Very short patch repair
ವೆರಿ ಶಾರ್ಟ್ ಪ್ಯಾಚ್ (ವಿ. ಎಸ್. ಪಿ) ರಿಪೇರಿ ಡಿಎನ್ಎ ರಿಪೇರಿ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದ್ದು, ಇದು 5-ಮೀಥೈಲ್ಸೈಟೋಸಿನ್ ಅನ್ನು ಥೈಮಿನ್ಗೆ ಡಿಯಾಮಿನೇಷನ್ ಮಾಡುವುದರಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಜಿಟಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ. ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಡಿಯಾಮಿನೇಟೆಡ್ ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಸ್ಗಳು ಥೈಮಿನ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ (ಇದು ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿನ ಸಾಮಾನ್ಯ ನಾಲ್ಕು ಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ). ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಘಟಕಗಳೆಂದರೆ ಜಿಟಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಮ್ಯೂಟ್ಸ್, ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಕತ್ತರಿಸುವ ವಿಎಸ್ಆರ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಮತ್ತು ಯುವಿಆರ್ಡಿ ಹೆಲಿಕೇಸ್ ಅನ್ನು ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಮ್ಯೂಟ್ಎಲ್. ವಿಎಸ್ಆರ್ (ಬಹಳ ಸಣ್ಣ ಪ್ಯಾಚ್ ರಿಪೇರಿ) ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ವಿವಿಧ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಮೂಲ ಜೋಡಿಯು ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡಿದ್ದರೆ ಅಥವಾ ಹಾನಿಗೊಳಗಾಗಿದ್ದರೆ ಅವು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಕತ್ತರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ನಿಕ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಮೂಲ ಜೋಡಿಗಳಲ್ಲಿನ ಕ್ರಿಯೆಯ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಜೀವಿಗೆ ಹಾನಿಕಾರಕವಾಗಬಹುದು. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ, ಸೈಟೋಸಿನ್ನ ಮೆತಿಲೀಕರಣದಿಂದಾಗಿ ಸಿ ಯಿಂದ ಟಿ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ವಿಎಸ್ಆರ್ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳು ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡ ಡಿಎನ್ಎಯಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಹಾನಿಯಿಂದ ಜೀವಕೋಶವನ್ನು ರಕ್ಷಿಸುವ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಮೆಕ್ಯಾನಿಸಮ್ ವಿಎಸ್ಆರ್ ಮಿಥೈಲೇಟೆಡ್ ಸೈಟೋಸಿನ್ಗಳ ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ಡಿಯಾಮಿನೇಷನ್ ನಂತರ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಟಿಜಿ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗದ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಥೈಮಿನ್ನ 5 'ಬದಿಯಲ್ಲಿರುವ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಬೆನ್ನೆಲುಬನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ಒಂದೇ ಎಳೆ ಮೇಲೆ ನಿಕ್ ಅನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ. ನಂತರ ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ I 3 'ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿರುವ ಟಿ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಪ್ಯಾಚ್ ಅನ್ನು ಮರುಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಜಿಟಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸದಿದ್ದರೆ ಸಿ-ಟು-ಟಿ ಪರಿವರ್ತನೆಯ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ವಿಎಸ್ಆರ್ ಜಿ-ಹೊಂದಿರುವ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ ಪರವಾಗಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ, ಈ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ 2 '-ಡಿಯೋಕ್ಸಿಗುವಾನೋಸಿನ್ಗೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗದ ಥೈಮಿಡಿನ್ ಅವಶೇಷದ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿರುವ ಸಿಟಿ (ಎಟಿ) ಜಿಎನ್ ಅಥವಾ ಎನ್ಟಿ (ಎಟಿ) ಜಿಜಿ ಅನುಕ್ರಮದೊಳಗೆ ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಛೇದನವು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ-ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಎಳೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿದೆ. ವಿಎಸ್ಆರ್ನ ರಚನೆಯು ನಿರ್ಬಂಧದ ಎಂಡೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳ ಮೂಲ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಇದು 3-ಪದರದ ಆಲ್ಫಾ/ಬೀಟಾ/ಆಲ್ಫಾ ಟೋಪೋಲಜಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ವಿಎಸ್ಆರ್ ಮೂರು ಆರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (ಫೆ67, ಟ್ರಿಪ್68 ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್86), ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಬಾಗಿಸಿ ಮತ್ತು ಎರಡು ಎಳೆಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡುಗಳಲ್ಲಿ ಪರಸ್ಪರ ಬೆಸೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಸೀಳಿದ ಉತ್ಪನ್ನದ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎ ಲಿಗೇಸ್ನಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ I ಬರುವವರೆಗೆ ನಿಕ್ ಅನ್ನು ರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ.