Virtual Cell
ವರ್ಚುವಲ್ ಸೆಲ್ (ವಿಸಿಎಲ್) ಎಂಬುದು ಜೀವಂತ ಜೀವಿಗಳ, ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಮಾದರಿ ಮತ್ತು ಅನುಕರಣೆಗಾಗಿ ತೆರೆದ ಮೂಲ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ವೇದಿಕೆಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಜೀವಕೋಶ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರಿಂದ ಹಿಡಿದು ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಜೈವಿಕ ಭೌತವಿಜ್ಞಾನಿಗಳವರೆಗೆ ವ್ಯಾಪಕ ಶ್ರೇಣಿಯ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳಿಗೆ ಸಾಧನವಾಗಿ ಇದನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕಾನ್ಸೆಪ್ಟ್ ವರ್ಚುವಲ್ ಸೆಲ್ ಎಂಬುದು ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರ, ಪೊರೆಯ ಸಾಗಣೆ ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ಬಹುಕೋಶೀಯ ಅಂಗಾಂಶಗಳ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜ್ಯಾಮಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಸರಣವನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಮತ್ತು ಅನುಕರಿಸಲು ಒಂದು ಸುಧಾರಿತ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ವೇದಿಕೆಯಾಗಿದೆ. ವಿಸೆಲ್ ಮಾದರಿಗಳು ಶ್ರೇಣೀಕೃತ ಮರದ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಕಾಂಡದ ಮಟ್ಟವು ವಿಭಾಗಗಳು, ಪ್ರಭೇದಗಳು ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಕಾರ್ಯಗಳಾದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ದರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ "ಶರೀರಶಾಸ್ತ್ರ" ವಾಗಿದೆ. ಜಾತಿಗಳ ಆರಂಭಿಕ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಗಮನಿಸಿದರೆ, ಕಾಲಾನಂತರದಲ್ಲಿ ಈ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳು ಹೇಗೆ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿಸೆಲ್ ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಬಹುದು. ಈ ಸಂಖ್ಯಾತ್ಮಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ನಿರ್ವಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಹಲವಾರು "ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ಗಳು" ಮೂಲಕ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆಯೇ ಅಥವಾ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿದೆಯೇ ಮತ್ತು ಪ್ರಾದೇಶಿಕವಾಗಿದೆಯೇ ಅಥವಾ ಕಂಪಾರ್ಟ್ಮೆಂಟಲ್ ಆಗಿದೆಯೇ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸುತ್ತದೆ; ಬಹು "ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ಗಳು" ಆರಂಭಿಕ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳು, ಪ್ರಸರಣ ಗುಣಾಂಕಗಳು, ಹರಿವಿನ ದರಗಳು ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಮಾದರಿ ಊಹೆಗಳನ್ನು ಸಹ ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಬಹುದು. ಹೀಗಾಗಿ "ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳನ್ನು" ದೈಹಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಬಗೆಗಿನ ವಿಚಾರಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳಾಗಿ ನೋಡಬಹುದು. ಪ್ರತಿ "ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್" ಗಣಿತದ ವಿವರಣೆಗೆ ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತವಾಗಿ ವಿಸೆಲ್ ಮ್ಯಾಥ್ ಡಿಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಲಾಂಗ್ವೇಜ್ಗೆ ಅನುವಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ನಿಯತಾಂಕ ಸ್ಕ್ಯಾನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಹಾರಕ ವಿಶೇಷಣಗಳಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಅನೇಕ "ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು" ಪ್ರತಿ "ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್" ಒಳಗೆ ಚಲಾಯಿಸಬಹುದು. ಮಾದರಿಗಳು ಸರಳದಿಂದ ಹಿಡಿದು ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣವಾಗಿರಬಹುದು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ದತ್ತಾಂಶ ಮತ್ತು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಊಹೆಗಳ ಮಿಶ್ರಣವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಬಹುದು. ವರ್ಚುವಲ್ ಸೆಲ್ ಅನ್ನು ಅಂತರ್ಜಾಲದ ಮೂಲಕ ವಿತರಿಸಿದ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಆಗಿ ಅಥವಾ ಸ್ವತಂತ್ರ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಆಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಚಿತ್ರಾತ್ಮಕ ಬಳಕೆದಾರ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಸೂಕ್ತವಾದ ಪದಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಕೀರ್ಣ ಮಾದರಿಗಳ ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆಃ ವಿಭಾಗದ ಆಯಾಮಗಳು ಮತ್ತು ಆಕಾರ, ಆಣ್ವಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಮತ್ತು ಸಂವಹನ ನಿಯತಾಂಕಗಳು. ವಿಸಿಎಲ್ ಜೈವಿಕ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ಭೇದಾತ್ಮಕ ಸಮೀಕರಣಗಳ ಸಮಾನ ಗಣಿತದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. ಬಳಕೆದಾರರು ಸಾಮಾನ್ಯ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಸ್ಕೀಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಜೈವಿಕ ದೃಷ್ಟಿಕೋನ ಮತ್ತು ಗಣಿತದ ದೃಷ್ಟಿಕೋನದ ನಡುವೆ ಹಿಂದಕ್ಕೆ ಮತ್ತು ಮುಂದಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು. ವಾಸ್ತವವಾಗಿ, ಬಳಕೆದಾರರು ಬಯಸಿದರೆ, ಅವರು ಗಣಿತದ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಕುಶಲತೆಯಿಂದ ನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು, ಯೋಜನಾ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಬಹುದು. ಗಣಿತದ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಕೋಡ್ ಆಗಿ ಭಾಷಾಂತರಿಸಲು ವೀಸೆಲ್ ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಸಂಖ್ಯಾತ್ಮಕ ಪರಿಹಾರಕಗಳ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಆನ್ಲೈನ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಬಹುದು ಅಥವಾ ಅವುಗಳನ್ನು ವಿವಿಧ ರಫ್ತು ಸ್ವರೂಪಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಕೆದಾರರ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗೆ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಬಹುದು. ವರ್ಚುವಲ್ ಸೆಲ್ ಪರವಾನಗಿಯು ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಮುದಾಯದ ಎಲ್ಲಾ ಸದಸ್ಯರಿಗೆ ಉಚಿತ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಬಳಕೆದಾರರು ತಮ್ಮ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಯು. ಕನೆಕ್ಟಿಕಟ್ನ ಸರ್ವರ್ಗಳಲ್ಲಿ ನಿರ್ವಹಿಸಲಾಗುವ ವಿಸೆಲ್ ಡಾಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಉಳಿಸಬಹುದು. ವೀಸೆಲ್ ದತ್ತಸಂಚಯವು ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ತಮ್ಮ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಖಾಸಗಿಯಾಗಿ ನಿರ್ವಹಿಸಲು, ಆಯ್ದ ಸಹಯೋಗಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲು ಅಥವಾ ಅವುಗಳನ್ನು ಸಾರ್ವಜನಿಕಗೊಳಿಸಲು ಅನುಮತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರವೇಶ ನಿಯಂತ್ರಣ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ವಿಸಿಎಲ್ ಜಾಲತಾಣವು ಸಾರ್ವಜನಿಕವಾಗಿರುವ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಮಾದರಿಗಳ ಹುಡುಕಬಹುದಾದ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು ವಿಸೆಲ್ ಈ ಕೆಳಗಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆಃ "ಶರೀರಶಾಸ್ತ್ರ" ದೊಳಗೆ, ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಜಾಲಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ನಿಯಮಗಳೆಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಬಹುದು. ಜಾಗದ ಮೇಲೆ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು (ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು) ಅಥವಾ ವಿಭಾಗಗಳಾದ್ಯಂತ ಸ್ಥಿರವಾದ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಊಹಿಸಬಹುದು (ಕಂಪಾರ್ಟ್ಮೆಂಟಲ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು). ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳಿಗಾಗಿ, ಜ್ಯಾಮಿತಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಣಾತ್ಮಕ ಜ್ಯಾಮಿತಿ ಸಮೀಕರಣಗಳಿಂದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಬಹುದು, ಸರಳ ಆಕಾರಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ 3ಡಿ ಕಾನ್ಫೋಕಲ್ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಕೋಪ್ ಸ್ಟ್ಯಾಕ್ಗಳಂತಹ ಆಮದು ಮಾಡಿದ ಚಿತ್ರಗಳಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್, ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯ, ಸೈಟೋಸಾಲ್ ಮತ್ತು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯಗಳಂತಹ ಪ್ರದೇಶಗಳಾಗಿ ಚಿತ್ರ ದತ್ತಾಂಶದ 3ಡಿ ವಿಭಜನೆಯ ಉಪಯುಕ್ತತೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸಂಖ್ಯೆಗಳ (ನಿರ್ಣಾಯಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು) ಬಳಕೆಯಿಲ್ಲದೆ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಸಮೀಕರಣಗಳ ಏಕೀಕರಣವನ್ನು ಆಧರಿಸಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಘಟನೆಗಳನ್ನು (ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳು) ಆಧರಿಸಿರಬಹುದು. 6 ಸಾಧಾರಣ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಸಮೀಕರಣ (ODE) ಪರಿಹಾರಕಗಳು, 2 ಭಾಗಶಃ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಸಮೀಕರಣ (PDE) ಪರಿಹಾರಕಗಳು, 4 ಪ್ರಾದೇಶಿಕವಲ್ಲದ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಪರಿಹಾರಕಗಳು ಮತ್ತು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಅನುಕರಣೆಗಳಿಗಾಗಿ ಸ್ಮೋಲ್ಡಿನ್ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಪರಿಹಾರಕಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ಚಲಾಯಿಸಬಹುದು. ಕೆಲವು ಪ್ರಭೇದಗಳು ಕಡಿಮೆ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿದ್ದರೆ ಮತ್ತು ಇತರ ಪ್ರಭೇದಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ನಕಲು ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿದ್ದರೆ ಅಂತಹ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ವಿಸೆಲ್ ಹೈಬ್ರಿಡ್ ನಿರ್ಣಾಯಕ/ಸಂಭವನೀಯ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪರಿಹಾರಕವನ್ನು ಸಹ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಜಾಲಬಂಧ ಮುಕ್ತ ಪರಿಹಾರಕವಾದ ಎನ್. ಎಫ್. ಎಸ್. ಐ. ಎಂ. ಅನ್ನು ದೊಡ್ಡ ಸಂಯೋಜಿತ ಸಂಕೀರ್ಣ ನಿಯಮ-ಆಧಾರಿತ ಮಾದರಿಗಳ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಅನುಕರಣೆಗಾಗಿ ಲಭ್ಯಗೊಳಿಸಲಾಯಿತು. ಹೆಚ್ಚಿನ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಸ್ಥಳೀಯವಾಗಿ ಚಲಾಯಿಸಬಹುದು, ಎಲ್ಲಾ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ವಿಸೆಲ್ ಸರ್ವರ್ಗಳಲ್ಲಿ ದೂರದಿಂದಲೇ ಚಲಾಯಿಸಬಹುದು. ಕಂಪಾರ್ಟ್ಮೆಂಟಲ್ ಡಿಟರ್ಮಿನಿಸ್ಟಿಕ್ ಮಾದರಿಗಳಿಗೆ, ಕೋಪಾಸಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಸರಿಹೊಂದುವ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ನಿಯತಾಂಕ ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಉಪಕರಣಗಳು ವಿಸಿಎಲ್ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ ಸೆಟಪ್ಗಳನ್ನು (ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ) ಸ್ಥಳೀಯ ಫೈಲ್ಗಳಲ್ಲಿ ವರ್ಚುವಲ್ ಸೆಲ್ ಮಾರ್ಕಪ್ ಲ್ಯಾಂಗ್ವೇಜ್ (ವಿಸಿಎಂಎಲ್) ಆಗಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಬಹುದು ಅಥವಾ ವಿಸಿಎಲ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ದೂರದಿಂದಲೇ ಸಂಗ್ರಹಿಸಬಹುದು. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಮದು ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು ಮತ್ತು ಸಿಸ್ಟಮ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿ ಮಾರ್ಕಪ್ ಲ್ಯಾಂಗ್ವೇಜ್ (ಎಸ್. ಬಿ. ಎಂ. ಎಲ್.) ಆಗಿ ರಫ್ತು ಮಾಡಬಹುದು. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಜೈವಿಕ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಜೈವಿಕ ಮಾರ್ಗ ವಿನಿಮಯ (ಬಯೋಪಾಕ್ಸ್) ಆಗಿ ಆಮದು ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಜೈವಿಕ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ದತ್ತಾಂಶ ಮೂಲಗಳು ವಿ. ಸಿ. ಇ. ಎಲ್. ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು ವಿವಿಧ ಮೂಲಗಳಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆಃ ವಿ. ಸಿ. ಇ. ಎಲ್. ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಅವರ ಲೇಖಕರು ಕೆಲವು ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ (ಹಂಚಿಕೊಂಡ) ಅಥವಾ ಎಲ್ಲಾ ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ (ಸಾರ್ವಜನಿಕ) ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು. ವಿಸಿಎಲ್ ಜೈವಿಕ ಮಾದರಿಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯದಿಂದ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಮದು ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಜೈವಿಕ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಪಾಥ್ವೇ ಕಾಮನ್ಸ್ನಿಂದ ಆಮದು ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಮಾದರಿ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಪಬ್ಮ್ಡ್ ಯುನಿಪ್ರೋಟ್ (ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು) ಕೆಇಜಿಜಿ (ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಭೇದಗಳು) ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ (ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಭೇದಗಳು), ರಿಯಾಕ್ಟೋಮ್ (ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಭೇದಗಳು) ಮತ್ತು ಚಿಇಬಿಐ (ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳು) ಯಿಂದ ಐಡಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಬಹುದು. ವರ್ಚುವಲ್ ಸೆಲ್ ಅನ್ನು ಕನೆಕ್ಟಿಕಟ್ ಆರೋಗ್ಯ ಕೇಂದ್ರದ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಆರ್. ಡಿ. ಬರ್ಲಿನ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಸೆಲ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಅಂಡ್ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಈ ತಂಡಕ್ಕೆ ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ಆರೋಗ್ಯ ಸಂಸ್ಥೆಗಳ ಮೂಲಕ ಸಂಶೋಧನಾ ಅನುದಾನದ ಮೂಲಕ ಧನಸಹಾಯ ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಿಸ್ಟಮ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ವಿಸಿಎಲ್ ಮುಖಪುಟ ವಿಸಿಎಲ್ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ವಿಸಿಎಲ್ ಯೂಸರ್ ಫೋರಂ ವಿಸಿಎಲ್ ಮಾಡೆಲ್ಸ್ ಇನ್ ಪಬ್ಲಿಕೇಷನ್ಸ್ ಯುಟ್ಯೂಬ್ನಲ್ಲಿ ವಿಸಿಎಲ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವ ಬಗೆಗಿನ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್. ಗಿಟ್ಹಬ್ ಗಣಿತ ಮತ್ತು ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಮೂಲ ಸಂಕೇತ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಸಂಖ್ಯಾತ್ಮಕ ತಂತ್ರಾಂಶ ಸಂಖ್ಯಾತ್ಮಕ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಸಮೀಕರಣಗಳು ಉಚಿತ ವಿಜ್ಞಾನ ತಂತ್ರಾಂಶ