HYPHY (software)
ಹೈಫೈ (HYPHY) ಒಂದು ಉಚಿತ ಮಲ್ಟಿಪ್ಲ್ಯಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ (ಮ್ಯಾಕ್, ವಿಂಡೋಸ್ ಮತ್ತು ಯುನಿಕ್ಸ್) ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶದ ಗರಿಷ್ಠ ಸಂಭವನೀಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಮಾಡಲು ಉದ್ದೇಶಿಸಿದೆ ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಊಹೆಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಹೈಫೈ ಹೆಸರು "ಹೈಪೋಥೆಸಿಸ್ ಟೆಸ್ಟಿಂಗ್ ಯೂಸಿಂಗ್ ಪಿ. ಎಚ್. ವೈಲೋಜೆನೀಸ್" ಎಂಬ ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತ ರೂಪವಾಗಿದೆ. ಮಾರ್ಚ್ 2018 ರ ಹೊತ್ತಿಗೆ, ಸುಮಾರು 2,000 ಪೀರ್-ರಿವ್ಯೂಡ್ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಜರ್ನಲ್ ಲೇಖನಗಳು ಹೈಫಿಯನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖಿಸುತ್ತವೆ. ಪೂರ್ವನಿರ್ಧರಿತ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮಾದರಿಗಳು ಅಥವಾ ವಿಕಾಸದ ಬಳಕೆದಾರ-ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿತ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಕೋಡಾನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಹೈಫ್ವೈ ಪ್ರಮುಖ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ದೊಡ್ಡ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಮತ್ತು ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗೊಳಿಸಲು ಚಿತ್ರಾತ್ಮಕ ಬಳಕೆದಾರ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಚ್ ಭಾಷೆಯ ಮೂಲಕ ಸಂವಹನವನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ನೀಲ್ಸನ್-ಯಾಂಗ್ ಪಿಎಎಂಎಲ್ ಮತ್ತು ಸುಜುಕಿ-ಗೊಜೊಬೋರಿ ವಿಧಾನಗಳ ಸಾಮಾನ್ಯೀಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಅನೇಕ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅಮೈನೋ-ಆಮ್ಲ ತಾಣಗಳು ಮತ್ತು/ಅಥವಾ ವಂಶಾವಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ವಿಕಾಸವನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಹೈಫೈ ಬಹುಮುಖ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಹೈಫೈ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯು 1997 ರಲ್ಲಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾಯಿತು, 2000 ರಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಬಿಡುಗಡೆಯೊಂದಿಗೆ ಮತ್ತು ಡಿಸೆಂಬರ್ 2020 ರಂತೆ ಇತ್ತೀಚಿನ ಆವೃತ್ತಿಯು 2.5 ಆಗಿತ್ತು. ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್/ಕೋಡ್ ಲಭ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಪರವಾನಗಿ ಹೈಫೈ ಅನ್ನು ಎಂಐಟಿ ಪರವಾನಗಿ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾದ ಸೋರ್ಸ್ ಕೋಡ್ನೊಂದಿಗೆ ಫ್ರೀವೇರ್ ಆಗಿ ವಿತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮ್ಯಾಕ್ ಓಎಸ್ ಎಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ವಿಂಡೋಸ್ಗಾಗಿ ಸಂಕಲಿಸಲಾದ ಬೈನರಿಗಳು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಸೋರ್ಸ್ ಕೋಡ್ ಲಭ್ಯವಿದ್ದು, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಬಳಕೆದಾರರು ಪೊಸಿಕ್ಸ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಹೈಫೈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಅನ್ನು ಕಂಪೈಲ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಅಡಾಪ್ಟಿವ್ ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ಅನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಹೈಫೈ ವಿಧಾನಗಳ ಉಪವಿಭಾಗವನ್ನು ಟೆಂಪಲ್ ಯೂನಿವರ್ಸಿಟಿಯ ಹೈಫೈ ತಂಡವು ಡಾಟಾಮಂಕಿ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಾಗುವಂತೆ ಮಾಡಿದೆ. ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳುಃ ಹೈಫೈ ಮುಖಪುಟಃ ಡಾಟಾಮೋಂಕಿ ಸರ್ವರ್, ಇದು ವಿವಿಧ ಹೈಫೈ ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ (ಯಾವುದೇ ವೆಚ್ಚವಿಲ್ಲದೆ). : ಹೈಪಿ/ಡಾಟಾಮಂಕಿ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ತಂತ್ರಾಂಶವನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ