ZNF548
ಝಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 548 (ZNF548) ಎಂಬುದು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 19ರಲ್ಲಿರುವ ZNF548 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ನಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದು ಕ್ರುಪೆಲ್ C2H2-ರೀತಿಯ ಸತು-ಬೆರಳಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಅನೇಕ ಸತು-ಬೆರಳಿನ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ 4987 ಬಿಪಿ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ರೂಪಾಂತರ 1 ಅನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಅತಿ ಉದ್ದದ ZNF548 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 19ರಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ; ಇದರ ನಿಖರವಾದ ಸ್ಥಾನವು ಪ್ಲಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿ 19q13.43 ಆಗಿದೆ. ಜೀನ್ 4 ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಇದು ಕ್ರುಪೆಲ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಪೆಟ್ಟಿಗೆ (ಕೆಆರ್ಎಬಿ ಡೊಮೇನ್) ಮತ್ತು 11 ಸತು ಬೆರಳು ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳಿಗೆ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ZNF548 ವಂಶವಾಹಿಯ ಪ್ರವರ್ತಕವು 1198 ಬೇಸ್ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 19ರ ಮೇಲೆ 57388850-57390047ರಲ್ಲಿ ಇದೆ. ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು 6 ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆಃ ರೀಸಸ್ ಮಕಾಕ್ (ರೀಸಸ್ ಮಂಗ), ಪ್ಯಾನ್ ಟ್ರೊಗ್ಲೋಡೈಟ್ಸ್ (ಚಿಂಪಾಂಜಿ), ಒರಿಕ್ಟೋಲಾಗಸ್ ಕುನಿಕ್ಯುಲಸ್ (ಯುರೋಪಿಯನ್ ಮೊಲ), ಈಕ್ವಸ್ ಕ್ಯಾಬಲಸ್ (ಕುದುರೆ), ಕ್ಯಾನಿಸ್ ಲೂಪಸ್ ಪರಿಚಿತ (ನಾಯಿ) ಮತ್ತು ಸುಸ್ ಸ್ಕ್ರೋಫಾ (ಹಂದಿ). ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರೂಪಾಂತರ 1 ಅತಿ ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು 545 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವಿರುವ ಅತಿ ಉದ್ದದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ (ZNF548 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 1) ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ರೂಪಾಂತರ 2ರಲ್ಲಿ ಎಕ್ಸಾನ್ 2 ಕಾಣೆಯಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು 533 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಉದ್ದವಿರುವ ZNF548 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ 2 ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ZNF548 ಕ್ರುಪೆಲ್ C2H2-ರೀತಿಯ ಸತು ಬೆರಳಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು 11 Cys2His2-ರೀತಿಯ ಸತು ಬೆರಳಿನ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಸತುವಿನ ಬೆರಳು ಸಂರಕ್ಷಿತ ββα ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಅಲ್ಲಿ ಸತುವಿನ ಪರಮಾಣು C2H2 ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ZNF548 ತನ್ನ C2H2 Zn ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೂಲಕ 44 bp ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಲಗತ್ತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ 4 ಡಿಎನ್ಎ ಬೇಸ್ಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ರುಪೆಲ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯನ್ನು (ಕೆ. ಆರ್. ಎ. ಬಿ) ಸಹ ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಎನ್ ಟರ್ಮಿನಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅನೇಕ ಚಾರ್ಜ್ ಮಾಡಲಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ; ಇದು ಕೆ. ಎ. ಪಿ.-1/ಟಿ. ಐ. ಎಫ್. 1-ಬೀಟಾ ಕೋ-ರೆಪ್ರೆಸರ್ನ ರಿಂಗ್-ಬಿ ಬಾಕ್ಸ್-ಕಾಯಿಲ್ಡ್ ಕಾಯಿಲ್ (ಆರ್ಬಿಸಿಸಿ) ಡೊಮೇನ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ZNF548 ನ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು I-ಟಾಸರ್ ಬಳಸಿ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ZNF548 64 kDa ನ ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕವನ್ನು ಮತ್ತು 8,21 ರ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಬಿಂದುವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ZNF548 ನ ಸಂಯೋಜನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಅಲನೈನ್ ನಿರೀಕ್ಷೆಗಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಶೇಕಡಾವಾರು ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಮಾನವ ZNF548 ನಲ್ಲಿ ನಿರೀಕ್ಷೆಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಶೇಕಡಾವಾರು ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. ಉಪಕೋಶದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂ ಅಥವಾ ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಬಹುದು. ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಅಂಗಾಂಶ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ZNF548 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಕಡಿಮೆ ಅಂಗಾಂಶದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ; ಇದು ಎಲ್ಲಾ ಮಾನವ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪತ್ತೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮಾನವನ ZNF548 ಪ್ರೋಟೀನಿನ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಡಿಸ್ಟ್ರಿಬ್ಯೂಷನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ನುಡ್ಇ-ಲೈಕ್ 1 (ಎನ್ಡಿಇಎಲ್1) ಮತ್ತು ಡಿಸ್ರಪ್ಟೆಡ್ ಇನ್ ಸ್ಕಿಜೋಫ್ರೇನಿಯಾ 1 (ಡಿಐಎಸ್ಸಿ1) ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಎರಡು ಹೈಬ್ರಿಡ್ ಫ್ರಾಗ್ಮೆಂಟ್ ಪೂಲಿಂಗ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. 36 (ಎಲ್. ಆರ್. ಆರ್. ಸಿ. 36), ಮಯೋಟುಬುಲಾರಿನ್ 1 (ಎಂ. ಟಿ. ಎಂ. 1), ಮಯೋಟುಬುಲಾರಿನ್ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ 4 (ಎಂ. ಟಿ. ಎಂ. ಆರ್. 4) ಮತ್ತು ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮೋಟಿಫ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 39 (ಆರ್. ಬಿ. ಎಂ. 39) ಹೊಂದಿರುವ ಲ್ಯೂಸಿನ್ ರಿಚ್ ರಿಪೀಟ್ ಸಹ ಅಫಿನಿಟಿ ಕ್ಯಾಪ್ಚರ್-ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಮೂಲಕ ಜೆಡ್. ಎನ್. ಎಫ್. 548 ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಕಾರ್ಯ ZNF548 ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು ಮತ್ತು ಸತು ಅಯಾನುಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಇತರ ಕೆಆರ್ಎಬಿ-ಝಡ್ಎನ್ಎಫ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಆಧರಿಸಿ, ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ನಿಂದ ಲಿಪ್ಯಂತರಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ಇದು ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಇದು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಅಂಶವಾಗಿದ್ದು, ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ನಿಂದ ಲಿಪ್ಯಂತರಗೊಂಡ ಕೆಲವು ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ತಡೆಯುತ್ತದೆ. ಇದು ಅದರ ಸತು-ಬೆರಳುಗಳ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸ್ಥಳದ ಅದೇ ಎಳೆ (ಸಿಸ್) ಯಲ್ಲಿರುವ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿರುವ ಕೆ. ಆರ್. ಎ. ಬಿ-ಝಡ್. ಎನ್. ಎಫ್/ಕೆ. ಎ. ಪಿ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಭಾಗವಾಗುತ್ತದೆ. ಕೆ. ಆರ್. ಎ. ಬಿ.-ಝಡ್. ಎನ್. ಎಫ್. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಂಕೋಚಕಗಳೆಂದು ಪ್ರಸಿದ್ಧವಾಗಿವೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ZNF548 ನಂತಹ KRAB-ZNF ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಾಗ ಮತ್ತು ಅದರ KRAB ಡೊಮೇನ್ ಮೂಲಕ ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ KAP1 ಸಹ-ಸಂಕೋಚಕಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಸಾಂದ್ರಗೊಳಿಸಲು ಮತ್ತು ಅದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ತಡೆಗಟ್ಟಲು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಡೀಸೆಟಿಲೇಸ್ಗಳು, ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮೀಥೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಟೆರೋಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಂತಹ ವಿವಿಧ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹೋಮೋಲಾಗ್ಸ್ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ ZNF548 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಸಸ್ತನಿಗಳ ವಿವಿಧ ಶ್ರೇಣಿಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಸಸ್ತನಿಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ C2H2 ತರಹದ ಮಡಿಕೆ ಗುಂಪುಗಳು ಬಹಳ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿವೆ ಎಂಬ ಅಂಶಕ್ಕೆ ಇದು ಅನುಗುಣವಾಗಿದೆ. ಕೆ. ಆರ್. ಎ. ಬಿ ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು ಸತು ಬೆರಳಿನ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕೆಳಗಿನ ಕೋಷ್ಟಕದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವಂತೆ ZNF548 ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳು ಮಾನವರಲ್ಲಿ 25 ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆ ZNF548 ಅನ್ನು ಮೆಟಾ-ವೈರಸ್ ಸಿಗ್ನೇಚರ್ (MVS) ನಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ವೈರಲ್ ಸೋಂಕು ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳನ್ನು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸೋಂಕು ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳಿಂದ ಮತ್ತು ಆರೋಗ್ಯಕರ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ZNF548 ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಅಂಡಾಶಯದ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಅನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಮಾರ್ಕರ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ZNF548 ರಕ್ತದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಅನ್ನು ಆತ್ಮಹತ್ಯೆಗೆ ಗುರುತುಗಾರನಾಗಿಯೂ ಬಳಸಬಹುದು. ಮಾನವ ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಮೇಲೆ ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಜೀನ್ಗಳು 19 ಝಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು