Influenza A segment 7 splice site
ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಎ ವೈರಸ್ ಸೆಗ್ಮೆಂಟ್ 7 ಪ್ರಿ-ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎಯ 3 'ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಸೈಟ್ ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ರೀತಿಯ ಆರ್ಎನ್ಎ ರಚನೆಯನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದುಃ ಸೂಡೋಕ್ನಾಟ್ ಮತ್ತು ಹೇರ್ಪಿನ್. ಈ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಯು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಪರ್ಯಾಯ ವಿಭಜನೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಪೂರ್ವ-ಎಂ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವಿಭಜನೆಯಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಎಂ1 ಮತ್ತು ಎಂ2 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉತ್ಪಾದನೆಯ ಮೇಲೆ ಪ್ರಭಾವ ಬೀರಬಹುದು. ಅವಲೋಕನ ಈ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಥರ್ಮೋಡೈನಾಮಿಕ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಫ್ರೀ ಎನರ್ಜಿ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಸಿಡ್ ಕೋಡಾನ್ ನಿಗ್ರಹದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಎ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯ ಸಮೀಕ್ಷೆಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯ ಆರಂಭಿಕ ಮಾದರಿಗಳು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ರಚನೆಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ. ಹೇರ್ಪಿನ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಕ್ಯಾಲಿಫೋಲ್ಡ್ ಬಳಸಿ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಸೂಡೋಕ್ನಾಟ್ ಅನ್ನು ಡಾಟ್ನಾಟ್ ಮೂಲಕ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ವಿಭಾಗ 7 ಎಂ1 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಎಂ2 ಪ್ರೋಟಾನ್ ಚಾನೆಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ನಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತದೆ. ಎಂ2 ಪ್ರೋಟೀನ್ ವೈರಸ್ಗೆ ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆಃ ಇದು ಅಯಾನು ವಾಹಿನಿಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಅನ್-ಕೋಟಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಚೋದಿಸುವ ವೈರಿಯನ್ನ ಆಮ್ಲೀಕರಣಕ್ಕೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಎಂ2 ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಬಳಸುವ 3 'ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಸೈಟ್ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ರಚನೆ-ಸೂಕ್ಷ್ಮ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳು ಮತ್ತು ಕಿಣ್ವಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಹೇರ್ಪಿನ್ ಮತ್ತು ಸೂಡೋಕ್ನಾಟ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಸಂರಚನೆಯು ಪ್ರಮುಖ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ನಿಯಂತ್ರಕ ತಾಣಗಳನ್ನು ವಿವಿಧ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಇರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು 7ನೇ ವಿಭಾಗದ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ನ ಸಮನ್ವಯಕ್ಕೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಸೈಟ್, ಪಾಲಿಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಟ್, ಬ್ರಾಂಚ್ ಪಾಯಿಂಟ್, ಮತ್ತು ಎಎಸ್ಎಫ್/ಎಸ್ಎಫ್ 2 ಎಕ್ಸಾನಿಕ್ ವರ್ಧಕ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳು ಹೇರ್ಪಿನ್ ಸಂರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸುಲಭವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸೂಡೋಕ್ನಾಟ್ನಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು ಎಂದು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ (ಚಿತ್ರ 1). ಸೂಡೋಕ್ನಾಟ್ ಮತ್ತು ಹೇರ್ಪಿನ್ ನಡುವಿನ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಎಂ2 ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿದೆ. ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಹಂಚಿಕೊಂಡ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನ ಈ ಸಂಭಾವ್ಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ಡ್ ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳಿಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿದೆ. ಇದೇ ರೀತಿ ಇರಿಸಲಾಗಿರುವ, ಆದರೆ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನವಾದ, ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ವೈರಸ್ ಸೂಡೋಕ್ನಾಟ್/ಹೇರ್ಪಿನ್ ಅನ್ನು ವಿಭಾಗ 8 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳ 3 'ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಎನ್ಪಿಯನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಮೂಲಕ ಎನ್ಇಪಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ರಚನೆಗಳು ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಎ ಮತ್ತು ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಬಿ ಹೋಸ್ಟ್ ಪ್ರಭೇದಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸ್ಥಿರತೆಯ ನಡುವೆ ಹಂಚಿಕೊಂಡ ರಚನಾತ್ಮಕ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಕುಟುಂಬವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಎ ವಿಭಾಗ 7ರ 3 'ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ಸೈಟ್ ರಚನೆಗಳು ರಚನಾತ್ಮಕ ಸ್ಥಿರತೆಯಲ್ಲಿ ಹೋಸ್ಟ್-ಪ್ರಭೇದಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರವೃತ್ತಿಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಪಕ್ಷಿಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ತಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಅತ್ಯಂತ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಅಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮಾನವ ತಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆಃ ಹಂದಿಗಳು ನಡುವೆ ಬಿದ್ದವು. ಸ್ಥಿರತೆಯ ಈ ಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರವೃತ್ತಿಃ ಪಕ್ಷಿಗಳು, ಹಂದಿಗಳು, ಮಾನವ, ಸರಿಸುಮಾರು ಪ್ರತಿ ಆತಿಥೇಯ ಪ್ರಭೇದದೊಳಗೆ ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ವೈರಸ್ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ತಾಪಮಾನವನ್ನು ಅನುಸರಿಸುತ್ತದೆ. ಪಕ್ಷಿಗಳ ಕರುಳು ಮತ್ತು ಹಂದಿ ಮತ್ತು ಮಾನವನ ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ತಾಪಮಾನವು ಕ್ರಮವಾಗಿ 42,37 ಮತ್ತು 34 ಡಿಗ್ರಿ ಸೆಲ್ಸಿಯಸ್ ಆಗಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಅವಲೋಕನವು ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ ಎ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿನ ಜಾಗತಿಕ ಪ್ರವೃತ್ತಿಯ ಸ್ಥಳೀಯ ಉದಾಹರಣೆಯಾಗಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಪಕ್ಷಿಗಳು, ಹಂದಿಗಳು ಮತ್ತು ಮಾನವ ತಳಿಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ರಚನೆಗಳು ಅಥವಾ ಪ್ರಮುಖ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ತಾಪಮಾನವು ಹೆಚ್ಚಿರುವ ಆತಿಥೇಯಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ರಚನೆಯು ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರಬಹುದು. ಸ್ಯೂಡೋಕ್ನಾಟ್ ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಸ್ಯೂಡೋಬೇಸ್ + +-ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಆಫ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಯೂಡೋಕ್ನಾಟ್ ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಟರ್ನರ್ ಲ್ಯಾಬ್ ಸಿಸ್-ರೆಗ್ಯುಲೇಟರಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಲಿಮೆಂಟ್ಸ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಇನ್ಫ್ಲುಯೆನ್ಸ