Nidoviral papain-like protease
ನಿಡೋವೈರಲ್ ಪಾಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ (ಪಿಎಲ್ಪ್ರೊ ಅಥವಾ ಪಿಎಲ್ಪಿ) ಎಂಬುದು ನಿಡೋವೈರಸ್ಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪಾಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಒಆರ್ಎಫ್1ಎ ವಂಶವಾಹಿಯಿಂದ ದೊಡ್ಡ ಪಾಲಿಪ್ರೊಟೀನ್ನ ಭಾಗವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪ್ರೊಟೀನ್ನೊಳಗಿನ ಕೆಲವು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ವೈರಲ್ ನಾನ್ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಟಿಕ್ ಸೀಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾದ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಕಿಣ್ವಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. 3ಸಿ-ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಅಥವಾ ಮುಖ್ಯ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಒಆರ್ಎಫ್1ಎಯಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಎರಡನೇ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸೀಳುಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದೆ. ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳು ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡು ಪಾಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ; SARS-CoV ಮತ್ತು SARS-CoV-2ರಲ್ಲಿ, ಒಂದು PLPro ಡೊಮೇನ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ನಾನ್ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 3 (nsp3) ನಲ್ಲಿದೆ. ಆರ್ಟೆರಿವೈರಸ್ಗಳು ಎರಡರಿಂದ ಮೂರು ಪಿಎಲ್ಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಅವುಗಳ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಜೊತೆಗೆ, ಪಿ. ಎಲ್. ಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಸರಪಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಐಸೊಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧವನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಡಿಯುಬಿಕ್ವಿಟೇಟಿಂಗ್ ಕಿಣ್ವಗಳಾಗಿ (ಡಿಯುಬಿ) ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಅವು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಂದ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ತರಹದ ಡೊಮೇನ್ ಇಂಟರ್ಫೆರಾನ್-ಸ್ಟಿಮ್ಯುಲೇಟೆಡ್ ಜೀನ್ 15 (ಐಎಸ್ಜಿ15) ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವ "ಡಿಐಎಸ್ಜೈಲೇಟಿಂಗ್" ಕಿಣ್ವಗಳಾಗಿವೆ. ಈ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳು ಆತಿಥೇಯ ಸಹಜ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ವಿರೋಧಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ವೈರಲ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗೆ ಅವು ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ಪಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು MERS-CoV, SARS-CoV ಮತ್ತು SARS-CoV-2 ನಂತಹ ಮಾನವ ರೋಗಕಾರಕಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಆಂಟಿವೈರಲ್ ಔಷಧಿಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೆ ಔಷಧ ಗುರಿಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ವರ್ಗೀಕರಣ ಮತ್ತು ನಾಮಕರಣ ಮೆರೋಪ್ಸ್ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ವರ್ಗೀಕರಣ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಪ್ರಕಾರ, ನಿಡೋವೈರಲ್ ಪಾಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ಗಳು ಸಿಎ ಕುಲದ ಸದಸ್ಯರಾಗಿದ್ದು, ಪಾಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ಗಳು, ಅವುಗಳ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ವೇಗವರ್ಧಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಪಾಪೈನ್ ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತವೆ. ಈ ಗುಂಪು ಅನೇಕ ವೈರಲ್ ಪಾಲಿಪ್ರೊಟೀನ್-ಸಂಸ್ಕರಣಾ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀಸ್ಗಳು ಜೀವನದ ಎಲ್ಲಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಏಕ ಪಾಪೈನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪಿಎಲ್ಪ್ರೊ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್ ಮತ್ತು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್-2ರಲ್ಲಿ. ಅಂತಹ ಎರಡು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದಾಗ, ಅವುಗಳನ್ನು ಪಿಎಲ್ಪಿ 1 ಮತ್ತು ಪಿಎಲ್ಪಿ 2 ಅಥವಾ ಪಿಎಲ್ಪಿ ಪ್ರೋ 1 ಮತ್ತು ಪಿಎಲ್ಪಿ ಪ್ರೋ 2 ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಏಕ-ಡೊಮೇನ್ ವೈರಸ್ಗಳ ಪಿಎಲ್ಪಿ ಪ್ರೋ ಪಿಎಲ್ಪಿ 2 ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಆರ್ಟೆರಿವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಮೂರು ಪಿಎಲ್ಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಪಿಎಲ್ಪಿ1α, ಪಿಎಲ್ಪಿ1β, ಮತ್ತು ಪಿಎಲ್ಪಿ2 ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಫಂಕ್ಷನ್ ಪಿಎಲ್ಪ್ರೊ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀಸ್, ಡ್ಯೂಬಿಕ್ವಿಟಿನೇಸ್ ಮತ್ತು ಡೀಐಎಸ್ಜೈಲೇಟಿಂಗ್ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ವೈರಲ್ ಜೀವನ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಬಹುಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ. ಕರೋನವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಇದು ದೊಡ್ಡ, ಬಹು-ಡೊಮೇನ್ ರಚನೆಯಲ್ಲದ ಪ್ರೋಟೀನ್ 3 (ಎನ್ಎಸ್ಪಿ 3) ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಳಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ವೈರಲ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗೆ ಪಿಎಲ್ಪ್ರೊ ಚಟುವಟಿಕೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿದೆ. ಆತಿಥೇಯ ಸಹಜ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಮೇಲೆ ಪ್ರಭಾವ ಬೀರುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವಾಗಿ ಡ್ಯೂಬಿಕ್ವಿಟಿನೇಶನ್ ಮತ್ತು ಡಿಐಎಸ್ಜೈಲೇಷನ್ಗಾಗಿ ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ಗಳ ವಿಕಸನೀಯ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯು ಹಲವಾರು ವೈರಲ್ ಕುಟುಂಬಗಳಿಗೆ ಹೆಸರುವಾಸಿಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಟಿಕ್ ಪ್ರೊಸೆಸಿಂಗ್ ನಿಡೋವೈರಲ್ ಪಿಎಲ್ಪ್ರೋ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಒಆರ್ಎಫ್1ಎಬಿ ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ದೊಡ್ಡ ಪಾಲಿಪ್ರೊಟೀನ್ನ ಭಾಗವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅವು ಪಾಲಿಪ್ರೊಟೀನ್ನ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲೈಟಿಕ್ ಸಂಸ್ಕರಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದ್ದು, ಪ್ರೌಢ ವೈರಲ್ ನಾನ್ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು (ಎನ್. ಎಸ್. ಪಿ. ಎಸ್) ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತವೆ, ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನವು ರೆಪ್ಲಿಕೇಸ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೇಸ್ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಘಟಕಗಳಾಗಿವೆ. ಕರೋನವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಪಿಎಲ್ಪ್ರೊ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಎನ್ಎಸ್ಪಿಎಸ್1-4 ನ ಸೀಳುಗಳನ್ನು ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ 3ಸಿ-ರೀತಿಯ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ (ಮುಖ್ಯ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್) ಉಳಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಎನ್ಎಸ್ಪಿ 5-16 ಅನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಮಾನವನ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ ಡಿಯುಬಿಗಳ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಒಂದಾದ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ 18 ಗೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ಹೋಲಿಕೆಯಿಂದ SARS-CoV PLPro ಗೆ ಡ್ಯೂಬಿಕ್ವಿಟಿನೇಸ್ (ಡಿಯುಬಿ) ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯನ್ನು ನಂತರ SARS-CoV-2 ಸೇರಿದಂತೆ ಹಲವಾರು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಮತ್ತು ಆರ್ಟರಿವೈರಸ್ ಪಿಎಲ್ಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ಪ್ರಯೋಗಗಳಿಂದ ದೃಢೀಕರಿಸಲಾಯಿತು. ಡೀಐಎಸ್-ಗೈಲೇಷನ್ ಐಎಸ್ಜಿ15 ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ಗೆ ಹೋಲುವ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡಾಗಿ ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಬಹುದು. ಡ್ಯೂಬಿಕ್ವಿಟಿನೇಟಿಂಗ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಜೊತೆಗೆ, ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಮತ್ತು ಆರ್ಟರಿವೈರಸ್ ಪಿಎಲ್ಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಡಿಐಎಸ್ಜೈಲೇಸ್ ಕಿಣ್ವಗಳೆಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಂದ ಐಎಸ್ಜಿ15 ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. SARS-CoV-2 PLProಯ ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ಗಿಂತ ISGಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ರಕ್ಷಿಸುತ್ತವೆ