Shine–Dalgarno-szekvencia
A Shine–Dalgarno-szekvencia a bakteriális RNS egy meghatározott nukleotidbázisokból álló, konszenzus része, amelyet a fehérjeszintézis transzlációs szakaszának megkezdése előtt a kapcsolódó riboszóma felismer. Riboszómális kötőhely, amely elősegíti az információ pontos fordítását. Megelőzi a start tripletet, jelzi a hollétét.
Általában a start kodontól visszafelé, változóan 6-8-10 bázisnyira található. Prokariótákban nélkülözhetetlen szekvenciarészlet, archaea baktériumok, illetve mitokondriumok és kloroplasztiszok RNS-eiben is megtalálható.

Jellemzők 

A Shine–Dalgarno-szekvencia a prokarióta mRNS promóter szakaszának része, funkciója, hogy a „P” kötőhelyre pozicionálja az 'AUG' (start) kodont. egy puringazdag, 6 bázisos konszenzus bázissor: 'AGGAGG', ami fajtól függően minimálisan bővülhet. Ez komplementer a 16 S rRNS 3’-végének nukleotidszekvenciájával és így a hidrogénhidak kialakulása révén segíti a riboszóma kis alegységének és az mRNS-nek az összekapcsolódását. Két ausztráliai kutató: John Shine (1946–) és Lynn Dalgarno (1935–) 1975-ben fedezte fel a prokarióta promóterekre jellemző szekvenciát.

Kozak-szekvencia  

Az eukarióta mRNS-en nincs Shine–Dalgarno-szekvencia, ami a P-helyre pozicionálna egy AUG kezdő kodont. Ugyanakkor Marylin Kozak nyomán van egy úgynevezett konszenzus Kozak-szekvencia, ami funkcionálisan hasonló szerepet tölt be. A különbözősége, hogy a Kozak-szekvenciának része a kezdő AUG kodon, tehát annak szekvencia környezete közvetlenül segít azonosítani a riboszóma számára, hogy melyik AUG kodont használja.
Kozak-szekvencia: A/GCCACCAUGG

Jegyzetek 

 Stanssens P, Remaut E, Fiers W. Alterations upstream from the Shine-Dalgarno region and their effect on bacterial gene expression. Gene. 1985;36(3):211–223. [PubMed]
 http://www.tankonyvtar.hu/en/tartalom/tamop425/0011_1A_Proteinbiotech_hu_book/ch01.html
 http://www.lifetechnologies.com/hu/en/home/references/ambion-tech-support/translation-systems/general-articles/ribosomal-binding-site-sequence-requirements.html

Források 

 Sarkadi Lívia: Biokémia mérnök szemmel, Budapest: Typotex, 2007 
 Boross László – Sajgó Mihály: A biokémia alapjai, Budapest: Mezőgazda Kiadó 2003, 
 Shine J, Dalgarno L (1975) Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes. Nature 254
 Dalgarno L, Shine J (1973) Conserved terminal sequence in 18S rRNA may represent terminator anticodons. Nature 245

Több információért lásd még 
 Fehérjeszintézis
 Transzláció
 DNS, RNS
 Nukleotid

Génkifejeződés
A Shine–Dalgarno-szekvencia a bakteriális RNS egy meghatározott nukleotidbázisokból álló , konszenzus része , amelyet a fehérjeszintézis transzlációs szakaszának megkezdése előtt a kapcsolódó riboszóma felismer . Riboszómális kötőhely , amely elősegíti az információ pontos fordítását . Megelőzi a start tripletet , jelzi a hollétét . Általában a start kodontól visszafelé , változóan10 bázisnyira található . Prokariótákban nélkülözhetetlen szekvenciarészlet , archaea baktériumok , illetve mitokondriumok és kloroplasztiszok RNS-eiben is megtalálható . Jellemzők A Shine–Dalgarno-szekvencia a prokarióta mRNS promóter szakaszának része , funkciója , hogy a „ P” kötőhelyre pozicionálja az 'AUG' ( start ) kodont. egy puringazdag, bázisos konszenzus bázissor : 'AGGAGG' , ami fajtól függően minimálisan bővülhet . Ez komplementer aS rRNS-végének nukleotidszekvenciájával és így a hidrogénhidak kialakulása révén segíti a riboszóma kis alegységének és az mRNS-nek az összekapcsolódását . Két ausztráliai kutató : John Shine ) és Lynn Dalgarno) ben fedezte fel a prokarióta promóterekre jellemző szekvenciát . Kozak-szekvencia Az eukarióta mRNS-en nincs Shine–Dalgarno-szekvencia , ami a P-helyre pozicionálna egy AUG kezdő kodont . Ugyanakkor Marylin Kozak nyomán van egy úgynevezett konszenzus Kozak-szekvencia , ami funkcionálisan hasonló szerepet tölt be . A különbözősége , hogy a Kozak-szekvenciának része a kezdő AUG kodon , tehát annak szekvencia környezete közvetlenül segít azonosítani a riboszóma számára , hogy melyik AUG kodont használja . Kozak-szekvencia : A/GCCACCAUGG Jegyzetek Stanssens P , Remaut E , Fiers W. Alterations upstream from the Shine-Dalgarno region and their effect on bacterial gene expression . Gene.36( 3) :211–223. [ PubMed ] http://www.tankonyvtar.hu/en/tartalom/tamop425/0011_1A_Proteinbiotech_hu_book/ch01.html http://www.lifetechnologies.com/hu/en/home/references/ambion-tech-support/translation-systems/general-articles/ribosomal-binding-site-sequence-requirements.html Források Sarkadi Lívia : Biokémia mérnök szemmel , Budapest : Typotex , Boross László – Sajgó Mihály : A biokémia alapjai , Budapest : Mezőgazda Kiadó Shine J , Dalgarno LDeterminant of cistron specificity in bacterial ribosomes . Nature Dalgarno L, Shine JConserved terminal sequence in rRNA may represent terminator anticodons . Nature Több információért lásd még Fehérjeszintézis Transzláció DNS , RNS Nukleotid Génkifejeződés