Πολύ πριν από την άφιξη των πρώτων Ευρωπαίων , το ναγκασάκι ήταν ένα σημαντικό επίκεντρο του εμπορίου της Ιαπωνίας με την Κίνα .
Μετά την παρουσία των Ευρωπαίων , το ναγκασάκι δεν διαδραμάτισε πλέον σημαντικό ρόλο στο εμπόριο της Ιαπωνίας με την Κίνα .