The capital, Nanking, fell in December 1937, which was followed by mass murders and rapes known as the Nanking Massacre. The national capital was briefly at Wuhan, then removed in an epic retreat to Chongqing, the seat of government until 1945. In 1940, the Japanese set up the collaborationist Wang Jingwei regime, with its capital in Nanking, which proclaimed itself the legitimate "Republic of China" in opposition to Chiang Kai-shek's government, although its claims were significantly hampered due to its being a puppet state controlling limited amounts of territory.
ในเวลานั้น รัฐบาลก๊กมินตั๋งอยู่ในช่วงรวบรวมกําลัง เพื่อสู้รบกับคอมมิวนิสต์ที่ลุกขึ้นต่อต้านในประเทศ จึงได้มีคําสั่งห้ามต่อต้าน ให้พยายามแก้ไขด้วยวิธีการทางการทูต และให้ถอนกําลังไปที่ด่านซันไห่กวน ทําให้ทหารญี่ปุ่นบุกยึดเสิ่นหยาง แล้วบุกยึดต่อไปที่จี๋หลิน เฮยหลงเจียง จนกระทั่งสามารถยึด 3 มณฑลทางตะวันออกเฉียงเหนือของจีนได้ในเดือนมกราคม 1932 ในเดือนถัดมาญี่ปุ่นได้สร้างรัฐใหม่ขึ้นบนแผ่นดินแมนจูเรีย โดยมีญี่ปุ่นคอยเชิดอยู่เบื้องหลัง ตั้งชื่อว่า ประเทศแมนจูกัว (满洲国) มีฉางชุนเป็นเมืองหลวง แล้วนําจักรพรรดิผู่อี๋ (ปูยี) ฮ่องเต้ราชวงศ์ชิงองค์สุดท้ายที่ถูกปฏิวัติในปี ค.ค. 1911 ซึ่งมีอายุ 25 พรรษในขณะนั้นมาเป็นฮ่องเต้หุ่นเชิดที่ได้ปกครองแต่ในนาม จากนั้นญี่ปุ่นก็ใช้อํานาจในการขูดรีดประชาชน ทําลายวัฒนธรรม ทําให้ชาวจีนกว่า 30 ล้านคนต้องทนทุกข์ทรมาน เหตุร้าย 18 กันยายนได้กลายเป็นชนวนความแค้นของจีนทั่วประเทศ