RK2 plasmid
ಆರ್. ಕೆ. 2 ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಐ. ಎನ್. ಸಿ. ಪಿ. ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಿದ ವಿಶಾಲ-ಆತಿಥೇಯ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ವಿವಿಧ ರೀತಿಯ ಏಕಕೋಶೀಯ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಪುನರಾವರ್ತಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕೆ ಹೆಸರುವಾಸಿಯಾಗಿದೆ, ಇದು ಆನುವಂಶಿಕ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಸಾಧನವಾಗಿ ಸೂಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಇದು ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಕುಲಗಳಲ್ಲಿ ವರ್ಗಾವಣೆ, ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಮತ್ತು ನಿರ್ವಹಣೆಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಆರ್. ಕೆ. 2 ಅನ್ನು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಪಿ. ಆರ್. ಕೆ. 2 ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಬಹುದು, ಇದು ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲದ ಮತ್ತೊಂದು ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ನ ಹೆಸರೂ ಆಗಿದೆ. ಆರ್ ಕೆ 2 ಗೆ ಇತರ ಹೆಸರುಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ 18, ಆರ್ 68, ಆರ್ ಪಿ 1, ಮತ್ತು ಆರ್ ಪಿ 4 ಸೇರಿವೆ. ಇವೆಲ್ಲವೂ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಐಸೋಲೇಟ್ಗಳಾಗಿದ್ದವು ಮತ್ತು ನಂತರ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳೆಂದು ಕಂಡುಬಂದವು. ಆರ್. ಕೆ. 2 ಒಂದು ಭಾಗವಾಗಿರುವ ಐ. ಎನ್. ಸಿ. ಪಿ.-1 ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಗುಂಪು (ಐ. ಎನ್. ಸಿ. ಪಿ. ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳು ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ) ಅನ್ನು "ಸಂಕೀರ್ಣ ನಿಯಂತ್ರಕ ಸರ್ಕ್ಯೂಟ್ನೊಂದಿಗೆ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಬಲವಾದ, ಸ್ವಯಂ-ಹರಡುವ, ಸ್ವಾರ್ಥಿ ಡಿಎನ್ಎ ಅಣುಗಳು" ಎಂದು ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. 1969 ರಲ್ಲಿ ಬರ್ಮಿಂಗ್ಹ್ಯಾಮ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಜೀವಕ-ನಿರೋಧಕ ಸ್ಯೂಡೋಮೊನಸ್ ಎರುಜಿನೋಸಾ ಮತ್ತು ಕ್ಲೆಬ್ಸಿಯೆಲ್ಲಾ ಏರೋಜೆನ್ಗಳ ಏಕಾಏಕಿ ಸಂಭವಿಸಿದ ಸಂಬಂಧದಲ್ಲಿ ಡಿಸ್ಕವರಿ ಆರ್. ಕೆ. 2 ಅನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಯಿತು, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳ ನಡುವೆ ಆಂಪಿಸಿಲಿನ್ ಪ್ರತಿರೋಧದ ವರ್ಗಾವಣೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ. ಐ. ಎನ್. ಸಿ. ಪಿ-1 ಉಪಗುಂಪಿನಲ್ಲಿರುವ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳನ್ನು ತ್ಯಾಜ್ಯನೀರು, ಕೃಷಿ ಮಣ್ಣು ಮತ್ತು ಆಸ್ಪತ್ರೆಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆರ್ಕೆ2 ರಚನೆಯು ಸರಿಸುಮಾರು 60 ಕೆಬಿಪಿ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕೃತಿ, ನಿರ್ವಹಣೆ, ಸಂಯೋಗ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಪ್ರತಿರೋಧಕ್ಕಾಗಿ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿರೋಧಕ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಾದ ಕನಮೈಸಿನ್, ಆಂಪಿಸಿಲಿನ್ ಮತ್ತು ಟೆಟ್ರಾಸೈಕ್ಲಿನ್ಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆ. ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, ಆರ್. ಕೆ. 2. ಕಿಲೊ ಜೀನ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಸಂಭಾವ್ಯ ಮಾರಕ (ಜೀವಕೋಶಕ್ಕೆ) ಜೀನ್ಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಮತ್ತು ಕಿಲೊ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಕೋರ್ (ಕಿಲೊ-ಓವರ್ ರೈಡ್ಗೆ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ) ಜೀನ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಪೂರಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿರೋಧಕ ಜೀನ್ಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಆರ್. ಕೆ. 2 ನ ವಿಶಾಲ ಆತಿಥೇಯ ಶ್ರೇಣಿಯಲ್ಲಿ ಕಿ ಮತ್ತು ಕೋರ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಒಟ್ಟಾಗಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಶಂಕಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಆರ್. ಕೆ. 2ರಲ್ಲಿನ ಅಗತ್ಯ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಪ್ರತಿಕೃತಿ, ಒರಿವಿ ಮತ್ತು ಜೀನ್, ಟಿ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎ. ಯ ಮೂಲವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಇದರ ಜೀನ್ ಉತ್ಪನ್ನವಾದ ಟಿ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎ. ಪ್ರೋಟೀನ್, <ಐ. ಡಿ. 1> ಎಂ. ಥಾಮಸ್, ರಿಚರ್ಡ್ ಮೇಯರ್, * ಮತ್ತು ಡೊನಾಲ್ಡ್ ಆರ್. ಹೆಲಿನ್ಸ್ಕಿಃ "ಪುನರಾವರ್ತನೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ವಹಣೆಗೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾದ ಬ್ರಾಡ್-ಹೋಸ್ಟ್-ರೇಂಜ್ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಆರ್. ಕೆ. 2 ಪ್ರದೇಶಗಳು", ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಲಜಿ, ಸಂಪುಟ. 172, ನಂ. ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ, ಟಿ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎ. ಯಿಂದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಂಡ ನಂತರ ಒರಿವಿಯಿಂದ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯು ಏಕಮುಖವಾಗಿ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ, ಅನೇಕ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪ್ರತಿಗಳು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಆಗಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಪ್ರತಿ cell.Kolatka ಕೆ, ವಿಟೊಸಿನ್ಸ್ಕಾ ಎಂ, ಪಿಯರೆಕಾಡ್ ಎಂ, ಕೊನಿಜ್ನಿ ಐನಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಮಲ್ಟಿಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ಗಳನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತವೆಃ "ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವಿಭಜಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ವಿಶಾಲ-ಹೋಸ್ಟ್-ಶ್ರೇಣಿಯ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಆರ್ಕೆ2ನ ಉಪಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ", ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್, 2010 ನವೆಂಬರ್; 64 (3): 119-34 ಆರ್ಕೆ2ನ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆ ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ಕೋಶಕ್ಕೆ ಸುಮಾರು 4-7 ಮತ್ತು ಪಿ. ಎರುಜಿನೋಸಾದಲ್ಲಿ 3 ಆಗಿದೆ. ಕನಿಷ್ಠ ಉತ್ಪನ್ನಗಳು ಆರ್. ಕೆ. 2 ನ ಹಲವಾರು ಕನಿಷ್ಠ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಲಾಗಿದ್ದು, ಪುನರಾವರ್ತನೆಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಜೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚು ಆಯ್ದ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಬಿಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ಒಂದು "ಮಿನಿ-ಪ್ರತಿಕೃತಿ" ಎಂದರೆ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪಿ. ಎಫ್. ಎಫ್. 1, ಇದು 5873 ಬೇಸ್ಪೇರ್ಗಳ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ. ಪಿಎಫ್ಎಫ್1 ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಮೂಲ, ಒರಿವಿ, ವರ್ಗಾವಣೆಯ ಮೂಲ, ಒರಿಟಿ, ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಜೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್, ಟಿಆರ್ಎಫ್ಎ, ಮತ್ತು ಎರಡು ಪ್ರತಿಜೀವಕ ನಿರೋಧಕ ಜೀನ್ಗಳಾದ ಬ್ಲಾ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಟ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಕ್ರಮವಾಗಿ ಆಂಪಿಸಿಲಿನ್ ಮತ್ತು ಕ್ಲೋರಾಂಫೆನಿಕೋಲ್ಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಪಿ. ಎಫ್. ಎಫ್. 1 ನಂತಹ ಕನಿಷ್ಠ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳು ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಮತ್ತು ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಮೂಲ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತಿರುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಕಡಿಮೆ ಅನಗತ್ಯ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳಿವೆ. ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ನ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಪಿಎಫ್ಎಫ್1ನ ಹಲವಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಂತಹ ಎರಡು ರೂಪಾಂತರಗಳಾದ ಪಿಎಫ್ಎಫ್1ಕೋಪ್254ಡಿ ಮತ್ತು ಪಿಎಫ್ಎಫ್1ಕೋಪ್271ಸಿ, ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿನ ಪಿಎಫ್ಎಫ್1ನ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಸರಿಸುಮಾರು 39-40 ನಿಂದ ಪ್ರತಿ ಕೋಶಕ್ಕೆ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಸುಮಾರು 501 ಮತ್ತು 113 ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತವೆ. ಪುನರಾವರ್ತಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಉತ್ಪಾದನಾ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಆನುವಂಶಿಕ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಅನ್ವಯಗಳಿಗೆ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿನ ಹೆಚ್ಚಳವು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಮತ್ತಷ್ಟು ಓದುವ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ವೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಬಯೋಸೊಲ್ಯೂಷನ್ಸ್ಃ "ದಿ ಆರ್. ಕೆ. 2 ರೆಪ್ಲಿಕಾನ್", http://vectronbiosolutions.com/info.php?id=14 ಮೆಯೆರ್, ಮತ್ತು ಇತರರು. : "ವಿಶಾಲ ಆತಿಥೇಯ ಶ್ರೇಣಿಯ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ RK2 ನ ಆಣ್ವಿಕ ವಾಹನ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು", ಸೈನ್ಸ್, ಡಿಸೆಂಬರ್ 1975: pp. 1226-1228. https://www.science.org/doi/abs/10.1126/science.1060178 ಸ್ಟ್ಯಾನ್ಫೋರ್ಡ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾನಿಲಯದ ಜೀನೋಮ್ ದತ್ತಾಂಶಃ http://genome-www.stanford.edu/vectordb/vector_descrip/NOTCOMPL/RK2.SEQ.html ಸಿ. ಎಂ. ಥಾಮಸ್ (ಸಂಪಾದಕ): "ಪ್ರೋಮಿಸ್ಕ್ಯೂಸ್ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಸ್ ಆಫ್ ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ", ಅಕಾಡೆಮಿಕ್ ಪ್ರೆಸ್, ಲಂಡನ್, 1989. ಸಿ. ಎಂ. ಥಾಮಸ್, ಮತ್ತು ಸಿ. ಎ. ಸ್ಮಿತ್ಃ "ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಗುಂಪು ಪಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಸ್ಃ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್, ಎವಲ್ಯೂಷನ್, ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮ್ಯಾನಿಪ್ಯುಲೇಷನ್ನಲ್ಲಿ ಬಳಕೆ", ಮೈಕ್ರೋಬಯಾಲಜಿಯ ವಾರ್ಷಿಕ ವಿಮರ್ಶೆ, ಸಂಪುಟ. 41: 77-101, ಅಕ್ಟೋಬರ್ 1987 "ಪಾನ್ಸೆಗ್ರೌ ಮತ್ತು ಇತರರು. : "ಕಂಪ್ಲೀಟ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಫ್ ಬರ್ಮಿಂಗ್ಹ್ಯಾಮ್ ಇಂಕ್ಪಿಎ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಸ್ಃ ಕಂಪೈಲೇಷನ್ ಅಂಡ್ ಕಂಪ್ಯಾರಿಟಿವ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್", ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಬಯಾಲಜಿ, ಸಂಪುಟ 239, ಸಂಚಿಕೆ 5,23 ಜೂನ್ 1994, ಪುಟಗಳು 623-663 ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಡೇಟಾಃ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/508311?report=genbank&log $= ನ್ಯೂಕ್ಲೊಪ್ಟಾಪ್ & ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ _ ರ್ಯಾಂಕ್ = 18 & ಆರ್ಐಡಿ = ಸಿಡಿ93ಆರ್ಯುಎ001ಎಸ್ ಮೊಬೈಲ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಲಿಮೆಂಟ್ಸ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಬಯಾಲಜಿ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ಸ್