В 1474 году принцесса Изабелла останавливалась в Алькасаре во время своей коронации в качестве королевы Кастилии, а в 1570 году король Фелипе II женился в цитадели на своей четвертой невесте, Анне Австрийской.
У короля Фелипе II было много жен.