From 13 August 1961 until 9 November 1989, East Berlin was separated from West Berlin by the Berlin Wall. The Western Allied powers did not recognise East Berlin as the GDR's capital, nor the GDR's authority to govern East Berlin. On 3 October 1990, the day Germany was officially reunified, East and West Berlin formally reunited as the city of Berlin.
แม้เบอร์ลินตะวันออกจะมีสถานะเป็นเมืองที่ถูกยึดครอง ถึงอย่างไรก็ตามก็ยกให้เป็นเมืองหลวงของประเทศเยอรมนีตะวันออก ตั้งแต่ 13 สิงหาคม ค.ศ. 1961 ถึง 9 พฤศจิกายน ค.ศ. 1989 มันถูกแยกออกจากเบอร์ลินตะวันตกโดยกําแพงเบอร์ลิน รัฐบาลเยอรมนีตะวันออกเรียกเบอร์ลินตะวันออกเพียงแค่ "เบอร์ลิน" หรือบ่อย ๆ ว่า ""Berlin, Hauptstadt der DDR"" (เบอร์ลิน เมืองหลวงของเยอรมนีตะวันออก) คําว่า "Democratic Sector" (เขตประชาธิปไตย) ก็มีใช้เช่นกัน จนถึงคริสต์ทศวรรษ 1960 ในวันที่ 3 ตุลาคม ค.ศ. 1990 ประเทศเยอรมนีตะวันตกและประเทศเยอรมนีตะวันออกได้รวมกัน จึงเป็นการสิ้นสุดการมีอยู่ของเบอร์ลินตะวันออกอย่างเป็นทางการ