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Sec61
Sec61（原核生物ではSecYEG）は、全てのドメインの生物に存在する膜タンパク質複合体である。トランスロコンの核となる構成要素として、真核生物の場合には小胞体へ、原核生物の場合には細胞外へタンパク質を輸送する。3つの異なるサブユニットSecY（Sec61α）、SecE（Sec61γ）、SecG（Sec61β）から構成され、膜を貫通するドーナツ型のポアを形成する。小胞体内外への輸送を遮断するプラグ（plug）と呼ばれる領域も存在する。新生ポリペプチド鎖の疎水的領域がシーム（seam）と呼ばれるSec61の別の領域と相互作用するとこのプラグは取り外され、ポリペプチドが小胞体内腔へ移行（トランスロケーション）できる状態となる。