В молекулярных системах с водородными связями может иметь место механизм релаксации, обусловленный перераспределением протонов между их устойчивыми положениями в двухъямном потенциале на линиях водородных связей. Такое перераспределение происходит в ответ на изменение электронного состояния молекулярной системы, сопровождающееся изменением параметров двухъямного потенциала водородной связи. Особенностью процесса является то, что перераспределение протонов осуществляется благодаря их туннельному переносу вдоль линии связей. На примере реакции рекомбинации <nobr>$\mathrm{P}^+\mathrm{Q}_A^- \to\mathrm{PQ}_A$</nobr> в РЦ <i>Rhodobacter sphaeroides</i> показано, что данный релаксационный процесс может определять температурную зависимость энергетических параметров этой реакции (разности свободной энергии <nobr>$\Delta G$</nobr> и/или энергии реорганизации среды <nobr>$\lambda$</nobr>).
водородные связи, электронный транспорт, протонная релаксация