Daire Başkanlığımız Bakanlar Kurulu’nun 17 Mart 2006 tarih ve 5467 sayılı kanunu ile üniversitemizin bünyesinde kurulmuş bulunmaktadır.2007 mali yılı Aralık ayına dek Ondokuz Mayıs Üniversitesi İdari ve Mali İşler Daire Başkanlığı binasında faaliyet gösteren başkanlığımız, personelimizin geçici görev ve eğitimini tamamlaması üzerine bu tarihten sonra çalışmalarını yeni kurulan Ordu Üniversitesi Rektörlüğü Cumhuriyet Kampusunda sürdürmeye devam etmiştir.