上原賞
1990年代
年度受賞者所属（受賞時）受賞対象研究テーマ1990
垂井清一郎大阪大学医学部教授筋肉の酵素欠損症の発見より異常遺伝子の同定にいたる一連の研究1991
高久史麿国立病院医療センター院長造血細胞の分化と腫瘍化に関する基礎的・臨床的研究中西重忠京都大学医学部教授G蛋白共役受容体の構造、機能発現、受容機構に関する分子生物学的研究1992
市原明徳島大学酵素科学研究センター長・教授初代培養肝臓細胞を用いた肝臓機能と肝臓再生機構の解明多田啓也東北大学医学部教授先天代謝異常症の病因・病態の解明並びに診断法の開発に関する研究永津俊治藤田保健衛生大学総合医科学研究所教授カテコールアミンの分子遺伝学的研究1993
谷口維紹大阪大学細胞生体工学センター教授サイトカインの構造と機能に関する先駆的業績本庶佑京都大学医学部教授・遺伝子実験施設長リンパ球の分化制御に関する一連の研究1994
廣川信隆東京大学医学部教授細胞の形態形成と細胞内物質輸送機構の解明1995
竹市雅俊京都大学大学院理学研究科教授細胞接着分子カドヘリンの発見とその機能の研究1996
矢崎義雄東京大学医学部長・教授心血管系の発生・分化と負荷に対する適応の分子機序に関する研究1997
長田重一大阪大学医学部教授アポトーシス（細胞死）の分子機構とその生理作用御子柴克彦東京大学医科学研究所教授哺乳類中枢神経系の発生と分化の分子生物学的研究1998
該当者なし1999
宮下保司東京大学医学部教授大脳認知記憶メカニズムの解明
2000年代
年度受賞者所属（受賞時）受賞対象研究テーマ2000
浅島誠東京大学大学院総合文化研究科教授脊椎動物の臓器形成と形づくりの基礎的研究田中紘一京都大学大学院医学研究科教授生体肝移植の確立と展開に関する業績2001
成宮周京都大学大学院医学研究科教授プロスタノイド受容体と低分子量G蛋白質Rhoの生理機能と病態的意義に関する研究柳田充弘京都大学大学院生命科学研究科長・教授生命継承の基礎としての染色体分配・伝達制御機構に関する一連の研究2002
月田承一郎京都大学大学院医学研究科教授細胞間接着装置の分子構築に関する研究2003
谷口克千葉大学大学院医学研究院教授NKT細胞の研究長野哲雄東京大学大学院薬学系研究科教授生体可視化プローブの理論的開発と生体への応用研究2004
清水孝雄東京大学大学院医学系研究科教授生理活性脂質の生合成と機能に関する総合的研究田中啓二（財）東京都医学研究機構東京都臨床医学総合研究所副所長プロテアソームの発見と病態生理に関する研究2005
鍋島陽一京都大学大学院医学研究科教授動物個体の発生、成熟、恒常性維持機構の研究水野美邦順天堂大学医学部教授パーキンソン病の発症機序に関する研究2006
審良静男大阪大学微生物病研究所教授自然免疫による病原体認識機構の解明寒川賢治国立循環器病センター研究所副所長独自の探索法による新規生理活性ペプチドの発見とその基盤的研究：グレリンを中心として2007
門脇孝東京大学大学院医学系研究科教授2型糖尿病の分子機構に関する研究坂口志文京都大学再生医科学研究所長制御性T細胞による免疫応答制御の研究2008
飯野正光東京大学大学院医学系研究科教授カルシウムシグナルの時空間制御機構とその生理的意義の解明山中伸弥京都大学iPS細胞研究所|京都大学物質-細胞統合システム拠点iPS細胞研究センター長多能性幹細胞の維持と誘導2009
杉山雄一東京大学大学院薬学系研究科長・教授トランスポーターの関わる薬物体内動態予測法の確立と創薬支援への応用西田栄介京都大学大学院生命科学研究科教授細胞内シグナル伝達経路の同定、制御機構並びに生理機能に関する研究
2010年代
年度受賞者所属（受賞時）受賞対象研究テーマ2010
河西春郎東京大学大学院医学系研究科教授大脳シナプスと分泌現象の2光子顕微鏡を用いた研究間野博行自治医科大学教授・東京大学特任教授肺がん原因遺伝子EML-ALKの発見と臨床応用2011
森和俊京都大学大学院理学研究科教授小胞体ストレス応答の発見とその分子機構の解明山本雅之東北大学大学院医学系研究科長・教授酸素や食物が内包する毒性に対する生体の応答機構の解明2012
竹縄忠臣神戸大学大学院医学研究科特命教授・質量分析総合センター長ホスホイノシタイド結合タンパク質による細胞ダイナミズム制御渡邊嘉典東京大学分子細胞生物学研究所教授染色体分配の基本原理の解明2013
笹井芳樹理化学研究所発生・再生科学総合研究センター副センター長幹細胞の自己組織化による臓器形成の自律制御原理の研究濡木理東京大学大学院理学系研究科教授細胞膜輸送の分子機構の解明2014
狩野方伸東京大学大学院医学系研究科教授シナプスの機能発達、可塑性および伝達調節の基本メカニズムの解明2015
豊島近東京大学分子細胞生物学研究所イオンポンプによる能動輸送機構の原子構造による解明水島昇
吉森保東京大学大学院医学系研究科
大阪大学大学院生命機能研究科・医学系研究科哺乳類オートファジーの分子機構と生理機能の研究2016
一條秀憲東京大学大学院薬学系研究科新たなストレスシグナル機構の発見から創薬基盤形成へ小川誠司
宮野悟京都大学大学院医学研究科
東京大学医科学研究所先端ゲノミクスによる癌の分子基盤の解明2017
松本邦弘名古屋大学大学院理学研究科動物の発生・分化を制御する情報伝達機構の解明宮脇敦史理化学研究所バイオイメージングの医学応用的開発研究2018
佐々木裕之九州大学生体防御医学研究所哺乳類のエピジェネティクス制御機構の解明高柳広東京大学大学院医学系研究科骨免疫学の創始による自己免疫疾患・骨関節疾患の研究