OSER1
ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 20 ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ 111, ಅಥವಾ C20orf111, ಮಾನವರಲ್ಲಿ C20orf111 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಕಾಲ್ಪನಿಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. C20orf111 ಅನ್ನು ಪೆರಿಟ್1 (ಪೆರಾಕ್ಸೈಡ್ ಇಂಡ್ಯುಸಿಬಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ 1), ಎಚ್ಎಸ್ಪಿಸಿ207, ಮತ್ತು dJ1183I21.1 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಮೂಲತಃ ವರ್ಣತಂತು 20ರ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿತು. ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್, ಅಥವಾ NCBI, ಇದು ವರ್ಣತಂತು 20ರ ಮೇಲೆ q13.11 ನಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಕ್ಯಾಲಿಫೋರ್ನಿಯಾ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ-ಸಾಂತಾ ಕ್ರೂಜ್ (UCSC) ವೆಬ್ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿನ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ ಇದು q13.12 ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು ಅಡೆನೊಸಿನ್ ಡೀಮಿನೇಸ್ ಲೋಕಸ್ನ ಒಂದು ಮಿಲಿಯನ್ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಪೆರಾಕ್ಸೈಡ್ ()-ಪ್ರೇರಿತ ಅಪೊಪ್ಟೋಸಿಸ್ಗೆ ಒಳಗಾಗುವ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. C20orf111 ನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅಂಶವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ ನಂತರ, ಇದು ಸೆರಿನ್ ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಜೀನ್ C20orf111 ಯು ಮಾನ್ಯವಾದ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಯುಸಿಎಸ್ಸಿ ಜೀನೋಮ್ ಬ್ರೌಸರ್ ಅನ್ನು ಹುಡುಕುವ ಮೂಲಕ q13.12 ನಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 20 ರ ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಆದರೆ NCBI ಯ ರೆಫ್ಸೆಕ್ನ ಪ್ರಕಾರ q13.11. C20orf111 ಹತ್ತಿರವಿರುವ ಕೆಲವು ತಿಳಿದಿರುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ತಿಳಿದಿರುವ ಕಾರ್ಯದೊಂದಿಗೆ ಕೆಳಗಿನ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಲ್ಲಿ ನೀಡಲಾಗಿದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಸಾಮಾನ್ಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ ಉದ್ದಃ 14,968 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳು (ಬಿಪಿ) ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಉದ್ದಃ 4 ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ 2,260 ಬಿಪಿ. ಇದು 10 ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. 252 ಬಿಪಿ ಉದ್ದದ 5 'ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶ. 3 'ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶವು 1,129 ಬಿಪಿ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಉತ್ತಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುವ 10 ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳು, ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ 8 ವಿಭಿನ್ನ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳು, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 2 ಸಂಪೂರ್ಣ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳಾಗಿವೆ. ಕೆಳಗಿನ ಚಿತ್ರವು ಊಹಿಸಲಾದ 10 ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ 10 ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳಲ್ಲಿ, 8 ವಿಭಿನ್ನ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಉದ್ದಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಈ ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕೇವಲ ಊಹಾತ್ಮಕವಾಗಿದ್ದು ಅವುಗಳ ಮೇಲೆ ಯಾವುದೇ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಮಾಡಲಾಗಿಲ್ಲ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಣ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಪ್ರವರ್ತಕ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನೋಡುವಾಗ, ಯಾವುದೇ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳಿಲ್ಲ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಟಾಟಾ-ಕಡಿಮೆ ಪ್ರವರ್ತಕರಿಗೆ ಕೋರ್ ಪ್ರವರ್ತಕ ಅಂಶಕ್ಕಾಗಿ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಇದೆ. ಪ್ರವರ್ತಕನ ಇದೇ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ, ಟಾಟಾ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಸಹ ಇದೆ, ಇದು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ಗಾಗಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ಅನ್ನು ಇರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಾಮಾನ್ಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯ 776 (DUF776) ನ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ 62 ಪ್ರತಿಶತವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಆಣ್ವಿಕ ತೂಕ 31.8 ಕಿಲೋಡಾಲ್ಟನ್ ಐಸೋಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಪಾಯಿಂಟ್ 8.57 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫಂಕ್ಷನ್ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ C20orf111 ನ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಮುದಾಯವು ಚೆನ್ನಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಂಡಿಲ್ಲ. ಇದು ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯದ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, DUF776, ಇದು ಕ್ಸೆನೋಪಸ್ ಟ್ರಾಪಿಕಲಸ್ ಮೂಲಕ ಉತ್ತಮವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ದೊಡ್ಡ ಭಾಗವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಪೆರಾಕ್ಸೈಡ್ ಪ್ರೇರಿತ ಅಪೊಪ್ಟೋಸಿಸ್ಗೆ ಒಳಗಾಗುವ ಇಲಿಗಳ ಕಾರ್ಡಿಯೋಮಯೋಸೈಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಇದು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಇಎಸ್ಟಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ನೋಡುವಾಗ, ಸಾಮಾನ್ಯ ಅಂಗಾಂಶವು (ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಅಲ್ಲದ), ಪ್ರತಿ ದಶಲಕ್ಷಕ್ಕೆ 82 ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. |H |2 |O |2 |-ಪ್ರೇರಿತ ಅಪೊಪ್ಟೋಸಿಸ್ಗೆ ಒಳಗಾಗುವ ಇಲಿ ಹೃದಯದ ಮಯೋಸೈಟ್ಗಳಲ್ಲಿ C20orf111 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ, ಇದು ಜೀವಕೋಶದ ಸಾವಿನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂತ್ರಕೋಶ, ಗರ್ಭಕಂಠ, ತಲೆ ಮತ್ತು ಕುತ್ತಿಗೆ, ನಿಯೋಪ್ಲಾಸಿಯಾ ಅಲ್ಲದ, ಪ್ಯಾಂಕ್ರಿಯಾಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ, ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಟ್ಟಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಇರುತ್ತವೆ. ಹೋಮೋಲಜಿ C20orf111 ಜೀನ್ ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಸ್ಪಷ್ಟ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದು ಇತರ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಮತ್ತು ಕ್ಸೆನೋಪಸ್ ಟ್ರಾಪಿಕಾಲಿಸ್ನಂತಹ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಮತ್ತು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೋ-ಅನಿಮಲ್ ಟ್ರೈಕೋಪ್ಲ್ಯಾಕ್ಸ್ ಅನುಯಾಯಿಗಳಲ್ಲಿ ಅರೆ-ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಷ್ಟಕವು ಕಂಡುಬರುವ ಆಯ್ದ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಕೆಳಗಿನ ಚಿತ್ರವು ಇತರ ಜೀವಿಗಳ ನಡುವೆ C20orf111 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯಾಗಿದೆ. ಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಯುಎಫ್776 ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಕ್ಸ್ಪೇಸಿ ಯಲ್ಲಿನ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಈ ಕೆಳಗಿನವುಗಳನ್ನು C20orf111 ಗಾಗಿ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. R81 ಮತ್ತು S82 ಸ್ಥಾನದ ನಡುವೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರೊಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸೀಳು ಸ್ಥಳವನ್ನು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. 30 ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಸೆರಿನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳು 5 ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಥ್ರೆಯೊನಿನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳು 3 ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಟೈರೋಸಿನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳು ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆ PELE (ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಪ್ರಿಡಿಕ್ಷನ್) ಅನ್ನು C20orf111 ನ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಬಳಸಲಾಯಿತು. β-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅಥವಾ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಸೆಕೆಂಡರಿ ರಚನೆಯ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಸ್ವಲ್ಪವೇ ಇದೆ, ಆದರೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಭಾಗವು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸುರುಳಿಗಳಾಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ. ಇದನ್ನು ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ C20orf111 ಚಿತ್ರಗಳ ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕ್ರೋಮೊಸೋಮ್ಗಳು ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ ಯೋಜನೆಗಳು