Όσον αφορά την αιτιώδη συνάφεια , οι ερευνητές που χρησιμοποιούν μεθόδους μελέτης της περίπτωσης δεν μπορούν να βασίζονται σε γνωστούς τρόπους για να κυβερνών εναλλακτικές εξηγήσεις .
Ο μόνος τρόπος για να κανόνας εναλλακτικές εξηγήσεις χρησιμοποιώντας μεθόδους μελέτης περιπτώσεων , είναι η χρήση των τρόπων με τους οποίους είναι εξοικειωμένοι οι ερευνητές .