Cation diffusion facilitator
ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಡಿಫ್ಯೂಷನ್ ಫೆಸಿಲಿಟೇಟರ್ಗಳು (ಸಿಡಿಎಫ್ಗಳು) ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾಗಿದ್ದು, ಅವು ಕ್ಯಾಡ್ಮಿಯಮ್, ಸತು ಮತ್ತು ಕೋಬಾಲ್ಟ್ನಂತಹ ಡೈವಾಲೆಂಟ್ ಲೋಹದ ಅಯಾನುಗಳಿಗೆ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಜೀವಕೋಶಗಳಿಂದ ಈ ದ್ವಿಗುಣ ಲೋಹದ ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವ ಎಫ್ಲಕ್ಸ್ ಪಂಪ್ಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಸಿ. ಡಿ. ಎಫ್. ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯ ಕೆಲವು ಸದಸ್ಯರು ಅಯಾನು ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದ್ದಾರೆ. ಸಿಡಿಎಫ್ ಕುಟುಂಬದ ಎಲ್ಲಾ ಸದಸ್ಯರು ನಾಲ್ಕು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಸ್ಪ್ಯಾನರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಬಲವಾದ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆರು ಸಂಭಾವ್ಯ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಸ್ಪ್ಯಾನರ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದಾರೆ. ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಡಿಫ್ಯೂಷನ್ ಫೆಸಿಲಿಟೇಟರ್ (ಸಿಡಿಎಫ್) ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆಃ 1.A.52-ಸಿಎ2 + ಬಿಡುಗಡೆ-ಸಕ್ರಿಯ ಸಿಎ2 + (ಸಿಆರ್ಎಸಿ) ಚಾನೆಲ್ (ಸಿಆರ್ಎಸಿ-ಸಿ) ಫ್ಯಾಮಿಲಿ 2. ಎ. 4-ಕಾಟಯಾನ್ ಡಿಫ್ಯೂಷನ್ ಫೆಸಿಲಿಟೇಟರ್ (ಸಿಡಿಎಫ್) ಫ್ಯಾಮಿಲಿ 2.A.19-ಸಿಎ2 +: ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಆಂಟಿಪೋರ್ಟರ್ (ಸಿಎಸಿಎ) ಫ್ಯಾಮಿಲಿ 2.A.103-ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಮ್ಯೂರಿಯನ್ ಪ್ರಿಕರ್ಸರ್ ಎಕ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ (ಎಂಪಿಇ) ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಡಿಫ್ಯೂಷನ್ ಫೆಸಿಲಿಟೇಟರ್ (ಸಿಡಿಎಫ್) ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಸಿಡಿಎಫ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿ (ಟಿಸಿ #2. ಎ. 4) ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಕುಟುಂಬವಾಗಿದ್ದು, ಅದರ ಸದಸ್ಯರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಆರ್ಕಿಯಾ ಮತ್ತು ಯೂಕ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತಾರೆ. ಅವು ಕ್ಯಾಡ್ಮಿಯಂ, ಸತು, ಕೋಬಾಲ್ಟ್, ನಿಕಲ್, ತಾಮ್ರ ಮತ್ತು ಮರ್ಕ್ಯುರಿಕ್ ಅಯಾನುಗಳಂತಹ ಭಾರೀ ಲೋಹದ ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ಸಾಗಿಸುತ್ತವೆ. 9 ಸಸ್ತನಿಗಳ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳಿವೆ, ZnT1-8 ಮತ್ತು 10. ಕುಟುಂಬದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಆರು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಎಸ್. ಸೆರೆವಿಸಿಯದ ಎಂಎಸ್ಸಿ2 ಮತ್ತು ಎಚ್. ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ನ ಝೆಡ್ಎನ್ಟಿ5 ಮತ್ತು ಎಚ್ಝೆಡ್ಟಿಎಲ್1 ಕ್ರಮವಾಗಿ 15 ಮತ್ತು 12 ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಟಿಎಂಎಸ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರಮಾಣದ ಅನುಕ್ರಮ ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಮತ್ತು ಗಾತ್ರದ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು (300-750 ಅವಶೇಷಗಳು) ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಜೀವಕೋಶದ ಸ್ಥಳೀಕರಣದಲ್ಲಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ. ಕೆಲವರು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಿಂದ ವಿವಿಧ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಅಂಗಕಗಳಾಗಿ (ZnT2-7) ಭಾರೀ ಲೋಹದ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತಾರೆ, ಆದರೆ ಇತರರು (ZnT1) ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಅಡ್ಡಲಾಗಿ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಿಂದ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಮಾಧ್ಯಮಕ್ಕೆ ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತಾರೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಕೆಲವು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಇತರವು ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಯೀಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಗೋಲ್ಗಿಗಳಂತಹ ಆರ್ಗನೆಲ್ಲಾರ್ ಮೆಂಬರೇನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಅವು ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಅನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತವೆಃ ಪ್ರೋಟಾನ್ ಆಂಟಿಪೋರ್ಟ್, ಡೈಮರ್ನೊಳಗೆ ಪ್ರತಿ ಮೊನೊಮರ್ನ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಅಗತ್ಯವಾದ ಸತು-ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಬೈನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಸತು-ಸಂವೇದನೆ ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಫ್. ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರತಿನಿಧಿ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ ವರ್ಗೀಕರಣ ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಫೈಲೋಜೆನಿ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಆಗುತ್ತವೆ ಆದರೆ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳಿಂದ ಅದೇ ಧ್ರುವೀಯತೆಯೊಂದಿಗೆ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪ್ರೋಟಾನ್ ಪ್ರೇರಕ ಬಲವನ್ನು (ಪಿ. ಎಂ. ಎಫ್.) ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಮತ್ತು ಎಚ್ + ಆಂಟಿಪೋರ್ಟ್ನಿಂದ (ಲೋಹದ ಪ್ರವಾಹಕ್ಕೆ) ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ದ್ವಿತೀಯಕ ವಾಹಕಗಳಾಗಿವೆ. ಒಂದು ಸದಸ್ಯ, ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ನ (TC #2.A.4.1.3) CzcD, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ pH ಗ್ರೇಡಿಯಂಟ್ನಿಂದ ಶಕ್ತಿಯುತವಾದ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋನ್ಯೂಟ್ರಲ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಎರಡು ಮೊನೊವೆಲೆಂಟ್ ಕ್ಯಾಟಯಾನುಗಳಿಗೆ (K + ಮತ್ತು H +) ಡೈವೆಲೆಂಟ್ ಕ್ಯಾಟಯಾನ್ ಅನ್ನು (Zn2 + ಅಥವಾ Cd2 +) ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮತ್ತೊಂದು, ಇ. ಕೋಲಿಯ ಜಿಟ್ಬಿ (ಟಿಸಿ #2.A.4.1.4) ಅನ್ನು ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಪೋಸೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪುನರ್ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಚಲನಶೀಲವಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಇದು 1:1 ಸ್ಟೋಯಿಕಿಯೋಮೆಟ್ರಿಯೊಂದಿಗೆ ಸರಳವಾದ ಮೀ2 +: ಎಚ್ + ಆಂಟಿಪೋರ್ಟ್ ಮೂಲಕ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಮೊಂಟಾನಿನಿ ಮತ್ತು ಇತರರು. (2007) ಸಿಡಿಎಫ್ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸಿದೆ. ಅವರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಮೂರು ಪ್ರಮುಖ ಮತ್ತು ಎರಡು ಸಣ್ಣ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. ಲೋಹದ ಅಯಾನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯ ಪ್ರಕಾರ ಮೂರು ಪ್ರಮುಖ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಅವರು ಸೂಚಿಸುತ್ತಾರೆಃ Mn2 + Fe2 + ಮತ್ತು Zn2 + ಜೊತೆಗೆ ಇತರ ಲೋಹದ ಅಯಾನುಗಳು Zn2 + ಜೊತೆಗೆ ಇತರ ಲೋಹಗಳು, ಆದರೆ ಕಬ್ಬಿಣವಲ್ಲ. ಇ. ಕೋಲಿಯ ವೈಐಐಪಿಯ ಎಕ್ಸ್-ರೇ ರಚನೆಯು ಹೋಮೋಡೈಮರ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ಕೌಡ್ರೆ ಮತ್ತು ಇತರರು. (2013) Zn2 + ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಲಿಪಿಡ್ ದ್ವಿಪದರದೊಳಗೆ ಶೆವನೆಲ್ಲಾ ಒನಿಡೆನ್ಸಿಸ್ನಿಂದ YiiP ಹೋಮೋಲಾಗ್ನ 13 Å ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ರಚನೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಕ್ರಯೋಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕವನ್ನು ಬಳಸಿದರು. Zn2 + ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ಷ-ಕಿರಣ ರಚನೆಯಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿ, ಅವರು ಮಾದರಿಯನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ ಫ್ಲೆಕ್ಸಿಬಲ್ ಫಿಟ್ಟಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿದರು. ರಚನೆಗಳ ಹೋಲಿಕೆಯು ಎಂ3-ಎಂ6 ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಜೋಡಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್, ನಾಲ್ಕು-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಬಂಡಲ್ (ಎಂ1, ಎಂ2, ಎಂ4, ಮತ್ತು ಎಂ5) ಅನ್ನು ತಿರುಗಿಸುವುದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕ್ಷ-ಕಿರಣ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ಸಾರಿಗೆ ತಾಣಗಳ ಲಭ್ಯತೆಯು ಅದು ಬಾಹ್ಯ-ಮುಖ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆಯಾದರೂ, ಅವುಗಳ ಮಾದರಿಯು ಆಂತರಿಕ-ಮುಖ ಸ್ಥಿತಿಯೊಂದಿಗೆ ಸ್ಥಿರವಾಗಿದೆ, ಇದು ಸಾರಿಗೆಗಾಗಿ ಪರ್ಯಾಯ ಪ್ರವೇಶ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಕ್ಕೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಡೈಮರ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳ ಮರುಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸಂಘಟಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಅವರು ಊಹಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಎಫ್ಲಕ್ಸ್ನಿಂದ ಲೋಹದ ಸಹಿಷ್ಣುತೆ/ಪ್ರತಿರೋಧದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಿಡಿಎಫ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ (ಟಿಎಮ್ಡಿ) ಮತ್ತು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ (ಸಿಟಿಡಿ) ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎರಡು-ಮಾಡ್ಯುಲರ್ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಅದು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನೊಳಗೆ ಚಾಚಿಕೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಸಿಟಿಡಿ ಹೊಂದಿರದ ಸಮುದ್ರದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೆಡ್ಎನ್2 + ಮತ್ತು ಸಿಡಿ2 + ಸಿಡಿಎಫ್ ಸಾಗಣೆದಾರ, ಮೇರಿಕೌಲಿಸ್ ಮಾರಿಸ್, ಸಿಡಿಎಫ್ಗಳ ಹೊಸ, ಸಿಟಿಡಿ-ಕೊರತೆಯ ಉಪಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಾಗಿದ್ದಾರೆ. ಸಿ. ಡಿ. ಎಫ್. ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಿಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯೀಕೃತ ಸಾರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯೆಂದರೆಃ ಮೀ2 + (ಇನ್) ಎಚ್ + (ಔಟ್) ±ಕೆ + (ಔಟ್) → ಮೀ2 + (ಔಟ್) ಎಚ್ + (ಇನ್) ±ಕೆ + (ಇನ್). ಇಂಟಿಗ್ರಲ್ ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಯಾನ್ ಚಾನೆಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ ಕ್ಲಾಸಿಫಿಕೇಷನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಜೀವಕೋಶ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಇಂಟಿಗ್ರಲ್ ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು