These fluorophores are vulnerable to photobleaching, have low signal intensity, and overlapping spectra which restrict their use, particularly in multispectral bioimaging
तसेच त्यांच्या सिग्नलची तीव्रता कमी आणि ओव्हरलॅपिंग स्पेक्ट्रामुळे त्यांच्या वापरावर मर्यादा येतात. विशेषतः मल्टीस्पेक्ट्रल जैवप्रतिमा विकसित करताना प्रतिबंध येतात.