So, for example, there are some helices in the N terminal in the first protein, and the C terminal second protein if they have same contact map or similar contact map then they can be aligned together in 3 D structures.
எனவே, எடுத்துக்காட்டாக, முதல் புரதத்தில் N முனையத்தில் சில ஹெலிக்ஸ்களும் , இரண்டாவது புரதத்தின் C முனையம் ஒரே காண்டாக்ட் மேப் அல்லது ஒத்த காண்டாக்ட் மேப் கொண்டிருந்தால் அவை 3 டி கட்டமைப்புகளில் ஒன்றாக சீரமைக்கப்படலாம்.