Tasarı, Vakıfbank'la ilgili de önemli düzenlemeler içeriyor. Buna göre, Vakıflar Genel Müdürlüğü'nün bankada idare ve temsil ettiği (A) ve (B) grubu hisselerden yüzde 58.5'i Hazine Müsteşarlığı'na devredilecek. Böylece, temettü ödemelerinin banka bünyesinde kalması sağlanacak. Düzenlemeyle devir sonrası hukuki rejiminin kamu bankalarına uyumu sağlanıyor. Böylece bankanın halka açıklık oranı artırılacak. Ziraat Bankası'nın ardından Vakıfbank da katılım bankacılığı sistemine girecek. Vakıfbank'ın, yönetim kurulu 9 üyeden oluşacak. Yönetim kurulu üyeleri genel kurul tarafından seçilecek.