En 1842, son père rapporta une "grande nouvelle", et alors que le jeune John Lubbock pensait au départ qu'il s'agissait peut-être d'un nouvel étang et était déçu que la nouvelle soit juste que Charles Darwin déménageait à Down House dans le village, il fut bientôt un visiteur fréquent à Down House, et devint le plus proche des plus jeunes amis de Darwin.
Lubbock est aussi un biologiste amateur qui se distingue en écrivant des livres sur les hyménoptères, sur les organes sensoriels des insectes et sur le développement, sur l'intelligence des animaux et sur d'autres sujets d'histoire naturelle.