A proteína alterada resultou diretamente da
tradução do DNA tradução do mRNA transcrição do DNA transcrição do mRNA
A B C D
A classe Seq apresenta métodos para manipulação de sequências, como por exemplo, a detecção da sequência complementar e complementar reversa de uma sequência de nucleotídeos pertencentes a DNA, métodos para transcrição (DNA -> RNA) e transcrição reversa (RNA -> DNA), além de métodos para tradução (RNA -> proteína / DNA -> proteína). Em eucariotas, a acessibilidade de grandes regiões de DNA pode depender da sua estrutura da cromatina, o qual pode ser alterada, como resultado de modificações de histonas dirigidas por metilação do DNA, RNA não codificante, ou proteína de ligação a DNA. Se a célula retém os danos de DNA, a transcrição do gene pode ser evitada, e, também, a tradução dentro da proteína pode também ser bloqueada. Durante a expressão de um gene codificante de proteína, a informação flui do DNA→ RNA→ PROTEÍNA. A concentração dessa proteína é alterada por esteroides sexuais. Por sua vez, a proteína extraída diretamente do leite não apresenta os efeitos indesejados da proteína extraída do soro do leite. O domínio de ligação ao DNA do terminal N confere a atividade única de ligação ao DNA desta proteína. Juntamente com a proteína ligase, que consegue unir fragmentos de DNA, as enzimas de restrição formaram a base inicial da tecnologia do DNA recombinante. Uma desta interações DNA-proteína determina onde começa a transcrição. A mesma nucleoproteína RecA-ssDNA modifica a proteína UmuD na proteína de UmuD após a tradução. Uma expansão desta magnitude resulta na metilação dessa porção do DNA, silenciando a expressão da proteína FMR1. Esta doença resulta na acumulação de lesões no DNA, pois o produto do gene defeituoso é a DNA helicase - uma proteína envolvida na replicação e reparação do DNA. A tradução do ARNm de resgate substitui a produção da proteína que fora bloqueada pelo morfolino. A proteína "bicoid" possui um homeodomínio, característica de genes Homeobox, sendo uma das poucas proteínas que consegue se ligar a RNA e DNA, e dessa forma conseguir regular transcrição e tradução. DNA polimerase V (Pol V) é uma DNA-polimerase da família Y que está envolvida na resposta SOS e mecanismos de reparação do DNA da síntese de tradução. Dentre reações mais tardias, estão a retomada da síntese de DNA, devido ao aumento do pH e ao Ca, que inativa a enzima MAP quinase, responsável pela inibição da síntese de DNA; e também a retomada da síntese de proteínas, devido à degradação de inibidores (como a proteína de ligação eIF4E) da tradução dos RNAs mensageiros estocados no óvulo. Dentre reações mais tardias, estão a retomada da síntese de DNA, devido ao aumento do pH e ao Ca, que inativa a enzima MAP quinase, responsável pela inibição da síntese de DNA; e também a retomada da síntese de proteínas, devido à degradação de inibidores (como a proteína de ligação eIF4E) da tradução dos RNAs mensageiros estocados no óvulo. Tus (proteína)

A proteína tus ("terminus utilization substance") é uma proteína de procariotos que se liga à sequencias de 21 pares de base do DNA bacteriano denominadas sequências terminadoras (Ter). O processo de mover informações da linguagem do DNA para a linguagem dos aminoácidos é chamada de tradução. A transcrição gera, então, a fita de mRNA que permite a tradução da proteína correspondente à subunidade beta do TCR. Para muitas proteínas regulatórias, a ligação do DNA é feita pela interação de dois sítios diferentes na estrutura tridimensional da proteína. Na planta "Arabidopsis thaliana", uma única proteína (a histona H2A) desempenha o papel em variações de temperatura inferiores a 1° C. Esta proteína altera o enrolamento do DNA, controlando assim o acesso a determinadas moléculas de DNA, ou inibindo a ativação de genes. Na planta "Arabidopsis thaliana", uma única proteína (a histona H2A) desempenha o papel em variações de temperatura inferiores a 1° C. Esta proteína altera o enrolamento do DNA, controlando assim o acesso a determinadas moléculas de DNA, ou inibindo a ativação de genes. A proteína transposase reconhece as repetições invertidas mais externas, cortando o segmento de DNA. São necessários dois tipos de interações DNA-proteína para uma transcrição regulada. A transcrição gera, então, a fita de mRNA que permite a tradução da proteína correspondente à subunidade beta do TCR. A tradução do mRNA processado para cadeia kappa ou lambda resulta na produção da proteína de cadeia leve κ ou λ de imunoglobulina. A tradução do mRNA produz 4 produtos de proteína ribossômica, um dos quais (S4) atua como um repressor de tradução ligando-se à região aninhada do pseudonó. Ao mesmo tempo, a proteína "bicoid" é também um repressor de tradução, inativando certos mRNA dependendo do seu gradiente de concentração. LIN28 codifica uma proteína de ligação de RNA que liga e aumenta a tradução do IGF-2 (insulin-like growth fator 2) do mRNA. A proteína PABP1 se liga ao RNA mensageiro (mRNA)e participa de diversas atividades, como exportação do RNA núcleo para o citoplasma, degradação, tradução e estabilidade. Quando o pico de expressão do mRNA ocorrer no escuro, o mesmo será traduzido na proteína "CO", mas ela será degradada e não ativará a expressão do mRNA da proteína "FT", que promove a floração. Vários papéis na expressão gênica têm sido atribuídos às regiões não traduzidas, incluindo instabilidade do mRNA, localização do mRNA e eficiência da tradução. A ligação de um miRNA com um mRNA pode reprimir a tradução da mensagem e acelerar a remoção da cauda poli-A, acelerando assim a degradação do mRNA. A tradução desse mRNA leva a produção da cadeia pesada μ de imunoglobulina. "Caudal" possui tradução reprimida por "bicoid", pois seu mRNA é um alvo dessa proteína, e assim tem maior concentração proteica nas regiões com menor concentração de "bicoid". O processo de detecção de transcritos aberrantes ocorre durante a tradução do mRNA. Se há uma proteína específica presente, é porque o gene da mesma está sendo expresso e originando mRNA para tal proteína. No final do processo, o mRNA é constituído apenas pelas sequências que codificam os aminoácidos de uma proteína, podendo assim migrar para o citoplasma, onde vai ocorrer a "tradução" da mensagem, isto é, a síntese de proteínas. Variações nessa sequência podem afetar a eficiência e a magnitude da biossíntese da proteína codifica por esse mRNA. Tradução (genética)

Em biologia, tradução é o nome dado ao processo biológico no qual a sequência nucleótica de uma molécula de mRNA (RNA mensageiro) é utilizada para ordenar a síntese de uma cadeia nucleotidica, cuja sequência de aminoácidos determina uma proteína

Neste processo, moléculas de RNA de transferência (tRNA) operam a tradução reconhecendo as sequências nucleotídicas do mRNA e correlacionando-as com a sequência que corresponde a determinados aminoácidos. Micro-RNA ligados a 3'UTR também podem afetar a eficiência da tradução ou a estabilidade do mRNA. Uma classe de elementos de mRNA, os riboswitch, ligam-se diretamente em moléculas pequenas, mudando seu "fold" para modificar os níveis de transcrição e tradução. As PDL possuem um oscilador central que controla a variação do mRNA de uma proteína denominada "CO". Isto significa que as células não podem mais produzir novas proteínas através da tradução do mRNA. A concentração dessa proteína é alterada por esteroides sexuais. Esta cauda promove a exportação do núcleo e tradução, além de proteger o mRNA de degradação. O oscilador central controla a expressão do mRNA Hd1, que é traduzido na proteína "Hd1", que inibe um indutor da floração ("Hd3a"). Outra usa pequenas moléculas catalíticas de RNA chamadas ribossomos para decompor sequências específicas únicas no mRNA na transcrição do gene defeituoso, perturbando a tradução do mRNA defeituoso e a expressão do gene. Por sua vez, a proteína extraída diretamente do leite não apresenta os efeitos indesejados da proteína extraída do soro do leite. Uma desta interações DNA-proteína determina onde começa a transcrição. A classe Seq apresenta métodos para manipulação de sequências, como por exemplo, a detecção da sequência complementar e complementar reversa de uma sequência de nucleotídeos pertencentes a DNA, métodos para transcrição (DNA -> RNA) e transcrição reversa (RNA -> DNA), além de métodos para tradução (RNA -> proteína / DNA -> proteína). São necessários dois tipos de interações DNA-proteína para uma transcrição regulada. O outro tipo de interação DNA-proteína decide se a transcrição iniciada pelo promotor irá ocorrer. Uma proteína repressora ligada ao DNA atua tipicamente seja interferindo fisicamente na ligação da RNA polimerase a seu promotor (bloqueando o início da transcrição) ou impedindo o movimento da RNA polimerase ao longo da cadeia do DNA (bloqueando a transcrição). Fator de transcrição

Factores de transcrição (TF) são proteínas que se ligam ao DNA de células eucarióticas para permitir que haja uma ligação entre a enzima RNA-polimerase e o DNA, permitindo assim a transcrição e a futura tradução.Qualquer proteína necessária para o início da transcrição, mas que não seja parte integrante do RNA polimerase. Se a célula retém os danos de DNA, a transcrição do gene pode ser evitada, e, também, a tradução dentro da proteína pode também ser bloqueada. Em eucariotas, a acessibilidade de grandes regiões de DNA pode depender da sua estrutura da cromatina, o qual pode ser alterada, como resultado de modificações de histonas dirigidas por metilação do DNA, RNA não codificante, ou proteína de ligação a DNA. [esclarecimentos necessários]
Uma unidade de transcrição de DNA que codifica para uma proteína pode conter uma "sequência de codificação", que será traduzida na proteína, e "sequências reguladoras", que direcionam e regulam a síntese dessa proteína. A transcrição modelo de DNA é o método de transcrição. A transcrição do DNA é ditada por sua estrutura. Proteína de ligação TATA

TATA binding protein (TBP) é um factor de transcrição que se liga especificamente a uma sequência de DNA denominada caixa TATA. Isto aumenta a transcrição do DNA e, consequentemente, síntese protéica. Isto aumenta a transcrição do DNA e, consequentemente, síntese protéica. Isto aumenta a transcrição do DNA e, conseqüentemente, síntese protéica. A proteína codificada por este gene contém dois locais de ligação diferentes que são conhecidos por se ligarem ao DNA e funcionarem como fatores de transcrição. A proteína codificada por este gene é um regulador da transcrição. Ela irá inibir a transcrição através da ligação ao DNA dupla-fita, intercalando com o DNA e impedindo que ele se abra para que ocorra a transcrição. Durante a expressão de um gene codificante de proteína, a informação flui do DNA→ RNA→ PROTEÍNA. Anteriormente, o método mais popular para estabelecer interações DNA-proteína era ChIP-on-chip, que combina a imunoprecipitação da cromatina com a hibridação em microarranjos de DNA 

O principal uso de ChIP-seq é estudar o efeito de fatores de transcrição e outras proteínas ligadas ao DNA no fenótipo. O Z-DNA é formado após o início da transcrição. Durante transcrição, RNA polimerase desenrola uma pequena seção da dupla hélice de DNA perto do início do gene (o sítio de início da transcrição). A metilação do DNA age, em geral, de modo à reprimir a transcrição do DNA, quando localizada em um promotor gênico. Como resultado, a transcrição tem uma fidelidade menor que a replicação do DNA. A concentração dessa proteína é alterada por esteroides sexuais. A transcrição gera, então, a fita de mRNA que permite a tradução da proteína correspondente à subunidade beta do TCR. Vários passos no processo de expressão génica podem ser modulados, incluindo a transcrição do mRNA e a modificação pós-traducional de uma proteína. Esta sequência induz o término da transcrição dando um sinal no mRNA que está sendo sintetizado que faz com que o mRNA se solte do complexo de transcrição. Quando o pico de expressão do mRNA ocorrer no escuro, o mesmo será traduzido na proteína "CO", mas ela será degradada e não ativará a expressão do mRNA da proteína "FT", que promove a floração. Uma classe de elementos de mRNA, os riboswitch, ligam-se diretamente em moléculas pequenas, mudando seu "fold" para modificar os níveis de transcrição e tradução. Com esta complexidade, o splicing alternativo de uma transcrição pre-mRNA é regulado por uma sistema de proteínas (activadores e repressores) que se ligam a elementos (potenciadores e silenciadores) na mesma transcrição de pre-mRNA. A proteína codificada por este gene é um regulador da transcrição. Outra usa pequenas moléculas catalíticas de RNA chamadas ribossomos para decompor sequências específicas únicas no mRNA na transcrição do gene defeituoso, perturbando a tradução do mRNA defeituoso e a expressão do gene. Se há uma proteína específica presente, é porque o gene da mesma está sendo expresso e originando mRNA para tal proteína. Variações nessa sequência podem afetar a eficiência e a magnitude da biossíntese da proteína codifica por esse mRNA. O CDS é a porção de uma transcrição de mRNA que é traduzido por uma ribossoma. Quando a coenzima B12 não está presente em quantidades suficientes, a transcrição de um mRNA associado a um "riboswitch" de B12 ocorre porque o aptâmero não consegue se complexar ao metabólito e forma um tronco antiterminador ,o qual impede a formação do terminador intrínseco e permite a transcrição da mRNA completo. As PDL possuem um oscilador central que controla a variação do mRNA de uma proteína denominada "CO". Uma desta interações DNA-proteína determina onde começa a transcrição. No processo de transcrição o código é lido das tiras de DNA, mRNA são produzidos. A concentração dessa proteína é alterada por esteroides sexuais. Na síntese proteica, no processo de transcrição, a célula do mRNA(RNAmensageiro) sofre maturação (ou splicing), onde são retirados os intrões. O oscilador central controla a expressão do mRNA Hd1, que é traduzido na proteína "Hd1", que inibe um indutor da floração ("Hd3a"). Splicing

Splicing é o processo de maturação de um pré-mRNA (RNA precursor), nesse processo as regiões não codificantes ("íntrons)" são retiradas do pré-mRNA, que passa a conter somente as regiões codificantes (exons).O splicing pode ocorrer durante e/ou após a transcrição do pré-mRNA. Como o mRNA é gerado por transcrição a partir do DNA, a informação genética que estes carregam está presente no DNA celular. Entretanto, quando as concentrações de coenzima B12 são suficientes, o mRNA liga-se a molécula de coenzima B12 que provoca uma mudança estrutural na molécula de mRNA, induzindo a formação do terminador intrínseco impedindo a transcrição. Por sua vez, a proteína extraída diretamente do leite não apresenta os efeitos indesejados da proteína extraída do soro do leite. A tradução do mRNA processado para cadeia kappa ou lambda resulta na produção da proteína de cadeia leve κ ou λ de imunoglobulina. No tipo de terminação "dependente de Rho", um fator de proteína chamado "Rho" desestabiliza a interação entre o modelo e o mRNA, liberando assim o mRNA recém-sintetizado do complexo de alongamento. Além do material genético, o núcleo também possui algumas proteínas com a função de regular a expressão gênica, que envolve processos complexos de transcrição, pré-processamento do mRNA (RNA mensageiro), e o transporte do mRNA formado para o citoplasma.