古蔺县人民检察院指控：2016年12月至2017年6月初，被告人刘某在经营其位于古蔺县的生猪、肉牛养殖场期间，擅自将自家及养殖场产生的人畜粪便污水在未经无害化处理的情况下，通过PVC管道持续排入养殖场附近的溶洞（渗井）内，致使丹桂镇位于该村小地名“大某角”的集中式饮用水源受到污染。2017年6月6日晚，丹桂镇供水站在发现该情况后，立即中断了“大某角”饮用水源取水，并在丹桂镇场镇采取分时段、定点供水措施。后，该镇于6月8日下午18时全面恢复供水，“大某角”饮用水源至今未恢复取水。经四川省煤田地质局一三五队勘查，该养殖场排放废物的干溶洞与其下方的丹桂镇饮用水取水点岩溶泉通过地下岩溶管道存在连通关系。经古蔺县环境监测站监测，该养殖场2017年6月7日外排污水监测项目中化学需氧量、氨氮、悬浮物和总磷均不符合《畜禽养殖业污染物排放标准》（GB18596-2001）表5排放限值规定，其中化学需氧量超标21.7倍，氨氮超标9倍，悬浮物超标1.6倍，总磷超标8.2倍。当日丹桂镇现龙村七组饮用水源（溶洞地下水）监测项目中，氨氮超标3倍。经古蔺县疾病预防控制中心监测，2017年6月7日丹桂镇现龙村七组“大某角”水源地出厂水菌落总数、总大肠菌群、臭和味检测项目单项判定不合格；丹桂镇新街管网末梢水的菌落总数、总大肠菌群检测项目单项判定不合格。2017年8月1日，侦查人员在古蔺县刘某家中将其抓获。公诉机关认为，被告人刘某违反国家规定，排放有害物质，严重××，其行为已触犯《中华人民共和国刑法》××之规定，应当以××罪追究其刑事责任；其到案后如实供述犯罪事实，系坦白，可以从轻处罚；其系处罚，案发后积极采取整改措施，减少污染影响，认罪悔罪态度较好，可以酌情从轻处罚；可以适用××。为证明上述事实，公诉机关向本院提供了相应证据予以证实。