Il a été désactivé par défaut, car il a radicalement modifié le fonctionnement du système d'exploitation, mais a été activé par défaut dans Fedora Core 3 et a introduit une politique moins stricte et ciblée.
SELinux a également été activé par défaut, mais avec une nouvelle politique ciblée, qui était moins stricte que la politique utilisée dans Fedora Core 2.