While both databases can serve as reference for searching and comparing sequences using the BLAST algorithm, the nr/nt database is broader and contains the GenBank, European Bioinformatics Institute EMBL-EBI, DNA Databank of Japan DDBJ, and Protein Data Bank PDB sequence collections, as well as the NCBI Reference Sequence RefSeq database.
Si bien ambas bases de datos pueden servir como referencia para la búsqueda y comparación de secuencias nucleotídicas, mediante el algoritmo BLAST, la base de datos no redundante es más amplia y contiene las colecciones de secuencias del GenBank, del Instituto Europeo de Bioinformática EMBL-EBI, del Banco de Datos de ADN de Japón DDBJ, y del Banco de Datos de Proteínas PDB, además de las secuencias de referencia del NCBI RefSeq.