le XVIIIe siècle, le ruisseau San Juan et son affluent, le ruisseau Trabuco, avaient des noms autochtones, mais ceux-ci sont encore inconnus.
Son plus grand affluent, le Trabuco Creek ou Arroyo Trabuco, mesure environ 21 m de longueur et s "écoule vers le sud des monts Santa Ana dans le ruisseau San Juan. Le ruisseau Oso est un petit tributaire du ruisseau Trabuco, mais il contient beaucoup d'eau toute l'année.