南宫市人民检察院指控：2014年4月，被告人侯某甲在南宫市吴村乡郝屯村弘旺棉业公司租赁的厂房内非法经营电镀锌作坊，将生产电镀汽车滤芯壳的废水直接排入院内私挖的渗水坑内。4月13日16时许，被南宫市公安局查获。经邢台市环境监测站检测、河北省环保厅认证：侯某甲排放的废水总锌含量1149mg／L，锌含量严重超标。公诉机关就指控的上述事实，当庭宣读和出示了现场勘查笔录、现场方位图和照片、鉴定意见、证人证言、被告人供述等证据。认为被告人侯某甲无视国家法律，将严重超过国家排放标准的含有重金属的工业废水直接排入私挖的渗井内，严重××，其行为触犯了《中华人民共和国刑法》××的规定，应当以××罪追究其刑事责任。鉴于被告人侯某甲有自首情节，根据《中华人民共和国刑法》××之规定，可以从轻或者减轻处罚。提请本院依法判处。