The Bank of Japan was reorganized in 1942 (fully only after May 1, 1942), under the , promulgated on February 24, 1942. There was a brief post-war period during the Occupation of Japan when the bank's functions were suspended, and military currency was issued.
และใน ค.ศ. 1899 อดีตธนบัตรธนาคาร "แห่งชาติ" ได้หมดอายุลงอย่างเป็นทางการ ธนาคารแห่งประเทศญี่ปุ่นดําเนินการอย่างต่อเนื่องนับแต่ก่อตั้งขึ้น อย่างไรก็ตาม มีการจัดระบบองค์กรใหม่ใน ค.ศ. 1942 ภายใต้พระราชบัญญัติธนาคารญี่ปุ่น ค.ศ. 1942 () และมีช่วงหลังสงครามโลกครั้งที่สองสั้น ๆ ระหว่างการยึดครองญี่ปุ่น