公诉机关指控的犯罪事实是：被告人董某于2007年12月至2014年2月担任太谷县国土资源局某管理中心所副所长、某白乡某某村巡查包片责任人。2010年8月，太谷县某白乡某某村村民田某某、乔某某在某某村某宝元坟地开始非法挖土，9月28日在被太谷县国土资源局某管理中心所工作人员巡查发现下达了责令停止违法行为通知书后仍继续挖土，截止2011年3月太谷县国土资源局某管理中心所向太谷县国土资源局上报田某某非法挖土违法行为时，已造成基本农田14.25亩被破坏。2014年10月16日，晋中市国土资源局会同晋中市农业局有关专家共同对太谷县某白乡某某村擅自挖损耕地现场进行了审核，经市耕地破坏程度鉴定委员会审核认定，共挖损土地面积45.33亩（基本农田43.89亩、农村道路1.44亩），后经太谷县价格认证中心鉴定，损毁的土地价值349280元。对于上述犯罪事实，公诉机关提供了相关证据予以证明。据此，公诉机关认为被告人董某作为太谷县国土资源局某管理中心所副所长、某白乡某某村巡查包片责任人，工作严重不负责任，对太谷县某白乡某某村村民非法挖土的行为监管不到位，致使基本农田大量被损毁，造成重大损失，其行为已触犯《中华人民共和国刑法》××××之规定，应以××罪追究其刑事责任。