हालांकि यूनिक्स अभिगम नियंत्रण प्रक्रिया समझने में काफी आसान है, इसे लागू करना काफी आसान है और बहुत लचीलेपन के होते हैं, इस तरह में चीजें हो जाती हैं, सुरक्षा की बात आते ही यूनिक्स के अभिगम नियंत्रण प्रक्रिया में काफी दिक्कतें आती हैं मुख्य समस्याओं में यह है कि मूल उपयोगकर्ता लगभग कुछ भी कर सकता है, तो यह फ़ाइलों को पढ़ और संशोधित या बना सकता है, यह किसी भी फाइल को पढ़ सकता है या हटा सकता है या संशोधित कर सकता है, यह किसी भी विशेष फाइलों के स्वामी से स्वतंत्र किसी भी फाइल को पढ़ या निष्पादित कर सकता है।
যদিও ইউনিক্স অ্যাক্সেস কন্ট্রোল মেকানিজমগুলি বোঝা বেশ সহজ, বাস্তবায়ন করা বেশ সহজ এবং পারমিটগুলি অনেক নমনীয়ভাবে, জিনিসগুলি সম্পন্ন করা হয়। নিরাপত্তার ক্ষেত্রে ইউনিক্স অ্যাক্সেস কন্ট্রোল মেকানিজমগুলিতে এখনও অনেক সমস্যা রয়েছে। একটি প্রধান সমস্যা হল যে রুট প্রায় সব কিছু করতে পারে, তাই এটি ফাইলগুলি পড়তে এবং পরিবর্তন করতে বা তৈরি করতে পারে। এটি ফাইল মুছে ফেলতে বা পরিবর্তন করতে পারে, এটি যেকোন ফাইল পড়তে বা চালাতে পারে, সেই নির্দিষ্ট নথি পত্রগুলির মালিকের থেকে স্বাধীন।