Prokaryotic ubiquitin-like protein
ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಪಪ್) ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ ಮೈಕೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಟ್ಯುಬರ್ಕ್ಯುಲೋಸಿಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಾದೃಶ್ಯವಾಗಿದೆ. ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ನಂತೆ, ಪಪ್-ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿನ (ಪಿಪಿಎಸ್) ಅವನತಿಗಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನುಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ಗೆ ನಿರ್ದೇಶಿಸಲು ಪಪ್ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಅವುಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟ ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲಗಳಿಂದಾಗಿ, ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿತ್ವ ಮತ್ತು ಪ್ಯೂಪೈಲೇಷನ್ಗಳ ಕಿಣ್ವಶಾಸ್ತ್ರವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿಲೇಷನ್ನ ಮೂರು-ಹಂತದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ಪ್ಯೂಪಿಲೇಷನ್ಗೆ ಕೇವಲ ಎರಡು ಹಂತಗಳು ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಪ್ಯೂಪಿಲೇಷನ್ನಲ್ಲಿ ಕೇವಲ ಎರಡು ಕಿಣ್ವಗಳು ಮಾತ್ರ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ಯೂಪೈಲೇಷನ್ನಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಕಿಣ್ವಗಳು ಗ್ಲುಟಮೈನ್ ಸಿಂಥೆಟೇಸ್ನಿಂದ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡಿವೆ. ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ನಂತೆಯೇ, ಪಪ್ ಅನ್ನು ಐಸೊಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳಿಂದ ತಲಾಧಾರದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಲೈಸಿನ್ ಅವಶೇಷಗಳಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ಇದನ್ನು ಪ್ಯುಪಿಲೇಷನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ನಂತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೈಕೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಪ್ರೋಟಿಯೋಸೋಮಲ್ ಎಟಿಪೇಸ್ (ಎಂಪಿಎ) ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಪಪ್ನ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಎ. ಟಿ. ಪಿ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನವನ್ನು ಜೋಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅವನತಿಗಾಗಿ ಸಬ್ಸ್ಟ್ರೇಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನನ್ನು ಪ್ರೋಟಿಸೋಮ್ಗೆ ಎಂ. ಪಿ. ಎ. ತಲುಪಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ಯೂಪ್ನ ಆವಿಷ್ಕಾರವು ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಂತೆ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಸಣ್ಣ-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾರ್ಪಡಕವನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಪಪ್ ಜೀನ್ ಸುಮಾರು 6.9 ಕೆಡಿಎ ಆಣ್ವಿಕ ಗಾತ್ರದ 64-ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಪಪ್ ಎಂಬುದು ಆಂತರಿಕವಾಗಿ ಅವ್ಯವಸ್ಥಿತವಾಗಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. 2010ರಲ್ಲಿ, ಬ್ರೂಕ್ಹೇವನ್ ನ್ಯಾಷನಲ್ ಲ್ಯಾಬೊರೇಟರಿಯ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಪಪ್ ಮತ್ತು ಅದರ ಡೆಲಿವರಿ ಎಂಜೈಮ್ ಎಮ್ಪಿಎ ನಡುವಿನ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಿದರು ಮತ್ತು ಎಮ್ಪಿಎಗೆ ಪಪ್ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಕೊಂಡರು. 2017ರಲ್ಲಿ, ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಗುಂಪಿನ ಹೊರಗಿನ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಪಪ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಪಪ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಯುಬಾಕ್ಟ್ (ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ಗಾಗಿ) ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು, ಆದಾಗ್ಯೂ ಈ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ವಿಕಸನೀಯ ಮೂಲದಿಂದ ಜಾತಿಜನ್ಯವಾಗಿ ಬೆಂಬಲಿತವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸಾಬೀತಾಗಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಗಳಿಲ್ಲ. ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಪಪ್ನ ಹೋಮೋಲಾಗ್ ಆಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಇದು ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಹಲವಾರು ಫೈಲಾಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ (ಪಪ್ ಪ್ರಧಾನವಾಗಿ ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಮ್ ಆಕ್ಟಿನೋಮೈಸೆಟೋಟಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ). ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ (ಯುಬಾಕ್ಟ್) ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಪಪ್) ಗೆ ಏಕರೂಪವಾಗಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಇಸ್ರೇಲ್ನ ಟೆಕ್ನಿಯಾನ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರೊಫೆಸರ್ ಆರನ್ ಸಿಯೆಚಾನೋವರ್ ಅವರ ಗುಂಪು ವಿವರಿಸಿದೆ. ಯೂಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಇರುವಿಕೆಗೆ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ('ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ') ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಬಹಳ ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ. 'ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್' ಮತ್ತು 'ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್' ಎಂಬ ಪದಗಳು ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಮತ್ತು ಯುಬಾಕ್ಟ್/ಪಪ್ ನಡುವಿನ ಆಣ್ವಿಕ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾದ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತದೆಯಾದರೂ, ಪಪ್ ಆಂತರಿಕವಾಗಿ ಅಸ್ತವ್ಯಸ್ತವಾಗಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಎಂಬ ಪದದ ಸ್ಥಾಪನೆಯು ವಿವಾದಾತ್ಮಕವಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗೆ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಮತ್ತು ಪಪ್ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಸಮರ್ಥಿಸಲು ಯಾವುದೇ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪುರಾವೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಫೈಲಮ್ ನೈಟ್ರೋಸ್ಪಿರೆಯ ಹಲವಾರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರಭೇದಗಳು (ಅಲ್ಲಿ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾಯಿತು; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಲೆಪ್ಟೋಸ್ಪಿರಿಲ್ಲಮ್ ಫೆರಿಫಿಲಮ್) ಪಪ್-ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆ ಮತ್ತು ಹೊಸ ಒಆರ್ಎಫ್-ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆ ಎರಡನ್ನೂ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಬೇಕಾಗಿತ್ತು ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಇದನ್ನು ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ನೈಟ್ರೋಸ್ಪಿರೇ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿನ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಮತ್ತು ಪಪ್ ಲೋಕಿಯ ನೆರೆಯಿರುವ ಸಂಯೋಗ-ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಘಟಕಗಳು ದುರ್ಬಲ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಬಹುಶಃ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅನಗತ್ಯವಾಗಿಲ್ಲ. ಚಿತ್ರ 2 ಪ್ರತಿನಿಧಿ ನೈಟ್ರೋಸ್ಪೈರಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಲೆಪ್ಟೋಸ್ಪಿರಿಲ್ಲಮ್ ಫೆರೋಡಿಯಾಜೋಟ್ರೋಫಮ್ನಲ್ಲಿ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಮತ್ತು ಪಪ್ ಲೋಕಿಯ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ. ಲೆಪ್ಟೋಸ್ಪಿರಿಲ್ಲಮ್ ಫೆರೋಡಿಯಾಜೋಟ್ರೋಫಮ್ನಲ್ಲಿನ ಯುಬಾಕ್ಟ್ (ಮತ್ತು ಪಪ್ ಅಲ್ಲ) ಲೋಕಸ್ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಚಿತ್ರ 3 ರಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಿದಂತೆ, ಹಲವಾರು ಗ್ರಾಮ್-ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾಗಳಾದ್ಯಂತ ಅದರ ಅಸ್ತಿತ್ವ ಮತ್ತು ತೀವ್ರ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದವು. ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ದೊಡ್ಡ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಪಪ್ಗೆ ಏಕರೂಪವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅದರೊಂದಿಗೆ ಹಲವಾರು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆಃ (i) ಎಮ್ಪಿಎ-> ಡಾಪ್-> ಪಪ್/ಯುಬಾಕ್ಟ್-> ಪಿಆರ್ಸಿಬಿಬಿ-> ಪಿಆರ್ಸಿಎ-> ಪಿಎಎಫ್ಎಗೆ ಸಮಾನವಾದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಗುಂಪಿನೊಳಗೆ ಒಂದೇ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಸ್ಥಳ, (ii) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರಭೇದಗಳಾದ್ಯಂತ ಗ್ಲುಟಮೈನ್ ಅಥವಾ ಗ್ಲುಟಮೇಟ್ನಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಕೊನೆಗೊಳ್ಳುವ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅನುಕ್ರಮ, (iii) ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರ (ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ಗೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ) ಮತ್ತು, (iv) ಪ್ರಚಂಡ ವಿಕಸನೀಯ ದೂರದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುಕ್ರಮ ಸಂರಕ್ಷಣೆ (ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ಗೆ ಸಹ ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ಗುಣಲಕ್ಷಣ). ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಮತ್ತು ಪಪ್ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳೆಂದರೆ ಅವುಗಳ ವರ್ಗೀಕರಣದ ವಿತರಣೆ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಗಳು. ಪಪ್ ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಫೈಲಮ್ ಆಕ್ಟಿನೋಮೈಸೆಟೋಟಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆಯಾದರೂ, ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಐದು ಫೈಲಾಗಳ ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆಃ ನೈಟ್ರೋಸ್ಪಿರೋಟಾ, ವೆರುಕೊಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ, ಆರ್ಮಟಿಮೊನಡೋಟಾ, ನೈಟ್ರೋಸ್ಪಿನೋಟಾ ಮತ್ತು ಪ್ಲ್ಯಾಂಕ್ಟೋಮೈಸೆಟೋಟಾ. ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಹಲವಾರು ಕ್ಯಾಂಡಿಡೇಟಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ "ಅಸಿಟೋಥರ್ಮಿಯಾ", "ಹ್ಯಾಂಡೆಲ್ಸ್ಮನ್ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ", "ಫ್ರಾಸರ್ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ", "ಟೆರ್ರಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ", "ಪೋರಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ", "ಪಾರ್ಕ್ಯುಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ" ಮತ್ತು "ಯಾನೋಫ್ಸ್ಕೈಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ" ವಿಭಾಗಗಳಿಂದ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ಪಪ್ ಮತ್ತು ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿ, ಯುಬಾಕ್ಟ್ ತನ್ನ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಲ್ಲಿ ಡಿ-ಗ್ಲೈಸಿನ್ ಮೋಟಿಫನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಬದಲಿಗೆ, ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಆರ್ [ಟಿ/ಎಸ್] ಜಿ [ಇ/ಕ್ಯೂ] ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಕೊನೆಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ 3 ನೋಡಿ). 2008ರಲ್ಲಿ ಪಪ್ ಪತ್ತೆಯಾದಾಗಿನಿಂದ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸುಮಾರು ಹತ್ತು ವರ್ಷಗಳು ಬೇಕಾಯಿತು. ಇದು ಬಹುಶಃ ಪಪ್ ಮತ್ತು ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸದಿಂದಾಗಿ ಮತ್ತು ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಕಂಡುಬರುವ ಐದು ಫೈಲಾಗಳಿಂದ ಕೆಲವೇ ಕೆಲವು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಕಂಡುಬರುವ ಫೈಲಾದಿಂದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಮಾನವರೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಮಾನವನ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಸಮುದ್ರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ, ಆಗಾಗ್ಗೆ ಎದುರಾಗುವ ಸಾರಜನಕ-ಆಕ್ಸಿಡೀಕರಣಗೊಳಿಸುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ನೈಟ್ರೋಸ್ಪಿನಾ ಗ್ರ್ಯಾಸಿಲಿಸ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ ಪಪ್-ಪ್ರೋಟಿಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಸಂಗ್ರಹವಾದ ಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಬಾಳಿಕೆ ಮತ್ತು ರೋಗವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದಲ್ಲಿ ಅದರ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯಿಂದ, ಏಕರೂಪದ ಯುಬಾಕ್ಟ್-ಪ್ರೋಟಿಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಕಂಡುಬರುವ ಗ್ರಾಂ-ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮೇಲೆ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮಾನವರ ಜೊತೆಗೆ, ನೆಲದಿಂದ ತಿನ್ನುವ ಅಥವಾ ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಈಜುವ ಜಾನುವಾರುಗಳು ಮತ್ತು ಮೀನುಗಳು ಕ್ರಮವಾಗಿ ಮಣ್ಣು ಮತ್ತು ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಯುಬಾಕ್ಟ್ಗೆ ನಿರಂತರವಾಗಿ ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ವಿಕಸನೀಯ ದೃಷ್ಟಿಕೋನದಿಂದ, ಗ್ರಾಮ್-ಋಣಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿನ ಯುಬಾಕ್ಟ್-ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಆವಿಷ್ಕಾರವು 3000 ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಗ್ರಾಮ್ ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ಕ್ಲೇಡ್ಗಳಾಗಿ ವಿಭಜನೆಯಾಗುವ ಮೊದಲು ಪಪ್/ಯುಬಾಕ್ಟ್-ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ ಅಥವಾ, ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳನ್ನು ಮೂರನೇ, ಇನ್ನೂ ತಿಳಿದಿಲ್ಲದ, ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಸಮತಲವಾದ ಜೀನ್ ವರ್ಗಾವಣೆ (ಗಳ) ಮೂಲಕ ವಿವಿಧ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವಂಶಾವಳಿಗಳಿಂದ ಸ್ವಾಧೀನಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎರಡನೇ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸಲು, ಎರಡು ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಲೋಕೈಗಳು ಸಂಸ್ಕರಿಸದ ಆಮ್ಲಜನಕರಹಿತ ಮೆಥನೊಟ್ರೊಫಿಕ್ ಆರ್ಕಿಯಾನ್ (ಎಎನ್ಎಂಇ-1; ಲೋಕಸ್ CBH38808.1 ಮತ್ತು ಲೋಕಸ್ CBH39258.1) ನ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ. ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಧ್ಯತೆಗಳಿವೆ. ನವೀಕರಿಸಿಃ ಯುಬಾಕ್ಟ್ ಗ್ರಾಮ್-ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಮ್ ಜೆಮ್ಮ್ಯಾಟಿಮೊನಡೋಟಾ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಎ0ಎ2ಇ8ಡಬ್ಲ್ಯೂಎ32, ಎ0ಎ2ಇ3ಜೆ6ಎಫ್7, ಎ0ಎ2ಇ7ಜೆಎಸ್ಇ3) ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯ ಫೈಲಮ್ "ಲ್ಯಾಟ್ಸಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ" (ಹಿಂದೆ ಡಬ್ಲ್ಯುಎಸ್3 ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಎ0ಎ3ಡಿ2ಆರ್ಎಚ್ಪಿ4, ಎ0ಎ3ಡಿ5ಎಫ್ಟಿಆರ್6, ಎ0ಎ3ಡಿ4ಎಚ075, ಮತ್ತು ಎ0ಎ3ಬಿ8ಎಂಎಂಡಬ್ಲ್ಯೂ3), ಫೈಲಮ್ "ಅಬ್ದಿಟಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಟಾ" (ಹಿಂದೆ ಕ್ಯಾಂಡಿಡೇಟ್ ಫೈಲಮ್ ಎಫ್ಬಿಪಿ; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಎ0ಎ2ಎಸ್) ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ಸುಮೋ ಪ್ರೋಟೀನ್ ನೆಡಿಲೇಷನ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳಾದ ಪ್ಯೂಪಿಡಿಬಿ, ಪ್ಯೂಪಿಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ಯೂಪಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು