RNA22
ಆರ್. ಎನ್. ಎ. 22 ಎಂಬುದು ಮೈಕ್ರೋ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗುರಿ ತಾಣಗಳು ಮತ್ತು ಅದಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾದ ಹೆಟೆರೊಡುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರಕ್ಕಾಗಿ ಮಾದರಿ-ಆಧಾರಿತ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಆಗಿದೆ. ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಊಹಿಸುವ ಇತರ ವಿಧಾನಗಳಿಗಿಂತ ಕಲ್ಪನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆಃ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಹೆಟೆರೊಡುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಇದು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಿದ ಹೆಟೆರೊಡುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ತರಬೇತಿಗಾಗಿ ಬಳಸುವುದಿಲ್ಲ, ಬದಲಿಗೆ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ತಿಳಿದಿರುವ ಪ್ರೌಢ ಮಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ. ಆರ್ಎನ್ಎ22ನ ಪ್ರಮುಖ ಕಲ್ಪನೆಯೆಂದರೆ, ಪ್ರಬುದ್ಧ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ (ಮಾದರಿ ಆವಿಷ್ಕಾರ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು) ಗುರುತಿಸಬಹುದಾದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಮುಖ ಅನುಕ್ರಮ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳ ಹಿಮ್ಮುಖ ಪೂರಕತೆಯು ಆಸಕ್ತಿಯ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಗುರಿ ತಾಣಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆಃ ಆರ್ಎನ್ಎ22 ಅಂತಹ ಪ್ರಮುಖ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಟೀರೆಸಿಯಾಸ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಗುರಿ ತಾಣವನ್ನು ಪತ್ತೆ ಮಾಡಿದ ನಂತರ, ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುವ ಹಲವಾರು ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳ ಸಹಾಯದಿಂದ ಗುರಿಪಡಿಸುವ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದುಃ ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೆಟೆರೊಡುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು. ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನ ಹೊಸ ಆವೃತ್ತಿಯು (v2.0) ಈಗ ಲಭ್ಯವಿದೆಃ v2.0-beta ಪ್ರತಿ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗೆ ಸಂಭವನೀಯತೆಯ ಅಂದಾಜುಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುತ್ತದೆ, ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಆನ್-ದಿ-ಫ್ಲೈ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆ/ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಮೂಲಕ್ಕಿಂತ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ವೇಗವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು http://cm.jefferson.edu/rna22/Interactive ಮೂಲಕ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. 22, ಅಸಂಭವವಾದ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಶೋಧಿಸಲು ಯಾವುದೇ ಅಡ್ಡ-ಜೀವಿ ಸಂರಕ್ಷಣಾ ನಿರ್ಬಂಧಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ವಿಧಿಸುವುದಿಲ್ಲ; ಇದು ಜಾತಿಜನ್ಯವಾಗಿ ಸಮೀಪದ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸದ ಮೈಕ್ರೋಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಅಲ್ಲದೆ, ಮೇಲೆ ತಿಳಿಸಿದಂತೆ, ಆರ್. ಎನ್. ಎ. 22 ಉದ್ದೇಶಿತ ಮೈಕ್ರೋಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯ ಗುರುತನ್ನು ತಿಳಿದುಕೊಳ್ಳುವ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲದೇ ಸಂಭಾವ್ಯ ಮೈಕ್ರೋಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. 22ರ ಒಂದು ಗಮನಾರ್ಹ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ, ಇದಕ್ಕೆ ಹೆಟೆರೊಡುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ನ ಬೀಜ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯ ಬೀಜದ ನಿಖರವಾದ ಹಿಮ್ಮುಖ ಪೂರಕ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯ ಅಗತ್ಯವಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಕೊನೆಯದಾಗಿ, ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಿಗ್ನಲ್-ಟು-ಶಬ್ದ ಅನುಪಾತವನ್ನು ಸಾಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. 22ನ ಬಳಕೆಯು ಮೌಸ್ ನ್ಯಾನೋಗ್, ಆಕ್ಟೋಬರ್ 4 ಮತ್ತು ಸಾಕ್ಸ್ 2ರ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ "ಕ್ಯಾನಾನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ" ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಗುರಿಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಯಿತು. ಈ ಗುರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನವು ಅನುಗುಣವಾದ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುತ್ತಿದ್ದರೂ ಸಹ ಈ ಮೂರು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ಮಾನವ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಈ ಗುರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನವು ಹೆಟೆರೊಡುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ನ ಬೀಜ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಜಿಃ ಯು ಅಡೆತಡೆಗಳು, ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಉಬ್ಬುಗಳು ಅಥವಾ ಎರಡನ್ನೂ ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಜೊತೆಗೆ, ಆರ್ಎನ್ಎ22 3 'ಯುಟಿಆರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ಯಾನಾನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ ಗುರಿಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಿದೆ. ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನವು ಆರ್ಗೋನೌಟ್-ಮಿಆರ್ಎನ್ಎಃ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಟೆರ್ನರಿ ಕಾಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ನ ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಯ ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕ್ಯಾನಾನಿಕಲ್ ಅಲ್ಲದ ಮಿಆರ್ಎನ್ಎ ಗುರಿಗಳ ಸಮಸ್ಯೆಯನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಿದೆ. ಬೀಜ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿನ ಅನೇಕ ಜಿಃ ಯು ಅಡೆತಡೆಗಳು ಮತ್ತು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಹಲವಾರು ರೀತಿಯ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಸ್ವೀಕಾರಾರ್ಹವಾಗಿವೆ ಮತ್ತು ಮೂರು ಹಂತದ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರದ ಸಣ್ಣ ರಚನಾತ್ಮಕ ಏರಿಳಿತಗಳಿಗೆ ಮಾತ್ರ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ನ ಆವಿಷ್ಕಾರಗಳನ್ನು ಎಚ್ಐಟಿಎಸ್-ಸಿಎಲ್ಐಪಿ (ಸಿಎಲ್ಐಪಿ-ಸೆಕ್) ದತ್ತಾಂಶವು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ತೋರಿಸಿದೆ. ಈ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ಪ್ರಾಮಾಣಿಕವಾದ ಮಿಆರ್ಎನ್ಎ ಗುರಿಗಳು ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಬೀಜ-ಮಾದರಿಯನ್ನು ಮೀರಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಆರ್ಎನ್ಎ 22 ನಂತಹ ಗುರಿ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಸಾಧನಗಳು ಮಿಆರ್ಎನ್ಎ ಗುರಿಗಳ ಹೊಸದಾಗಿ ವರ್ಧಿತ ವರ್ಣಪಟಲವನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಲು ಸೂಕ್ತವಾದ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ