公诉机关指控：2014年12月期间，被告人申某某在经营上海某某有限公司期间，以支付票面金额8.5％开票费的方式，通过他人为被告单位虚开了出票单位为某某有限公司的增值税专用发票2份，价税合计人民币233，600.00元，涉及税款人民币33，941.88元，已全部向税务机关申报抵扣。2015年12月14日，被告人申某某至公安机关投案，到案后，其如实供述了上述事实。案发后，被告单位上海某某有限公司已补缴了全部税款。