Dumontinia tuberosa
Dumontinia tuberosa, la Sclérotinie tubéreuse, est une espèce de champignons ascomycètes de la famille des Sclerotiniaceae. Il s'agit de l'unique espèce du genre Dumontinia. Cette petite pézize brune qui ne dépasse pas trois centimètres de diamètre est un parasite phytopathogène de certaines Anémones, principalement l'Anémone sylvie, son long pied se rattachant profondément à un sclérote, c'est-à-dire à un amas souterrain de mycélium dur et noir, formant un manchon autour d'un vieux rhizome dont le champignon se nourrit et constituant une réserve nutritive depuis laquelle se développe la fructification printanière. L'espèce est présente sur l'ensemble de l'écozone holarctique.

Taxonomie 

Il s'agit de l'une des pézizes les plus anciennement connues. Elle est décrite pour la première fois par le botaniste allemand Johannes Hedwig en , sous le nom Octospora tuberosa. Mais elle avait été récoltée et illustrée plus de dix ans auparavant, en , par son compatriote . L'espèce est recombinée dans le genre Peziza en  par l'Écossais James Dickson puis formellement décrite en , par le Français Pierre Bulliard, ce qui constitue son basionyme. Tout au long du , son sclérote, son parasitisme sur les rhizomes d'Anémones et ses conidies attirent l'attention de mycologues de renom comme les Français Edmond Tulasne, Hector Léveillé et Jules de Seynes ou le Prussien Anton de Bary.

Cette espèce est recombinée en  dans le genre Sclerotinia, qui regroupe les pézizes produisant des sclérotes. La mycologue américaine Linda Myra Kohn créé un genre distinct en  pour rassembler les espèces de Sclerotinia à la structure cellulaire de l'excipulum particulière, c'est-à-dire aux cellules extérieures des apothécies à la texture prismatique et à la partie interne composée d’hyphes détachés dans une matrice gélatineuse. Sclerotinia ulmariae, qui produit un sclérote sur la Reine des prés est également recombiné dans ce genre par Kohn sous le nom Dumontinia ulmariae. Cependant, son nom correct est depuis  Hyalopeziza millepunctata, classé dans la famille des Hylopezizaceae. Le genre Dumontinia est donc monotypique. 

Le nom de genre Dumontinia est un hommage au mycologue américain du Jardin botanique de New York , collègue de l'auteure. L'épithète spécifique « tuberosa » fait référence au sclérote, tuber signifiant « truffe, racine bombée ».

En français, l'espèce est nommée de son nom vulgarisé et normalisé « Sclérotinie tubéreuse ». Le nom vulgarisé « Pézize tubéreuse » est également employé aux  et .

Description

Macroscopie 

La Sclérotinie tubéreuse produit une apothécie d'abord profondément bombée, puis en forme de cruche ou de coupe étalée. Elle mesure de  de diamètre. Les surfaces interne et externe sont lisses, la marge est incurvée, droite et régulière et l'ensemble est uniformément coloré de brun fonçant à mesure du mûrissement, l'extérieur étant parfois un peu plus clair et finement pruineux. Sa chair est cireuse, cassante et brunâtre. Le tout est prolongé par un long pied fin, mesurant de , plus ou moins déformé et partiellement enfoui dans le sol. Il prend naissance d'un sclérote souterrain globuleux ou en forme de haricot, noir à l'extérieur, blanc à l'intérieur, dur et résistant. Sa taille varie de celle d'une tête d'épingle à celle d'une noisette et peut atteindre .

Microscopie  
Dumontinia tuberosa produit des spores elliptiques à ellipsoïdales, lisses, hyalines, biguttulées à quadriguttulées, plus rarement garnies de six guttules et mesurant de  de long pour  de large. Ces spores sont produites par huit et disposées en une seule file dans des asques cylindriques et clavés qui mesurent de  de long pour  de diamètre et dont l'extrémité bleuie au bleu de méthylène. Les paraphyses sont minces, cylindriques, non cloisonnées et légèrement élargies aux extrémités. Les cellules externes des apothécies présentent une formation prismatique alors que la partie interne est composée d’hyphes détachés dans une matrice gélatineuse. Les hyphes constituant le sclérote sont longs, sinueux, anguleux, disposés sans ordre précis et mesurent  de diamètre. Ceux de la partie interne sont hyalins alors que ceux de la couche externe sont noirâtres.

Écologie et répartition 

La Sclérotinie tubéreuse pousse tôt au printemps, de façon solitaire ou en troupe, parmi les Anémones en fleurs dans les forêts de feuillus humides notamment les ripisylves ainsi que dans les prairies humides. 

Dumontinia tuberosa est dispersé, peu fréquent à courant, mais jamais en grand nombre.

L'espèce est présente en Europe dont les pays francophones, en Asie jusqu'au Japon et en Amérique du Nord.

Plantes hôtes 
La Sclérotinie tubéreuse a pour plantes hôtes des Anémones, essentiellement l'Anémone sylvie, mais également l'Anémone de Grèce et l'Anémone fausse-renoncule. Selon certaines sources, Dumontinia tuberosa peut produire un sclérote à partir des rhizomes de la Renoncule ficaire alors que d'autres le limitent aux Anémones. Au Japon, l'espèce est aussi en association avec la variété japonica de l'Anémone hépathique.

Biologie 

Même si l'Anémone n'est pas totalement indispensable à la formation du sclérote, la relation entre la plante et Dumontinia tuberosa reste fréquente.

Le champignon est capable d'attaquer le rhizome par sa surface en traversant la cuticule et les parois cellulaires. Si elles existent, les blessures servent également de voie de pénétration. L'infestation concerne toujours les parties âgées du rhizome, à l'opposé du bourgeon terminal et n'atteint jamais les parties récentes ; ces zones anciennes étant souvent plus abimées et plus riches en amidon que les jeunes. Des coussinets d'infection se forment au contact de la cuticule où ils émettent des filaments d'infection qui traversent les couches cuticulaires de l'hôte par l'intermédiaire d'appressoria simples servant à franchir les parois cellulaires. Cependant, il ne forme pas d'haustoria. Le champignon s'y nourrit d'amidon, de pectine ainsi que d'acides aminés tout en délaissant les acides organiques. Bien qu'il soit capable de percer les parois cellulosiques, il ne digère pas la cellulose. 

Petit à petit, le mycélium forme un manchon qui entoure le rhizome infecté, sans qu'il n'intègre la plante hôte. Cette gaine mycélienne est toujours mêlée d'humus et de débris végétaux et passe facilement inaperçue. Il s'ensuit une phase de dormance hivernale qui se lève au printemps suivant. La grande quantité de mycélium accumulée dans le sclérote permet d'amorcer le développement de la fructification, lequel coïncide, dans le cycle annuel, avec la période de végétation active de l'Anémone.

Les spores germent facilement, y compris au sein de la cupule, et produisent soit directement des conidies hyalines et sphériques soit un mycélium très mince, un promycélium, donnant naissance à un grand nombre de conidies. Ces dernières produisent ensuite un mycélium qui cherche à se développer en parasitant le rhizome d'une nouvelle Anémone.

Une fois colonisés et vidés de leur réserve, les rhizomes peuvent subir des infestations secondaires de la part d'autres agents parasites ou saprobiontes, laissant in fine des « rhizomes fantômes » creux souvent rencontrés lors des prospections du champignon.

Étant donné que les jeunes rhizomes ne sont pas infectés, le parasitisme est limité et il serait possible de qualifier la relation de commensalisme. Cependant, cette association est généralement considérée comme néfaste aux Anémones. C'est par exemple le cas dans le cas pour l'Anémone hépatique au Japon où il s'agit bien de parasitisme : les feuilles flétrissent en devenant brun rougeâtre alors que le collet et les racines pourrissent en présence du champignon.

Confusions possibles 

Sclerotinia sclerotiorum (dont Sclerotinia ficariae est un synonyme courant) est morphologiquement similaire à Dumontinia tuberosa. Cependant, son apothécie est brun doré, ses spores mesurent de  de long pour  de large et contiennent moins de quatre guttules. De plus, il est saprobionte d'un large éventail de plantes telles que la Renoncule ficaire et de plantes cultivées comme Phaseolus, Daucus, Helianthus et Solanum dans le tissu duquel s'enfonce le sclérote, ce dernier mesurant généralement  par . Dans le cas où Dumontinia tuberosa est parasite de la Renoncule ficaire, les spécimens sont délicats à différencier. D'autres critères plus ténus sont alors utilisables : la couche externe de l'apothécie de Dumontinia tuberosa est composée d'hyphes aux cellules distendues généralement noyées dans un gel et la partie externe du sclérote est composée d'une couche unique de cellules aux hyphes clavés. À l'inverse, la couche externe de l'apothécie de Sclerotinia sclerotiorum est composée de cellules globuleuses et la partie externe de son sclérote est composée de deux à six couches d'hyphes globuleux.

Une autre espèce proche, Sclerotinia trifoliorum, est parasite de Fabacées comme le genre Trifolium. Sa coloration tend plus vers le brun rougeâtre, sa taille est plus petite et ses spores mesurent de  de long pour  de large. Son sclérote noir est de forme irrégulière et peut mesurer jusqu'à  par .

Stromatinia rapulum est également une espèce de champignons phytopathogènes morphologiquement similaires mais il parasite les rhizomes du genre Polygonatum. Ses apothécies pédonculées ressemblent à celles de Dumontinia tuberosa et ses spores qui mesurent de  de long pour  de large, ont des dimensions proches

Notes et références

Liens externes

Dumontinia

Dumontinia tuberosa 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Sclerotiniaceae
Espèce de champignons (nom scientifique)
Ascomycète phytopathogène
Dumontinia tuberosa , la Sclérotinie tubéreuse , est une espèce de champignons ascomycètes de la famille de les Sclerotiniaceae . Il s' agit de l' unique espèce de le genre Dumontinia . Cette petite pézize brune qui ne dépasse pas trois centimètres de diamètre est un parasite phytopathogène de certaines Anémones , principalement l' Anémone sylvie , son long pied se rattachant profondément à un sclérote , c'est-à-dire à un amas souterrain de mycélium dur et noir , formant un manchon autour d' un vieux rhizome dont le champignon se nourrit et constituant une réserve nutritive depuis laquelle se développe la fructification printanière . L' espèce est présente sur l' ensemble de l' écozone holarctique . Taxonomie Il s' agit de l' une de les pézizes les plus anciennement connues . Elle est décrite pour la première fois par le botaniste allemand Johannes Hedwig en , sous le nom Octospora tuberosa . Mais elle avait été récoltée et illustrée plus de dix ans auparavant , en , par son compatriote \ . L' espèce est recombinée dans le genre Peziza en par l' Écossais James Dickson puis formellement décrite en , par le Français Pierre Bulliard , ce qui constitue son basionyme . Tout à le long de le , son sclérote , son parasitisme sur les rhizomes d' Anémones et ses conidies attirent l' attention de mycologues de renom comme les Français Edmond Tulasne , Hector Léveillé et Jules de Seynes ou le Prussien Anton de Bary . Cette espèce est recombinée en dans le genre Sclerotinia , qui regroupe les pézizes produisant de les sclérotes . La mycologue américaine Linda Myra Kohn créé un genre distinct en pour rassembler les espèces de Sclerotinia à la structure cellulaire de l' excipulum particulière , c'est-à-dire à les cellules extérieures de les apothécies à la texture prismatique et à la partie interne composée d’ hyphes détachés dans une matrice gélatineuse . Sclerotinia ulmariae , qui produit un sclérote sur la Reine de les prés est également recombiné dans ce genre par Kohn sous le nom Dumontinia ulmariae . Cependant , son nom correct est depuis Hyalopeziza millepunctata , classé dans la famille de les Hylopezizaceae . Le genre Dumontinia est donc monotypique . Le nom de genre Dumontinia est un hommage à le mycologue américain de le Jardin botanique de New York , collègue de l' auteure . L' épithète spécifique « tuberosa » fait référence à le sclérote , tuber signifiant « truffe , racine bombée » . En français , l' espèce est nommée de son nom vulgarisé et normalisé « Sclérotinie tubéreuse » . Le nom vulgarisé « Pézize tubéreuse » est également employé à les et \ . Description Macroscopie La Sclérotinie tubéreuse produit une apothécie d' abord profondément bombée , puis en forme de cruche ou de coupe étalée . Elle mesure de de diamètre . Les surfaces interne et externe sont lisses , la marge est incurvée , droite et régulière et l' ensemble est uniformément coloré de brun fonçant à mesure de le mûrissement , l' extérieur étant parfois un peu plus clair et finement pruineux . Sa chair est cireuse , cassante et brunâtre . Le tout est prolongé par un long pied fin , mesurant de , plus ou moins déformé et partiellement enfoui dans le sol . Il prend naissance d' un sclérote souterrain globuleux ou en forme de haricot , noir à l' extérieur , blanc à l' intérieur , dur et résistant . Sa taille varie de celle d' une tête d' épingle à celle d' une noisette et peut atteindre \ . Microscopie Dumontinia tuberosa produit de les spores elliptiques à ellipsoïdales , lisses , hyalines , biguttulées à quadriguttulées , plus rarement garnies de six guttules et mesurant de de long pour de large . Ces spores sont produites par huit et disposées en une seule file dans de les asques cylindriques et clavés qui mesurent de de long pour de diamètre et dont l' extrémité bleuie à le bleu de méthylène . Les paraphyses sont minces , cylindriques , non cloisonnées et légèrement élargies à les extrémités . Les cellules externes de les apothécies présentent une formation prismatique alors que la partie interne est composée d’ hyphes détachés dans une matrice gélatineuse . Les hyphes constituant le sclérote sont longs , sinueux , anguleux , disposés sans ordre précis et mesurent de diamètre . Ceux de la partie interne sont hyalins alors que ceux de la couche externe sont noirâtres . Écologie et répartition La Sclérotinie tubéreuse pousse tôt à le printemps , de façon solitaire ou en troupe , parmi les Anémones en fleurs dans les forêts de feuillus humides notamment les ripisylves ainsi que dans les prairies humides . Dumontinia tuberosa est dispersé , peu fréquent à courant , mais jamais en grand nombre . L' espèce est présente en Europe dont les pays francophones , en Asie jusqu' à le Japon et en Amérique de le Nord . Plantes hôtes La Sclérotinie tubéreuse a pour plantes hôtes de les Anémones , essentiellement l' Anémone sylvie , mais également l' Anémone de Grèce et l' Anémone fausse-renoncule . Selon certaines sources , Dumontinia tuberosa peut produire un sclérote à partir de les rhizomes de la Renoncule ficaire alors que d' autres le limitent à les Anémones . À le Japon , l' espèce est aussi en association avec la variété japonica de l' Anémone hépathique . Biologie Même si l' Anémone n' est pas totalement indispensable à la formation de le sclérote , la relation entre la plante et Dumontinia tuberosa reste fréquente . Le champignon est capable d' attaquer le rhizome par sa surface en traversant la cuticule et les parois cellulaires . Si elles existent , les blessures servent également de voie de pénétration . L' infestation concerne toujours les parties âgées de le rhizome , à l' opposé de le bourgeon terminal et n' atteint jamais les parties récentes ; ces zones anciennes étant souvent plus abimées et plus riches en amidon que les jeunes . De les coussinets d' infection se forment à le contact de la cuticule où ils émettent de les filaments d' infection qui traversent les couches cuticulaires de l' hôte par l' intermédiaire d' appressoria simples servant à franchir les parois cellulaires . Cependant , il ne forme pas d' haustoria . Le champignon s' y nourrit d' amidon , de pectine ainsi que d' acides aminés tout en délaissant les acides organiques . Bien qu' il soit capable de percer les parois cellulosiques , il ne digère pas la cellulose . Petit à petit , le mycélium forme un manchon qui entoure le rhizome infecté , sans qu' il n' intègre la plante hôte . Cette gaine mycélienne est toujours mêlée d' humus et de débris végétaux et passe facilement inaperçue . Il s' ensuit une phase de dormance hivernale qui se lève à le printemps suivant . La grande quantité de mycélium accumulée dans le sclérote permet d' amorcer le développement de la fructification , lequel coïncide , dans le cycle annuel , avec la période de végétation active de l' Anémone . Les spores germent facilement , y compris à le sein de la cupule , et produisent soit directement de les conidies hyalines et sphériques soit un mycélium très mince , un promycélium , donnant naissance à un grand nombre de conidies . Ces dernières produisent ensuite un mycélium qui cherche à se développer en parasitant le rhizome d' une nouvelle Anémone . Une fois colonisés et vidés de leur réserve , les rhizomes peuvent subir de les infestations secondaires de la part d' autres agents parasites ou saprobiontes , laissant in fine de les « rhizomes fantômes » creux souvent rencontrés lors de les prospections de le champignon . Étant donné que les jeunes rhizomes ne sont pas infectés , le parasitisme est limité et il serait possible de qualifier la relation de commensalisme . Cependant , cette association est généralement considérée comme néfaste à les Anémones . C' est par exemple le cas dans le cas pour l' Anémone hépatique à le Japon où il s' agit bien de parasitisme \ : les feuilles flétrissent en devenant brun rougeâtre alors que le collet et les racines pourrissent en présence de le champignon . Confusions possibles Sclerotinia sclerotiorum ( dont Sclerotinia ficariae est un synonyme courant ) est morphologiquement similaire à Dumontinia tuberosa . Cependant , son apothécie est brun doré , ses spores mesurent de de long pour de large et contiennent moins de quatre guttules . De plus , il est saprobionte d' un large éventail de plantes telles que la Renoncule ficaire et de plantes cultivées comme Phaseolus , Daucus , Helianthus et Solanum dans le tissu de lequel s' enfonce le sclérote , ce dernier mesurant généralement par \ . Dans le cas où Dumontinia tuberosa est parasite de la Renoncule ficaire , les spécimens sont délicats à différencier . D' autres critères plus ténus sont alors utilisables \ : la couche externe de l' apothécie de Dumontinia tuberosa est composée d' hyphes à les cellules distendues généralement noyées dans un gel et la partie externe de le sclérote est composée d' une couche unique de cellules à les hyphes clavés . À l' inverse , la couche externe de l' apothécie de Sclerotinia sclerotiorum est composée de cellules globuleuses et la partie externe de son sclérote est composée de deux à six couches d' hyphes globuleux . Une autre espèce proche , Sclerotinia trifoliorum , est parasite de Fabacées comme le genre Trifolium . Sa coloration tend plus vers le brun rougeâtre , sa taille est plus petite et ses spores mesurent de de long pour de large . Son sclérote noir est de forme irrégulière et peut mesurer jusqu' à par \ . Stromatinia rapulum est également une espèce de champignons phytopathogènes morphologiquement similaires mais il parasite les rhizomes de le genre Polygonatum . Ses apothécies pédonculées ressemblent à celles de Dumontinia tuberosa et ses spores qui mesurent de de long pour de large , ont de les dimensions proches Notes et références Liens externes Dumontinia Dumontinia tuberosa Sclerotiniaceae Espèce de champignons ( nom scientifique ) Ascomycète phytopathogène