许昌县人民检察院指控：被告人王某甲在担任许昌县农业综合开发办公室任副主任期间，负责农业综合开发产业化项目的申报、检查、验收工作。在其负责的2012年“许昌县2000头无公害肉牛养殖小区扩建项目”的检查、验收工作中，在明知不符合相关文件规定及上级部门要求情况下，为不应被验收合格的建设项目出具了验收合格手续，为企业非法骗取国家补贴资金提供便利条件，致使许昌县金牛肉牛专业合作社非法骗取了国家的专项补贴资金人民币56万某，给国家造成了重大经济损失。上述事实有被告人的供述、证人证言、书证等证据证实，被告人王某甲的行为已构成××罪，请依法惩处。