God Eater animesinde, 2071 Japonya’sında dünya Aragami adı verilen gizemli yaratıklar tarafından neredeyse yok edilmenin eşiğine gelmiştir. Korunaklı bölgede hüküm süren Fenrir adındaki örgüt Aragamileri temizlemek ve onlardan elde ettikleri çekirdeklerle yeni bir yaşam alanı oluşturacak bir proje yürütmektedir. Fenrir bünyesinde görev alan bağışıklığı yüksek olan God Eater adı verilen kişiler, kullandıkları God Arcs ismi verilen silahları kullanmaktadır. Utsugi Lenka’da korunaklı bölgenin dışında kalan topraklarda yaşamını devam ettirirken birgün Fenrir tarafından teste tabi tutulur ve God Eater olarak korunaklı bölgeye alınır. Eğitimini tamamlayan Lenka, efsane ekip adı verilen öncü tim ile Aragami avlamanın hayallerini kurmaya başlar. Acaba Lenka’nın başına neler gelecektir?