Ribosome profiling
ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್, ಅಥವಾ ರೈಬೋ-ಸೆಕ್ (ರೈಬೋಸೋಮ್ ಫುಟ್ಪ್ರಿಂಟಿಂಗ್ ಎಂದೂ ಹೆಸರಿಸಲಾಗಿದೆ), ಸುಮಾರು 50 ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಜೋನ್ ಸ್ಟಿಟ್ಜ್ ಮತ್ತು ಮರ್ಲಿನ್ ಕೋಝಾಕ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ತಂತ್ರದ ರೂಪಾಂತರವಾಗಿದ್ದು, ನಿಕೋಲಸ್ ಇಂಗೋಲಿಯಾ ಮತ್ತು ಜೊನಾಥನ್ ವೈಸ್ಮಾನ್ ಅವರು ಮುಂದಿನ ಪೀಳಿಗೆಯ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಕೆಲಸ ಮಾಡಲು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಂಡರು, ಇದು ಯಾವ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿ ಅನುವಾದಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ವಿಶೇಷ ಮೆಸೆಂಜರ್ ಆರ್ಎನ್ಎ (ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ) ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಯಾವ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿ ಅನುವಾದಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದಾದ ಸಂಬಂಧಿತ ತಂತ್ರವೆಂದರೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಲೇಟಿಂಗ್ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಅಫಿನಿಟಿ ಪ್ಯೂರಿಫಿಕೇಷನ್ (ಟಿಆರ್ಎಪಿ) ವಿಧಾನ, ಇದನ್ನು ರಾಕ್ಫೆಲ್ಲರ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದಲ್ಲಿ ನಥಾನಿಯಲ್ ಹೈಂಟ್ಜ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ (ಪಾಲ್ ಗ್ರೀನ್ಗಾರ್ಡ್ ಮತ್ತು ಮಿರಿಯಮ್ ಹೈಮನ್ ಸಹಯೋಗದೊಂದಿಗೆ). TRAP ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪಾದಮುದ್ರಣವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವುದಿಲ್ಲ ಆದರೆ ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರಕಾರ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ವಿವರಣೆ ಇದು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕ್ಷಣದಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿ ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿ ಭಾಷಾಂತರಗೊಳ್ಳುವ ಎಲ್ಲಾ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳ "ಜಾಗತಿಕ ಸ್ನ್ಯಾಪ್ಶಾಟ್" ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಟ್ರಾನ್ಸಲಟೋಮ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಇದು ಭಾಷಾಂತರದ ಆರಂಭದ ತಾಣಗಳ ಸ್ಥಳ, ಜೀವಕೋಶ ಅಥವಾ ಅಂಗಾಂಶದಲ್ಲಿ ಅನುವಾದಿಸಲಾದ ಒಆರ್ಎಫ್ಗಳ ಪೂರಕ, ಸಂದೇಶವಾಹಕ ಆರ್ಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳ ವಿತರಣೆ ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳನ್ನು ಭಾಷಾಂತರಿಸುವ ವೇಗವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಸೆಕ್ಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿ ಅನುವಾದದ ಮೂಲಕ ಡಿಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ನಿಂದ ರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಗುರಿಯಾಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿರುವ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮದ ಎಲ್ಲಾ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ತಂತ್ರವು ಪಾಲಿಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. ರೈಬೋಸೋಮ್ನೊಳಗಿನ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಅಸುರಕ್ಷಿತ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ಗಳ ಬಳಕೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಬಹುದು ಎಂಬ ಆವಿಷ್ಕಾರವನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಆಧರಿಸಿದೆ. ಈ ತಂತ್ರವು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತದೆ, ಜೊತೆಗೆ ಜಾಗತಿಕ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಬಗ್ಗೆ ಒಳನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಪ್ರತಿ ಪ್ರದೇಶದ ಅನುವಾದದ ಮಟ್ಟವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತದೆ. ಅದರ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯ ಮೊದಲು, ವಿವೊದಲ್ಲಿ ಅನುವಾದವನ್ನು ಅಳೆಯುವ ಪ್ರಯತ್ನಗಳಲ್ಲಿ ಪಾಲಿಸೋಮ್ಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾದ ಆರ್ಎನ್ಎಯ ಮೇಲೆ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಜೊತೆಗೆ ಎಪಿಟೋಪ್ ಟ್ಯಾಗ್ ಮಾಡಲಾದ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳ ಅಫಿನಿಟಿ ಶುದ್ಧೀಕರಣದ ಮೂಲಕ ಅನುವಾದದ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಸೇರಿತ್ತು. ಇವು ಉಪಯುಕ್ತ ಮತ್ತು ಪೂರಕ ವಿಧಾನಗಳಾಗಿವೆ, ಆದರೆ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಒದಗಿಸಿದ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆ ಮತ್ತು ಸ್ಥಾನಿಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ನ ಮೂರು ಮುಖ್ಯ ಉಪಯೋಗಗಳಿವೆಃ ಅನುವಾದಿತ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು, ನವಜಾತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಮಡಚಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಗಮನಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಸಂಶ್ಲೇಷಿತವಾದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಅಳೆಯುವುದು. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಔಷಧಿಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ, ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಯ ಆರಂಭಿಕ ಪ್ರದೇಶಗಳು, ಉದ್ದನೆಯ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಮತ್ತು ಅನುವಾದ ಸ್ಥಗಿತಗೊಳ್ಳುವ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು. ಯಾವುದೇ ಮುಂದುವರಿದ ಪ್ರಾರಂಭವನ್ನು ತಡೆಗಟ್ಟಲು ಹ್ಯಾರಿಂಗ್ಟೋನ್ ಅಥವಾ ಲ್ಯಾಕ್ಟಿಡೋಮೈಸಿನ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಆರಂಭಿಕ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದು. ಇದು ಜೀವಕೋಶದ ಲೈಸೇಟ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಆರಂಭಿಕ ಕೋಡಾನ್ ಅನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಅನುವಾದವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಎಯುಜಿ ಅಲ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಳಾಂತರವನ್ನು ತಡೆಯುವ ಸೈಕ್ಲೋಹೆಕ್ಸಿಮೈಡ್, ರೈಬೋಸೋಮ್ನೊಳಗೆ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ವರ್ಗಾವಣೆಯನ್ನು ತಡೆಯುವ ಕ್ಲೋರಾಮ್ಫೆನಿಕೋಲ್ ಅಥವಾ ಥರ್ಮಲ್ ಫ್ರೀಜಿಂಗ್ನಂತಹ ಔಷಧವಲ್ಲದ ವಿಧಾನಗಳಂತಹ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಇತರ ಉದ್ದವಾದ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದು. ಈ ಉದ್ದನೆಯ ಘನೀಕರಣ ವಿಧಾನಗಳು ಅನುವಾದದ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆ. ಅನುವಾದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ವೇಗಗೊಳಿಸಲು ಅನೇಕ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳು ಒಂದೇ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುವನ್ನು ಭಾಷಾಂತರಿಸಬಹುದಾದ್ದರಿಂದ, ರೈಬೋಸೆಕ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಒಳಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ಇದನ್ನು ಎಷ್ಟು ವೇಗವಾಗಿ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕೋಡಾನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ನೊಳಗೆ ವಿರಾಮ ತಾಣಗಳನ್ನು ತೋರಿಸಲು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ. ನಿಧಾನ ಅಥವಾ ವಿರಾಮಗೊಂಡ ಅನುವಾದದ ಈ ತಾಣಗಳು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಹೆಚ್ಚಳದಿಂದ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಈ ವಿರಾಮಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಜೀವಕೋಶದೊಳಗಿನ ಅವುಗಳ ಪಾತ್ರಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕಿಸಬಹುದು. ಚಿಐಪಿಯೊಂದಿಗಿನ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಕಪ್ಲಿಂಗ್ ರಿಬೊಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಹೊಸದಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಮತ್ತು ಯಾವಾಗ ಮಡಚಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ. ರೈಬೋ-ಸೆಕ್ ಒದಗಿಸಿದ ಹೆಜ್ಜೆಗುರುತುಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳಂತಹ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳನ್ನು ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಬಹುದು. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಮಯದ ಬಿಂದುಗಳಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಅನ್ನು ವಿರಾಮಗೊಳಿಸುವುದು, ಕಾಲಾನಂತರದಲ್ಲಿ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನ್ನು ಭಾಷಾಂತರಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಬಿಂದುಗಳನ್ನು ಚಾಪೆರೋನ್ಗೆ ಒಡ್ಡುವುದು ಮತ್ತು ಚಿಐಪಿ ಬಳಸಿ ಹೊರಹಾಕುವುದು ಈ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಶುದ್ಧೀಕರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನ್ನು ಯಾವ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಮಡಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುವ ರಿಬೊ-ಸೆಕ್ ಅನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಪ್ರತಿನಿಧಿಯಾದ ಅನುವಾದ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲು ಸಹ ಬಳಸಬಹುದು. ಈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ಗಾಗಿ, ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆರಂಭಿಕ ದತ್ತಾಂಶ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಮೀಸಲಾದ ಗಣನೆಯ ಚೌಕಟ್ಟುಗಳಿಂದ (ಉದಾ.) ಸಾಧಿಸಬಹುದು. ಅನುವಾದ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಅದರ ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಾಗ ಪ್ರತಿ ವಂಶವಾಹಿಯ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಆಕ್ಯುಪೆನ್ಸಿ ಎಂದು ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಬಹುದು. ಈ ವಿಧಾನವನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಿರ್ದೇಶಿತ ಅಡ್ಡಿ ಮತ್ತು ಅನುವಾದದಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಅಳೆಯಲು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಈ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಿದ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರಬಹುದು, ಅವುಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ಈಗಾಗಲೇ ಆರ್ಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ಇದು ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಜೀವಕೋಶಗಳು ಅಥವಾ ಅಂಗಾಂಶಗಳನ್ನು ವಿಭಜಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸಲಾದ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುತ್ತದೆ. ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ನಿಶ್ಚಲಗೊಳಿಸಿ. ಇದನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸೈಕ್ಲೋಹೆಕ್ಸಿಮೈಡ್ನೊಂದಿಗೆ ನಡೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಆದರೆ ಇತರ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಅನುವಾದ-ಅಸಮರ್ಥ ಲೈಸಿಸ್ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಅನುವಾದ ಪ್ರತಿರೋಧಕಗಳನ್ನು ತ್ಯಜಿಸಲು ಸಹ ಸಾಧ್ಯವಿದೆ. ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲೀಸ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ, ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳಿಂದ ರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಡದ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯನ್ನು ಜೀರ್ಣಿಸಿಕೊಳ್ಳಿ. ಸುಕ್ರೋಸ್ ಗ್ರೇಡಿಯಂಟ್ ಡೆನ್ಸಿಟಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಗೇಷನ್ ಅಥವಾ ವಿಶೇಷ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟೋಗ್ರಫಿ ಕಾಲಮ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ-ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಿ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಲು ಮಿಶ್ರಣದ ಫೀನಾಲ್/ಕ್ಲೋರೋಫಾರ್ಮ್ ಶುದ್ಧೀಕರಣ. ಹಿಂದೆ ರಕ್ಷಿಸಲಾದ ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ ತುಣುಕುಗಳಿಗಾಗಿ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿ. ತುಣುಕುಗಳಿಗೆ 3 'ಅಡಾಪ್ಟರ್ ಅನ್ನು ಲಗತ್ತಿಸಿ. ತಿಳಿದಿರುವ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳನ್ನು ಕಳೆಯಿರಿ (ಐಚ್ಛಿಕ). ರಿವರ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೇಸ್ ಬಳಸಿ ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಸಿಡಿಎನ್ಎಗೆ ರಿವರ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಮಾಡಿ. ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ವರ್ಧಿಸಿ. ಅನುಕ್ರಮವು ಓದುತ್ತದೆ. ಅನುವಾದಾತ್ಮಕ ಪ್ರೊಫೈಲ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಅನುಕ್ರಮ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಜೋಡಿಸಿ. ರೈಬೋಸೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಾಗಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫಲಿತಾಂಶದ ಡೇಟಾವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿ. ಮೆಟೀರಿಯಲ್ಸ್ ಆರ್. ಎನ್. ಎ-ರೈಬೋಸೋಮ್ ಕಾಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಸೈಕ್ಲೋಹೆಕ್ಸಿಮೈಡ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸಸ್ ಫಿನಾಲ್/ಕ್ಲೋರೋಫಾರ್ಮ್ ರಿವರ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೇಸ್ ಡಿ. ಎನ್. ಟಿ. ಪಿ. ಗಳು ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಮೆಥಡ್-ಸಿ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ ಲೈಬ್ರರಿ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಜಿ. ಡಬ್ಲ್ಯು. ಐ. ಪಿ. ಎಸ್-ಅಂದರೆ ಬ್ರೌಸರ್ ರಿಬೊಗ್ಯಾಲಾಕ್ಸಿ ಆರ್. ಪಿ. ಎಫ್-ಡಿಬಿ ಟ್ರಿಪ್ಸ್-ವಿಐಝಡ್ ಬ್ರೌಸರ್ ರಿಬೊಫ್ಲೋ, ರಿಬೊಆರ್, ರಿಬೊಪೈ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ತಂತ್ರಗಳು ರಿಬೋಜೈಮ್ಸ್ ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ತಂತ್ರಗಳು