पहली बात जिस पर हम ध्यान केंद्रित करने जा रहे हैं, वह विभिन्न अणुओं में विभिन्न प्रोटॉन के pKa का अनुमान लगा रहा है और कैसे उन pKa की संरचना से संबंधित है।
முதலாவதாக மூலக்கூறுகளில் உள்ள வெவ்வேறு புரோட்டான்களின் pKa மதிப்புகளை கண்டறிவதன் மூலம் அவை மூலக் கூறுகளின் வடிவமைப்புடன் எவ்வாறு தொடர்புடையது என்பதை காணலாம்.