L'expression "mutilation génitale" est également utilisée de façon un peu plus controversée pour décrire certains types de modifications des organes génitaux prescrites par la société, comme la circoncision, la circoncision féminine, la castration et les interventions chirurgicales effectuées pour aligner les organes génitaux des personnes ayant des relations sexuelles avec d'autres hommes ou femmes.
Types de modification du corps