इसलिए, आसानी से आप गणना कर सकते हैं यदि हमारे पास 3 Dस्ट्रक्चरस हैं, तो आप हाइड्रोफोबिक फ्रीएनर्जी की गणना कर सकते हैं, यहां तक   कि आप PDBparam का उपयोग कर सकते हैं; यह वह सर्वर है जो पचास से अधिक स्ट्रक्चर आधारित पैरामीटर्स की गणना करता है जिससे आप ज्ञात स्ट्रक्चरस के किसी भी प्रोटीन के लिए हाइड्रोफोबिक फ्री एनर्जी प्राप्त कर सकते हैं।
எனவே எங்களிடம் 3D கட்டமைப்புகள் இருந்தால் ஹைட்ரோபோபிக் இலவச ஆற்றல் கூட நீங்கள் கணக்கிடலாம். நீங்கள் பி. டி. பி பராமைப் பயன்படுத்தலாம்.