当社と歴史的に関わりのある岡本家の古文書の中から棟札の写しが発見されており、それによると貞享2年(1685年)以降の約120年間に5回の遷宮や屋根の葺き替えが行われ、さらにその後も明治27年(1894年)まで数回の遷宮や修復を実施した記録が残っている。

なお、遷宮において新社殿を造営する際には新しい部材で全体を造り直すことはせずに傷んだ部材のみを交換していたことから、現在でも当社本殿の部材に天正期頃のものが使用されている。