IUJ is located in Minami-Uonuma, a small city on the southeastern end of Niigata prefecture, Japan. It is approximately 100 km south of Niigata city, the prefectural capital, and 230 km northwest of Tokyo.
IUJ ตั้งอยู่ที่เมือง มินามิ อุโอนุมา ซึ่งเป็นเมืองเล็กๆ ทางทิศใต้ของจังหวัดนิอิกาตะ จังหวัดชายทะเลทิศตะวันตกของญี่ปุ่น โดยตั้งอยู่ห่างจากตัวจังหวัดประมาณ 100 ก.ม. และห่างจากเมืองหลวงโตเกียวประมาณ 230 ก.ม.