FAM193A
ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕುಟುಂಬ 193 ಸದಸ್ಯರ ಎ ಎಂಬುದು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 4 ರ ಲೋಕಸ್ p16.3 ನಲ್ಲಿರುವ ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. FAM193A ಅನ್ನು C4orf8, ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 4 ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ 8, RES 4-22, ಪ್ರೋಟೀನ್ IT143, ಮತ್ತು ಕಾಲ್ಪನಿಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ LOC86032 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಎನ್ಸೆಂಬಲ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ಜೀನ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಹೋಲಿಸಿದಾಗ, 11 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಮೂರು ತಪ್ಪಾದ ಅಥವಾ ಮೊಟಕುಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಎರಡು ಸಿಡಿಎಸ್ ಅಲ್ಲದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳಿಂದ ಇಂಟ್ರಾನ್ಗಳನ್ನು ಉಳಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ. ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲಾದ ಎಲ್ಲಾ ನಕಲುಗಳು ಎಕ್ಸಾನ್ 1ಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ನಿಖರವಾಗಿ ಅದೇ ಆರಂಭಿಕ ಬಿಂದುವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ನಿರಂತರತೆಯು 5 'ಯುಟಿಆರ್ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಎಲ್ಲಾ ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ಡ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ರೂಪಾಂತರ 4 ಹೊರತುಪಡಿಸಿ. ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಳಗೆ ಮೂರು ಪ್ರದೇಶಗಳಿವೆ, ಅವು ಬಹುಶಃ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ; ಸುರುಳಿಯಾಕಾರದ ಸುರುಳಿಯೊಳಗೆ ಲ್ಯೂಸಿನ್ ಜಪ್ಪರ್. ಈ ಮೂರು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳು ಎಕ್ಸಾನ್ 5,16 ಮತ್ತು 17ರೊಳಗಿವೆ. ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ತಪ್ಪಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇತರ ಭಾಗಗಳನ್ನು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂಗಾಂಶ ವಿತರಣೆ ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ವಂಶವಾಹಿಯು ಭ್ರೂಣ, ದುಗ್ಧರಸ ಗ್ರಂಥಿ, ನರ, ಗರ್ಭಾಶಯ, ವೃಷಣ, ಲಾರೆಂಕ್ಸ್ ಅಂಗಾಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ವಲ್ಪಮಟ್ಟಿಗೆ ರಕ್ತದಲ್ಲಿ ಅದರ ಇಎಸ್ಟಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್ Hs.652364 ನಿಂದ ಸ್ಪಾಟ್ ತೀವ್ರತೆಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಹೇರಳವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಹಲವಾರು ಆರೋಗ್ಯ ಸ್ಥಿತಿಗಳ ಮೂಲಕ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಮೂತ್ರಜನಕಾಂಗದ, ಕೊಂಡ್ರೋಸಾರ್ಕೋಮಾ ಮತ್ತು ಗರ್ಭಾಶಯದ ಗೆಡ್ಡೆಗಳು, ಇದು ಮೃದು ಅಂಗಾಂಶ/ಸ್ನಾಯು ಅಂಗಾಂಶದ ಗೆಡ್ಡೆಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಪ್ರಸವಪೂರ್ವ ಎಲ್ಸಿಎಂ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ದತ್ತಾಂಶದೊಳಗೆ BRAINSPAN.org ನಿಂದ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಮೆದುಳಿನಾದ್ಯಂತ ಸರ್ವತ್ರವಾಗಿ ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದ ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂರು ಶೋಧಕಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ (ಎ _ 24 _ ಪಿ126465) ಯ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಬಹಳ ಕಡಿಮೆ ತೋರಿಸಿದೆ. ಮೈಕ್ರೋಅರೇಯಿಂದ ಸಿಗ್ನಲ್ ತೀವ್ರತೆಯ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ಮಹತ್ವದ ರಚನೆಗಳೆಂದರೆ; ಆಕ್ಸಿಪಿಟಲ್ ಲೋಬ್, ಹಿಪೊಕ್ಯಾಂಪಲ್ ರಚನೆ, ಗ್ಲೋಬಸ್ ಪ್ಯಾಲಿಡಸ್, ಪ್ಯಾರಾಹಿಪ್ಪೋಕ್ಯಾಂಪಲ್ ಗೈರಸ್, ಅಮಿಗ್ಡಾಲಾ, ಆದರೆ ಇನ್ಸುಲಾದಲ್ಲಿ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ. ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ನಿಯಂತ್ರಣವು ಪ್ರಕಟಿತ ಸಾಹಿತ್ಯದಿಂದ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಹಲವಾರು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರಾಸಾಯನಿಕ-ಜೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಮೈಕೋಟಾಕ್ಸಿನ್ ಅಫ್ಲಾಟಾಕ್ಸಿನ್ನೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ದೀರ್ಘಕಾಲದ ದಂಶಕಗಳ ಜೈವಿಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ಅನ್ವಯದ ಮೂಲಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲಾದ ಕಾರ್ಸಿನೋಜೆನಿಕ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕಾಗಿ ಪರಿಶೀಲಿಸಲಾಯಿತು. ಈ ಸಂಯುಕ್ತವು ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಶ್ರೇಣೀಕೃತ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಮೂಲಕ ಈ ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಮ್ಯಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ಗಳು, ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಆರ್ಗನೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಣಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಡೈಹೈಡ್ರೊಟೆಸ್ಟೊಸ್ಟೆರಾನ್ ಎಂಬುದು ಪುರುಷ ಲೈಂಗಿಕ ಹಾರ್ಮೋನಿನ ಆಂಡ್ರೋಜೆನ್ ಆಗಿದೆ. ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕೋಶಗಳ ನಿರ್ವಹಣೆ ಮತ್ತು ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಆಂಡ್ರೊಜೆನ್ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುತ್ತದೆ. 6, 24, ಮತ್ತು 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ಡೈಹೈಡ್ರೊಟೆಸ್ಟೊಸ್ಟೆರಾನ್ ಮತ್ತು ಬೈಕಲೂಟಮೈಡ್ನೊಂದಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನೀಡಿದ ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಕೋಶ ಲೈನ್ ಎಲ್ಎನ್ಸಿಎಪಿಯನ್ನು ಬಳಸುವ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, ಸಂಶೋಧಕರು 56 ವಿಭಿನ್ನ ನಕಲುಗಳನ್ನು ದಾಖಲಿಸಿದ್ದಾರೆ, ಇದು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು, ಜೀವಕೋಶ ಚಕ್ರ ನಿಯಂತ್ರಕರು, ಚಯಾಪಚಯ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಕಾಲ್ಪನಿಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಏಕರೂಪತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ. ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ ವಂಶವಾಹಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಡೈಹೈಡ್ರೊಟೆಸ್ಟೊಸ್ಟೆರಾನ್ನ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯ ಸಿ. ಬಿ. ಎಲ್. ಎ. ಎಸ್. ಟಿ. ಐದು ರಚನೆಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ರಚನೆಯು ಸ್ವಲ್ಪಮಟ್ಟಿಗೆ ಎಫ್. ಎ. ಎಂ. 193ಎ. ಗೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗಿರುವುದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿ ಕೇವಲ ಎರಡನ್ನು ಮಾತ್ರ ಚೈನ್ ಎ, ಸ್ಕಿಜೋಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಪೊಂಬೆಯಿಂದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಐ ಮತ್ತು ಚೈನ್ ಎ ಟ್ರೊಪೊಮಿಯೊಸಿನ್ ಅನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಯಿತು. ಮೊಳಕೆಯೊಡೆಯುವ ಯೀಸ್ಟ್ ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯಾದಿಂದ ಕಿಣ್ವದ ಹಿಂದಿನ ರಚನೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಕೆಯು ಪ್ರಾರಂಭದ ಸೈಟ್ ಆಯ್ಕೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದ ಈ ಅಂಶಗಳು ಎಸ್. ಪಾಂಬೆ ಮತ್ತು ಎಸ್. ಸೆರೆವಿಸಿಯ ನಡುವೆ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಎಸ್. ಪಾಂಬೆ ಮತ್ತು ಮಾನವರ ನಡುವೆ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ರಚನಾತ್ಮಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಗೆ ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಕಾರಣವಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಎಸ್. ಪಾಂಬೆ ಮತ್ತು ಮಾನವರ ನಡುವೆ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಎಸ್. ಪಾಂಬೆ ರಚನೆಯು ಮಾನವನ ಕಿಣ್ವಕ್ಕೆ ಉತ್ತಮ ಬಾಡಿಗೆ ತಾಯಿಯಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎಫ್ಎಎಂ193ಎಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು predictprotein.org ಮೂಲಕ ಪರಿಶೀಲಿಸಿದಾಗ, 3⁄4 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಅವಶೇಷಗಳು ಅವುಗಳ ಮೇಲ್ಮೈಯ ಶೇಕಡಾ 16 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಭಾಗವನ್ನು ಒಡ್ಡುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ಈ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ FAM193A ಸರಿಸುಮಾರು 1⁄2 ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕಲ್ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಐ. ಆರ್. ಐ. ಜಿ. ಐ. ಓ. ಎಂಬ ಹೊಸ ಜೀನ್ ಇದೆ, ಇದು ಪಿಎಎಕ್ಸ್3-ಎಫ್ಒಎಕ್ಸ್ಒ1 ಸಮ್ಮಿಳನ ಜೀನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಹಕರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮಕ್ಕಳಲ್ಲಿ ರಾಬ್ಡೋಮಿಯೊಸಾರ್ಕೋಮಜೆನೆಸಿಸ್ಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಬಹುದು. ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ ಬೇಸಿಕ್ ಲೋಕಲ್ ಅಲೈನ್ಮೆಂಟ್ ಸರ್ಚ್ ಟೂಲ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಈ ಹೊಸ ಜೀನ್ ಎಫ್ಎಎಂ193ಎಗೆ ಹೋಲೋಲೋಗಸ್ ಆಗಿದ್ದು ಒಟ್ಟಾರೆ 53 ಪ್ರತಿಶತ ಹೋಲೋಲಜಿಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಎರಡೂ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕೊನೆಯ 76 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ (89 ಪ್ರತಿಶತ ಹೋಮೋಲಜಿ) ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೋಲಿಕೆ ಇದೆ. ಕ್ವಾಂಟಿಟೇಟಿವ್ ಟ್ರೇಟ್ ಲೋಕಸ್ ಕ್ವಾಂಟಿಟೇಟಿವ್ ಟ್ರೇಟ್ ಲೋಕಸ್ಃ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್ಗಳು ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ ಪ್ರೈಮೇಟ್ಗಳು, ಚಿಂಪ್ ಮತ್ತು ಗಿಬ್ಬನ್, ಮನುಷ್ಯರಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಆರ್ಥೋಲೋಗಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಹತ್ತಿರದ ಗುಂಪನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತವೆ (ಇ ಶ್ರೇಣಿ = 0.0-0.0), ಇವುಗಳನ್ನು ಇತರರೊಂದಿಗೆ ಬಳಸಿ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು (ಎಂಎಸ್ಎ) ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮನುಷ್ಯರಿಗೆ ಅತ್ಯಂತ ಹತ್ತಿರದ ಕ್ಲೇಡ್ನ ಎಂ. ಎಸ್. ಎ ಒಂದೇ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಘಟನೆಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಬಂದಿತು. ಪಕ್ಷಿ (ಜೀಬ್ರಾದ ಫಿಂಚ್, ಕೋಳಿ, ಟರ್ಕಿ) ಮತ್ತು ಮೀನು (ಜೀಬ್ರಾದ ಮೀನು, ಪಫರ್ಫಿಶ್). ಪುನರಾವರ್ತನೆ ಘಟನೆಯ ಮೊದಲು ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಪಡೆದ ಪ್ರಾಣಿಗಳು. ಮಾನವನ ಜೀನೋಮ್ಗೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ ಬ್ಲಾಸ್ಟಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಇವುಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನ ವಿರುದ್ಧ BLASTpಗಾಗಿ ಹುಡುಕಲಾದ RNA ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳು ಯಾವುದೇ ಮಹತ್ವದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ನೀಡಲಿಲ್ಲ. ಅಂತೆಯೇ, BLASTp ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ದೂರದ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಆದರೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ, ಸಣ್ಣ ಭಾಗಗಳು ಮಾತ್ರ FAM193A ನೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳು ಒಂದು ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗೆ ಬೆಂಬಲ, ಎಫ್ಎಎಂ193ಬಿ, ಎಫ್ಎಎಂ193ಎಯ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅಂತ್ಯಕ್ಕೆ ಹೋಲೋಲಜಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಎಫ್ಎಎಂ193ಬಿ 2961 ಎನ್ಟಿಎಸ್ ಉದ್ದವಿದ್ದರೆ, ಎಫ್ಎಎಂ193ಎ 4710 ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು ಬಯಾಲಜಿ ವರ್ಕ್ಬೆಂಚ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಜೋಡಿಸಿದಾಗ-4490 ರ ಕಡಿಮೆ ಅಂಕವನ್ನು ಪಡೆಯಿತು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು