局長
次長
総務部
総務課
契約課
航空振興課
人事課
経理課
管財調達課
安全企画・保安対策課
総務企画調整官
広報対策官
空港部
次長
管理課
空港企画調整課
空港経営改革調整課
空港安全監督課
補償課(大阪航空局に限る。)
環境・地域振興課
土木建築課
機械課
建築室
保安部
技術保安企画調整課
運用課
管制課
管制技術課
航空灯火・電気技術課
交通管制安全監督課
航空事業安全監督官
運航審査官
航空機検査官
整備審査官
航空従事者試験官

管制区域・出先機関
 空港事務所
 航空機の運航管理や航空機に対する管理業務、滑走路などの基本施設や航空保安施設の維持管理
 空港出張所
 航空機の運航管理と管制業務、通信業務、航空保安無線施設の管理
 空港・航空路監視レーダー事務所
 空港出張所の業務、航空路監視レーダーの維持管理
 航空路監視レーダー事務所
 航空路を航行する航空機を監視する航空路監視レーダーの維持管理
 運航拠点(FAIB)
 運航援助情報業務の実施拠点として、航空管制運航情報官による対空援助業務・発着調整や認許可等の航空交通流調整を実施。