盐城市亭湖区人民检察院指控，2012年4月，xx市xx区xxxx总社应xx市xxxx有限公司（以下简称“xx公司”）的申请，为该公司申报2012年度江苏省新农村现代流通及供销合作发展xx资金（以下简称“xx资金”）。xx市xx区xxxx总社财计科科长被告人秦某某负责对xx资金申报材料的具体审核工作。在申报项目过程中，被告人秦某某未采取实地考察、委托审查等方式对xx公司申报专项资金项目内容的真实性、准确性进行审核，即将xx公司在项目投资、支出等方面存在弄虚作假的申报材料上报，致使2012年度江苏省的xx资金人民币90万元于2012年12月18日被xx公司获取，造成财政专项资金损失人民币90万元。2014年2月20日，被告人秦某某主动至盐城市亭湖区人民检察院投案，并如实供述了上述事实。公诉机关当庭讯问了被告人秦某某，宣读并出示了盐城市亭湖区人民检察院反渎职侵权局出具的发破案经过、归案经过及xx市xx区xxxx总社的职务任免通知、证人证言等证据。公诉机关认为被告人秦某某身为受国家机关委托行使国家行政管理职权的组织中从事公务的人员，工作中严重不负责任，不正确履行职责，致使国家利益遭受重大损失，其行为触犯了《中华人民共和国刑法》××××，犯罪事实清楚，证据确实、充分，应当以××罪追究其刑事责任。被告人秦某某案发后主动投案，并如实供述自己的罪行，根据《中华人民共和国刑法》××××的规定，系自首，可以从轻或减轻处罚。