Avec les chercheurs américains Hamilton Smith et Daniel Nathans, Werner Arber a partagé le prix Nobel de physiologie ou de médecine de 1978 pour la découverte d'endonucléases de restriction.
En 1978, il remporte le prix Nobel de physiologie ou de médecine pour sa découverte des endonucléases de restriction qu'il partage avec Daniel Nathans et Hamilton O. Smith.