Formate-nitrite transporter
ಫಾರ್ಮೇಟ್-ನೈಟ್ರೈಟ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ (ಎಫ್ಎನ್ಟಿ) ಕುಟುಂಬವು ಮೇಜರ್ ಇಂಟ್ರಿನ್ಸಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಎಂಐಪಿ) ಸೂಪರ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ. ಎಫ್ಎನ್ಟಿ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರನ್ನು ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಮತ್ತು ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಆರ್ಕಿಯಾ, ಯೀಸ್ಟ್, ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಲೋವರ್ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಿಂದ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಫ್ಎನ್ಟಿ ಕುಟುಂಬದ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಬಹುಶಃ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಸಂಯುಕ್ತಗಳಾದ ಫಾರ್ಮೇಟ್ ಮತ್ತು ನೈಟ್ರೈಟ್ಗಳ ಸಾಗಣೆಯಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಯೀಸ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ (627 ಅಮೈನೊ ಅಸೈಲ್ ಅವಶೇಷಗಳು) ಹೊರತುಪಡಿಸಿ, ಕುಟುಂಬದ ಎಲ್ಲಾ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸದಸ್ಯರು ಉದ್ದದಲ್ಲಿ 256-285 ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾರೆ ಮತ್ತು 6-8 ಪುಟೇಟಿವ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ α-ಹೆಲಿಕಲ್ ಸ್ಪ್ಯಾನರ್ಗಳನ್ನು (TMSs) ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತಾರೆ. ಒಂದು ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಇ. ಕೋಲಿ ಫೋಕಾ (ಟಿಸಿ #1.A.16.1.1) ಪ್ರೋಟೀನಿನ 6 ಟಿಎಂಎಸ್ ಟೋಪೋಲಜಿಯನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಯೀಸ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಸ್ಪಷ್ಟ ಟೋಪೋಲಜಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಆದರೆ ಸುಮಾರು 400 ಅವಶೇಷಗಳ ದೊಡ್ಡ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ವಿಸ್ತರಣೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯ ಎಫ್ಒಸಿಎ ಒಂದು ಸಮ್ಮಿತೀಯ ಪೆಂಟಾಮರ್ ಆಗಿದ್ದು, ಪ್ರತಿ ಉಪಘಟಕವು ಆರು ಟಿಎಂಎಸ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಫೈಲೋಜೆನಿ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವು ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಆರ್ಗ್ಯಾನಿಸ್ಮಲ್ ಫೈಲೋಜೆನಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಪೈರುವೇಟ್-ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಲೈಸ್ (ಪಿಎಫ್ಎಲ್) ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪುಟೇಟಿವ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಎಫ್ಲಕ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ಗಳು (ಎಫ್ಒಸಿಎ; TC#s 1.A.16.1.1 ಮತ್ತು 1.A.16.1.3) ಕ್ಲಸ್ಟರ್ I ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ; ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಡಿಹೈಡ್ರೋಜಿನೇಸ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದ ಪುಟೇಟಿವ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಅಪ್ಟೇಕ್ ಪ್ರವೇಶಗಳು (ಎಫ್ಡಿಎಚ್ಸಿ; TC#s 1.A.16.2.1 ಮತ್ತು 1.A.16.2.3) ಕ್ಲಸ್ಟರ್ II ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ; ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ನೈಟ್ರೈಟ್ ಅಪ್ಟೇಕ್ ಪ್ರವೇಶಗಳು (ಎನ್ಆರ್ಸಿ, TC#s 1.A.16.2.5,1.A.16.3.1, ಮತ್ತು 1.A.16.3.4) ಕ್ಲಸ್ಟರ್ III ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಯೀಸ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ IV ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಎಫ್. ಎನ್. ಟಿ. ಕುಟುಂಬದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಶಕ್ತಿ ಜೋಡಣೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಎಚ್ಸಿಒ ಮತ್ತು ಎನ್ಒ ಅಪ್ ಟೇಕ್ಗಳನ್ನು ಎಚ್ + ಸಿಂಪೋರ್ಟ್ಗೆ ಜೋಡಿಸಬಹುದು. ಎಚ್ಸಿಒ ಎಫ್ಲಕ್ಸ್ಅನ್ನು ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೊಟೆನ್ಶಿಯಲ್ನಿಂದ ಯುನಿಪೋರ್ಟ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದಿಂದ ಅಥವಾ ಎಚ್ + ಆಂಟಿಪೋರ್ಟ್ನಿಂದ ಪ್ರೇರೇಪಿಸಬಹುದು. ಇ. ಕೋಲಿಯ ಎಫ್. ಒ. ಸಿ. ಎ. ಯು ದ್ವಿ-ದಿಕ್ಕಿನ ಫಾರ್ಮೇಟ್ ಸಾರಿಗೆಯನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಚಾನೆಲ್-ರೀತಿಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದಿಂದ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು. ಎಫ್ಓಸಿಎ, ಶಾರ್ಟ್-ಚೈನ್ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಸಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಎಫ್ಒಸಿಎ ತನ್ನ ಕಾರ್ಯಾಚರಣೆಯ ವಿಧಾನವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿನ ಬಾಹ್ಯ ಪಿಹೆಚ್ನಲ್ಲಿ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ರಫ್ತು ಚಾನೆಲ್ನಿಂದ ಕಡಿಮೆ ಪಿಹೆಚ್ನಲ್ಲಿ ದ್ವಿತೀಯ ಸಕ್ರಿಯ ಫಾರ್ಮೇಟ್/ಎಚ್ + ಆಮದುದಾರರಿಗೆ ಬದಲಾಯಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. pH 4ರಲ್ಲಿ ಸಾಲ್ಮೊನೆಲ್ಲಾ ಟೈಫಿಮುರಿಯಂ FocAಯ ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಯು ಈ ಬದಲಾವಣೆಯು ಪೆಂಟಾಮೆರಿಕ್ ಚಾನೆಲ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪ್ರೊಟೋಮರ್ಗಳ ಅಮೈನೊ ಟರ್ಮಿನಿಯ ಪ್ರಮುಖ ಮರುಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಅಮೈನೋ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಸಂಘಟಿತ, ಸಹಕಾರಿ ಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಸಾರಿಗೆಯನ್ನು ತೆರೆಯುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ನಿರ್ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಎಫ್. ಒ. ಸಿ. ಎ ಅನ್ನು ಪಿ. ಎಚ್-ಅವಲಂಬಿತ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಹೇಗೆ ಗೇಟೆಡ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫಿಸಿಯೋಲಾಜಿಕಲ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ pH 7 ನಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರಚನೆಯ ಚಾನೆಲ್ ಆಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು pH ಅನ್ನು 5.1 ಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಿದಾಗ ಅದು ಮುಚ್ಚುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಎಫ್. ಎನ್. ಟಿ. ಕುಟುಂಬದ ವಿವಿಧ ಸದಸ್ಯರು ವೇಗವರ್ಧಿಸುವ ಸಂಭಾವ್ಯ ಸಾರಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳೆಂದರೆಃ (1) ಆರ್. ಸಿ. ಓ. ಅಥವಾ ಎನ್. ಓ. (ಔಟ್) ಆರ್. ಸಿ. ಓ. ಅಥವಾ ಎನ್. ಓ. (ಇನ್), (2) ಎಚ್. ಸಿ. ಓ. (ಇನ್) ಎಚ್. ಸಿ. ಓ. (ಔಟ್), (3) ಎಚ್. ಎಸ್.-(ಔಟ್) ಎಚ್. ಎಸ್.-(ಇನ್). ಎಫ್. ಎನ್. ಟಿ. ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದ ಪ್ರಸ್ತುತ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾದ ಸದಸ್ಯರ ಪ್ರತಿನಿಧಿ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ ವರ್ಗೀಕರಣ ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಕೆಲವು ವಿಶಿಷ್ಟ ಸದಸ್ಯರಲ್ಲಿ ಇವು ಸೇರಿವೆಃ ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿಯಿಂದ ಫೋಕಾ ಮತ್ತು ಫೋಕ್ಬಿ (ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ TC#s 1.A.16.1.1 ಮತ್ತು 1.A.16.1.2), ಫಾರ್ಮೇಟ್ನ ದ್ವಿಮುಖ ಸಾಗಣೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಸಾಗಣೆದಾರರು. ಎಫ್. ಡಿ. ಎಚ್. ಸಿ, ಮೆಥನೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಮಾರಿಪಾಲುಡಿಸ್ನಿಂದ (ಟಿಸಿ #1.A.16.2.3) ಮತ್ತು ಮೆಥನೋಥರ್ಮೊಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಥರ್ಮೋಫಾರ್ಮಿಕಮ್ನಿಂದ (ಟಿಸಿ #1.A.16.2.1), ಸಂಭಾವ್ಯ ಫಾರ್ಮೇಟ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್. ಎನ್ಆರ್ಸಿ, ಇ. ಕೋಲಿಯಿಂದ (ಟಿಸಿ #1.A.16.3.1), ಸಂಭಾವ್ಯ ನೈಟ್ರೈಟ್ ಸಾಗಣೆದಾರ. ಕ್ಲಮೈಡೋಮೋನಾಸ್ ರೀನ್ಹಾರ್ಡ್ಟಿ (ಕ್ಲೈಮೈಡೋಮೋನಾಸ್ ಸ್ಮಿತ್ಹಿ) ಯ ನಾರ್1 (ಟಿಸಿ #1.A.16.2.4), 355 ಅಮೈನೊ ಅಸೈಲ್ ಅವಶೇಷಗಳ ನೈಟ್ರೈಟ್ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಪೋರ್ಟರ್ ಆಗಿದೆ. ಬಿ. ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ ಹೈಪೋಥೆಟಿಕಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವೈಡಬ್ಲ್ಯೂಸಿಜೆ (ಐಪಾ-48ಆರ್) (ಟಿಸಿ #1.A.16.3.2). ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಇಂಟಿಗ್ರಲ್ ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು