古モンゴロイド
概要
氷河期時代の北アジアで寒冷適応した結果、凹凸の少ない顔立ち、一重まぶたにみられる蒙古ひだなどの体質的特徴を有する新モンゴロイドに比べると、一般には彫りが深く、比較的小柄で、二重のまぶたや、厚い唇、湿った耳垢、多毛などの特徴を持っているとされた。
日本においては、縄文時代の住民（縄文人）は主に古モンゴロイド系であったと言われるが、その後に中国および北東アジアから渡来した新モンゴロイドと混血をした結果、現在の日本人の新モンゴロイドと古モンゴロイドの特徴が混在する形質が形成されたと考えられた。遺伝子解析の結果、日本人（琉球人、本土人、アイヌ人）は皆縄文人の血を受け継いでいるため、現在の東アジア大陸部の主要な集団とは異なる遺伝的構成であるという結果が出ている。
形質
古モンゴロイドは、新モンゴロイドと比較して低めの身長、彫の深い顔、二重瞼、体毛が多いこと、湿った耳垢、波状の頭髪などの形質を持つと考えられている。
古モンゴロイドに属すアイヌは、彫が深い、毛深い、蒙古斑がまれなど和人とは異質の特徴から、かつてはコーカソイドと考えられたこともあったが、これはコーカソイド特有の形質ではなく、新モンゴロイド以外の多くの人種に共通する形質である。
遺伝的には古モンゴロイドは新モンゴロイドに近く、他の人種とは隔たりが大きいとされているが、このように古モンゴロイドの形質が他人種と共通する部分が少なくないのは、コーカソイドやオーストラロイドと分岐した直後の状態を長く保持している（新モンゴロイドの固有派生形質を獲得していない）ためである。すなわち多くの人種と古モンゴロイドの共通点は共有原始形質である。
遺伝子
Y染色体で見ると、古モンゴロイドとされる縄文人とアイヌにて最多を占めるハプログループD1a2系統と、新モンゴロイドとされる現代日本人（大和民族）や漢民族と朝鮮民族にて最多を占めるハプログループO系統、テュルク系とモンゴル系やツングース系にて最多を占めるハプログループC2系統では分岐から7万年以上もの時を経ている。
古モンゴロイドを特徴付けるハプログループD1a2系統の祖先であるハプログループDEは、全ユーラシア人の共通祖先であるハプログループCTから早期に分岐したため、E系統以外のユーラシア系とは分岐してから7万年以上の時間を経ている。比較的近縁なE系統とも6万年ほど前に、最も近縁であるD1a1系統とも4万年程前に分岐しているため、4万年以内に共通祖先を持つ系統が無く、非常に独立的であると言える。
その一方、新モンゴロイドの主要系統であるハプログループO系統は、コーカソイド系で最多を占めるハプログループR系統とは約4万年程前に分岐したため、これに従うと新モンゴロイドは古モンゴロイドよりコーカソイドのほうが近いということになる。
ただし、人種を反映する形態形質は、父系のY染色体ハプログループのみでなく、母系のミトコンドリアDNAハプログループとも相関性があること（古モンゴロイドに特徴的な母系のハプログループとしては、ハプログループM7aなどがある）、さらに多くのY染色体ハプログループの系統が同一集団として同じ人種を形成した（遺伝子の系統と集団の系統が一致しない）ため、形質とY染色体ハプログループの系統は一致しない場合が多い。