ファクトリー・ノイズ&AG
雑音工房NOISE時代～FNAG社設立まで
雑音工房NOISEは、テクノソフトを退社した九十九百太郎が代表を務め、長崎繁（後のFNAG社専務プロデューサー）らが参加していた音楽制作サークルである。
同サークルはアダルトゲームや同人ゲームのBGMや主題歌制作を手掛けていた一方で、サンダーフォースシリーズの続編を独自に制作することを企画しており「project Thunder Force Ⅵ」の一環として、仮想サウンドトラック「BROKEN THUNDER」を発売している。同CD発売時に商品の受け渡しを巡って混乱が発生したこと、また九十九百太郎がサンダーフォースⅢ及びⅣの作曲に参加していたと虚偽の発言を行ったことを理由に、雑音工房NOISEは活動を停止し、九十九は活動を自粛することが発表された。
しかし、雑音工房NOISEはメンバーを変えず、NoBrandSounds（有限会社ノーブランドサウンズ、NBS）として法人化。長崎繁が代表を務め、支援を受けたライアーソフトを中心に楽曲を提供していた。2004年末に「ライアーソフトのイメージが強くなった」NBSとの差別化を図り、新規に有限会社ファクトリー・ノイズ&AG（FNAG）が設立されることになった。なお、2005年以降は主にマッツミュージックスタジオがライアーソフトへの楽曲提供を行っており、NBSはぼーん・ふりーくす!を最後に楽曲提供は行っていない。
BROKEN THUNDER発売まで
FNAG社はアダルトゲームに楽曲を提供する一方、自社のCDレーベルから東方アレンジCDや、活動を休止していたテクノソフトの作品のサウンドトラック（九十九百太郎の作品が中心）を続々と製作し、発表していた。
そして、かつて雑音工房NOISEで製作された仮想サントラと同じタイトル「BROKEN THUNDER」を持つ同人パソコンゲームを製作することが2006年に発表された。
以降の経緯はBROKEN THUNDERを参照。
活動停止
BROKEN THUNDERの発売後、FNAG社、特にゲームプロデューサーの長崎繁が2ちゃんねる等において激しく非難を受ける中、作曲チームの山西利治は椎名治美と石川ナオトを伴って退社し、株式会社アムーヴを設立した。また九十九百太郎も株式会社マカロンボックスに活動の場所を移している。
2008年以降、FNAG社の公式サイトが表示されない状態が続いており、所属していた作曲スタッフがすべて会社を去っていることから、現在は活動を停止しているものと思われる。