公诉机关指控：一、××罪部分2009年至2013年，被告人李某甲在合江县农村能源土壤肥料生态管理站（以下简称土肥站）工作期间，伙同站长李某乙（另案处理）及工作人员林某某（另案处理），从该站负责实施的土壤有机质提升、退耕还林巩固成果基本口粮田建设、测土配方施肥、高标准良田建设等项目中，采用虚增工程量和虚假采购的方式套取国家专项资金，作为办公经费，私设小金库。从2010年起李某甲伙同站长李某乙、工作人员林某某私自以津补贴、加班费、过节费等名义将小金库的347250元发放给土肥站全体人员。其中，以2009年津补贴的名义发放67000元；以2010年津补贴名义发放120000元；以2010年测土配方施肥土样采集费名义发放19250元；以2011年土样采集和化验费名义发放30000元；以2011年中秋节、国庆节过节费名义发放7000元；以2012年加班费名义发放19000元；以2012年未休年休假补助发放25000元；以2013年补贴名义发放60000元。李某甲个人分得59450元。二、贪污罪部分2013年，被告人李某甲伙同土肥站站长李某乙、工作人员林某某，以三人工作量较大为由，在发放2012年未休年休假补助时私下每人多发10000元，在发放2013年津补贴时私下每人多发5000元，共同侵吞45000元。被告人李某甲在合江县纪委调查时，主动供述了自己的犯罪事实。为支持公诉，公诉机关出示了书证、证人证言、被告人供述和辩解、视听资料等证据材料。公诉机关认为，被告人李某甲身为国家工作人员，伙同他人以单位名义将国有资产集体私分给个人，数额较大的行为，应以××罪追究其刑事责任。被告人李某甲伙同他人利用职务上的便利，共同侵吞公共财物的行为，应以贪污罪追究刑事责任。被告人李某甲在接受纪委调查时，主动供述了纪委未掌握的所有犯罪事实，但在庭审中对三人协商××这一重要情节予以否认，不应认定为自首。被告人李某甲一人犯数罪，应对其实行数罪并罚。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》××的规定，提请依法判处。