These include the environment and the immune, genetic, social and cultural characteristics of the host. It is also important to note that when considering the microorganism alone there are other factors in addition to determination of the type of cagA in a given population that must be considered. The features present in the motifs of the protein as well as the characteristics of cagPAI must be identified for the specific study population. In addition, the presence of other virulence factors of the microorganism independent of cagPAI that might be influence the pathogenesis of the bacterium must be verified or discarded.
Aunque en varios estudios se ha planteado la posible relación entre cepas cagA+ y el desenlace de la enfermedad, aún es materia investigación ya que el desenlace no solo depende exclusivamente del microorganismo, sino de varios factores adicionales, como es el ambiente, las características inmunes, genéticas, sociales y culturales del huésped; es importante tener presente que si dependiese solo del microorganismo, además de determinar cagA en una determinada población sería necesario determinar cuáles son las características presentes en los motivos de la proteína, así como también las de cagPAI específicamente para la población en estudio, y el análisis de la presencia de otros factores de virulencia del microorganismo independientes de cagPAI que pueden estar influenciando en la patogénesis de la bacteria.