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DNAメチル化シグネチャーは、心筋細胞であらかじめ形成されたクロマチンコンパートメントに従う
制限された核空間にクロマチンを保管するには、DNAのアクセシビリティを確保しながら、高密度にパッキングすることが必要である。そのため、何層ものクロマチン組織化メカニズムとエピジェネティック制御メカニズムが存在する。ゲノムワイドクロマチン相互作用マップは、大きな相互作用ドメイン（TAD）と高次AおよびBコンパートメントを明らかにし、これらはそれぞれ活性および非活性なクロマチンを反映する。クロマチン組織化と、DNAメチル化を含むエピジェネティックマークパターンとの間の相互依存性は、未だよくわかっていない。ここで我々は、心筋細胞の分化・成熟中に、A/Bコンパートメントの確立が先行し、その後DNAメチル化シグネチャーを定義することを示す。注目すべきこととして、心筋細胞における動的CpGおよび非CpGメチル化は、Aコンパートメントに限定されている。さらに、胚性幹細胞または心筋細胞において、それぞれDNAメチル化を遺伝子除去または抑制しても、ゲノム全体のクロマチン構成に影響しない。したがって、DNAメチル化は、あらかじめ形成されたクロマチンコンパートメントにおいて確立されるように見え、高次クロマチン構造の形成に必須でない可能性がある。