Có 3 sân bay lớn ở Vịnh San Francisco: Sân bay quốc tế San Francisco (SFO), Sân bay quốc tế Oakland (OAK) và Sân bay quốc tế San Jose (SJC). Chúng nằm ở các khu vực khác nhau ở Vùng Vịnh và phục vụ các khu phố khác nhau.  Nếu bạn đang bay đến San Francisco hoặc khu vực bán đảo, Sân bay nội bộ San Francisco là sân bay thuận tiện nhất.  Nếu bạn đi đến vịnh Đông, như UC Berkeley hoặc Oakland, Sân bay Quốc tế Oakland là lựa chọn tốt nhất.  Nếu bạn đi đến vịnh Nam, như Palo Alto, Mountain View, San Jose, thì sân bay quốc tế San Jose sẽ là điểm đến của bạn.