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アルファコロナウイルスの適応及び進化における受容体結合ループ
RNAウイルスは、高い変異率、すなわち環境変化に対する緩衝機能を特徴とする。しかし、ランダム変異がウイルスの適応度を改善する機序は十分解明されていない。本研究にて、我々は、ヒトコロナウイルスHCoV-229Eの受容体結合ドメイン（RBD）について、その受容体であるアミノペプチダーゼN（APN）の外部ドメインとの複合体でのX線結晶構造を報告する。3本の拡張ループのみがHCoV-229Eの受容体結合及び進化に関与し、その近縁ウイルスはループ‐受容体相互作用の変化を伴う。系統発生解析は観察された自然HCoV-229E受容体結合ループ変異体が、過去50年間にヒト集団内でウイルスが連続的に相互置換した6つのRBDクラスを定義することを示す。これらのRBDクラスは、APNへの親和性及びHCoV-229E中和抗体への結合能が異なる。以上から、我々の結果は、受容体結合への拡張ループの使用に基づく、アルファコロナウイルスの適応及び進化のモデルを提示する。