本庁 
北海道教育委員会
北海道教育庁(教育長、教育次長)
総務政策局 
学校教育局 
生涯学習推進局 
教職員局 
ICT教育推進局 (ICT教育推進課)

出先機関 
出先機関は下記のとおりである。
空知教育局 
石狩教育局 
後志教育局 
胆振教育局 
日高教育局 
渡島教育局 
檜山教育局 
上川教育局 
留萌教育局 
宗谷教育局 
オホーツク教育局 
十勝教育局 
釧路教育局 
根室教育局

所管機関 
所管する機関は下記のとおりである。
北海道立高等学校(191校)
北海道立中等教育学校(1校)
北海道立特別支援学校(67校)
北海道立図書館
北海道立近代美術館
北海道立三岸好太郎美術館
北海道立旭川美術館
北海道立函館美術館
北海道立帯広美術館
北海道立文学館
北海道立釧路芸術館
北海道立北方民族博物館
北海道立埋蔵文化財センター北海道立青少年体験活動支援施設ネイパル砂川
北海道立青少年体験活動支援施設ネイパル深川
北海道立青少年体験活動支援施設ネイパル森
北海道立青少年体験活動支援施設ネイパル北見
北海道立青少年体験活動支援施設ネイパル足寄
北海道立青少年体験活動支援施設ネイパル厚岸
北海道立生涯学習推進センター
北海道立教育研究所
附属情報処理教育センター
附属理科教育センター
北海道立特別支援教育センター

地域連携校・地域連携協力校について 
地域連携校は小規模の道立高等学校に対して北海道教育委員会が行なっている制度で、北海道高等学校遠隔授業配信センター(愛称:T-base)からの遠隔授業の配信を行っている。