幹部 
所長
副所長2名
研究総務官2名

本部・旭庁舎 
総務部
調査官
福利厚生官
契約財産管理官
人事厚生課
総務課
会計課
総務管理官
企画部
評価研究官
基準研究官
コーディネート研究官
企画課
研究評価・推進課
施設課
国際研究推進室
サイバーセキュリティ対策・情報利活用推進官
下水道研究部
下水道研究官
下水道エネルギー・機能復旧研究官
下水道研究室
下水処理研究室
河川研究部
河川構造物管理研究官
水防災システム研究官
水環境研究官
河川研究室
海岸研究室
水循環研究室
大規模河川構造物研究室
水害研究室
土砂災害研究部
深層崩壊対策研究官
砂防研究室
土砂災害研究室
道路交通研究部
道路研究官
道路防災研究官
道路研究室
道路交通安全研究室
道路環境研究室
高度道路交通システム研究室
道路構造物研究部
道路構造物管理システム研究官
橋梁研究室
構造・基礎研究室
道路基盤研究室
道路地震防災研究室
社会資本マネジメント研究センター
建設マネジメント研究官
国土防災研究官
情報研究官
社会資本マネジメント研究室
社会資本システム研究室
社会資本施工高度化研究室
社会資本情報基盤研究室
建設経済研究室
緑化生態研究室

立原庁舎 
総務部
総務管理官
建築研究部
建築新技術統括研究官
建築品質研究官
建築災害対策研究官
基準認証システム研究室
構造基準研究室
防災基準研究室
設備基準研究室
材料・部材基準研究室
評価システム研究室
住宅研究部
住宅性能研究官
住宅情報システム研究官
住宅計画研究室 
住宅ストック高度化研究室 
建築環境研究室
住宅生産研究室
都市研究部
都市計画研究室 
都市施設研究室 
都市防災研究室 
都市開発研究室

横須賀庁舎 
管理調整部(→港湾・空港研究部門の企画部に相当)
情報・施工システム研究官
管理課
企画調整課
技術情報課
積算支援業務課
国際業務研究室
沿岸海洋・防災研究部
沿岸海洋新技術研究官
津波・高潮災害研究官
海洋環境・危機管理研究室
沿岸防災研究室 
沿岸域システム研究室
港湾研究部
港湾新技術研究官
港湾計画研究室 
港湾システム研究室 
港湾施設研究室 
港湾施工システム・保全研究室  
空港研究部
空港新技術研究官
空港計画研究室 
空港施設研究室 
空港施工システム室

熊本庁舎 

 社会資本マネジメント研究センター
 熊本地震復旧対策研究室

関係機関 
独立行政法人
土木研究所
建築研究所
港湾空港技術研究所

外部リンク 
 国土交通省国土技術政策総合研究所

施設等機関
土木工学
日本の建築
日本の港湾
日本の空港
つくば市の研究所
国土交通省
2001年設立の政府機関