ScGET-seq
ಸಿಂಗಲ್-ಸೆಲ್ ಜೀನೋಮ್ ಮತ್ತು ಎಪಿಜೆನೋಮ್ ಬೈ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಸೆಕ್) ತೆರೆದ ಮತ್ತು ಮುಚ್ಚಿದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಸಕ್ರಿಯ ಯೂಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ಮಾತ್ರ ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಅನುಕ್ರಮ (ಸ್ಕಾಟಾಕ್-ಸೆಕ್) ಯೊಂದಿಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್-ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದಾದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ಗಾಗಿ ಏಕ-ಕೋಶ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿದೆ. ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ಶೋಧಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಸಹ ಎಸ್. ಸಿ. ಜಿ. ಇ. ಟಿ-ಸೆಕ್ ಹೊಂದಿದೆ. ಇದನ್ನು ಟಿಎನ್ಎಚ್ ಬಳಕೆಯ ಮೂಲಕ ಸಾಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್-1-ಆಲ್ಫಾ (ಎಚ್. ಪಿ.-1) ನ ಕ್ರೋಮೋಡೋಮೈನ್ (ಸಿ. ಡಿ.) ಅನ್ನು ಟಿಎನ್5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ಗೆ ಜೋಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ರಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಟಿಎನ್ಎಚ್ ನಂತರ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ಗೆ ಗುರುತು ನೀಡುವ ಹಿಸ್ಟೋನ್ 3 ಲೈಸಿನ್ 9 ಟ್ರೈಮೀಥೈಲೇಷನ್ (ಎಚ್3ಕೆ9ಮೆ3) ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಅಕಿನ್ ಟು ಆರ್ಎನ್ಎ ವೇಗವು, ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ಡ್ ಟು ಅನ್ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ಡ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಪಾತವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಸೆಕ್ನಿಂದ ಪಡೆದ ಟಿಎನ್ಎಚ್ ಟು ಟಿಎನ್5 ಸಂಕೇತಗಳ ಅನುಪಾತವನ್ನು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ವೇಗವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲು ಬಳಸಬಹುದು, ಇದು ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಲಭ್ಯತೆಯ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಇತಿಹಾಸದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಣವು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಿಗಿಯಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ತೆರೆದ ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಲೇಖನಕ್ಕೆ ಅನುಮತಿಸುವ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್, ಜೀನೋಮ್ನ 2-3% ಅನ್ನು ಮಾತ್ರ ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶದ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳ 94.4% ಅನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಹೆಚ್ಚು ಬಿಗಿಯಾಗಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಲಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್, ಜೀನೋಮ್ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದೆ. ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಡಿಫರೆನ್ಸಿಯೇಷನ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯು ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ವಿಧಾನಗಳ ಕೊರತೆಯಿದೆ. ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನಂತಹ ಅನೇಕ ಜೀನೋಮಿಕ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಕಾಯಿಲೆಗಳು ಅವುಗಳ ಎಪಿಜೆನೋಮ್ನಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳು ಏಕ-ಜೀವಕೋಶದ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯಿಂದ ನಿರೂಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಇದು ಮೆಟಾಸ್ಟಾಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಏಕ-ಜೀವಕೋಶದ ಎಪಿಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಏಕ-ಜೀವಕೋಶದ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳ ಆಗಮನವು ಅವುಗಳ ಸ್ಪಷ್ಟೀಕರಣಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದ್ದರೂ, ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ತಿಳಿದಿಲ್ಲ. 2015ರಲ್ಲಿ, ಎಟಿಎಸಿ-ಸೆಕ್, ಟಿಎನ್5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಅನ್ನು ತುಣುಕು ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದಾದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅಥವಾ ಯೂಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಏಕ-ಕೋಶ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ನಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು. ಪ್ರತಿ ಜೀವಕೋಶದೊಳಗಿನ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರದ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರವಾದ ನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಈ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಸೆಕ್ ನಿರ್ಮಿಸುತ್ತದೆ. ವಿಧಾನಗಳು ಮಾದರಿ ತಯಾರಿಕೆ ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಸೆಕ್ಗಾಗಿ ಮಾದರಿ ತಯಾರಿಕೆಯು ಆರಂಭಿಕ ವಸ್ತುಗಳಿಗೆ ಸೂಕ್ತವಾದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಜೀವಕೋಶಗಳಿಂದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ಗಳ ಅಮಾನತು ಪಡೆಯುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. ಮುಂದಿನ ಹಂತವು ಟಿಎನ್ಹೆಚ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವುದು. ಟಿಎನ್5 ಒಂದು ಟ್ರಾನ್ಸ್ ಪೋಸೇಸ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೋಮ್ಗಳಿಂದ (ಓಪನ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್) ಬಂಧಿಸಲ್ಪಡದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಿಗೆ ಅಡಾಪ್ಟರ್ಗಳನ್ನು ಕತ್ತರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೋಡಿಸುತ್ತದೆ. HP-1a, HP1 ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಾಗಿದ್ದು, H3K9me3 ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಬಂಧಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಇದರ ಕ್ರೋಮೋಡೋಮೈನ್ ಈ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಮಾರ್ಪಾಡನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಪ್ರೇರಿತ-ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಮೂರು ಪಾಲಿ-ಟೈರೋಸಿನ್-ಗ್ಲೈಸಿನ್-ಸೆರಿನ್ (ಟಿ. ಜಿ. ಎಸ್) ಲಿಂಕರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕ್ರೋಮೋಡೋಮೈನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎಚ್. ಪಿ.-1ಎಯ ಮೊದಲ 112 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಟಿ. ಎನ್. 5ಗೆ ಜೋಡಿಸುವುದರಿಂದ ಟಿ. ಎನ್. ಎಚ್. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ನ ಸೃಷ್ಟಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಎಚ್3ಕೆ9ಮೆ3ನಿಂದ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಏಕ-ಜೀವಕೋಶದ ಎಟಿಎಸಿ-ಸೆಕ್ಗಾಗಿ ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ಶಿಷ್ಟಾಚಾರವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ತಯಾರಿಕೆಯನ್ನು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಅಮಾನತುಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಮೊದಲು ಟಿಎನ್5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಮತ್ತು ನಂತರ ಟಿಎನ್ಎಚ್ನೊಂದಿಗೆ ಕಾವುಕೊಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ದತ್ತಾಂಶ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಗುರಿಗಳೆಂದರೆಃ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ವಿಭಿನ್ನ ಜೀವಕೋಶದ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು ಮತ್ತು ನಿರೂಪಿಸುವುದು ಜೀನೋಮ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟಿನ್ ಲಭ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರೊಫೈಲ್ ಮಾಡಲು ನಕಲು-ಸಂಖ್ಯೆಯ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ಏಕ-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಪೂರ್ವ-ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ನಂತರದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ, ರೀಡ್ಗಳನ್ನು ಡಿಮಲ್ಟಿಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ಮಾಡಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸೂಕ್ತ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ. ನಕಲು ಮಾಡಲಾದ ರೀಡ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ತೆಗೆದುಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ. "ಶಿಖರಗಳು" ಅಥವಾ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಲಾದ ರೀಡ್ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿರುವ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಕಡಿಮೆ ಸಂಖ್ಯೆಯ ರೀಡ್ಗಳು ಅಥವಾ ಕಡಿಮೆ ಪತ್ತೆಯಾದ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಫಿಲ್ಟರ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ನಾಲ್ಕು ಎಣಿಕೆ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು (ಪ್ರತಿ ಕಾಲಮ್ ಒಂದು ಕೋಶವಾಗಿರುವ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಸಾಲು ಒಂದು ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯವಾಗಿರುವ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳು) ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತವೆಃ ಟಿಎನ್5-ಡಿಹೆಚ್ಎಸ್, ಟಿಎನ್5-ಕಂಪ್ಲೀಮೆಂಟ್, ಟಿಎನ್ಎಚ್-ಡಿಹೆಚ್ಎಸ್ ಮತ್ತು ಟಿಎನ್ಎಚ್-ಕಂಪ್ಲೀಮೆಂಟ್, ಇದು ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಸಂಕುಚಿತ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ನಿಂದ ಸಂಕೇತವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಆಯಾಮ ಕಡಿತ, ದೃಶ್ಯೀಕರಣ ಮತ್ತು ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಹಂಚಿದ ಪ್ರದೇಶಗಳಿಂದ ಫಿಲ್ಟರ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಸಾಮಾನ್ಯೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಲಾಗ್ 2 ಅನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರಧಾನ ಘಟಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು (ಪಿಸಿಎ) ಬಳಸಿಕೊಂಡು ರೇಖೀಯ ಆಯಾಮ ಕಡಿತವನ್ನು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀವಕೋಶಗಳ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಕೆ-ಎನ್ಎನ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಮತ್ತು ಲೈಡೆನ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಬಳಸಿ ಗುರುತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ಯುಎಂಎಪಿ ಕಡಿತವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ನಾಲ್ಕು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀವಕೋಶದ ಗುರುತಿನ ಟಿಪ್ಪಣಿಗೆ ಎರಡು ವಿಧಾನಗಳಿವೆಃ ಎಟಿಎಸಿ ಶಿಖರಗಳ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಉಲ್ಲೇಖ ಎಸ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೆಕ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಏಕೀಕರಣದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ. Tn5 ಮತ್ತು TnH ಸಂಕೇತಗಳ ಅನುಪಾತವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಮರುರೂಪಿಸುವಿಕೆಯು ಎಷ್ಟು ವೇಗವಾಗಿ ಮತ್ತು ಯಾವ ದಿಕ್ಕಿನಲ್ಲಿ ನಡೆಯುತ್ತಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುವ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಬಹುದು (ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ವೇಗ). ಅತ್ಯಂತ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾದ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಅಲ್ಲಿ ಯಾವ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಮೂಲಕ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಜೀವಕೋಶದೊಳಗೆ ಸಂಭವಿಸುವ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ವಿವಿಧ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ಕೊಡುಗೆಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ವೇಗವನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಭವಿಷ್ಯದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಮರುರೂಪಿಸುವಿಕೆಯು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಮುಂಚಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶದ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಪಥಗಳು ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಬಹುವಿಧದ ದತ್ತಾಂಶಗಳ ಏಕೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ ವೇದಿಕೆಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಧನಗಳು ಸಕ್ರಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಾಗಿವೆ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವೇಗದೊಂದಿಗೆ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ವೇಗದ ಏಕೀಕರಣದ ಮೂಲಕ ತಾತ್ಕಾಲಿಕ ಮತ್ತು ದಿಕ್ಕಿನ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ವಿಭಿನ್ನತೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮಿತಿಗಳು ಎಸ್. ಸಿ. ಜಿ. ಇ. ಟಿ.-ಎಸ್. ಇ. ಕ್ಯು. ಯು ಎಸ್. ಸಿ. ಎ. ಟಿ. ಎ. ಸಿ.-ಎಸ್. ಇ. ಕ್ಯು. ನಂತೆಯೇ ಕೆಲವು ಮಿತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎರಡೂ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯವಾದ ಜೀವಕೋಶಗಳಿಂದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಜೀವಕೋಶದ ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯತೆಯ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ. ಕಡಿಮೆ ಜೀವಕೋಶದ ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯತೆಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ಹಿನ್ನೆಲೆ ಡಿಎನ್ಎ ಮಾಲಿನ್ಯಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಅದು ಅಧಿಕೃತ ಜೈವಿಕ ಸಂಕೇತಗಳನ್ನು ನಿಖರವಾಗಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಸ್ಕಾಟಾಕ್-ಸೆಕ್ ಮತ್ತು ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಸೆಕ್ ದತ್ತಾಂಶದ ವಿರಳತೆ ಮತ್ತು ಗದ್ದಲದ ಸ್ವರೂಪವು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸವಾಲಿನದ್ದಾಗಿಸುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಈ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಹೇಗೆ ಉತ್ತಮವಾಗಿ ನಿರ್ವಹಿಸಬೇಕು ಎಂಬುದರ ಬಗ್ಗೆ ಇನ್ನೂ ಒಮ್ಮತವಿಲ್ಲ ಮತ್ತೊಂದು ಮಿತಿಯೆಂದರೆ ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಸೆಕ್ಗೆ ಇನ್ನೂ ಬೃಹತ್ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಎಸ್ಎನ್ವಿ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಊರ್ಜಿತಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಬೃಹತ್ ಎಕ್ಸೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಎಸ್ಇಕ್ಯೂ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ನಡುವೆ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧವಿದ್ದರೂ ಸಹ, ಎಸ್ಸಿಜಿಇಟಿ-ಎಸ್ಇಕ್ಯೂ ಎಲ್ಲಾ ಎಕ್ಸೋಮ್ ಎಸ್ಎನ್ವಿಗಳನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯಲು ವಿಫಲವಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ತಂತ್ರಗಳು