section_heading: Klupska karijera
paragraph_text: 26. kolovoza 2006., menadžer Bayern Münchena, Uli Hoeneß je najavio da se van Bommel pridružuje bavarskoj momčadi. Mediji su špekulirali da se transfer dogodio zbog odlaska Owena Hargreavesa, ali Hoeneß je to demantirao.<ref>  Bayern München je za van Bommela isplatio 6 milijuna € Barceloni. Od pridruživanja klubu, postao je jedan od ključnih igrača Bayerna. Nakon odlaska Olivera Kahna 2008. godine, van Bommel je izabran za novog kapetana kluba. On je drugi kapetan Bayerna ne-Nijemac, nakon Danca Sørena Lerbyja.