Hangi kodonlar sinonim kodonlar olarak adlandırılırlar?
farklı iki amino asit için sorumlu olanlar. protein sentezi sürecini başlatanlar. hiçbir amino aside uyugun olmayanlar. aynı amino asitler için sorumlu olanlar.
A B C D
Kodlayıcı iplikte kodonlar bulunur, kodlamayan iplikte ise anti-kodonlar bulunur. Bir amino asidi kodlayan kodonlar her üç pozisyonda da farklılık gösterebilir. tRNA molekülü ile amino asitleri belirleyen kodonlar arasında birebir bir ilişki sağlamak için hücrede 61 tip tRNA molekülü olması gerekir. Keza, iki misli dejenere kodonlar 3. pozisyonda olabilecek 3 mutasyondan birine dayanıklıdırlar. Dört baz olduğu için en az 21 kodu oluşturmak için üçlü kodonlar gereklidir. Antikodonlar 3'->5' yönünde, mRNA'da kodonlar 5'->3' yönünde okunur. Ribozoma yüklenen mRNA dizinindeki her kodon, üçer nükleititlik birimler yani kodonlar olarak okunur. Bu farklılıklara rağmen tüm bilinen kodlar büyük benzerlikler gösterirler ve tüm organizmalarda işleyen temel mekanizma aynıdır: üç bazlı kodonlar, tRNA, ribozomlar, kodonların okunma yönü ve nükleotit dizisinin üçer harfler olarak okunup bir amino asit dizisi olarak sentezlenmesi. Amino grup ve karboksilik asit grubu aynı monomer üzerinde olabilir, veya biri iki amino grup ile, diğeri iki karboksilik asit veya asit klorid grubu ile iki farklı bifonksiyonel monomerden, polimer oluşabilir. Amino asit dışında, yapısında farklı türler barındıran amino asitlere, “konjuge proteinler” denir. Bu amino asit -Sistein’den farklı olarak kükürt atomunun yerine Selenyum atomu barındırır. Örneğin, teorik olarak, dört misli dejenere kodonlar üçüncü pozisyonda bir mutasyona dayanıklı olmaları beklenebilir (ama gerçekte kodon kullanım yanlılığı (İng. CAG, amino asit glutamin için kodlama yapar. Ribozomlar üzerinde amino asit sentezinde her zaman L amino asit kullanılır. Amino asit permeaz

Amino asit permeazlar amino asitlerin hücre içine taşınmasında rol alan membran permeazlarıdır. Bir nükleik asit dizisindeki üçlü kodon genelde tek bir amino asidi belirler (ancak bazı durumlarda farklı konumlarda bulunan aynı kodon üçlüsü, çevredeki bağlamla ilişkili olarak iki farklı amino asidi kodlayabilir). Bu RNA dizisi, üç amino asit uzunluğunda bir amino asit dizisine çevrilecektir. Protein sentezi sırasında proteine 20 farklı tür amino asit dahil edilebilir. Proteinler amino asit polimerleridir. Normal olarak idrarda az miktarda amino asit bulunur. İki amino asit arasındaki tek fark tirozinde bulunan hidroksil grubudur (-OH). Tek fark, 8 ve 34. pozisyonlardaki sırasıyla 2-aminoizobütirik asit ve argininin mevcut olduğu, iki amino asitin farklı olmasıdır. Strecker amino asit sentezi

Adolph Strecker tarafından bulunan Strecker amino asit sentezi bir aldehit (ya da keton)dan bir dizi kimyasal reaksiyonla bir amino asit sentezlenmesidir . Amino asit dönüşümlerinde, nükleik asit sentezinde, ve amino asitlerin ince bağırsaktan kana absorpsiyonunda (emiliminde) görev alır. Amino asit tiyoesterlerinin polipeptitlere polimerizasyonu da, amino asit esterlerinin polinükleotitler tarafından yönlendirilmiş polimerizasyonundan önce meydana gelmiştir. Kodlayıcı iplikte kodonlar bulunur, kodlamayan iplikte ise anti-kodonlar bulunur. Antikodonlar 3'->5' yönünde, mRNA'da kodonlar 5'->3' yönünde okunur. Ribozoma yüklenen mRNA dizinindeki her kodon, üçer nükleititlik birimler yani kodonlar olarak okunur. Bir amino asidi kodlayan kodonlar her üç pozisyonda da farklılık gösterebilir. Keza, iki misli dejenere kodonlar 3. pozisyonda olabilecek 3 mutasyondan birine dayanıklıdırlar. Dört baz olduğu için en az 21 kodu oluşturmak için üçlü kodonlar gereklidir. Örneğin, teorik olarak, dört misli dejenere kodonlar üçüncü pozisyonda bir mutasyona dayanıklı olmaları beklenebilir (ama gerçekte kodon kullanım yanlılığı (İng. Böylece protein sentezi sonlanmış olur. Bu metabolik işlemlere örnek olarak; protein sentezi, hücre çeperi sentezi, nükleik asit sentezi veya hücre zarı fonksiyonlarını verebiliriz. G1 evresinde ATP sentezi, organel sayısı ve protein sentezi artar. Ayrıca protein sentezi (translasyon) sırasında bir enerji kaynağı olarak kullanılır. tRNA molekülü ile amino asitleri belirleyen kodonlar arasında birebir bir ilişki sağlamak için hücrede 61 tip tRNA molekülü olması gerekir. Genler, protein sentezi için gerekli bilgiyi kodlarlar. Matriksin sentezi esnasında osteoblastlar aktif protein sentezi yapıp salgılayan hücrelerin ince yapısına sahiptir. Polizomun olduğu yerde protein sentezi yapılıyorsa, o bölgede yoğun protein üretimi olmaktadır. Diğer seçenek ise başlama kodonuna veya durma kodonuna yanına tekrar eden histidin kodlayan kodonlar (CAT veya CAC) barındıran primerler ile PCR yapmaktır. Ribozomların hepsinde protein sentezi sitoplazmada serbest haldeyken başlar. Bu bölgede çok miktarda protein sentezi meydana gelir. Protein sentezi esnasinda ribozom tarafından peptid baginin kurulmasini bloke eder. Fotosentez, amino asitlerden protein sentezi, monosakkaritlerden, disakkarit ve polisakkarit üretimi anabolik reaksiyonlara örnek olarak gösterilebilir. Protein sentezi ilerler ve polipeptid ER’ye bağlı kanallardan organelin boşluğuna bırakılır. Hücrede protein sentezi ve yıkımı hücresel bileşenlerin ihtiyaç duyduğu homeostasisi sağlar. Ribozomların protein sentezi yapmak için okuduğu RNA molekülü "mesajcı RNA"dır. Protein sentezi sırasında proteine 20 farklı tür amino asit dahil edilebilir. Bu virüsler protein sentezi yapabilmek için genomlarının pozitif iplikçiğini sentezletmek zorundadırlar. Kodlayıcı iplikte kodonlar bulunur, kodlamayan iplikte ise anti-kodonlar bulunur. Bir amino asidi kodlayan kodonlar her üç pozisyonda da farklılık gösterebilir. tRNA molekülü ile amino asitleri belirleyen kodonlar arasında birebir bir ilişki sağlamak için hücrede 61 tip tRNA molekülü olması gerekir. Antikodonlar 3'->5' yönünde, mRNA'da kodonlar 5'->3' yönünde okunur. Ribozoma yüklenen mRNA dizinindeki her kodon, üçer nükleititlik birimler yani kodonlar olarak okunur. Tablo 1, 64 kodonun her birinin hangi amino aside karşılık geldiğini göstermektedir. Keza, iki misli dejenere kodonlar 3. pozisyonda olabilecek 3 mutasyondan birine dayanıklıdırlar. Dört baz olduğu için en az 21 kodu oluşturmak için üçlü kodonlar gereklidir. Örneğin, teorik olarak, dört misli dejenere kodonlar üçüncü pozisyonda bir mutasyona dayanıklı olmaları beklenebilir (ama gerçekte kodon kullanım yanlılığı (İng. Bu farklılıklara rağmen tüm bilinen kodlar büyük benzerlikler gösterirler ve tüm organizmalarda işleyen temel mekanizma aynıdır: üç bazlı kodonlar, tRNA, ribozomlar, kodonların okunma yönü ve nükleotit dizisinin üçer harfler olarak okunup bir amino asit dizisi olarak sentezlenmesi. ATP, AMP’ye dönüşerek amino aside bağlanır ve aktive edilmiş amino asit kendine özgün enzime bağlanır. 3' CCA uçları bir amino aside kovalent bağlanmış tRNA molekülleri üretir. Diğer seçenek ise başlama kodonuna veya durma kodonuna yanına tekrar eden histidin kodlayan kodonlar (CAT veya CAC) barındıran primerler ile PCR yapmaktır. İnsülin degludec, insan insüline kıyasla silinmiş tek bir amino aside sahip olan ve B29 pozisyonundaki amino asit lizindeki gama-L-glutamil aralayıcı vasıtasıyla heksadekanedioik aside konjuge edilmiş bir modifiye insülindir. Daha sonra bu enzime ve amino aside özgü tRNA enzime bağlanır ve amino asitle tRNA arasında bir bağ oluşur. Vücuda alınan bazı amino asitler, özellikle esansiyel olmayanlar, protein sentezi için doğrudan kullanılmazlar. Her bir tRNA'ya aminoasil tRNA sentetaz olarak adlandırılan enzimler tarafından spesifik bir amino asit yüklenir, bu enzimlerin hem yükledikleri amino aside hem de tRNA'ya yüksek derecede özgüllükleri vardır. Ama hangi hallerde parçacık hangi hallerde dalga olarak yayıldığı konusunda hiçbir bilgimiz yok. Hangi kimyasal bağı kestiklerine bağlı olarak bu enzimler fosfolipaz A1, A2, B, C ve D olarak adlandırılırlar. olarak adlandırılırlar. Bu yapıya hassas olmayanlar ise hiçbir engelleme olmadan yayılırlar. Gamow dört DNA bazının yirmi kombinasyonun üçlü gruplar halinde yirmi amino aside denk gelerek proteinlerin oluşturulduğunu önerdi. Sinonim (taksonomi)

Sinonim veya Eş Anlamlılık, canlıların latince isimlerinin birden fazla olması. olarak da adlandırılırlar. “Dokunulmazlar” olarak adlandırılırlar. Kodlayıcı iplikte kodonlar bulunur, kodlamayan iplikte ise anti-kodonlar bulunur. Bir amino asidi kodlayan kodonlar her üç pozisyonda da farklılık gösterebilir. tRNA molekülü ile amino asitleri belirleyen kodonlar arasında birebir bir ilişki sağlamak için hücrede 61 tip tRNA molekülü olması gerekir. Dört baz olduğu için en az 21 kodu oluşturmak için üçlü kodonlar gereklidir. Antikodonlar 3'->5' yönünde, mRNA'da kodonlar 5'->3' yönünde okunur. Ribozoma yüklenen mRNA dizinindeki her kodon, üçer nükleititlik birimler yani kodonlar olarak okunur. Amino asitler aynı zamanda sadece sitoplazmada üretilirler. Bir organizmanın sentezleyemediği amino asitler esansiyel amino asitler olarak bilinir (bu terim sıkça insanlar için gerekli olanları kastetmek için kullanılır). Keza, iki misli dejenere kodonlar 3. pozisyonda olabilecek 3 mutasyondan birine dayanıklıdırlar. Çeviri süreci, amino asitler için spesifik olan taşıyıcı RNA'lar (tRNA'lar) gerektirir, proteine eklenecek amino asitler bunlara kovalent olarak bağlıdır. Özel olarak elde edilen amino asitlerle ilgilenildi çünkü amino asitler proteinlerin yapıtaşlarıdır. Örneğin, teorik olarak, dört misli dejenere kodonlar üçüncü pozisyonda bir mutasyona dayanıklı olmaları beklenebilir (ama gerçekte kodon kullanım yanlılığı (İng. Amino asitler önemli bir azot kaynağıdır. Proteinlerin yapısını oluşturan 20 çeşit amino asit arasında 10 tanesi "temel amino asitler" olarak adlandırılır. Maya ekstresi, tipik büyümesi için gerekli tüm amino asitler ihtiva eder. Bu nükleik asitler aynı zamanda proteinlerin parçalanarak amino asitlere dönüşmesine de yardım etmektedir. Eklembacaklı hemolenfi yüksek seviyeli amino asitler içerir. Bu farklılıklara rağmen tüm bilinen kodlar büyük benzerlikler gösterirler ve tüm organizmalarda işleyen temel mekanizma aynıdır: üç bazlı kodonlar, tRNA, ribozomlar, kodonların okunma yönü ve nükleotit dizisinin üçer harfler olarak okunup bir amino asit dizisi olarak sentezlenmesi. Örneğin, NUN şeklinde bir kodon (N = herhangi bir nükleotit) genelde hidrofobik amino asitleri kodlar; NCN küçük boyutlu ve orta derecede hidrofobik amino asitler kodlar; NAN orta büyüklüklü hidrofobik amino asitler kodlar; UNN hidrofilik olmayan amino asitler kodlar. Özelikle, proteinlerde bulunan L-amino asitler bazen spontan olarak formula_1 atomunda izomerize olup D-amino asitlere dönüşebilirler. tRNA'nın CCA dizisi ile sonlanan 3' ucuna amino asitler kovalent olarak "yüklenirler". Genetik kod 22 "standart" amino asit tanımlasa da proteinlerdeki amino asitler çevrim sonrası değişimle kimyasal olarak değişikliğe uğrar. Vücuda alınan bazı amino asitler, özellikle esansiyel olmayanlar, protein sentezi için doğrudan kullanılmazlar. Farklı amino asitler, 20 temel amino asitle oluşturulmuş polipeptidlerin daha sonra “farklılaşmaları” ile oluşur. Proteinlerde bunlardan çok daha farklı amino asitler de bulunabilir.