Fetal EKO, anne karnındaki fetusun, kalp incelemesinin yapılmasıdır. Yetişkinde yapılan EKO prensipleriyle yapılır. Fetusun kalbinin tüm fonksiyonları ve görüntülemesine ultrason eşliğinde bakılır. En ideal zaman 18-23 hafta arasıdır ve detaylı organ taraması sırasında ya da ayrı bir inceleme olarak yapılır. Bazen kendi doktorunuz da yapabilir ya da sizi bir pediatrik kardiyolog ya da perinatolojiste yönlendirebilir. Fetusun kalbinde bir anormallikten şüphelenildiğinde veya 11- 14 hafta arası yapılan ense kalınlığı ölçümünün yüksek bulunduğu durumlarda yapılır. Kalp boşlukları, kalp kapakçıkları, büyük damar çıkışları, kalbin aksı, ritmi değerlendirilir. Bir anormallik saptanması durumunda, bebek doğar doğmaz müdahale edilebilmesi için pediatrik kardiyolog ya da kalp-damar cerrahisine yönlendirilir.