Liste der Naturschutzgebiete in Niederbayern
# Liste der Naturschutzgebiete in Niederbayern

Die Liste der Naturschutzgebiete in Niederbayern bindet folgende Listen der Naturschutzgebiete in niederbayerischen Landkreisen und Städten aus dem Artikelnamensraum ein:

* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Freyung-Grafenau
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Deggendorf
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Dingolfing-Landau
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Kelheim
* Liste der Naturschutzgebiete in Landshut
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Landshut
* Liste der Naturschutzgebiete in Passau
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Passau
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Regen
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Rottal-Inn
* Liste der Naturschutzgebiete in Straubing
* Liste der Naturschutzgebiete im Landkreis Straubing-Bogen

Die Auswahl entspricht dem Regierungsbezirk Niederbayern. Im Regierungsbezirk gibt es 66 Naturschutzgebiete (Stand Februar 2017). Die Abweichung der Anzahl der Schutzgebiete zwischen der Grünen Liste und dieser Liste ist in vernachlässigbaren Überschneidungen begründet. Das größte Naturschutzgebiet im Bezirk ist die Isarmündung.

| Name | Bild | Kennung | Kreis | Einzelheiten | Position | Fläche Hektar | Datum |
| - | - | - | - | - | - | - | - |
| Haidfilz | | NSG-00182.01 WDPA: 81801 | Landkreis Freyung-Grafenau | | ⊙ | 38,73 | 1983 |
| Hochwald | | NSG-00184.01 WDPA: 81901 | Landkreis Freyung-Grafenau | | ⊙ | 268,67 | 1983 |
| Mitternacher Ohe | | NSG-00240.01 WDPA: 164637 | Landkreis Freyung-Grafenau, Landkreis Regen | LK Freyung-Grafenau 76,70 ha, LK Regen 30,28 ha | ⊙ | 106,98 | 1985 |
| Moorwald bei Kirchl | | NSG-00180.01 WDPA: 82180 | Landkreis Freyung-Grafenau | | ⊙ | 7,90 | 1983 |
| Obere Ilz | | NSG-00535.01 WDPA: 164864 | Landkreis Freyung-Grafenau, Landkreis Passau | LK Freyung-Grafenau 286,38 ha, LK Passau 81,42 ha | ⊙ | 367,80 | 1997 |
| Saußbachleite | | NSG-00025.01 WDPA: 82501 | Landkreis Freyung-Grafenau | | ⊙ | 20,47 | 1939 |
| Urwald am Dreisessel | BW | NSG-00003.01 WDPA: 82763 | Landkreis Freyung-Grafenau | Neureichenau Urwaldrest. | ⊙ | 3,80 | 1938 |
| Zwicklfilz | | NSG-00017.01 WDPA: 82966 | Landkreis Freyung-Grafenau | Philippsreut | ⊙ | 6,45 | 1939 |
| Altlaufsenke zwischen äußerem Mühlgraben und Kühmoos | | NSG-00263.01 WDPA: 162126 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 0,77 | 1985 |
| Donaualtwasser Staatshaufen | | NSG-00196.01 WDPA: 81537 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 57,90 | 1994 |
| Donaualtwasser Winzerer Letten | | NSG-00330.01 WDPA: 162779 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 62,23 | 1983 |
| Forchenhügel und Moosleiten | | NSG-00741.01 WDPA: 389591 | Landkreis Deggendorf, Landkreis Passau | LK Deggendorf 94,06 ha, LK Passau 60,15 ha | ⊙ | 154,21 | 2007 |
| Hoiberhügel | | NSG-00741.02 WDPA: 389603 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 90,04 | 2007 |
| Isaraltwasser bei Neutiefenweg | | NSG-00210.01 WDPA: 163925 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 36,91 | 1984 |
| Isarmündung | | NSG-00369.01 WDPA: 163929 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 807,74 | 1990 |
| Runstwiesen und Totenmoos | | NSG-00568.01 WDPA: 319024 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 149,43 | 2000 |
| Schuttholzer Moor | | NSG-00189.01 WDPA: 82558 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 15,75 | 1983 |
| Stockhügel und Auerbach | | NSG-00741.04 WDPA: 389979 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 6,02 | 2007 |
| Todtenau und umgebende Auen | | NSG-00188.01 WDPA: 82719 | Landkreis Deggendorf, Landkreis Regen | LK Deggendorf 6,71 ha, LK Regen 138,11 ha | ⊙ | 144,82 | 1983 |
| Vogelfreistätte Graureiherkolonie bei Kleinschwarzach | | NSG-00338.01 WDPA: 166072 | Landkreis Deggendorf, Landkreis Straubing-Bogen | LK Deggendorf 27,29 ha, LK Straubing-Bogen 35,78 ha | ⊙ | 63,07 | 1988 |
| Deggendorfer Himmelreich | | NSG-00752.01 WDPA: 555560671 | Landkreis Deggendorf | | ⊙ | 103,953 | 2012 |
| Isaraltwasser- und Brennenbereich bei Mamming | | NSG-00486.01 WDPA: 163926 | Landkreis Dingolfing-Landau | | ⊙ | 51,41 | 1994 |
| Isarauen bei Goben | | NSG-00461.01 WDPA: 163927 | Landkreis Dingolfing-Landau | | ⊙ | 75,07 | 1994 |
| Magerstandorte bei Rosenau | | NSG-00462.01 WDPA: 164536 | Landkreis Dingolfing-Landau | | ⊙ | 9,57 | 1994 |
| Rosenau | | NSG-00449.01 WDPA: 82439 | Landkreis Dingolfing-Landau | | ⊙ | 10,65 | 1993 |
| Vilstal bei Marklkofen | | NSG-00220.01 WDPA: 166061 | Landkreis Dingolfing-Landau | | ⊙ | 171,94 | 1984 |
| Walperstettener Quellmoor | BW | NSG-00474.01 WDPA: 166164 | Landkreis Dingolfing-Landau | | ⊙ | 4,19 | 1994 |
| Binnendünen bei Siegenburg und Offenstetten | | NSG-00221.01 WDPA: 162422 | Landkreis Kelheim | Siegenburg , Abensberg Flugsand-, Decksand- und Terrassensandvorkommen. | ⊙ | 25,14 | 1984 |
| Goldau | | NSG-00203.01 WDPA: 163270 | Landkreis Kelheim | Neustadt an der Donau Altwasser und Schilfröhrichte. | ⊙ | 24,59 | 1984 |
| Hirschberg und Altmühlleiten | BW | NSG-00503.01 WDPA: 163698 | Landkreis Kelheim | | ⊙ | 374,98 | 1995 |
| Klamm und Kastlhäng | | NSG-00088.01 WDPA: 82070 | Landkreis Kelheim | | ⊙ | 250,15 | 1969 |
| Ludwigshain | BW | NSG-00008.01 WDPA: 82117 | Landkreis Kelheim | Hienheim Waldteil. | ⊙ | 2,16 | 1939 |
| Mattinger Hänge | | NSG-00037.01 WDPA: 82144 | Landkreis Kelheim, Landkreis Regensburg | Matting Bewaldete Hangleite mit markanten Felsformationen. LK Kelheim 11,25 ha, LK Regensburg 48,05 ha | ⊙ | 59,30 | 1941 |
| Niedermoor südlich Niederleierndorf | BW | NSG-00212.01 WDPA: 164808 | Landkreis Kelheim | | ⊙ | 62,15 | 1984 |
| Sandharlander Heide | | NSG-00090.01 WDPA: 82486 | Landkreis Kelheim | | ⊙ | 11,12 | 1970 |
| Schloß Prunn | | NSG-00075.01 WDPA: 82527 | Landkreis Kelheim | Riedenburg Die zur Altmühl abfallenden Jurahänge zwischen den Orten Prunn und Pillhausen mit dem Mittelpunkt „Schloss Prunn“. | ⊙ | 77,46 | 1956 |
| Schulerloch | | NSG-00087.01 WDPA: 82557 | Landkreis Kelheim | Essing Steppenheidewald, Kalk-Buchenwald und Karsthöhle. | ⊙ | 12,67 | 1968 |
| Sippenauer Moor | | NSG-00009.01 WDPA: 82597 | Landkreis Kelheim | Mitterfecking Einzigartiges Schwefelquell-Moor am Randbereich der Alb. | ⊙ | 8,72 | 1939 |
| Ehemaliger NATO-Übungsplatz Siegenburg | | NSG-00755.01 WDPA: 555595783 | Landkreis Kelheim | Siegenburg | ⊙ | 273,71 | 2015 |
| Weltenburger Enge | | NSG-00089.01 WDPA: 6977 | Landkreis Kelheim | Kelheim Das Donautal von Weltenburg bis Kelheim. | ⊙ | 559,25 | 1970 |
| Ehemaliger Standortübungsplatz Landshut mit Isarleite | | NSG-00593.01 WDPA: 318323 | Landshut | | ⊙ | 278,93 | 1982 |
| Vogelfreistätte Mittlere Isarstauseen | | NSG-00170.01 WDPA: 82804 | Landkreis Freising, Landkreis Landshut | LK Freising 191,12 ha, LK Landshut 399,13 ha | ⊙ | 590,25 | 23. Sep. 1982 |
| Audobel | BW | NSG-00741.03 WDPA: 389576 | Landkreis Passau | | ⊙ | 8,97 | 2007 |
| Halser Ilzschleifen | | NSG-00456.01 WDPA: 163505 | Passau, Landkreis Passau | Stadt Passau 54,16 ha, LK Passau 35,30 ha | ⊙ | 89,46 | 1993 |
| Unterer Inn | | NSG-00094.01 WDPA: 82753 | Landkreis Passau, Landkreis Rottal-Inn | LK Passau 260,74 ha, LK Rottal-Inn 438,50 ha | ⊙ | 699,24 | 1972 |
| Vils-Engtal | | NSG-00533.01 WDPA: 166060 | Landkreis Passau | Vilshofen an der Donau | ⊙ | 78,54 | 1997 |
| Donauleiten von Passau bis Jochenstein | | NSG-00277.01 WDPA: 162782 | Passau, Landkreis Passau | Stadt Passau 17,65 ha, Landkreis Passau 373,61 ha | ⊙ | 391,26 | 1987 |
| Bachlerner Moos | | NSG-00626.01 WDPA: 318152 | Landkreis Regen | | ⊙ | 8,65 | 1993 |
| Birkenbruchwald Oed | | NSG-00214.01 WDPA: 162431 | Landkreis Regen | | ⊙ | 18,77 | 1984 |
| Großer Arbersee und Arberseewand | | NSG-00021.01 WDPA: 163348 | Landkreis Regen | | ⊙ | 148,57 | 1939 |
| Großer Pfahl und Pfahlriegel St. Antoniuspfahl | | NSG-00012.01 WDPA: 81769 | Landkreis Regen | Der Pfahl, ein Höhenzug im Bayerischen Wald Viechtach | ⊙ | 24,03 | 1939 |
| Hof-Pfahl | | NSG-00013.01 WDPA: 81905 | Landkreis Regen | Allersdorf | ⊙ | 15,93 | 1939 |
| Kiesau | | NSG-00448.01 WDPA: 164068 | Landkreis Regen | | ⊙ | 9,59 | 1993 |
| Moosbacher Pfahl | | NSG-00011.01 WDPA: 82182 | Landkreis Regen | Moosbach | ⊙ | 10,98 | 1939 |
| Pfahl bei der Ruine Weißenstein | | NSG-00028.01 WDPA: 82319 | Landkreis Regen | Ruine Weißenstein | ⊙ | 4,61 | 1940 |
| Riesloch | | NSG-00016.01 WDPA: 318989 | Landkreis Regen | Bodenmais | ⊙ | 33,40 | 1939 |
| Rotfilz | | NSG-00095.01 WDPA: 82449 | Landkreis Regen | | ⊙ | 12,88 | 1973 |
| Stockau-Wiesen | | NSG-00134.01 WDPA: 82647 | Landkreis Regen | Zwiesel | ⊙ | 10,99 | 1980 |
| Stockwiesen bei Schollenried | | NSG-00178.01 WDPA: 82650 | Landkreis Regen | | ⊙ | 12,33 | 1983 |
| Vogelfreistätte Salzachmündung | | NSG-00419.01 WDPA: 166076 | Landkreis Altötting, Landkreis Rottal-Inn | LK Altötting 288,03 ha, LK Rottal-Inn 281,51 ha | ⊙ | 569,54 | 1992 |
| Öberauer Donauschleife | | NSG-00288.01 WDPA: 164857 | Straubing, Landkreis Straubing-Bogen | Stadt Straubing 230,02 ha, LK Straubing-Bogen 60,57 ha | ⊙ | 290,59 | 1986 |
| Bogenberg | | NSG-00074.01 WDPA: 81433 | Landkreis Straubing-Bogen | | ⊙ | 7,77 | 1998 |
| Brandmoos | | NSG-00137.01 WDPA: 81450 | Landkreis Straubing-Bogen | | ⊙ | 26,17 | 1996 |
| Buch- und Helmberg bei Münster | | NSG-00555.01 WDPA: 318251 | Landkreis Straubing-Bogen | Kalkschollen im Gäuboden südlich von Münster (Steinach). Teilflächen Buch- (2,95 ha) und Helmberg (ca. 12 ha). | ⊙ | 15,29 | 1994 |
| Donauauen bei Stadldorf | | NSG-00315.01 WDPA: 162781 | Landkreis Straubing-Bogen | Kirchroth Naturnahe, altwasserreiche Abschnitte der Donauaue mit Weichholzauen-Vegetation im Auflandungsbereich des Deichvorlandes. | ⊙ | 89,52 | 1992 |
| Weiherlandschaft bei Wiesenfelden | | NSG-00622.01 WDPA: 319299 | Landkreis Straubing-Bogen | | ⊙ | 77,05 | 2003 |
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