PAUP*
ಪಿ. ಎ. ಯು. ಪಿ. * (ಪಾರ್ಸಿಮನಿ ಮತ್ತು ಇತರ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್) ಎಂಬುದು ಡೇವಿಡ್ ಎಲ್. ಸ್ವೋಫೋರ್ಡ್ ಬರೆದ ವಿಕಸನೀಯ ಮರಗಳನ್ನು (ಫೈಲೋಜೆನಿಗಳು) ಊಹಿಸಲು ಬಳಸುವ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಆಗಿದೆ. ಮೂಲತಃ, ಹೆಸರೇ ಸೂಚಿಸುವಂತೆ, ಪಿಎಯುಪಿ ಪಾರ್ಸಿಮೋನಿಯನ್ನು ಮಾತ್ರ ಜಾರಿಗೆ ತಂದಿತು, ಆದರೆ ಆವೃತ್ತಿ 4 ರಿಂದ (ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಅನ್ನು ಪಿಎಯುಪಿ * ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಯಿತು) ಇದು ದೂರ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಂಭವನೀಯತೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಸಹ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಆವೃತ್ತಿ 3 ಮ್ಯಾಕಿಂತೋಷ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಿತು ಮತ್ತು ಶ್ರೀಮಂತ, ಬಳಕೆದಾರ ಸ್ನೇಹಿ ಚಿತ್ರಾತ್ಮಕ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸಿತು. ಇದು ನೆಕ್ಸಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ಸ್ವರೂಪವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವ ಮ್ಯಾಕ್ಕ್ಲೇಡ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂನೊಂದಿಗೆ, ಪಿಎಯುಪಿ * ಅನೇಕ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಸ್ಟ್ಗಳಿಗೆ ಆಯ್ಕೆಯ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಆಗಿತ್ತು. ಆವೃತ್ತಿ 4 ವಿಂಡೋಸ್ (ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಶೆಲ್ ಮತ್ತು ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್) ಮತ್ತು ಯುನಿಕ್ಸ್ (ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್ ಮಾತ್ರ) ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ಗಳಿಗೆ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ಸೇರಿಸಿತು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಮ್ಯಾಕಿಂತೋಷ್ನ ಚಿತ್ರಾತ್ಮಕ ಬಳಕೆದಾರ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ 10.14 ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮ್ಯಾಕ್ ಓಎಸ್ ಎಕ್ಸ್ನ ಆವೃತ್ತಿಗಳನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುವುದಿಲ್ಲ (ಆದಾಗ್ಯೂ ಮ್ಯಾಕ್ ಓಎಸ್ನ ನಂತರದ ಆವೃತ್ತಿಗಳಿಗೆ ಜಿಯುಐ ಅನ್ನು ಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ). ಪಿಎಯುಪಿ * ಸಹ ಜೀನಿಯಸ್ಗಾಗಿ ಪ್ಲಗಿನ್ ಆಗಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಈಗ ಪಿಎಯುಪಿ * (* ಪಿಎಯುಪಿ ಬಳಸಿ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್) ಎಂಬ ಸ್ವಯಂ-ಉಲ್ಲೇಖಿತ ಶೀರ್ಷಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪಿಎಯುಪಿ *, ತ್ವರಿತ ನವೀಕರಣಗಳಿಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಈಗ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ಗಾಗಿ ಪಾರ್ಸಿಮನಿ, ಸಂಭವನೀಯತೆ ಮತ್ತು ದೂರ ವಿಧಾನಗಳ ಜೊತೆಗೆ "ಸ್ಪೀಸೀಸ್ ಟ್ರೀ" ವಿಧಾನ ಎಸ್ವಿಡಿಕ್ವಾರ್ಟೆಟ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಅಧಿಕೃತ ಪರೀಕ್ಷಾ ಆವೃತ್ತಿಯ ಜಾಲತಾಣ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್