Son frère, Chris, était un hors-champ pour les Los Angeles Dodgers, Kansas City Royals et San Diego Padres -LRB- 1987 - '' 96 -RRB- et son fils, Tony Gwynn Jr., qui a joué pour les San Diego Padres et qui est actuellement signé par les Los Angeles Dodgers.
Son fils, Tony Gwynn Jr, joue actuellement pour les Padres, ainsi qu'un frère du nom de Chris qui a joué pour les Los Angeles Dodgers et les Padres.