ફાયરવોલ્સ ઇન્સ્ટોલ કરવા, ડીનાઈલ ઓફ સર્વિસ અટેક સાથે વ્યવહાર કરવા, ડેટા લેયરમાં નિયંત્રક અને ફોરવર્ડિંગ ડિવાઇસેસ વચ્ચે વિશ્વસનીય સુરક્ષિત જોડાણ પ્રદાન કરવા જેવા સલામતીના મુદ્દા, આ કેટલાક વિવિધ સુરક્ષા મુદ્દાઓ છે જે એસડીએનના સંદર્ભમાં પણ ચિંતાનો વિષય છે.
सुरक्षा मुद्दे जैसेफ़ायरवॉल स्थापित  करना, डिनायल ऑफ सर्विस अटैक से डील करना, कंट्रोलर और  डाटा लेयर में मौजूदफॉरवर्डिंग डिवाइस के बीच विश्वसनीय सुरक्षित कनेक्शन देना| ये कुछ ऐसे विभिन्न सुरक्षा मुद्दे हैं जो एसडीएन के संदर्भ में भी चिंता का विषय हैं।