The criminal proceeding against Chotchainavee 35 was a result of a joint operation undertaken by the Command Center for Combatting Illegal Fishing (CCCIF) and the Royal Thai Police on 2 May 2015 when the fishing vessel entered Thai waters. The owner of the vessel claimed that it was registered in Djibouti. However, the Thai authorities had been keeping track of the vessel and suspected that Chotchainavee 35 had illegally fished in Somalian waters. Since the owner of the vessel could not provide clear evidence that the catch on board was obtained legally, the Department of Fisheries subsequently issued an order to confiscate the vessel, its catch, and all assets on board on 27 July 2017. The Thai authorities also found out that the vessel was stateless since Djibouti had revoked the vessel's registration on 1 June 2017.
การดําเนินคดีกับเรือโชติชัยนาวี ๓๕ เป็นผลจากการสกัดตรวจเรือของศูนย์บัญชาการแก้ไขปัญหา การทําการประมงผิดกฎหมาย (ศปผม.) และเจ้าหน้าที่ตํารวจ เมื่อวันที่ ๒ พฤษภาคม ๒๕๖๐ ขณะที่เรือลําดังกล่าวแล่นเข้าสู่น่านน้ําไทย โดยอ้างว่า เป็นเรือประมงที่ชักธงของสาธารณรัฐจิบูตี แต่หน่วยงานของไทยซึ่งได้ติดตามข่าวเรือลําดังกล่าวได้ตั้งข้อสงสัยว่า เรือโชติชัยนาวี ๓๕ มีพฤติกรรมทําประมงผิดกฎหมายในน่านน้ําโซมาเลีย ประกอบกับบริษัทเจ้าของเรือไม่สามารถพิสูจน์ได้อย่างชัดเจนว่า สัตว์น้ําบนเรือไม่ได้มาจากการทําประมงผิดกฎหมาย เมื่อวันที่ ๒๗ กรกฎาคม ๒๕๖๐ กรมประมงจึงได้มีคําสั่งยึดเรือ สัตว์น้ํา และทรัพย์สินทั้งหมดในเรือ นอกจากนี้ จากการตรวจสอบของหน่วยงานที่เกี่ยวข้องของไทยในเวลาต่อมา ทราบว่า เรือลําดังกล่าวยังมีสถานะเป็นเรือไร้สัญชาติด้วย เนื่องจากจิบูตีได้ถอนสัญชาติของเรือโชติชัยนาวี ๓๕ ตั้งแต่เมื่อวันที่ ๑ มิถุนายน ๒๕๖๐