恩智神社
創建
創建は不詳。社伝（「恩智大明神縁起」）では、神功皇后の三韓征伐の際に住吉神・恩智神が現れて皇后を守護したので、恩智神は高安の七郷を賜ったとする。また現在の神社側では雄略天皇14年（470年）頃の創建としている。
現鎮座地に遷座するまでは西方の天王の森（現在の御旅所）に鎮座したというが、同地は弥生時代中期を中心とする遺跡（恩智遺跡）として知られ、恩智神社の創祀との関連性が指摘される。現社地への遷座の時期は確かではないが、伝承上では後述のように南北朝時代初期頃という。
中世・近世
中世期に入り、応永16年（1409年）には御体御卜に祟る有力社に遣使があったうちに当社が見える。天文20年（1551年）の観心寺の正月会での諸神勧請の際は、河内国では枚岡大明神に続いて恩智大明神と見える。
社伝（延宝3年（1675年）文書）では、南北朝時代初期頃に楠木正成に従った恩智左近が恩智城を築城した際、城が神社を見下す形になったため旧社地（天王の森）から現社地に遷座したというほか、戦国時代には織田信長の頃の放火で社殿を焼失したという。
なお、一般に恩智神社は河内国で枚岡神社に次ぐ二宮の位置づけにあったといわれるが、中世期に恩智神社が二宮であることを示す確かな史料はない。
近代以降
明治維新後、1873年（明治6年）に近代社格制度において郷社に列し、1912年（大正元年）に府社に昇格した。
明治の神仏分離では神宮寺の天川山神宮寺感応院が分離され、1871年（明治4年）に恩智神社境内の観音堂が感応院境内に移されている。
また、明治時代までは奈良の春日大社の猿楽は当社が受け持っていた。
境内
主要社殿のうち本殿は2棟からなり、いずれも王子造の切妻造である。造営年代は詳らかでないが、宝暦6年（1756年）頃と見られる。向かって右殿に大御食津彦命、左殿に大御食津姫命が祀られ、両殿の間に末社の天川神社が鎮座する。また両殿の周囲を玉垣・透塀で囲んだうえで各殿前に中門を設ける。両中門前には拝殿1棟（平成12年（2000年）再建）が建てられているほか、本殿の裏手には古墳1基があって横穴式石室を開口する。山麓の東高野街道沿いには鳥居が建てられている。
境内から西方約800メートル、現在の御旅所（頓宮）が所在する天王の森（恩智中町3丁目、位置）は、恩智神社の旧鎮座地と伝える。現在は境外末社の八坂神社（牛頭天王社）が鎮座し、「天王」の呼称は同社に由来する。同地一帯は縄文時代に始まる考古遺跡として知られ、特に弥生時代中期の集落遺跡が認められている。遺跡自体は南北1.2キロメートル・東西1.0キロメートルに広がるが、そのうち天王の森を中心とする南北20メートル・東西50メートルが「恩智遺跡」として大阪府指定史跡に指定されている。なお関連して、恩智神社の北方では銅鐸の出土も知られる。