形態音韻論
形態音韻論（けいたいおんいんろん、英語: morphophonology）または形態音素論（けいたいおんそろん、英語: morphophonemics）は、言語学の一分野で、形態変化に伴う音韻の交替を扱う。形態論と音韻論の境界的な分野である。
形態音韻論と正書法
多くの言語の正書法は音韻論的でなく、形態音韻論のレベルにとどまることが多い。たとえば英語の過去形の -ed や、アラビア語の定冠詞の ال (al) などが実際にどう発音するかにかかわらず同じように表記されるのは、形態音韻論的な表記と言える。
日本語の現代仮名遣いはあまり形態音韻論的ではないが、四つ仮名の使いわけ（「ものずき」と「もちづき」、「しかじか」と「ちかぢか」）は、連濁を起こす前の形を残している点で形態音韻論的表記である。
朝鮮語のハングルは発明された当初は発音どおり（音素的）に表記することを原則としていたが、現代の正書法は形態音韻論的である。
歴史
形態音韻論が対象とする個々の形態変化については古くから知られていたが、理論化されたのはカザン学派のクルトネとクルシェフスキにはじまる。クルトネに学んだプラハ学派のヘンリク・ウワシン（ポーランド語版）がはじめて「形態音素（モルフォネーマ）」という語を使い、ついでニコライ・トルベツコイが1929年以降の論文で形態音素を取りあげた。しかしトルベツコイの没後は形態音韻論という分野が形態論と別に必要かどうかは疑問とされた。
アメリカ合衆国でも形態音韻論的な考え方の萌芽はあったが、レナード・ブルームフィールド以前にはヨーロッパのものに匹敵する理論は生まれなかった。ブルームフィールドは『言語科学の公準の集合』(1926) や『言語』(1933) において交替を理論化し、『メノミニ語の形態音素論』(1939)では「形態音素論」の語を用いた。
ブルームフィールドに対する批判からアメリカ式の形態音韻論が発達した。チャールズ・ホケットやバーナード・ブロックは音韻論から文法を排除し、形態素の音韻的側面を扱う学問として形態音韻論を再定義した。ひとつの音素が複数の異音を持つように、ひとつの形態素は複数の異形態を持つものとされた。
生成文法と形態音韻論
生成文法で形態音韻論は大きく変化した。ノーム・チョムスキーの初期のモデルにおいて、形態音韻規則は形態素の記号列を音素列に書きかえるための規則とされた。しかしモリス・ハレは文法を排除した音素（自律的音素）の観念を不要とし、チョムスキーの形態音韻規則を単に音韻規則と呼んだ。
チョムスキーとハレによる1968年の『英語の音型』(The Sound Pattern of English) は生成音韻論の代表的な著書だが、ここでも形態音韻論と音韻論の区別はなされず、音韻規則が抽象的な音韻的表現を具体的な音声的表現に変換すると考えられている。
『英語の音型』の音韻規則は非常に強力であり、通常は通時論的な変化と考えられている大母音推移なども音韻規則に含められている。また、英語の伝統的な正書法は語彙を理想に近く表現しているとも主張した。たとえば英語の resign, paradigm の黙字の g は音韻的表現のレベルでは存在し、resignation や paradigmatic ではそれが音声的にも出現すると考えた。このような音韻的表現の存在には疑問が提出されており、たとえばチョムスキー夫人であるキャロル・チョムスキーの論文によれば、7年生（日本でいう中学1年生）の生徒には sign と signature に語源的な関係があることが理解できなかったという。ジェフリー・サンプソンによると、英語の不規則な綴りの形態音韻論的な説明は却下され、英語の綴りが表語的な性格を持つということによって説明される。