Возьмите все сегменты длиной более 5 см, сложите их, а затем разделите на 68. Расчет заключается в том, что общий размер вашего генома в cMs с помощью теста Family Finder составляет 6770 сантиметров.
Для подлинных небольших общих сегментов в диапазоне от 5 до 10 сантиметров общий предок может быть на 10-15 поколений или более старше. Истинные сегменты ВЗК менее 5 сантиметров не могут быть надежно обнаружены с помощью доступных в настоящее время генетических генеалогических тестов. Единица генетического расстояния, используемая для описания разделения генов в хромосоме. Она возникла в начале 20-го века, во времена генетических исследований с участием плодовых мушек, до открытия ДНК и картирования геномов с использованием рестрикционных ферментов и других передовых методов. Для некоторых маркеров он содержит как позиции в сантиметрах, так и в pb. Вы можете использовать эти значения для преобразования. Там есть один файл для каждой хромосомы, в котором перечислены позиции хромосомных bp для многих координат в сантиметрах. Карта плотная - например, в chr1 указано 256895 позиций. Как вы определяете значение сантиморгана для сегмента ДНК? Команда биоинформатиков Family Tree DNA работает с данными о сантиморгане (cM), полученными в рамках Международного проекта HapMap. Современные знания о значениях сантиморгана в геноме человека получены в результате тестирования в рамках международного проекта HapMap. В рамках проекта были протестированы трио "отец-мать-ребенок" из разных групп населения по всему миру. Используя эту информацию, они составили карту скорости рекомбинации в геноме человека. Перевод сантиметров в проценты. Чтобы получить приблизительный процент общей ДНК с помощью теста Family Tree DNA Family Finder, возьмите все сегменты длиной более 5 см, сложите их вместе, а затем разделите на 68. Расчет основан на том, что ваш общий геном в cMs с помощью теста Family Finder составляет 6770 сантиметров. Длина сегмента ВЗК может быть измерена в сантиметрах (единица генетического расстояния) или в мегабазах (единица физического расстояния). Все три крупнейшие компании по тестированию аутосомной ДНК (23andMe, AncestryDNA и Family Tree DNA) теперь сообщают о размерах сегментов в сантиметрах. Расстояния сцепления (сантиметры) должны быть рассчитаны на основе популяций, которые вы изучаете (т.е. путем подсчета рекомбинантов), в то время как физические расстояния могут быть определены путем сопоставления ваших маркеров с геномом, если вам повезет, и у вас будут ссылки и маркеры. взгляните на таблицу stsMap ucsc. Один сантиморган определяется как генетическое расстояние между двумя локусами со статистически скорректированной частотой рекомбинации, равной 1%; генетическое расстояние в сантиморганах численно равно частоте рекомбинации, выраженной в процентах. Символ, см. В результате кроссинговера потомство наследует рекомбинантные хромосомы своих родителей. Двоюродные братья первого порядка в нижнем ряду имеют один общий сегмент IBD (границы отмечены серыми линиями). Оба унаследовали этот сегмент ВЗК от одного и того же человека, а именно от своего деда (хромосома оранжевого цвета в верхнем ряду). В чем значение “общих сантиморганов”? Я прошел тест на аутосомную ДНК, и сайт, который я использовал (FamilyTreeDNA), сообщает мне, что у меня общая длина в сантиметрах 48,08 с моим ближайшим совпадением, а самый длинный блок равен 28,89. но я не могу найти ничего, что подсказало бы мне, как интерпретировать это число.
https://isogg.org/wiki/Identical_by_descent https://sizes.com/units/centimorgan.htm https://www.biostars.org/p/16236/ https://www.familytreedna.com/learn/autosomal-ancestry/universal-dna-matching/determine-centimorgan-value-dna-segment/ https://genealogy.stackexchange.com/questions/3364/what-is-the-significance-of-shared-centimorgans https://isogg.org/wiki/Identical_by_descent https://www.biostars.org/p/16236/ https://sizes.com/units/centimorgan.htm https://isogg.org/wiki/Identical_by_descent https://genealogy.stackexchange.com/questions/3364/what-is-the-significance-of-shared-centimorgans
как рассчитать соотношение сантиморганов к проценту общей днк