公诉机关指控：被告人杨某某于2011年4月至7月、2013年4月份，在时任政策法规科科长期间，在审核抚顺市广博物资有限公司等六家公司一般纳税人资格以及抚顺东拓矿产品销售有限公司和抚顺丰洲矿产品销售有限公司最高开票限额一百万元专用发票申请时，严重不负责任，未认真审查，通过了上述企业申请，致使上述企业对外虚开增值税专用发票，给国家造成损失共计111,414,548.68元。公诉机关据此指控被告人杨某某犯××罪，建议依照《中华人民共和国刑法》××××对其定罪处罚，并向法庭出示了相关证据。