公诉机关指控，2012年5月至2014年1月，被告人王某某在担任上海光华仪表有限公司财务经理期间，在无实际业务往来的情况下，以支付开票费的方式通过饶某某（另案处理）虚开抚州现代物流有限公司等3家公司的公路、内河货物运输业统一发票共计15份、广昌县富华物流有限公司等3家公司的货物运输业增值税专用发票6份，其中公路、内河货物运输业统一发票税款共计人民币59，185元，货物运输业增值税专用发票税款共计人民币40，660.35元，上述税款均已向税务机关申报抵扣。2014年3月10日，被告人王某某至公安机关投案。