A produção de biocombustíveis é resultado direto do fomento a pesquisas científicas em biotecnologia que ocorreu no Brasil nas últimas décadas. A escolha do vegetal a ser usado considera, entre outros aspectos, a produtividade da matéria-prima em termos de rendimento e custos associados. O etanol é produzido a partir da fermentação de carboidratos e quanto mais simples a molécula de glicídio, mais eficiente é o processo. 
O vegetal que apresenta maior eficiência no processo da produção do etanol é
o milho, pois apresenta sementes com alto teor de amido.
a mandioca, pois apresenta raízes com alto teor de celulose.
a soja, pois apresenta sementes com alto teor de glicogênio.
o feijão, pois apresenta sementes com alto teor de quitina.
a cana-de-açúcar, pois apresenta colmos com alto teor de sacarose.