section_heading: Trans-Mississippi
paragraph_text: U južnim i zapadnim područjima države Missouri odvijali su se manji vojnički udari čiji je cilj bila kontrola indijanskog teritorija i teritorija Novog Meksika, a sve za stranu Unije. Konfederalni proboji u Novom Meksiku zaustavljeni su već 1862. godine, a prognana vlada iz Arizone povukla se u Teksas. Na indijanskom teritoriju građanski rat izbio je među plemenima. Oko 12 tisuća indijanskih ratnika borilo se za Konfederaciju, a manji broj za Uniju.<ref>William H. Graves, "Indian Soldiers for the Gray Army: Confederate Recruitment in Indian Territory," Chronicles of Oklahoma (1991.) 69#2, str.&nbsp;134-145. Najprominentniji Cherokee bio je brigadni general Stand Watie, inače posljednji general Konfederacije koji se predao.<ref>J. Frederick Neet, Jr. "Stand Watie: Confederate General in the Cherokee Nation," Great Plains Journal (1996.) 6#1, str. 36-51.