Espèce sauvage apparentée à une plante cultivée
Une espèce sauvage apparentée à une plante cultivée (ESAPC) ou parent sauvage (en anglais, crop wild relative ou CWR) est une espèce ou variété de plantes sauvages étroitement apparentées à une plante domestiquée, dont les origines géographiques peuvent être attribuées à des régions connues sous le nom de centres de diversité, définis par le botaniste russe, Nikolaï Vavilov. Il peut s'agir d'un ancêtre sauvage de la plante domestiquée ou d'un autre taxon étroitement apparenté.

Vue d'ensemble 

Les espèces sauvages apparentées aux plantes cultivées constituent une ressource de plus en plus importante pour améliorer la production agricole et maintenir des agroécosystèmes durables.
Avec l'avènement du changement climatique et une plus grande instabilité des écosystèmes, les ESAPC  sont susceptibles de s'avérer une ressource essentielle pour assurer la sécurité alimentaire du nouveau millénaire. C'est Nikolaï Vavilov, le botaniste russe, qui a compris le premier l'importance des parents sauvages des plantes cultivées au début du .
Le matériel génétique des ESAPC a été utilisé par l'homme pendant des milliers d'années pour améliorer la qualité et le rendement des plantes cultivées. Les agriculteurs utilisent des méthodes de sélection traditionnelles depuis des millénaires, le maïs sauvage (Zea mexicana) est couramment cultivé aux côtés du maïs pour favoriser les croisements naturels et améliorer les rendements. Plus récemment, les sélectionneurs ont utilisé les gènes de parents sauvages pour améliorer diverses plantes cultivées comme le riz (Oryza sativa), la tomate (Solanum lycopersicum) et les légumineuses à graines.

Les ESAPC ont fourni de nombreux gènes utiles aux plantes cultivées, et les variétés modernes de la plupart des principales plantes cultivées contiennent maintenant des gènes de leurs parents sauvages. Par conséquent, les ESAPC  sont des plantes sauvages apparentées à des espèces importantes sur le plan socioéconomique, notamment les cultures vivrières, les plantes fourragères, les plantes médicinales, les condiments, les plantes ornementales et les essences forestières, ainsi que les plantes utilisées à des fins industrielles, pour la production d'huile et de fibres notamment, auxquelles elles peuvent apporter des traits bénéfiques.

Définition 
Pour établir le degré de parenté avec les plantes cultivées, une méthode qui pourrait être appliquée est celle du concept de « pool génique » de Harlan et de Wet (1971), subdivisé en trois groupes : le pool génique « primaire » pour les parents les plus proches, le pool génique « secondaire » pour les parents plus éloignés et le pool génique « tertiaire » pour ceux qui sont très éloignés. 

Cependant, pour la majorité des complexes d'espèces cultivées, en particulier ceux des régions tropicales, ce concept n'est pas utilisable, les informations disponibles étant insuffisantes.
Maxted et al. (2006) ont donc proposé une autre solution en s'appuyant sur la hiérarchie taxinomique existante. Les parents sauvages sont classés dans des groupes de taxons ainsi définis par rapport à la plante cultivée :
 1a : la plante cultivée elle-même, 
 1b : même espèce,
 2 : même série ou section, 
 3 : même sous-genre
 4 : même genre,
 5 : même tribu, mais genre différent. 

Ce système de classement suppose que la classification existante du genre contienne une structure infra-générique.
Dans ces conditions une « espèce sauvage apparentée à une plante cultivée » peut être définie comme « un taxon végétal sauvage qui a une utilité indirecte dérivée de sa relation génétique relativement étroite, c'est-à-dire appartenant soit aux pools géniques primaire ou secondaire, soit aux groupes de taxons 1 à 4, avec une plante cultivée. ».

Conservation des espèces sauvages apparentées 

Les ESAPC sont des composants essentiels des écosystèmes naturels et agricoles et sont donc indispensables au maintien de la santé des écosystèmes. Leur conservation et leur utilisation durable sont très importantes pour améliorer la production agricole, augmenter la sécurité alimentaire et maintenir un environnement sain

Les populations naturelles de nombreuses ESAPC sont de plus en plus menacées. Elles sont menacés par la perte d'habitat, par la destruction et la dégradation de l'environnement naturel ou par leur conversion à d'autres usages. La déforestation entraîne la perte de nombreuses populations de parents sauvages importants d'arbres fruitiers et de plantes industrielles. Les populations sauvages apparentées aux plantes céréalières qui se trouvent dans les zones arides ou semi-arides sont sévèrement réduites par le surpâturage et la désertification qui en résulte. L'industrialisation croissante de l'agriculture réduit considérablement la présence des ESAPC dans les agroécosystèmes traditionnels. La conservation et l'utilisation judicieuses des ESAPC sont des éléments essentiels pour renforcer la sécurité alimentaire, éliminer la pauvreté et préserver l'environnement.

Les stratégies de conservation des ESAPC prennent souvent en compte à la fois la conservation « in situ » et la conservation « ex situ ».
Ce sont des approches complémentaires de la conservation des ESAPC, car chacune a ses avantages et ses inconvénients. Par exemple, si la conservation « ex situ » protège les ESAPC (ou plus exactement leurs gènes) contre les menaces dans la nature, elle peut limiter leur évolution et leur adaptation aux nouveaux défis environnementaux..

En 2016, 29 % des espèces de plantes sauvages apparentées étaient complètement absentes des banques de gènes dans le monde, et 24 % étaient représentées par moins de 10 échantillons. Plus de 70 % de toutes les espèces sauvages apparentées dans le monde présentaient un besoin urgent de collecte supplémentaire pour améliorer leur représentation dans les banques de gènes, et plus de 95 % étaient insuffisamment représentées en termes de variation géographique et écologique. Alors que les priorités les plus importantes pour la collecte se trouvent dans le bassin méditerranéen et au Proche-Orient, en Europe occidentale et méridionale, en Asie du Sud-Est et en Amérique du Sud, les parents sauvages insuffisamment représentés dans les banques de gènes sont distribués dans presque tous les pays du monde.

En France et dans de nombreux pays, des réseaux de ressource génétique sont organisés selon la Convention sur la diversité biologique afin d'essayer de conserver au mieux et de manière équitable les principales espèces de plantes utilisées par l'homme dans les différents pays. En 2017, le Traité international sur les ressources phytogénétiques pour l'alimentation et l'agriculture (TIRPAA) a été complété pour améliorer les échanges et l'utilisation durable des ressources phytogénétiques.

Exemples de parents sauvages

Céréales 
 Avoine (Avena sativa) – Avena byzantina
 Quinoa (Chenopodium quinoa) – Chenopodium berlandieri
 Éleusine (Eleusine coracana) – Eleusine africana
 Orge (Hordeum vulgare) – Hordeum arizonicum
 Riz (Oryza sativa) – Oryza rufipogon
 Riz africain (Oryza glaberrima) – Oryza barthii
 Mil (Pennisetum glaucum) – Pennisetum purpureum
 Seigle (Secale cereale subsp. cereale) – Secale cereale subsp. dighoricum
 Sorgho (Sorghum bicolor) – Sorghum halepense
 Millet commun (Panicum miliaceum) – Panicum fauriei
 Blé dur (Triticum turgidum subsp. durum) - amidonnier sauvage (Triticum dicoccoides)
 Blé tendre (Triticum aestivum) – Engrain (Triticum monococcum)
 Maïs (Zea mays subsp. mays) – Zea (Zea diploperennis)

Légumes 

Nota : De nombreux légumes différents partagent un ancêtre commun, en particulier dans le genre Brassica. De nombreux légumes sont aussi des hybrides d'espèces différentes, ce qui est aussi particulièrement vrai pour le genre Brassica..
 Ail cultivé (Allium sativum var. sativum) – Allium atroviolaceum
 Asperge (Asparagus officinalis) – Asparagus dauricus
 Aubergine (Solanum melongena) – (Solanum incanum)
 Betterave potagère (Beta vulgaris subsp. vulgaris) – Beta vulgaris subsp. maritima
 Carotte (Daucus carota) – Daucus gracilis
 Chou (Brassica oleracea var. capitata) - Brassica elongata
 Concombre (Cucumis sativus) – Cucumis hystrix
 Courge (Cucurbita pepo subsp. pepo) – Cucurbita okeechobeensis
 Épinard (Spinacea oleracea) – Spinacia turkestanica
 Laitue (Lactuca sativa) – Laitue scariole (Lactuca serriola)
 Moutarde brune (Brassica juncea subsp. juncea) – Brassica carinata
 Moutarde noire (Brassica nigra) – Moutarde des champs (Sinapis arvensis)
 Navet (Brassica rapa subsp. rapa) – Brassica rapa
 Oignon (Allium cepa var. cepa) – Allium galanthum
 Piment (Capsicum annuum) – Capsicum baccatum
 Poireau (Allium ampeloprasum) – Ciboule (Allium fistulosum)
 Potiron (Cucurbita maxima subsp. maxima) – Cucurbita ecuadorensis
 Tomate (Solanum lycopersicum) – Solanum chilense

Plantes fruitières 
 Abricotier (Prunus armeniaca) – Prunus brigantina
 Amandier (Prunus dulcis) – Prunier japonais (Prunus salicina)
 Ananas (Ananas comosus) – Ananas bracteatus
 Arbre à pain (Artocarpus altilis) – Jacquier (Artocarpus heterphyllus)
 Avocatier (Persea americana) – Persea schiedeana
 Bananier – Musa acuminata et Musa balbisiana
 Cacaoyer (Theobroma cacao) – Theobroma angustifolium
 Cerisier (Prunus avium) – Prunus mahaleb
 Citronnier (Citrus limon) – Citrus indica
 Fraisier (Fragaria × ananassa)
 Manguier (Mangifera indica) – Mangifera altissima
 Oranger (Citrus sinensis) – Limettier (Citrus aurantiifolia)
 Pamplemoussier (Citrus paradisi) – Citrus medica
 Papayer (Carica papaya) – Jarilla chocola
 Pastèque (Citrullus lanatus var. lanatus) – Coloquinte (Citrullus colocynthis)
 Pêcher (Prunus persica var. persica) – Prunus tomentosa
 Poirier (Pyrus communis) – Pyrus pyraster et Pyrus caucasica
 Pommier (Malus domestica) – principalement Malus sieversii, mais certains cultivars appartiennet à Malus sylvestris ou sont des hybrides des deux.
 Prunier (Prunus domesticus subsp. domestica)- Prunus spinosa et Prunus cerasifera
 Vigne (Vitis vinifera) – Vigne sauvage (Vitis sylvestris). Des hybrides existent aussi incluant d'autres espèces de Vitis.

Plantes oléagineuses 
 Arachide (Arachis hypogaea subsp. hypogaea) – Arachis duranensis
 Carthame des teinturiers (Carthamus tinctorius) – Carthamus creticus
 Colza (Brassica napus) – Brassica rapa, Brassica oleracea
 Soja (Glycine max) – Glycine clandestina
 Tournesol (Helianthus annuus) – Helianthus exilis

Légumineuses 

 Dolique mongette (Vigna unguiculata) – Vigna monantha
 Gesse (Lathyrus sativus) – Lathyrus tuberosus
 Haricot (Phaseolus vulgaris) – Phaseolus coccineus
 Haricot azuki (Vigna angularis var. angularis) – Vigna umbellata
 Haricot de Lima (Phaseolus lunatus) – Phaseolus augusti
 Haricot mungo (Vigna radiata var. radiata) – Vigna stipulacea
 Haricot urd (Vigna mungo var. mungo) – Vigna grandiflora
 Fève (Vicia faba) – Vicia johannis
 Lentille (Lens culinaris) – Lens ervoides
 Luzerne (Medicago sativa)
 Pois bambara (Vigna subterranea) – Vigna hosei
 Pois d'Angole (Cajanus cajan) – Cajanus albicans
 Pois chiche (Cicer arietinum) -
 Pois cultivé (Pisum sativum) – Pisum fulvum
 Vesce (Vicia sativa) – Vicia barbazitae

Tubercules 
 Manioc (Manihot esculenta subsp. esculenta) – Manihot walkerae
 Patate douce (Ipomoea batatas) – Ipomoea triloba
 Pomme de terre (Solanum tuberosum) – Solanum chacoense

Notes et références

Voir aussi

Articles connexes 
 Type naturel
 Agriculture / Agronomie
 Ressource génétique
 Biodiversité agricole
 Diversité des plantes cultivées
 Traité international sur les ressources phytogénétiques pour l'alimentation et l'agriculture

Bibliographie 

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Liens externes 

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Agronomie
Agriculture durable 
Plante utile
Une espèce sauvage apparentée à une plante cultivée ( ESAPC ) ou parent sauvage ( en anglais , crop wild relative ou CWR ) est une espèce ou variété de plantes sauvages étroitement apparentées à une plante domestiquée , dont les origines géographiques peuvent être attribuées à de les régions connues sous le nom de centres de diversité , définis par le botaniste russe , Nikolaï Vavilov . Il peut s' agir d' un ancêtre sauvage de la plante domestiquée ou d' un autre taxon étroitement apparenté . Vue d' ensemble Les espèces sauvages apparentées à les plantes cultivées constituent une ressource de plus en plus importante pour améliorer la production agricole et maintenir de les agroécosystèmes durables . Avec l' avènement de le changement climatique et une plus grande instabilité de les écosystèmes , les ESAPC sont susceptibles de s' avérer une ressource essentielle pour assurer la sécurité alimentaire de le nouveau millénaire . C' est Nikolaï Vavilov , le botaniste russe , qui a compris le premier l' importance de les parents sauvages de les plantes cultivées à le début de le \ . Le matériel génétique de les ESAPC a été utilisé par l' homme pendant de les milliers d' années pour améliorer la qualité et le rendement de les plantes cultivées . Les agriculteurs utilisent de les méthodes de sélection traditionnelles depuis de les millénaires , le maïs sauvage ( Zea mexicana ) est couramment cultivé à les côtés de le maïs pour favoriser les croisements naturels et améliorer les rendements . Plus récemment , les sélectionneurs ont utilisé les gènes de parents sauvages pour améliorer diverses plantes cultivées comme le riz ( Oryza sativa ) , la tomate ( Solanum lycopersicum ) et les légumineuses à graines . Les ESAPC ont fourni de nombreux gènes utiles à les plantes cultivées , et les variétés modernes de la plupart de les principales plantes cultivées contiennent maintenant de les gènes de leurs parents sauvages . Par conséquent , les ESAPC sont de les plantes sauvages apparentées à de les espèces importantes sur le plan socioéconomique , notamment les cultures vivrières , les plantes fourragères , les plantes médicinales , les condiments , les plantes ornementales et les essences forestières , ainsi que les plantes utilisées à de les fins industrielles , pour la production d' huile et de fibres notamment , à lesquelles elles peuvent apporter de les traits bénéfiques . Définition Pour établir le degré de parenté avec les plantes cultivées , une méthode qui pourrait être appliquée est celle de le concept de « pool génique » de Harlan et de Wet subdivisé en trois groupes \ : le pool génique « primaire » pour les parents les plus proches , le pool génique « secondaire » pour les parents plus éloignés et le pool génique « tertiaire » pour ceux qui sont très éloignés . Cependant , pour la majorité de les complexes d' espèces cultivées , en particulier ceux de les régions tropicales , ce concept n' est pas utilisable , les informations disponibles étant insuffisantes . Maxted et al.ont donc proposé une autre solution en s' appuyant sur la hiérarchie taxinomique existante . Les parents sauvages sont classés dans de les groupes de taxons ainsi définis par rapport à la plante cultivée \ : \ : la plante cultivée elle-même , \ : même espèce , : même série ou section , : même sous-genre : même genre , : même tribu , mais genre différent . Ce système de classement suppose que la classification existante de le genre contienne une structure infra-générique . Dans ces conditions une « espèce sauvage apparentée à une plante cultivée » peut être définie comme « un taxon végétal sauvage qui a une utilité indirecte dérivée de sa relation génétique relativement étroite , c'est-à-dire appartenant soit à les pools géniques primaire ou secondaire , soit à les groupes de taxonsà avec une plante cultivée . » . Conservation de les espèces sauvages apparentées Les ESAPC sont de les composants essentiels de les écosystèmes naturels et agricoles et sont donc indispensables à le maintien de la santé de les écosystèmes . Leur conservation et leur utilisation durable sont très importantes pour améliorer la production agricole , augmenter la sécurité alimentaire et maintenir un environnement sain Les populations naturelles de nombreuses ESAPC sont de plus en plus menacées . Elles sont menacés par la perte d' habitat , par la destruction et la dégradation de l' environnement naturel ou par leur conversion à d' autres usages . La déforestation entraîne la perte de nombreuses populations de parents sauvages importants d' arbres fruitiers et de plantes industrielles . Les populations sauvages apparentées à les plantes céréalières qui se trouvent dans les zones arides ou semi-arides sont sévèrement réduites par le surpâturage et la désertification qui en résulte . L' industrialisation croissante de l' agriculture réduit considérablement la présence de les ESAPC dans les agroécosystèmes traditionnels . La conservation et l' utilisation judicieuses de les ESAPC sont de les éléments essentiels pour renforcer la sécurité alimentaire , éliminer la pauvreté et préserver l' environnement . Les stratégies de conservation de les ESAPC prennent souvent en compte à la fois la conservation « in situ » et la conservation « ex situ » . Ce sont de les approches complémentaires de la conservation de les ESAPC , car chacune a ses avantages et ses inconvénients . Par exemple , si la conservation « ex situ » protège les ESAPC ( ou plus exactement leurs gènes ) contre les menaces dans la nature , elle peut limiter leur évolution et leur adaptation à les nouveaux défis environnementaux .. En % de les espèces de plantes sauvages apparentées étaient complètement absentes de les banques de gènes dans le monde , et % étaient représentées par moins deéchantillons . Plus de % de toutes les espèces sauvages apparentées dans le monde présentaient un besoin urgent de collecte supplémentaire pour améliorer leur représentation dans les banques de gènes , et plus de % étaient insuffisamment représentées en termes de variation géographique et écologique . Alors que les priorités les plus importantes pour la collecte se trouvent dans le bassin méditerranéen et à le Proche-Orient , en Europe occidentale et méridionale , en Asie de le Sud-Est et en Amérique de le Sud , les parents sauvages insuffisamment représentés dans les banques de gènes sont distribués dans presque tous les pays de le monde . En France et dans de nombreux pays , de les réseaux de ressource génétique sont organisés selon la Convention sur la diversité biologique afin d' essayer de conserver à le mieux et de manière équitable les principales espèces de plantes utilisées par l' homme dans les différents pays . En le Traité international sur les ressources phytogénétiques pour l' alimentation et l' agriculture ( TIRPAA ) a été complété pour améliorer les échanges et l' utilisation durable de les ressources phytogénétiques . Exemples de parents sauvages Céréales Avoine ( Avena sativa ) – Avena byzantina Quinoa ( Chenopodium quinoa ) – Chenopodium berlandieri Éleusine ( Eleusine coracana ) – Eleusine africana Orge ( Hordeum vulgare ) – Hordeum arizonicum Riz ( Oryza sativa ) – Oryza rufipogon Riz africain ( Oryza glaberrima ) – Oryza barthii Mil ( Pennisetum glaucum ) – Pennisetum purpureum Seigle ( Secale cereale subsp. cereale ) – Secale cereale subsp. dighoricum Sorgho ( Sorghum bicolor ) – Sorghum halepense Millet commun ( Panicum miliaceum ) – Panicum fauriei Blé dur ( Triticum turgidum subsp. durum ) - amidonnier sauvage ( Triticum dicoccoides ) Blé tendre ( Triticum aestivum ) – Engrain ( Triticum monococcum ) Maïs ( Zea mays subsp. mays ) – Zea ( Zea diploperennis ) Légumes Nota \ : De nombreux légumes différents partagent un ancêtre commun , en particulier dans le genre Brassica . De nombreux légumes sont aussi de les hybrides d' espèces différentes , ce qui est aussi particulièrement vrai pour le genre Brassica .. Ail cultivé ( Allium sativum var. sativum ) – Allium atroviolaceum Asperge ( Asparagus officinalis ) – Asparagus dauricus Aubergine ( Solanum melongena ) – ( Solanum incanum ) Betterave potagère ( Beta vulgaris subsp. vulgaris ) – Beta vulgaris subsp. maritima Carotte ( Daucus carota ) – Daucus gracilis Chou ( Brassica oleracea var. capitata ) - Brassica elongata Concombre ( Cucumis sativus ) – Cucumis hystrix Courge ( Cucurbita pepo subsp. pepo ) – Cucurbita okeechobeensis Épinard ( Spinacea oleracea ) – Spinacia turkestanica Laitue ( Lactuca sativa ) – Laitue scariole ( Lactuca serriola ) Moutarde brune ( Brassica juncea subsp. juncea ) – Brassica carinata Moutarde noire ( Brassica nigra ) – Moutarde de les champs ( Sinapis arvensis ) Navet ( Brassica rapa subsp. rapa ) – Brassica rapa Oignon ( Allium cepa var. cepa ) – Allium galanthum Piment ( Capsicum annuum ) – Capsicum baccatum Poireau ( Allium ampeloprasum ) – Ciboule ( Allium fistulosum ) Potiron ( Cucurbita maxima subsp. maxima ) – Cucurbita ecuadorensis Tomate ( Solanum lycopersicum ) – Solanum chilense Plantes fruitières Abricotier ( Prunus armeniaca ) – Prunus brigantina Amandier ( Prunus dulcis ) – Prunier japonais ( Prunus salicina ) Ananas ( Ananas comosus ) – Ananas bracteatus Arbre à pain ( Artocarpus altilis ) – Jacquier ( Artocarpus heterphyllus ) Avocatier ( Persea americana ) – Persea schiedeana Bananier – Musa acuminata et Musa balbisiana Cacaoyer ( Theobroma cacao ) – Theobroma angustifolium Cerisier ( Prunus avium ) – Prunus mahaleb Citronnier ( Citrus limon ) – Citrus indica Fraisier ( Fragaria × ananassa ) Manguier ( Mangifera indica ) – Mangifera altissima Oranger ( Citrus sinensis ) – Limettier ( Citrus aurantiifolia ) Pamplemoussier ( Citrus paradisi ) – Citrus medica Papayer ( Carica papaya ) – Jarilla chocola Pastèque ( Citrullus lanatus var. lanatus ) – Coloquinte ( Citrullus colocynthis ) Pêcher ( Prunus persica var. persica ) – Prunus tomentosa Poirier ( Pyrus communis ) – Pyrus pyraster et Pyrus caucasica Pommier ( Malus domestica ) – principalement Malus sieversii , mais certains cultivars appartiennet à Malus sylvestris ou sont de les hybrides de les deux . Prunier ( Prunus domesticus subsp. domestica ) - Prunus spinosa et Prunus cerasifera Vigne ( Vitis vinifera ) – Vigne sauvage ( Vitis sylvestris ) . De les hybrides existent aussi incluant d' autres espèces de Vitis . Plantes oléagineuses Arachide ( Arachis hypogaea subsp. hypogaea ) – Arachis duranensis Carthame de les teinturiers ( Carthamus tinctorius ) – Carthamus creticus Colza ( Brassica napus ) – Brassica rapa , Brassica oleracea Soja ( Glycine max ) – Glycine clandestina Tournesol ( Helianthus annuus ) – Helianthus exilis Légumineuses Dolique mongette ( Vigna unguiculata ) – Vigna monantha Gesse ( Lathyrus sativus ) – Lathyrus tuberosus Haricot ( Phaseolus vulgaris ) – Phaseolus coccineus Haricot azuki ( Vigna angularis var. angularis ) – Vigna umbellata Haricot de Lima ( Phaseolus lunatus ) – Phaseolus augusti Haricot mungo ( Vigna radiata var. radiata ) – Vigna stipulacea Haricot urd ( Vigna mungo var. mungo ) – Vigna grandiflora Fève ( Vicia faba ) – Vicia johannis Lentille ( Lens culinaris ) – Lens ervoides Luzerne ( Medicago sativa ) Pois bambara ( Vigna subterranea ) – Vigna hosei Pois d' Angole ( Cajanus cajan ) – Cajanus albicans Pois chiche ( Cicer arietinum ) - Pois cultivé ( Pisum sativum ) – Pisum fulvum Vesce ( Vicia sativa ) – Vicia barbazitae Tubercules Manioc ( Manihot esculenta subsp. esculenta ) – Manihot walkerae Patate douce ( Ipomoea batatas ) – Ipomoea triloba Pomme de terre ( Solanum tuberosum ) – Solanum chacoense Notes et références Voir aussi Articles connexes Type naturel Agriculture / Agronomie Ressource génétique Biodiversité agricole Diversité de les plantes cultivées Traité international sur les ressources phytogénétiques pour l' alimentation et l' agriculture Bibliographie \ . \ . \ . \ . 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