Ο Naiku ( εσωτερικός ναός ) είναι ο πιο σημαντικός από τους δύο ναούς , καθώς είναι αφιερωμένος στην αματεράσου , τη θεά του ήλιου και την υπέρτατη θεότητα του σίντο .
Το naiku είναι το πιο σημαντικό μέρος του ise .