O etanol é considerado um biocombustível promissor, pois, sob o ponto de vista do balanço de carbono, possui uma taxa de emissão praticamente igual a zero. Entretanto, esse não é o único ciclo biogeoquímico associado à produção de etanol. O plantio da cana-de-açúcar, matéria-prima para a produção de etanol, envolve a adição de macronutrientes como enxofre, nitrogênio, fósforo e potássio, principais elementos envolvidos no crescimento de um vegetal. Revista Química Nova na Escola. no 28, 2008. 
O nitrogênio incorporado ao solo, como consequência da atividade descrita anteriormente, é transformado em nitrogênio ativo e afetará o meio ambiente, causando
o acúmulo de sais insolúveis, desencadeando um processo de salinificação do solo.
a eliminação de microorganismos existentes no solo responsáveis pelo processo de desnitrificação.
a contaminação de rios e lagos devido à alta solubilidade de íons como NO3− e NH4+ em água.
a diminuição do pH do solo pela presença de NH3, que reage com a água, formando o NH4OH(aq).
a diminuição da oxigenação do solo, uma vez que o nitrogênio ativo forma espécies químicas do tipo NO2, NO− , N2O.