हालांकि यूनिक्स अभिगम नियंत्रण प्रक्रिया समझने में काफी आसान है, इसे लागू करना काफी आसान है और बहुत लचीलेपन के होते हैं, इस तरह में चीजें हो जाती हैं, सुरक्षा की बात आते ही यूनिक्स के अभिगम नियंत्रण प्रक्रिया में काफी दिक्कतें आती हैं मुख्य समस्याओं में यह है कि मूल उपयोगकर्ता लगभग कुछ भी कर सकता है, तो यह फ़ाइलों को पढ़ और संशोधित या बना सकता है, यह किसी भी फाइल को पढ़ सकता है या हटा सकता है या संशोधित कर सकता है, यह किसी भी विशेष फाइलों के स्वामी से स्वतंत्र किसी भी फाइल को पढ़ या निष्पादित कर सकता है।
युनिक्स access control mechanisms समजण्यास अगदी सुलभ आहेत, अंमलबजावणी करणे अगदी सोपे आहे आणि परवानग्या मुळे त्या मार्गाने बर् याच प्रमाणात लवचिकता आहेत त्यामुळे बऱ्याच गोष्टी केल्या जातात, Unix access control mechanisms मध्ये सुरक्षेची बातमी येते तेव्हा अजूनही बर् याच अडचणी असतात. मुख्य समस्या अशी आहे की रूट जवळजवळ काहीही करू शकते, म्हणून ते फायली वाचू किंवा सुधारित करू शकते किंवा तयार करू शकते, तसेच ते कोणत्याही फायली वाचू शकते किंवा फायली हटवू किंवा सुधारित करू शकते, त्या स्वतंत्र फायली वाचू किंवा अंमलात आणू शकते, त्याही विशिष्ट मालकांशिवाय.