En plus de ce type d'hydrogène pur, il existe des combustibles à base d'hydrocarbures pour les piles à combustible, y compris le diesel, le méthanol - voir : piles à méthanol direct et piles indirectes au méthanol-combustible -RRB- et hydrures chimiques.
Les piles à combustible au méthanol sont utilisées en faisant réagir le méthanol électrochimiquement. Ce type de pile à combustible est un meilleur choix pour un système plus simple.