paragraph_text: Na ljeto 2013. godine prelazi u Bayer Leverkusen za 10 milijuna eura, najviši iznos koji je bavarska momčad dala u svojoj povijesti za nekog igrača.<ref> Phillip Quinn. Bayer Leverkusen sign Heung Min Son from Hamburg SB Nation, 14. lipnja 2013. (pristupljeno 15. srpnja 2018.)  Početkom studenog zabio je hat-trick u pobjedi nad bivšom momčadi iz Hamburga. Njegovi pogodci Borussiji i Bremenu osigurali su momčadi razigravanje za nastup u Ligi prvaka. Tijekom tri sezone u bavarskom prvoligašu odigrao je 62 utakmice i zabio 21 pogodak.