CheShift
ಚೆಶಿಫ್ಟ್-2 (ಉಚ್ಚರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ/ಟ್ಚೆಚ್ಎಚ್ಐಎಫ್/) ಎಂಬುದು 13ಸಿಎ ಮತ್ತು 13ಸಿಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲು ರಚಿಸಲಾದ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು 20 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ತಿರುಚು ಕೋನಗಳ (φ, si, ω ಮತ್ತು χ1, χ2) ಕಾರ್ಯವಾಗಿ 13Cα ಮತ್ತು 13Cβಕೆಮಿಕಲ್ ಶಿಫ್ಟ್ನ ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಮೆಕ್ಯಾನಿಕ್ಸ್ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಚೆಶಿಫ್ಟ್-2 ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ ಕಡತದಿಂದ ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ರಾಸಾಯನಿಕ ಶಿಫ್ಟ್ ಮೌಲ್ಯಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಹಿಂತಿರುಗಿಸಬಹುದು. ಇದು ಅಪ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪಿಡಿಬಿ ಕಡತ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಶಿಫ್ಟ್ ಮೌಲ್ಯಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ 3ಡಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸಹ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಬಹುದು. 3ಡಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾದರಿಯು ಐದು ಬಣ್ಣದ ಸಂಕೇತವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಬಣ್ಣವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕ ಮತ್ತು ಗಮನಿಸಿದ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಮೌಲ್ಯಗಳ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಗಮನಿಸಿದ ಮತ್ತು ಊಹಿಸಲಾದ 13Cα ಮತ್ತು 13Cβ ರಾಸಾಯನಿಕ ವರ್ಗಾವಣೆಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವನೀಯ ಸ್ಥಳೀಯ ನ್ಯೂನತೆಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಶೋಧಕವಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. 13Cα ಮತ್ತು 13Cβ ಎರಡೂ ಗಮನಿಸಿದ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಿದರೆ, ಚೆಶಿಫ್ಟ್-2 ಪರ್ಯಾಯ χ1 ಮತ್ತು χ2 ಸೈಡ್-ಚೈನ್ ತಿರುಚು ಕೋನಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತದೆ, ಅದು ಗಮನಿಸಿದ ಮತ್ತು ಗಣನೆಯ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಈ ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳಲ್ಲಿನ ನ್ಯೂನತೆಗಳನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಚೆಶಿಫ್ಟ್-2 ಅನ್ನು ಆನ್ಲೈನ್ನಲ್ಲಿ http://www.cheshift.com ನಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಪೈಮೊಎಲ್ ಪ್ಲಗ್ಇನ್ ಮೂಲಕ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು. ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ವ್ಯಾಲಿಡೇಷನ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಬಯಾಲಜಿ ರಿಲೇಟೆಡ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ರೊಚೆಕ್ ಪಿ. ಎಸ್. ವಿ. ಎಸ್ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಚೆಶಿಫ್ಟ್ ಪೈಮೊಎಲ್ ಪ್ಲಗ್ಇನ್ ಗಿಟ್ಹಬ್ ರೆಪೊಸಿಟರಿ ರೆಫರೆನ್ಸಸ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್