8 Å का एक गोला बनाना है और फिर उस 8 Å के घेरे में आने वाले रेसिड्यूज को पहचानना है और बाद में जो भी वैल्यू मिलेगी उसे रखना है एक ही प्रोटीन में विभिन्न अमीनो एसिड रेसिड्यूज हो सकते हैं या एक ही अमीनो एसिड रेसिड्यू विभिन्न जगहों पर हो सकता है तो इस प्रकार हमें भिन्न-भिन्न वैल्यूज प्राप्त होंगी. औसत लेंगे तो आपको औसत वैल्यू मिलेगी और फिर आपको 20 विभिन्न अमीनो एसिड रेसिड्यूज के लिए वैल्यू मिलेगी . यदि इन संख्याओं को देखेंगे और प्रयोग से प्राप्त हुई संख्या को भी देखेंगे तो उसमें आपको कुछ में संबंध मिलेगा और कुछ का व्यवहार अलग होगा यह प्रोटीन एनवायरमेंट मे रेसिड्यूज की जगह पर निर्भर करता है इस प्रकार हम हाइड्रोफोबिसिटी की गणना कर सकते हैं और हाइड्रोफोबिसिटी पैरामीटर प्रोटीन स्ट्रक्चर और प्रोटीन कार्य में बहुत उपयोगी है.
சுற்றியுள்ள மூலக்கூறுகளை எடுத்துக்கொள்ளவும் 8A  உருளையை எடுத்துக்கொண்டு இந்த  லிமிட்டில் உள்ள மூலக்கூறுகளை கண்டுபிடித்து அதன்பின் அதன் மதிப்புகளை எடுத்து கணக்கிட்டால் நம்மால் அதன் ஹைட்ரோபோபசிட்டி மதிப்பை கண்டுபிடிக்க முடியும் ஆகவே 20 வெவ்வேறு மதிப்புகளை ஒருபுறத்தில் வெவ்வேறு அமினோ அமிலங்கள் அல்லது ஒரே அமினோ அமிலங்கள் வெவ்வேறு இடங்களில் அமைந்திருக்கும் போது நாம் கண்டுகொள்ளலாம் அவற்றின் சராசரி மதிப்புகளை எடுத்துக்கொண்டு பார்த்தால் வெவ்வேறு மதிப்புகள் கிடைக்கும் இந்த எண்களை பார்க்கும் போது அதனுடைய சோதனை மதிப்புகளையும் உற்றுப்பார்த்தால் சில மூலக்கூறுகள் ஒத்துப்போகும் சில மூலக்கூறுகள் அதன் தன்மையிலிருந்து வேறுபடும் அது அது அந்த புரதத்தில் அமைந்துள்ள இடத்தைப் பொறுத்தது இதுபோன்று ஹைடிராப்ஹோபிசிஐடி நாம் எளிதாக கணக்கிட்டு அதனை புரத கட்டமைப்பைப் பெறுவதற்கு பயன்படுத்தலாம்