FAM83A
ಟ್ಯೂಮರ್ ಆಂಟಿಜೆನ್ ಬಿಜೆ-ಟಿಎಸ್ಎ-9 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ (ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆ 83 ಹೊಂದಿರುವ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯ) ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯ 1669 (DUF1669) ನ ಒಂದು ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು PLDC _ ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯಲ್ಲಿ ಇರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಶ್ವಾಸಕೋಶ, ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಮತ್ತು ಗಾಳಿಗುಳ್ಳೆಯ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭಾವ್ಯ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಜೀನ್ FAM83A ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 8, ಲೋಕಸ್ q24.13 ನಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು 27,566 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ. ಜೆನೋಮಾಟಿಕ್ಸ್ನ ಎಲ್ಡೋರಾಡೊ ಉಪಕರಣವು ಊಹಿಸಿದಂತೆ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು 4,000 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳಿವೆ. ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ವಂಶವಾಹಿ ಸೇರಿದಂತೆ ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಈ ಭಾಗದಲ್ಲಿನ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಲ್ಯಾಂಗರ್-ಗೈಡಿಯನ್ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ 10 ವಿಭಿನ್ನ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ರೂಪಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರೂಪಾಂತರ 1 ಈ ಲೇಖನದ ವಿಷಯವಾಗಿದೆ. ಈ ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಸುಮಾರು 2,900 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಇದು ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯ 1669 (DUF1669) ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು PLDC _ SF ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯ ಸದಸ್ಯವಾಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಮತ್ತು ಇತರ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಫಾಸ್ಫೋಲಿಪೇಸ್ ಡಿ-ರೀತಿಯ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಹೆಚ್ಚು ಹೋಲುವ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಈ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಯಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಅನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಇದೇ ರೀತಿಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ನಾಲ್ಕು ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳು ಈ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಯ ಅನುವಾದಿಸದ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಸಂಭಾವ್ಯ ಆರ್ಎನ್ಎ ಕಾಂಡದ ಲೂಪ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಜೀನ್ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಎ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉದ್ದದಲ್ಲಿ 434 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಸುಮಾರು 45 ಕಿಲೋ ಡಾಲ್ಟನ್ ತೂಗುತ್ತದೆ. ರಚನೆಯನ್ನು ದೃಢೀಕರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲವಾದರೂ, GOR4 ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ನಾಲ್ಕು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಐದು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, 8.964 ನ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಬಿಂದುವಿನೊಂದಿಗೆ ಯಾವುದೇ ಸಿಗ್ನಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಇಲ್ಲ ಮತ್ತು ಇದು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಲ್ಲ. CBLAST ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಇದು 3H0G ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವುದನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ, FAM83A ಯ ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದು ಈ ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಸಂಭವನೀಯ ಭಾಗಶಃ ರಚನೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಇನ್ನೂ ಮೌಲ್ಯಯುತವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸಬಹುದು. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ FAM83A ಅನ್ನು ಮಾನವ ದೇಹದ ವಿವಿಧ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ವಿಭಿನ್ನ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಜೀನ್ ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ವಯಸ್ಕರಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಇಎಸ್ಟಿ ದತ್ತಾಂಶವು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್, ಶ್ವಾಸಕೋಶ ಮತ್ತು ಅನ್ನನಾಳದಲ್ಲಿ ಇತರ ಎತ್ತರದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಾಯಿ ಮತ್ತು ಧ್ವನಿಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹ ಮಟ್ಟವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಾಮಾನ್ಯ ಮಟ್ಟಗಳು ತಲೆ ಮತ್ತು ಕುತ್ತಿಗೆಯ ಗೆಡ್ಡೆಗಳು, ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಗೆಡ್ಡೆಗಳು, ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳು ಮತ್ತು ಗಾಳಿಗುಳ್ಳೆಯ ಕಾರ್ಸಿನೋಮಗಳಲ್ಲಿ ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ದತ್ತಾಂಶವು ವಿಭಿನ್ನ ಪರಿಸರ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಕಿರಿಕಿರಿಯುಂಟುಮಾಡುವ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಸಹ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ಕಿರಿಕಿರಿಗಳು ಸಿಗರೆಟ್ ಹೊಗೆಯಾಗಿರಬಹುದು, ಅಲ್ಲಿ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ 24 ಗಂಟೆಗಳ ಒಡ್ಡಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯ ನಂತರ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಶ್ವಾಸನಾಳದ ಎಪಿಥೀಲಿಯಲ್ ಕೋಶಗಳ ಮೇಲೆ ಮನೆಯ ಧೂಳಿನ ಹುಳವನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಒಡ್ಡಿಕೊಂಡ ನಂತರ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ 2 (ಎಟಿಎಫ್ 2) ಅನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಿದಾಗ ಕಡಿಮೆಯಾದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಎಟಿಎಫ್2 ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿಲ್ಲವಾದ್ದರಿಂದ, ಇದು ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಮತ್ತು ಎಟಿಎಫ್2 ನಡುವೆ ಪರೋಕ್ಷ ಸಂಬಂಧವಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಉದ್ರೇಕಕಾರಿಗಳು ಮತ್ತು ಅಲರ್ಜಿನ್ಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ ಎಟಿಎಫ್ 2 ನೊಂದಿಗೆ ಪರೋಕ್ಷ ಸಂಬಂಧದೊಂದಿಗೆ, ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಸಂಕೇತ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿರಬಹುದು ಎಂದು ಇದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಶ್ವಾಸಕೋಶ, ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಮತ್ತು ಗಾಳಿಗುಳ್ಳೆಯ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳಿಗೆ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಅತಿಯಾದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸುವ ಅನೇಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿವೆ. ಈ ಜೀನ್ ಈ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳನ್ನು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಅನ್ನು ಆರಂಭಿಕ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಉತ್ತಮ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಸಂಶೋಧಕರು ನಂಬಿದ್ದಾರೆ. ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ ಅನ್ನು ಏಕೆ ಅಥವಾ ಹೇಗೆ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು ತಿಳಿದಿಲ್ಲ. ಆರ್ಸೆನಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವ ಪ್ರವರ್ತಕವನ್ನು ಅಸಿಟೈಲೇಟ್ ಮಾಡಬಹುದು ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ, ಇದು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನಲ್ಲಿ ಈ ಜೀನ್ ಹೇಗೆ ಅನಿಯಂತ್ರಿತವಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಹೋಲುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ ಎಫ್ಎಎಂ83ಎ, ಸ್ಟ್ರಿಂಗ್ ಉಪಕರಣದ ಮೂಲಕ ಅಂಗುಳಿನ, ಶ್ವಾಸಕೋಶ ಮತ್ತು ಮೂಗಿನ ಎಪಿಥೀಲಿಯಂ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ನೊಂದಿಗೆ (ಪ್ಲುಂಕ್) ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ಈ ಮಾಹಿತಿಯು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನೊಂದಿಗೆ ವ್ಯವಹರಿಸುವ ಪಠ್ಯ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯ ಮಾಹಿತಿಯಿಂದ ಬಂದಿದೆ. ಹೋಮೋಲಜಿ FAM83A ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೊಸ ಜೀನ್ ಎಂದು ತೋರುತ್ತದೆ, BLAST ಮತ್ತು BLAT ಮೂಳೆ ಮೀನುಗಳ ಮೂಲಕ ಮಾತ್ರ ಆರ್ಥೋಲಜಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಡಿಯುಎಫ್1669 ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅತ್ಯಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಪ್ರದೇಶವಾಗಿದ್ದು, ಅದರ ಹೊರಗಿನ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಇದು ಸಮಗ್ರವಾದ ಪಟ್ಟಿಯಲ್ಲ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುವ ಅಕ್ಷರವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಕೋಷ್ಟಕವನ್ನು ಕೆಳಗೆ ನೀಡಲಾಗಿದೆಃ