新潟市歴史博物館
沿革
1972年（昭和47年）4月に「新潟市郷土資料館」として開館。その後、1982年（昭和57年）には本館に隣接して旧新潟税関石庫（いしぐら）が復元され、横を通る市道には、かつて新潟市中心部に張り巡らされていた堀も再現された。しかし当時の本館は1969年（昭和44年）に重要文化財に指定された旧新潟税関庁舎を転用したものだったため、非常に手狭で、公開できる資料数が少ないため、博物館としての機能を果たしきれず、さらには建造物を保護する意味でも施設を拡充する必要性が生じた。
郷土資料館としては2003年（平成15年）3月に一旦閉館し、新築・改装など工事が行われた後、2004年（平成16年）3月27日、新たに建設された博物館本館と、移設・復原された旧第四銀行住吉町支店の公開を開始し、現名称に改称。信濃川・新潟西港に面するロケーションから、みなと（港）とユートピア（理想郷）をつないだ造語である「みなとぴあ」の愛称が、一般公募によって命名された。
新潟西港一帯はみなとオアシスとして登録していて、当館はみなとオアシス新潟の代表施設である。
旧第四銀行住吉町支店
昭和時代初期に全国で見られた、新古典主義様式の銀行建築。開館日であれば無料で見学できる。
1927年（昭和2年）10月に竣工した第四銀行住吉町支店が、都市計画道路「万代島ルート線」（柳都大橋など）の整備区間のルートにあたるため撤去されることになったものの、「昭和初期の貴重な建造物を残してほしい」と保存を求める市民らの強い要望で、みなとぴあ敷地内への移転・復原が実現した。移築が難しい鉄筋コンクリートの骨格部分は新たに作り直されたが、花崗岩製の外壁や列柱、ロビー部の大理石製のカウンターなどが建設当初の姿に復原された。
2005年（平成17年）、国の登録有形文化財に登録されている（第15-0186号）。
1・2階が一般公開されているほか、1階の営業室内側の事務スペースとして使用されていたフロアには、西蒲区角田浜でワイナリー「カーブドッチ」を運営する欧州ぶどう栽培研究所のレストラン「ぽるとカーブドッチ」が出店し、貸切利用にも対応している。
旧新潟税関庁舎
開港五港の中で唯一現存する、開港当時の運上所（税関）の遺構。いわゆる擬洋風建築の一例で、赤瓦葺きの屋根とナマコ壁の外観にアーチ状の玄関口と塔屋などの洋風の意匠を取り入れている。開館日であれば無料で見学できる。
戊辰戦争終結後の1869年（明治2年）10月に「新潟運上所」として開所。1872年（明治5年）11月28日、全国の運上所が「税関」と呼称統一されたのに伴って「新潟税関」に改称した。新潟税関は全国の税関統廃合に伴って1902年（明治35年）11月5日付で廃止され、新潟港は横浜税関の管轄下となり、庁舎はその支署となった。さらに1953年（昭和28年）8月1日、横浜税関から東京税関が分離独立し、新潟税関支署は東京税関へ移管した。庁舎は翌1954年（昭和29年）2月10日付で、新潟県の文化財に指定された。
しかし新潟税関支署は敷地・庁舎とも年々手狭となり、運上所の開所以来、保税倉庫として使用していた石庫の老朽化が著しくなったため1963年（昭和38年）に解体され、石材などの構造物は将来の復元を前提に保管された。1964年（昭和39年）6月16日の新潟地震では、税関支署周辺は液状化現象による地盤沈降と津波により浸水し、庁舎の建物が傾斜するなど甚大な被害を受けた。新潟税関支署は1966年（昭和41年）5月1日、対岸の竜が島地内の中央埠頭前に建設された新庁舎へ移転し、旧庁舎は97年間の役目を終えた。
だが庁舎移転当時、開港時の運上所の建造物が遺存している例は他に無かったことから、旧庁舎はその歴史的価値を評価され、新潟港の開港100周年を機に1969年6月20日付で「旧新潟税関庁舎」として国の重要文化財に、遺構を含む敷地は「旧新潟税関」として国の史跡にそれぞれ指定され、1970年（昭和45年）1月19日付で新潟市を管理団体とする旨が公示された。旧庁舎は同年から2年間を掛けた解体修復工事によって復原され、前述の通り1972年から2003年までの間は、当館前身の新潟市郷土資料館の本館として使用された。なお前述の重文・史跡指定の際、石庫跡地については土地問題が残存していたため指定が見送られたが、1979年（昭和54年）に解決したのを受けて石庫の復元が決まり、同年12月に史跡として追加指定された。石庫の復元工事は1年半掛かりで行われ、1982年10月8日に竣工。更にみなとぴあの建設に合わせ、開港当時の荷揚げ場が復元された。荷揚げ場には河岸に沿って石段が設けられていたが、昭和時代初期の信濃川両岸の埋め立てや、1960年代に新潟市内で著しく進行した地盤沈下、さらには新潟地震によって埋没してしまったため、新潟市では1996年（平成8年）から発掘調査を実施した上、資料等を元にして工事を行い、運上所開所当時の位置に復元された。なお開所当時には石庫と並んで土蔵も所在していたが、今日においては遺存していない。