Εκτός από το να γίνει κέντρο του δυτικού εμπορίου , το ναγκασάκι παρείχε μια σταθερή θέση στην Ιαπωνία για την καθολική εκκλησία σήμερα πολύ αναβιώσει μετά από 250 χρόνια βάναυσης καταστολής κάτω από τους σογκούν τοκουγκάουα .
Οι περισσότεροι από τους κατοίκους του ναγκασάκι μετατράπηκαν σε καθολικισμό .