Η ειδική μεθοδολογία ανάλυσης κινδύνου που χρησιμοποιείται μπορεί να διαφέρει από τον οργανισμό λόγω των διαφορών στις αποστολές των οργανισμών και της δυσκολίας σε ποιοτικά και ποσοτικά την επίπεδα κινδύνου .
Η μέθοδος ανάλυσης κινδύνου που χρησιμοποιείται είναι διαφορετική για κάθε υπηρεσία , διότι οι μεγάλες οργανώσεις έχουν διαφορετικές μεθόδους από τις μικρές .