Εκτός από την αναγνώριση της σύνθετης ατμοσφαιρικής χημείας που σχετίζεται με ορισμένους ρύπους , η ποιότητα του ατμοσφαιρικού αέρα πρέπει επίσης να αντιμετωπίσει αβεβαιότητες που σχετίζονται με τη μεταβλητή μετεωρολογία και τη χωρική και χρονική κατανομή των εκπομπών .
Η ποιότητα του ατμοσφαιρικού αέρα δεν χρειάζεται να ερμηνεύσει την ατμοσφαιρική χημεία .