Le nouveau gouvernement Meiji ordonna la destruction de toutes les anciennes fortifications féodales et, conformément à cette directive, toutes les structures du château d'Odawara furent démolies de 1870 à 1872, la base en pierre de l'ancien donjon devenant la base d'un sanctuaire de Shinto, le kubo Jinja, dédié aux esprits des générations de kubo daimy.
Le château d'Odawara a été détruit par le gouvernement Meiji.