section_heading: 2. sezona
paragraph_text: Nedugo nakon, Jajić pronađe dnevnik Geralda Robotnika, njegovog djeda, i Geraldov stari projekt Shadow u vojnoj bazi. Nakon što ga oslobodi Jajić, Shadow se probije u muzej da ukrade smaragd, zbog čega Sonic završi u zatvoru. Amy ga spasi, ali Shadow, Jajić, i dvosmislena Rouge pobjegnu na Space Colony ARK, gdje Jajić svima poćne prijetiti da će iskoristiti tajno oružje zvano Eclipse Cannon da uništi Zemlju ako ne budu pratili njegovu vladavinu; on otpuca pola Mjeseca da pokaže svoju moć. Jajuć skupi sve smaragde da pojaća top, ali ovo aktivira program koji je Gerald napravio prije mnogo godina, zbog kojeg će Space Colony ARK pasti na Zemlju, što bi brzo uništilo planete. Gerald je ovo napravio kao osveta svim ljudima, koje je okrivio za smrt njegove unuke Marije nakon što ju je vlada ubila tijekom napada na Space Colony ARK. Svi rade zajedno da to zaustave osim Shadowa, tko se ne osjeća loše jer misli da je pomogao ostvarenjem Geraldove osvete. Chris se suoći sa Shadowom, i podsjeti ga na Marijinu posljednju želju, koja je bila da Shadow zaštiti sve ljude, da im pomogne i vodi. Pomaknut do suza i s novim osjećajem svrhe, Shadow se udruži sa Sonicom i oboje iskoriste smaragde i teleportiraju ARK daleko od Zemlje, no čini se da je Shadow bio ubijen kad je pao na Zemlju. Sonic, njegovi prijatelji, i Jajić promisle o Shadowovom žrtvovanju samog sebe i vrate se na Zemlju.