C5orf22
ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 5 ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ 22 (c5orf22) ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಳಪೆ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅಲಿಯಾಸ್ ಅಜ್ಞಾತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬ 0489 (ಯುಪಿಎಫ್0489) ಆಗಿದೆ. ಜೀನ್ C5orf22 ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 5 ರ ಧನಾತ್ಮಕ ಎಳೆಗಳ ಮೇಲೆ 5P13.3 ನಲ್ಲಿ ನೆಲೆಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಬೇಸ್ ಜೋಡಿ 31532275 ರಿಂದ 31555053 ರವರೆಗೆ 22,779 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ. C5orf22 ಒಟ್ಟು 9 ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು 7 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಅವುಗಳ ಎಕ್ಸಾನ್ ಸಂರಚನೆ ಮತ್ತು ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರೂಪಾಂತರ 1 ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಆಗಿದ್ದು, 9 ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳಲ್ಲಿ 442 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಣ C5orf22 ಎಲ್ಲಾ 3 ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣು ಪದರಗಳಿಂದ ಮತ್ತು ಮಾನವರು, ಇಲಿಗಳು, ಕೋಳಿಗಳು ಮತ್ತು ಜೀಬ್ರಫಿಶ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಎಲ್ಲಾ ಹಂತಗಳಿಂದ ಅಂಗಾಂಶದ ಪ್ರಕಾರಗಳಲ್ಲಿ ಸರ್ವತ್ರ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ. ಆಯ್ದ ಅಂಗಾಂಶಗಳ ನಡುವೆ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ಗಮನಾರ್ಹ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿವೆ, ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯುಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಮೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ (7.8 ಆರ್ಪಿಕೆಎಂ) ಸಿ5ಆರ್ಎಫ್22 ಜೀನ್ನ ನೇರ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ (ಜಿಎಕ್ಸ್ಪಿ _ 55076) 1 ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಪ್ರವರ್ತಕವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರವರ್ತಕವು 1,081 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳು ಮತ್ತು 5 'ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶದೊಂದಿಗೆ ಭಾಗಶಃ ಅತಿಕ್ರಮಿಸುತ್ತದೆ. ಜಿಎಕ್ಸ್ಪಿ _ 55076 ಅನ್ನು ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ನಿಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅಂಶಗಳು ಟಾಟಾ ಬಾಕ್ಸ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅಂಶಗಳು, ಎಸ್ಎಂಎಡಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಅಂಶಗಳು, ಎಂಎಎಫ್/ಎಪಿ 1 ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಹಲವಾರು ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ನೆರೆಯ ಅಂಶಗಳಾದ C5orf22 ಹತ್ತಿರದ ನೆರೆಯ ಅಂಶವೆಂದರೆ ಡ್ರೋಶಾ, ಇದು C5orf22 ಗೆ ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಪ್ರಾಕ್ಸಿಮಲ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಆಗಿದೆ. ದ್ರೋಷವು ಡಬಲ್ ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ ಎಂಡೋರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಬಯೋಜೆನೆಸಿಸ್ನ ಮೊದಲ ಹಂತಕ್ಕೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. C5orf22 ರಚನೆಯು 2 ಗೋಳಾಕಾರದ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು 3 ಸಣ್ಣ ಅವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಆಣ್ವಿಕ-ತೂಕವು ಸುಮಾರು 50 ಕೆಡಿಎ ಆಗಿದೆ. ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಬಿಂದುವು 4.7 ಆಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ C5orf22 ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸರಾಸರಿ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಮೃದ್ಧಿಯಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಗಮನಾರ್ಹ ಬಾಹ್ಯರೇಖೆಗಳು ಇರಲಿಲ್ಲ. C5orf22 ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳು, ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ತಾಣಗಳು, ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳು, SH2 ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು ಮೈರಿಸ್ಟಿಲೇಷನ್ ಸೈಟ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಹಲವಾರು ಊಹಿಸಲಾದ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಸಬ್ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಡಿಸ್ಟ್ರಿಬ್ಯೂಷನ್ C5orf22 ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ನೊಳಗೆ ಕರಗುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರಬಹುದು. ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಇಮ್ಯುನೊಹಿಸ್ಟೊಕೆಮಿಕಲ್ ಸ್ಟೇನಿಂಗ್ C5orf22 ಅನ್ನು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗೆ ಸ್ಥಳೀಕರಣವನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಎಎ 175-185 ನಿಂದ ಊಹಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಭಾಗಶಃ ಪರಮಾಣು ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಸಂಕೇತವನ್ನು (ಎನ್ಎಲ್ಎಸ್) ಸೂಚಿಸಿದೆ. C5orf22 ನ ನಿಖರವಾದ ಕಾರ್ಯವು ಇನ್ನೂ ತಿಳಿದಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಒಂದು ಅಂಶವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉತ್ಪನ್ನವನ್ನು ಡಬ್ಲ್ಯು. ಬಿ. ಪಿ. 11/ಪಿಕ್ಯು. ಬಿ. ಪಿ. 1 ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಹೊಸ ಅಂಶವೆಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ರಿಪೇರಿನಿಂದ ಇಮ್ಯುನೊಮಾಡ್ಯುಲೇಷನ್ ವರೆಗಿನ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ವರ್ಣಪಟಲದಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಜೀನ್ಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. C5orf22 ನಾಕ್ಡೌನ್ ಆಯ್ದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಅಸಹಜ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ಜೀವಕೋಶದ ಚಕ್ರದ ಅಪಸಾಮಾನ್ಯ ಕ್ರಿಯೆಗೆ ಕಾರಣವಾದ ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಘಟನೆಗಳ ಡೌನ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಷನ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಜೀವಕೋಶದ ಸ್ಥಳೀಕರಣದ ಪುರಾವೆಗಳು ಮತ್ತು ಎನ್ಎಲ್ಎಸ್ನ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ಈ ಕಲ್ಪಿತ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಪರಸ್ಪರ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು C5orf22ನೊಂದಿಗೆ 20ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಗಳು ಸೂಚಿಸಿವೆ. ಇಂಟರಾಕ್ಟಂಟ್ಗಳು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂ ಎರಡಕ್ಕೂ ಸ್ಥಳೀಕರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಬಿ. ಪಿ. 11, ಓ. ಎಸ್. ಎಂ., ಸರ್ಫ್2, ಇ. ಎಲ್. ಓ. ಎಫ್1, ಮತ್ತು ಡಿ. ಡಿ. ಐ. ಟಿ. ಎಲ್. 4ಗಳು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆ ಹೆಚ್ಚು. ವಿಕಸನ ಮತ್ತು ಹೋಮೋಲಜಿ C5orf22 ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಅಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು 797 ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಿತು. ಇದು ಅದರ ವಂಶವಾಹಿ ಕುಟುಂಬದ ಏಕೈಕ ಸದಸ್ಯ. ಮಾನವನ ಯುಪಿಎಫ್0489 ಸಿ5ಆರ್ಎಫ್22ಅನ್ನು ಅಕಶೇರುಕಗಳ ಮೂಲಕ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. C5orf22 ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಎಲುಬಿನ ಮೀನುಗಳ ಮೂಲಕ ಎರಡು ಗೋಳಾಕಾರದ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಮತ್ತು ಸಂಧಿಪದಿಗಳೊಳಗೆ 1 ಗೋಳಾಕಾರದ ಡೊಮೇನ್ನ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಿವೆ. C5orf22 ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಪಾಯಿಂಟ್ ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕಗಳು ಎಲುಬಿನ ಮೀನುಗಳ ಮೂಲಕ 0.15 ಮತ್ತು 3kDa ಒಳಗೆ ಇದ್ದವು. ಮಾನವರಲ್ಲಿ c5orf22 ಗೆ ಯಾವುದೇ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳಿಲ್ಲ. ಯುಪಿಎಫ್0489 ಸಿ5ಆರ್ಎಫ್22 ನಿಧಾನವಾಗಿ ವಿಕಸನಗೊಳ್ಳುತ್ತಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಆರ್ಥೋಲೋಗಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಶೇಕಡಾವಾರು ಸರಿಪಡಿಸಿದ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಹೋಲಿಕೆಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆ ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ರೋಗಕಾರಕದಲ್ಲಿ ಮಿಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾತ್ರದ ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ರೋಗಿಗಳ ಬದುಕುಳಿಯುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಸಿ5ಆರ್ಎಫ್22ನ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ. ಟಿಬಿಯಲ್ ಮಸ್ಕ್ಯುಲರ್ ಡಿಸ್ಟ್ರೋಫಿ ಹೊಂದಿರುವ ರೋಗಿಯು C5orf22ನ ಕಡಿಮೆ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತಾನೆ. ಇಸ್ಕೆಮಿಕ್ ಅಲ್ಲದ ಕಾರ್ಡಿಯೊಮಿಯೊಪತಿ ಹೊಂದಿರುವ ರೋಗಿಯು C5orf22 ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತಾನೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು