Comme ces symptômes ne sont pas spécifiques à la grippe porcine, un diagnostic différentiel de la grippe porcine probable nécessite non seulement des symptômes, mais aussi une forte probabilité de grippe porcine en raison de l'histoire récente de la personne.
La souche actuelle de grippe porcine peut s'adapter aux humains et se propager plus efficacement que les souches H1N1 des porcs déjà connues. De plus, la co-infection de la grippe porcine H1N1 et de la grippe H1N1 résistante à l'oseltamivir peut mener à l'acquisition de la mutation H274Y par la grippe porcine par recombinaison ou réassortiment.