Рассматривается разработка перспективной стратегии использования бактериофагов в борьбе с опасными патогенными «супербактериями» из группы ESKAPE, в частности Staphylococcus aureus. В качестве нового подхода в поиске таргетных (штаммоспецифичных) бактериофагов предлагается их скрининг через структуры CRISPR/Cas-систем бактерий с использованием разработанного алгоритма из поисковых программных методов биоинформатики. С его помощью исследована структура CRISPR/Cas-системы в геноме штамма S. aureus ST228. Разработанный программный алгоритм поиска локусов CRISPR/Cas-систем позволяет определять степень устойчивости бактерий к специфичным бактериофагам, что должно обеспечить эффективность таргетной фаговой терапии инфекций, вызываемых «супербактериями».
программные методы биоинформатики, спейсеры, повторы, протоспейсеры