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トポロジカルドメイン
トポロジカルドメイン（、略称: TAD）はゲノム内の自己相互作用領域であり、すなわち各TAD内のDNA配列は外部の配列よりも高頻度で内部の配列と物理的相互作用を行う。マウス細胞におけるTADのサイズの中央値は880 kbであり、哺乳類以外の細胞でも同程度の大きさである。哺乳類では、TAD間の境界は細胞種、さらには生物種を越えて保存されており、CTCFやコヒーシンに非常に富む領域となっている。さらに、一部の種類の遺伝子（tRNA遺伝子や）はTAD境界の近傍により高頻度で存在している。
TADの機能は十分には理解されておらず、いまだ議論が行われている。大部分の研究では、TADはエンハンサー-プロモーター間相互作用を各TAD内に限定することで遺伝子発現を調節していることが示されているが、一方でTADの構成を変化させても大部分の遺伝子の発現には変化がみられないことも報告されている。TAD境界の破壊はがんのほか、、、F症候群（先端・胸・椎体異形成症、F-form of acro-pectoro-vertebral dysplasia）といった四肢の奇形、脳梁形成不全や成人発症脱髄性白質脳症といった脳疾患など、広範囲の疾患と関係していることが知られている。
TAD形成の根底にある機構もまた複雑であり、十分には解明されていない。しかしながら、いくつかのタンパク質複合体やDNAエレメントがTAD境界と関係していることが知られている。CTCFやコヒーシンタンパク質の助けのもとで行われるTAD形成のモデルとして、"handcuff"モデルや"loop extrusion"モデルが提唱されている。さらに、TAD境界部位の剛性がドメイン間のinsulationやTAD形成を引き起こしている可能性も提唱されている。