Systematic Protein Investigative Research Environment
ಸಿಸ್ಟಮೆಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇನ್ವೆಸ್ಟಿಗೇಟಿವ್ ರಿಸರ್ಚ್ ಎನ್ವಿರಾನ್ಮೆಂಟ್ (ಎಸ್. ಪಿ. ಐ. ಆರ್. ಇ.) ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮತ್ತು ಲೇಬಲ್-ಮುಕ್ತ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸಾಪೇಕ್ಷ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ವೆಬ್-ಆಧಾರಿತ ಪ್ರಯೋಗ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ (ಎಂ. ಎಸ್.) ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸ್ಪೈರ್ ವೆಬ್-ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಂವಾದಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಸರಳ ದತ್ತಾಂಶ ಸ್ವರೂಪಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ. ಮೆಥಡಾಲಜಿ ಸ್ಪೈರ್ನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ವಿನ್ಯಾಸವನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ, ಅದು ಸುಳ್ಳು ಆವಿಷ್ಕಾರ ದರಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಯ ಸುಳ್ಳು ಆವಿಷ್ಕಾರ ದರಗಳನ್ನು (ಎಫ್ಡಿಆರ್, ಎಲ್ಎಫ್ಡಿಆರ್) ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ತೆರೆದ ಮೂಲ ಹುಡುಕಾಟ ಮತ್ತು ದತ್ತಾಂಶ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. X ಅನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ! ಟಂಡೆಮ್, ಒಎಂಎಸ್ಎಸ್ಎ ಮತ್ತು ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರಾಸ್ಟ್ ಸ್ಪೈರ್ ಪ್ರಸ್ತುತ ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಏಕ ಸರ್ಚ್ ಇಂಜಿನ್ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಗಿಂತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಡಿಗಳಲ್ಲಿ (50-90%) ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ನಿಖರವಾದ ಬಹುಮುಖಿ ದೋಷ ಅಂದಾಜನ್ನು ಸಹ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸ್ಪೈರ್ ತನ್ನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕಾರ್ಯ, ಮಾರ್ಗಗಳು ಮತ್ತು ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ದತ್ತಾಂಶದೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಇತರ ಮಾಹಿತಿಯೊಂದಿಗೆ ಏಕೀಕರಣವಾದ ಸ್ಪೈರ್ ತನ್ನ ಮಲ್ಟಿ-ಓಮಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಎಕ್ಸ್ಪ್ರೆಶನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಎಂಓಪಿಇಡಿ) ಮೂಲಕ ಸಾರ್ವಜನಿಕವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾಗೆ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸುತ್ತದೆ. ಬಳಕೆದಾರರು ಒದಗಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಡಿ ಮತ್ತು ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕಾಗಿ ಸ್ಪೈರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಬಹುದು. ಬಳಕೆದಾರರು ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಅಪ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಬಹುದು (ಸೂಕ್ತವಾಗಿ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಬಹುದು) ಅಥವಾ ದತ್ತಾಂಶ ಕಡತಗಳಲ್ಲಿ ಮೇಲ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಹೆಚ್ಚಿನ ಓದುವಿಕೆ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು