ポーランド総督府
虐殺政策
1942年1月20日のヴァンゼー会議で、ポーランド総督府の次官であるヨーゼフ・ビューラー博士は、総督府領での「最終的解決」の実行にラインハルト・ハイドリヒを推薦した。彼によると、総督府領における最大の問題は官憲の仕事を妨害するブラックマーケットの著しい発達であった。彼は国内の「ユダヤ人問題」を可能な限り速やかに解決したいと考えていた。良い点は輸送の問題がないという点であった。
1942年、ドイツはユダヤ人の組織的な虐殺を開始した。総督府は6つの強制収容所のうち4つを持っており、そこでは、「望ましくない人種」をガス室で虐殺するホロコーストが実行されていた。ポーランドや他の国からのユダヤ人100万人近くが1942年から1944年までの間に処刑された。ポーランド総督府領にいた1939年時点の人口が、1944年の終わりにソビエト軍がその地域を占領した際には、約4百万人減少していた。
他のスラブ人の様に少数の（非ユダヤ人の）ポーランド人は農奴の階級に引き落とすと言うのはドイツの政策であった。その一方で、残りは国外に追放されるか、除去されて「支配人種」であるドイツ人の移住者に置き換えられた。
もともとの人々を将来どうするかと言うことに関しては様々な計画が出された。その1つは、約2千万人のポーランド人を西シベリアへ国外退去にし、4～5百万人をドイツ人化する。
実際には国外退去は、人々をどこかに強制的に移動させるという意味ではなく、同様の他の計画の様に対象の人間全てに死を与えるというものであった。
ポーランド総督府領では、全ての中等教育は廃止され、全てのポーランドの文化的施設は閉鎖された。1943年、ポーランドの人々は野蛮な民族浄化の真っ只中に置かれた。しかし、1944年まで一部のドイツ人しかその地域に移住しなかった。これに関しては 東部総合計画 を参照。
レジスタンス
ドイツの支配への抵抗は、一度といわず発生した。しかし、ポーランドはゲリラ戦に向いた地形ではなかった。主抵抗戦力は、ロンドンにあるポーランド亡命政府の指示に従う国内軍 (ポーランド語で、Armia Krajowa もしくは AK)であった。
これは、戦前からのポーランド軍の残りとたくさんの義勇兵により編成されていた。他の戦力、例えばソビエト連邦が背後に存在し、ポーランド共産党により指示される共産主義者の人民軍(Armia Ludowa or AL)の様なものも同時に存在した。1944年まで、国内軍は38万人となったが、武装は貧弱であった。占領下では、様々なポーランド人の抵抗組織が15万の枢軸軍を殺害した。人民軍は国内軍の15%の規模であった。
1943年、ドイツは4月19日から5月16日のワルシャワ・ゲットー蜂起に恐れをなし、ワルシャワ・ゲットーから残りのユダヤ人を追放した。これは、ポーランドにおけるドイツへの最初の武装蜂起であった。これに勇気を得たポーランド人は1944年に立ち上がり、ワルシャワ蜂起を起こした。
1944年7月にソビエト軍がワルシャワに近づくと、ワルシャワを自ら解放し、共産主義者に吸収されることを避けるために、亡命政府は蜂起を呼びかけた。タデウシュ・ブル＝コモロフスキに率いられた国内軍は、ロンドン亡命政府と、ソビエト含む連合国が支援するという約束の下に、8月1日にドイツ軍に対して攻撃を開始するが、共産主義政権をポーランドに設立することを計画していたソ連側は自軍の補給能力の限界を理由に支援せず、見殺しにした。
戦闘を63日行った後、蜂起軍指揮官は、ドイツ軍に条件付降伏を行った。国内軍の残り1万5千人は、戦時捕虜の扱いを受けた。(この同意前に捕虜になった反乱軍は射殺された。)そして、残り18万の市民は放免された。
終結
1944年の終わりにソビエト軍がポーランド全土をほぼ制圧し、ポーランド総督府は崩壊した。フランクは1945年5月にアメリカ軍の捕虜となり、後にニュルンベルク裁判の被告となった。裁判中、フランクはカトリック教会に改宗した。フランクは40冊にものぼる自分の日記を法廷に提出し、自分や他の者への証拠が彼により集められた。フランクは、戦争犯罪と人道に対する罪で有罪となり、1946年10月1日、絞首刑による死刑判決をうけた。