هندسة وراثية طبيعية
الهندسة الوراثية الطبيعية (NGE) هي فئة من العمليات التي اقترحها عالم البيولوجيا الجزيئية جيمس شابيرو لحساب الحداثة التي نشأت في سياق التطور البيولوجي. طور شابيرو هذا العمل على مدى العديد من المنشورات التي استعرضها النظراء منذ عام 1992 وما بعده وفي وقت لاحق من كتابه عام 2011 «التطور: منظر من القرن الحادي والعشرين». استخدم الهندسة الوراثية الطبيعية لحساب العديد من الأمثلة المضادة المقترحة لهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي (الاقتراح بأن اتجاه تدفق المعلومات التسلسلية هو فقط من الحمض النووي إلى الحمض النووي أو الحمض النووي إلى الحمض النووي الريبي إلى البروتينات، وليس العكس والذي تم رفضه جزئيًا في عام 1970). انطلق شابيرو من عمل متنوع مثل تكيف الجهاز المناعي للثديات، كبيرات النوى الهدبية وعلم التخلق. اكتسب العمل بعض الشهرة بعد أن دافع عنه مؤيدو التصميم الذكي بالرغم من نبذ شابيرو الصريح لتلك الحركة.

المفهوم 
طرح شابيرو أفكاره عن الهندسة الوراثية الطبيعية لأول مرة في عام 1992 واستمر بتطويرها من خلال كل من الأدبيات العلمية الأولية والعمل الموجه إلى جمهور أوسع وقد بلغت ذروتها في عام 2011 عند نشر كتابه التطور: منظور من القرن الواحد والعشرين.

الهندسة الوراثية الطبيعية هي رد فعل ضد الاصطناع التطوري الحديث وهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي. تمت صياغة الاصطناع التطوري الحديث قبل توضيح بنية الحلزون المزدوج للحمض النووي ووصول البيولوجيا الجزيئية إلى وضعها الراهن البارز. بالنظر إلى ما كان معروفاً في ذلك الوقت فإنه كان يُعتبر أن نموذج بسيط وقوي للتغير الوراثي من خلال طفرة غير موجهة (كانت توصف بأنها «عشوائية») ومن خلال الانتقاء الطبيعي بأنه كافٍ لشرح التطور كما لوحظ في الطبيعة. حث اكتشاف طبيعة وأدوار الأحماض النووية في علم الوراثة ما يسمى بهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي لفرانسيس كريك. «لا يمكن نقل المعلومات التسلسلية من بروتين إلى بروتين أو حمض نووي»

يشير شابيرو إلى أنه يمكن للأنظمة الخلوية المتعددة أن تؤثر على الحمض النووي استجابةً لمحرضات بيئية معينة. تتعارض هذه التغييرات «الموجهة» مع كل من الطفرات غير الموجهة في الاصطناع التطوري الحديث و (في تفسير شابيرو) الحظر المفروض على المعلومات التي تتدفق من البيئة إلى الجينوم.
يبدأ شابيرو بإدراج ثلاثة دروس من علم الوراثة الجزيئي في ورقة Genetica عام 1992 التي قدمت هذا المفهوم:
 هناك قدر مذهل من الحفظ الجيني عبر الحدود التصنيفية
 ينتج عن التركيب الموزاييكي للجينوم عدة جينات غير محلية ولها آثار متعددة على علم تطور السلالات وذلك بالاعتماد على عمل صديقتك ومعاونته باربرا مكلينتوك
 وجود آليات خلوية متعددة (بما في ذلك العناصر الوراثية المتحركة) التي يمكنها إعادة هيكلة الحمض النووي.

العلاقة مع التصميم الذكي 
يسرد شابيرو في مقالة في بوسطن ريفيو 1997 أربع فئات من الاكتشافات في البيولوجيا الجزيئية والتي لا يمكن تفسيرها من خلال الاصطناع التطوري الحديث بحسب تقديره:

في سياق المقال بشكل خاص وضمن عمل شابيرو بشكل عام يتم العثور على «الذكاء الموجه» داخل الخلية (على سبيل المثال في مقال في هافينغتون بوست بعنوان «الإدراك واتخاذ القرار الخلوي» يعرف شابيرو الإجراءات المعرفية بأنها تلك «القائمة على المعرفة وتتضمن اتخاذ قرارات مناسبة بناءً على المعلومات المكتسبة»، بحجة أن الخلايا تلبي هذه المعايير.). مع ذلك فإن الجمع بين الاصطناع التطوري الحديث ومناقشة الذكاء الخلاق قد لفت انتباه دعاة التصميم الذكي إلى عمله.

تم الاستشهاد بالهندسة الوراثية الطبيعية كجدل علمي مشروع (على عكس الخلافات التي أثارتها مختلف فروع الخلق). بينما يعتبر شابيرو الأسئلة التي يثيرها التصميم الذكي مثيرة للاهتمام، إلا أنه يقطع طرقًا مع الخلقيين من خلال اعتبار هذه المشكلات قابلة للتتبع العلمي (وتحديداً من خلال فهم كيفية لعب الهندسة الوراثية الطبيعية دوراً في تطور الحداثة).

مع نشر التطور: منظور من القرن الحادي والعشرين، ظهر عمل شابيرو مرة أخرى تحت المناقشة في مجتمع التصميم الذكي. في محادثة مع شابيرو، طلب وليام ديمبسكي أفكار شابيرو حول أصول أنظمة الهندسة الوراثية الطبيعية. أجاب شابيرو أن «من أين أتوا في المقام الأول ليس سؤالًا يمكننا الإجابة عليه بشكل واقعي في الوقت الراهن». أجاب شابيرو أن «من أين أتوا في المقام الأول ليس سؤالًا يمكننا الإجابة عليه بشكل واقعي في الوقت الراهن». بينما يرى ديمبسكي أن هذا الموقف لا يتعارض على الأقل مع التصميم الذكي إلا أن شابيرو رفض بشكل صريح ومتكرر كلاً من الخلق بشكل عام والتصميم الذكي بشكل خاص.

النقد 
في حين قيام شابيرو بتطوير الهندسة الوراثية الطبيعية في الأدب الذي يراجعه النظراء فإن الفكرة قد جذبت المزيد من الاهتمام عندما لخص عمله في كتابه التطور: منظور من القرن الحادي والعشرين. تمت مناقشة الكتاب ونقده بشكل واسع ويعود ذلك جزئياً إلى مناقشته لحركة التصميم الذكي. ينقسم النقد إلى فئتين رئيسيتين:
 النظرية تعبر الخط إلى علم الغائية وهو خط يتجلى في المراجعة التي كتبها لاري موران. يشتمل شكل حجة شابيرو على نقاط تشابه مع العديد من الحجج الخلقية التي تفيد بأن البيولوجيا المرصودة لا يمكن تفسيرها من خلال مزيج من الطفرة «العشوائية» (غير الموجهة) والانتقاء الطبيعي. أحد الردود المعيارية لهذه الحجج هو أنه يمكن تفسير البيولوجيا بشكل كاف دون التذرع بأسباب أعلى. تختلف وجهة نظر شابيرو اختلاف كبير عن وجهة نظر الخلقيين وليس أقلها لأن الأسباب العليا لا توجد إلا على مستوى الأجهزة الخلوية. مع ذلك فإنه بالنسبة لناقد غير مقتنع بالحاجة لأسباب عليا من غير المقنع استبدال الأسباب المادية العليا بالقوى الخارقة للطبيعية.
 شابيرو لا يعط قراءة عادلة لهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي. تتطلب قراءة شابيرو لهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي بأنه يمكن للطفرات العشوائية فقط أن تكون أصل التغيير التطوري. إن كانت هذه النظرية صيحة فإن التجاهل الذي تقوم به الآليات التي حددها شابيرو (علم التخلق على سبيل المثال) لرخاوة هذا التطبيق لمصطلح "عشوائي يغالظ هذه القراءة بالفعل. مع ذلك فإن كريك وباقي علماء الوراثة كانوا مدركين تماماً لوجود المطفرات خلال صياغة وإعادة صياغة هدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي وفي الواقع حتى قبل اكتشاف آليات الوراثة البيولوجية. التفسير الأكثر تحفظاً بحسب تعبير مارشال نيرنبرغ هو أن "الحمض النووي يصنع الحمض النووي الريبي وبالتالي البروتين". بموجب هذه القراءة فإن البروتينات غير قادرة على تعديل الحمض النووي ولكن شابيرو يقدم أمثلة متعددة على أماكن حصول هذا بما في ذلك تعديل الهيستون، الفئات الفرعية المطفرة لأنزيمات الإزالة، التنظيم المكثف للعناصر الجينية المتحركة والفئات المختلفة للعناصر المنظمة للحمض النووي الريبي عبر مثيلة السيتوزين ونزع الأمين الإنزيمي.

استجاب شابيرو للمراجعة في الذكاء التطوري.

المراجع 

عمليات تطورية
الهندسة الوراثية الطبيعية ( NGE ) هي فئة من العمليات التي اقترح ها عالم البيولوجيا الجزيئية جيمس شابيرو ل حساب الحداثة التي نشأت في سياق التطور البيولوجي . طور شابيرو هذا العمل على مدى العديد من المنشورات التي استعرض ها النظراء منذ عاموما بعد ه و في وقت لاحق من كتاب ه عام « التطور : منظر من القرن الحادي و العشرين » . استخدم الهندسة الوراثية الطبيعية ل حساب العديد من ال أمثلة المضادة المقترحة لهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي ( الاقتراح ب أن اتجاه تدفق المعلومات التسلسلية هو فقط من الحمض النووي إلى الحمض النووي أو الحمض النووي إلى الحمض النووي الريبي إلى البروتينات ، و ليس العكس و الذي تم رفض ه جزئيًا في عام انطلق شابيرو من عمل متنوع مثل تكيف الجهاز المناعي للثديات ، كبيرات النوى الهدبية و علم التخلق . اكتسب العمل بعض الشهرة بعد أن دافع عن ه مؤيدو التصميم الذكي ب الرغم من نبذ شابيرو الصريح ل تلك الحركة . المفهوم طرح شابيرو أفكار ه عن الهندسة الوراثية الطبيعية ل أول مرة في عامواستمر ب تطوير ها من خلال كل من الأدبيات العلمية الأولية و العمل الموجه إلى جمهور أوسع و قد بلغت ذروة ها في عام عند نشر كتاب ه التطور : منظور من القرن الواحد و العشرين . الهندسة الوراثية الطبيعية هي رد فعل ضد الاصطناع التطوري الحديث وهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي . تمت صياغة الاصطناع التطوري الحديث قبل توضيح بنية الحلزون المزدوج للحمض النووي و وصول البيولوجيا الجزيئية إلى وضع ها الراهن البارز . ب النظر إلى ما كان معروفاً في ذلك الوقت ف إن ه كان يُعتبر أن نموذج بسيط وقوي للتغير الوراثي من خلال طفرة غير موجهة ( كانت توصف ب أن ها « عشوائية » ) و من خلال الانتقاء الطبيعي ب أن ه كافٍ ل شرح التطور كما لوحظ في الطبيعة . حث اكتشاف طبيعة و أدوار الأحماض النووية في علم الوراثة ما يسمى ب هدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي لفرانسيس كريك . « لا يمكن نقل المعلومات التسلسلية من بروتين إلى بروتين أو حمض نووي » يشير شابيرو إلى أن ه يمكن للأنظمة الخلوية المتعددة أن تؤثر على الحمض النووي استجابةً لمحرضات بيئية معينة . تتعارض هذه التغييرات « الموجهة » مع كل من الطفرات غير الموجهة في الاصطناع التطوري الحديث و ( في تفسير شابيرو ) الحظر المفروض على المعلومات التي تتدفق من البيئة إلى الجينوم . يبدأ شابيرو ب إدراج ثلاثة دروس من علم الوراثة الجزيئي في ورقة Genetica عام التي قدمت هذا المفهوم : هناك قدر مذهل من الحفظ الجيني عبر الحدود التصنيفية ينتج عن التركيب الموزاييكي للجينوم عدة جينات غير محلية و ل ها آثار متعددة على علم تطور السلالات و ذٰلك ب الاعتماد على عمل صديقة ك ومعاونته باربرا مكلينتوك وجود آليات خلوية متعددة ( ب ما في ذلك العناصر الوراثية المتحركة ) التي يمكن ها إعادة هيكلة الحمض النووي . العلاقة مع التصميم الذكي يسرد شابيرو في مقالة في بوسطن ريفيوأربع فئات من الاكتشافات في البيولوجيا الجزيئية و التي لا يمكن تفسير ها من خلال الاصطناع التطوري الحديث ب حسب تقدير ه : في سياق المقال ب شكل خاص و ضمن عمل شابيرو ب شكل عام يتم العثور على « الذكاء الموجه » داخل الخلية ( على سبيل المثال في مقال في هافينغتون بوست ب عنوان « الإدراك و اتخاذ القرار الخلوي » يعرف شابيرو الإجراءات المعرفية ب أن ها تلك « القائمة على المعرفة و تتضمن اتخاذ قرارات مناسبة بناءً على المعلومات المكتسبة » ، ب حجة أن الخلايا تلبي هذه المعايير . ) . مع ذلك ف إن الجمع بين الاصطناع التطوري الحديث و مناقشة الذكاء الخلاق قد لفت انتباه دعاة التصميم الذكي إلى عمل ه . تم الاستشهاد بالهندسة الوراثية الطبيعية كجدل علمي مشروع ( على عكس الخلافات التي أثارت ها مختلف فروع الخلق ) . بينما يعتبر شابيرو الأسئلة التي يثير ها التصميم الذكي مثيرة للاهتمام ، إلا أن ه يقطع طرقًا مع الخلقيين من خلال اعتبار هذه المشكلات قابلة للتتبع العلمي ( و تحديدا من خلال ف هم كيفية لعب الهندسة الوراثية الطبيعية دوراً في تطور الحداثة ) . مع نشر التطور : منظور من القرن الحادي و العشرين ، ظهر عمل شابيرو مرة أخرى تحت ا المناقشة في مجتمع التصميم الذكي . في محادثة مع شابيرو ، طلب وليام ديمبسكي أفكار شابيرو حول أصول أنظمة الهندسة الوراثية الطبيعية . أجاب شابيرو أن « من أين أتوا في المقام الأول ليس سؤالًا يمكن نا الإجابة علي ه ب شكل واقعي في الوقت الراهن » . أجاب شابيرو أن « من أين أتوا في المقام الأول ليس سؤالًا يمكن نا الإجابة علي ه ب شكل واقعي في الوقت الراهن » . بينما يرى ديمبسكي أن هذا الموقف لا يتعارض على الأقل مع التصميم الذكي إلا أن شابيرو رفض ب شكل صريح ومتكرر كلاً من الخلق ب شكل عام و التصميم الذكي ب شكل خاص . النقد في حين قيام شابيرو ب تطوير الهندسة الوراثية الطبيعية في الأدب الذي يراجع ه النظراء ف إن الفكرة قد جذبت المزيد من الاهتمام عندما لخص عمل ه في كتاب ه التطور : منظور من القرن الحادي و العشرين . تمت مناقشة الكتاب ونقد ه ب شكل واسع و يعود ذلك جزئياً إلى مناقشة ه ل حركة التصميم الذكي . ينقسم النقد إلى فئتين رئيسيتين : ال نظرية تعبر الخط إلى علم الغائية و هو خط يتجلى في المراجعة التي كتب ها لاري موران . يشتمل شكل حجة شابيرو على نقاط تشاب ه مع العديد من الحجج الخلقية التي تفيد ب أن البيولوجيا المرصودة لا يمكن تفسير ها من خلال مزيج من الطفرة « العشوائية » ( غير الموجهة ) والانتقاء الطبيعي . أحد الردود المعيارية ل هٰذه الحجج هو أن ه يمكن تفسير البيولوجيا ب شكل كاف دون التذرع بأسباب أعلى . تختلف وجهة نظر شابيرو اختلاف كبير عن وجهة نظر الخلقيين و ليس أقل ها لأن الأسباب العليا لا توجد إلا على مستوى الأجهزة الخلوية . مع ذلك ف إن ه ب النسبة لناقد غير مقتنع ب الحاجة ل أسباب عليا من غير المقنع استبدال الأسباب المادية العليا ب القوى الخارقة للطبيعية . شابيرو لا يعط قراءة عادلة لهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي . تتطلب قراءة شابيرو لهدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي ب أن ه يمكن للطفرات العشوائية فقط أن تكون أصل التغيير التطوري . إن كانت هذه ال نظرية صيحة ف إن التجاهل الذي تقوم ب ه الآليات التي حدد ها شابيرو ( علم التخلق على سبيل المثال ) لرخاوة هذا التطبيق لمصطلح " عشوائي يغالظ هذه القراءة ب الفعل . مع ذلك ف إن كريك و باقي علماء الوراثة كانوا مدركين تماماً ل وجود المطفرات خلال صياغة و إعادة صياغة هدف علم الأحياء الجزيئي الرئيسي و في الواقع حتى قبل اكتشاف آليات الوراثة البيولوجية . التفسير الأكثر تحفظاً ب حسب تعبير مارشال نيرنبرغ هو أن " الحمض النووي يصنع الحمض النووي الريبي و ب التالي البروتين " . ب موجب هذه القراءة ف إن البروتينات غير قادرة على تعديل الحمض النووي و لٰكن شابيرو يقدم أمثلة متعددة على أماكن حصول هذا ب ما في ذلك تعديل الهيستون ، الفئات الفرعية المطفرة لأنزيمات ال إزالة ، التنظيم المكثف للعناصر الجينية المتحركة والفئات المختلفة للعناصر المنظمة للحمض النووي الريبي عبر مثيلة السيتوزين و نزع الأمين الإنزيمي . استجاب شابيرو للمراجعة في الذكاء التطوري . المراجع عمليات تطورية