Il est révélé que, lorsqu'elle était jeune, Xavier a enfermé une grande partie de son pouvoir, ce qui a créé deux personnalités en son sein, et qu'après l'incident à la fin de X2 : X-Men United, le côté sombre de la personnalité de Jean, le Phoenix, est déchaîné.
Après la fin de la X2, le côté sombre de Jeans persona a pris le contrôle.