Les zoologistes et les paléontologues utilisent la faune pour désigner une collection typique d'animaux trouvés dans un moment ou un lieu précis, par exemple la "faune du désert du Sonoran" ou la "" faune du shale de Burgess "".
On pourrait donc parler de la faune éocène comme étant différente de la faune du Miocène, ou, disons, de la faune d'un habitat particulier.