In addition to the datasets, SILVA also developed an alignment tool called SINA SILVA Incremental Aligner, which can align hundred thousands of sequences based on a curated seed alignment. SINA uses a combination of &-mer searching and partial order alignment to maintain high alignment accuracy .
Además de las bases de datos, SILVA dispone del programa SILVA Incremental Aligner SINA, que permite alinear cientos de secuencias sobre la base de alineamiento semilla utilizando una combinación de búsqueda por k-meros y un alineamiento de orden parcial para mantener alta exactitud de alineación .