湖南省宁乡县人民检察院指控：2012年6月份，时任湖南湘路机械科技有限公司（以下简称“湘路公司”）总经理的被告人李某甲在明知湘路公司不具备申报资质的前提下，为了申报后获得公司的奖金，经湘路公司法人代表沈1某同意，与湘路公司副总经理李某乙、总经理助理罗某某（均另案处理）通过变造“长环某[2010]93号”文件、“宁国土预审字[2010]159号”文件的方式使不具备申报国家重大节能减排项目建设补贴资金（以下简称“专项补贴资金”）资格的湘路公司违规获得1000万某的补贴资金。该专项补贴资金到账后，汇入了由湘路公司与宁乡县发改局双控的银行账户中，湘路公司将专项补贴资金中的600万某套出并转入湘潭万马贸易公司账户中，并未按政策要求做到专项补贴资金专款专用。另外湘路公司拿出150万某作为申请该项目资金的咨询、协调费用转给被告人李某甲以其母亲及妹妹的名义注册的湖南鸿盛泽业有限公司的账上。案发后湘路公司退还了200万某。为证明上述事实，公诉机关提交了户籍证明、无犯罪证明、“湘发改环资[2013]1009号”文件、“长发改[2013]498号”文件、“关于做好部分项目中央预算内资金收缴工作的通知”及撤销项目表、审计取证单、招商银行收款回单、长环某[2010]93号、宁国土预审字[2010]159号、宁经规要字[2011]第037号文件、湘路公司环保节能型煤转气公路筑养路设备产业化项目申报材料、湘路公司企业注册登记资料、湖南鸿盛泽业项目管理有限公司工商信息档案资料、中国银行客户借记通知单、国内跨行大额汇款凭证、中国银行鸿盛公司账户交易明细、工程咨询合同及咨询费付款凭证、“关于湖南湘路机械科技有限公司项目审计的说明”、湘路公司薪酬、股权激励方案、湘路公司账户交易明细表及记账凭证等书证；鉴定意见；现场辨认笔录；证人沈1某、罗某某、李某乙、唐某、徐某证人证言；被告人李某甲的供述与辩解等证据予以证明。该院认为，被告人李某甲在担任湖南湘路机械科技有限公司总经理期间经公司法人代表沈2某同意，采用变造国家公文、隐瞒真相的手段为湖南湘路机械科技有限公司骗取国家专项补贴资金，数额特别巨大，其行为触犯了《中华人民共和国刑法》××，犯罪事实清楚，证据确实充分，应当以诈骗罪追究其刑事责任。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》××的规定，提起公诉。提请本院依法判处。