Biomolecular Object Network Databank
ಬಯೋಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಡೇಟಾಬ್ಯಾಂಕ್ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾಬ್ಯಾಂಕ್ ಆಗಿದೆ. ದತ್ತಸಂಚಯವು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಣುವಿಗೆ ಪ್ರಸ್ತುತ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಮಾಹಿತಿಯ ಸಮಗ್ರ ಅವಲೋಕನವನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಹಲವಾರು ದತ್ತಸಂಚಯಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಹಿನ್ನೆಲೆ ಬ್ಲೂಪ್ರಿಂಟ್ ಇನಿಶಿಯೇಟಿವ್ ಟೊರೊಂಟೊದ ಮೌಂಟ್ ಸಿನಾಯ್ ಆಸ್ಪತ್ರೆಯ ಸ್ಯಾಮ್ಯುಯೆಲ್ ಲೂನೆನ್ಫೆಲ್ಡ್ ರಿಸರ್ಚ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ನ ಡಾ. ಕ್ರಿಸ್ಟೋಫರ್ ಹಾಗ್ ಅವರ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದಲ್ಲಿ ಸಂಶೋಧನಾ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮವಾಗಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾಯಿತು. ಡಿಸೆಂಬರ್ 14,2005 ರಂದು, ಅನ್ಲೀಶ್ಡ್ ಇನ್ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಲಿಮಿಟೆಡ್ ದಿ ಬ್ಲೂಪ್ರಿಂಟ್ ಇನಿಶಿಯೇಟಿವ್ ಬೌದ್ಧಿಕ ಆಸ್ತಿಯ ವಾಣಿಜ್ಯ ಹಕ್ಕುಗಳನ್ನು ಸ್ವಾಧೀನಪಡಿಸಿಕೊಂಡಿತು. ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಬಿಐಎನ್ಡಿ, ಸಣ್ಣ ಅಣು ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಎಸ್ಎಂಐಡಿ ಮತ್ತು ಡೇಟಾ ವೇರ್ಹೌಸ್ ಸೆಕ್ಹೌಂಡ್ನ ಹಕ್ಕುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ಅನ್ಲೀಶ್ಡ್ ಇನ್ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ದತ್ತಾಂಶ ನಿರ್ವಹಣಾ ಸೇವಾ ಪೂರೈಕೆದಾರರಾಗಿದ್ದು, ಡಾ. ಹಾಗ್ ಅವರ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನದಲ್ಲಿ ದಿ ಬ್ಲೂಪ್ರಿಂಟ್ ಇನಿಶಿಯೇಟಿವ್ನ ನಿರ್ವಹಣೆ ಮತ್ತು ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆಯನ್ನು ನೋಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತಿದೆ. ಕನ್ಸ್ಟ್ರಕ್ಷನ್ ಬಾಂಡ್ ಮೂಲ ಬ್ಲೂಪ್ರಿಂಟ್ ಇನಿಶಿಯೇಟಿವ್ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಜೆನ್ಬ್ಯಾಂಕ್ನಂತಹ ಇತರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳನ್ನು ಈ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಅನೇಕ ಸಾಧನಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಟ್ಯಾಕ್ಸನ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್ಗಳು, ರಿಡಂಡೆಂಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ಗಳು, ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ ವಿವರಣೆಗಳು, ಮ್ಯಾನ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಆನ್ಲೈನ್ ಮೆಂಡೆಲಿಯನ್ ಇನ್ಹೆರಿಟೆನ್ಸ್, ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೇನ್ಗಳು, ಡೇಟಾ ಬೇಸ್ ಕ್ರಾಸ್-ರೆಫರೆನ್ಸ್ಗಳು, ಲೋಕಸ್ಲಿಂಕ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಲಿಂಕ್ಗಳು ಸಹ ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಬಾಂಡ್ ಕ್ರಾಸ್-ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮುಕ್ತ ಪ್ರವೇಶ ಸಂಪನ್ಮೂಲವಾಗಿದೆ. ಸಣ್ಣ ಅಣು ಸಂವಹನ ದತ್ತಸಂಚಯ (ಎಸ್. ಎಂ. ಐ. ಡಿ.) ಸಣ್ಣ ಅಣು ಸಂವಹನ ದತ್ತಸಂಚಯವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್-ಸಣ್ಣ ಅಣು ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಇದು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೈನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ (ಸಿ. ಡಿ. ಡಿ.) ಕಂಡುಬರುವ ಡೊಮೇನ್ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಡೊಮೇನ್ ಆಧಾರಿತ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಪ್ರಶ್ನೆಯ ಸಣ್ಣ ಅಣುವಿನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯ ಸಿ. ಡಿ. ಡಿ. ಯು ಹಲವಾರು ವಿಭಿನ್ನ ಮೂಲಗಳಿಂದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ; ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು (ಪಿ. ಎಫ್. ಎ. ಎಂ.), ಸಿಂಪಲ್ ಮಾಡ್ಯುಲರ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ ರಿಸರ್ಚ್ ಟೂಲ್ (ಎಸ್. ಎಂ. ಎ. ಆರ್. ಟಿ.), ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಆಫ್ ಆರ್ಥೋಲೋಗಸ್ ಜೀನ್ಸ್ (ಸಿ. ಓ. ಜಿ. ಗಳು), ಮತ್ತು ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯ ಸ್ವಂತ ಕ್ಯೂರೇಟೆಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು. ಎಸ್ಎಂಐಡಿಯಲ್ಲಿನ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೇಟಾ ಬ್ಯಾಂಕ್ (ಪಿಡಿಬಿ) ನಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ, ಇದು ತಿಳಿದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜಿಐ, ಡೊಮೇನ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್, ಪಿಡಿಬಿ ಐಡಿ ಅಥವಾ ಎಸ್ಎಂಐಡಿ ಐಡಿಯನ್ನು ನಮೂದಿಸುವ ಮೂಲಕ ಎಸ್ಎಂಐಡಿಯನ್ನು ಪ್ರಶ್ನಿಸಬಹುದು. ಹುಡುಕಾಟದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಪ್ರತಿ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗೆ ಸಣ್ಣ ಅಣು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮತ್ತು ಡೊಮೇನ್ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಜೈವಿಕವಲ್ಲದ ಸಂಪರ್ಕಗಳೊಂದಿಗಿನ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪೂರ್ವನಿಯೋಜಿತವಾಗಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಎಂಐಡಿ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಎಂಬುದು ತಿಳಿದಿರುವ ಸಣ್ಣ-ಅಣುಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲು ಮತ್ತು ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಇನ್ನೂ ನಿರ್ಧರಿಸದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾದ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ. ಈ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯು ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಪರಿಚಿತ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ, ಆಸಕ್ತಿಯ ಸಣ್ಣ ಅಣುವಿನೊಂದಿಗೆ ಸ್ಫಟಿಕೀಕರಿಸದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ ಯಿಂದ ತಿಳಿದಿರುವ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಪರೀಕ್ಷಾ ಗುಂಪಿನ ವಿರುದ್ಧ ಎಸ್. ಎಂ. ಐ. ಡಿ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಅನ್ನು ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್-ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ನಿಖರವಾದ ಮುನ್ಸೂಚಕ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ; ಊಹಿಸಲಾದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ 60 ಪ್ರತಿಶತವು ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಈ 73 ಪ್ರತಿಶತವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿ 80 ಪ್ರತಿಶತಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ಗುರುತಿಸಿದೆ. ಹಾಗ್, ಸಿ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ದತ್ತಾಂಶದಲ್ಲಿ ಗಮನಿಸದ ಶೇಕಡಾ 45ರಷ್ಟು ಭವಿಷ್ಯವಾಣಿಗಳು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ನಿಜವಾದ ಧನಾತ್ಮಕತೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ. ಬಯೋಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಬಿಐಎನ್ಡಿ) ಪರಿಚಯ ಎಲ್ಲಾ ತಿಳಿದಿರುವ ಆಣ್ವಿಕ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ದಾಖಲಿಸಲು ಡೇಟಾಬೇಸ್ನ ಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ಮೂಲತಃ 1990 ರ ದಶಕದಲ್ಲಿ ಟೋನಿ ಪಾವ್ಸನ್ ಮಂಡಿಸಿದರು ಮತ್ತು ನಂತರ ಇದನ್ನು ಬ್ರಿಟಿಷ್ ಕೊಲಂಬಿಯಾ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಸಹಯೋಗದೊಂದಿಗೆ ಟೊರೊಂಟೊ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದರು. ಬಯೋಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಬಿಐಎನ್ಡಿ) ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಕೆನಡಿಯನ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ ಆಫ್ ಹೆಲ್ತ್ ರಿಸರ್ಚ್ (ಸಿಐಹೆಚ್ಆರ್), ಜೀನೋಮ್ ಕೆನಡಾ, ಕೆನಡಿಯನ್ ಫೌಂಡೇಶನ್ ಫಾರ್ ಇನ್ನೋವೇಶನ್ ಮತ್ತು ಒಂಟಾರಿಯೊ ರಿಸರ್ಚ್ ಅಂಡ್ ಡೆವಲಪ್ಮೆಂಟ್ ಫಂಡ್ ಅನುದಾನದಿಂದ ಬೆಂಬಲಿಸಲಾಗಿದೆ. ಜೈವಿಕ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ ನಿರಂತರವಾಗಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತಿರುವ ನಿಕ್ಷೇಪವಾಗಿ ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಅನ್ನು ಮೂಲತಃ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿತ್ತು. ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ವೇಗವಾಗಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಹೊಂದುತ್ತಿರುವ ಕ್ಷೇತ್ರವಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ನಿಯತಕಾಲಿಕಗಳಿಂದ ಮಾಹಿತಿಯು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಸುಲಭವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಾಗುವ ಅವಶ್ಯಕತೆಯಿದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗಗಳ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳಿಗೆ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗದ ರೋಗಕಾರಕಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಉತ್ತಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಯೋಜನೆಯ ಪ್ರಮುಖ ಗುರಿಗಳೆಂದರೆಃ ಎಲ್ಲರಿಗೂ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಸಂಪನ್ಮೂಲವನ್ನು ರಚಿಸುವುದು; ಇತರ ಮೂಲಗಳಿಂದ ಡೇಟಾಮೈನಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ರಚಿಸುವುದು (ಪ್ರೀಬಿನ್ಡ್); ಸಂಕೀರ್ಣ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ದೃಶ್ಯೀಕರಣಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ರಚಿಸುವುದು. ಮೊದಲಿನಿಂದಲೂ, ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಮುಕ್ತ ಪ್ರವೇಶವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಅನ್ನು ಮುಕ್ತವಾಗಿ ವಿತರಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಪಡಿಸಬಹುದು. ಪ್ರಸ್ತುತ, ಬಿಐಎನ್ಡಿ ದತ್ತಾಂಶ ವಿವರಣೆ, ದತ್ತಸಂಚಯ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆ ಮತ್ತು ದೃಶ್ಯೀಕರಣ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪ್ರಮುಖ ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಎಲ್ಲಾ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಆಶಿಸಲಾಗಿದೆ. ದತ್ತಸಂಚಯ ರಚನೆ ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಮೂರು ರೀತಿಯ ದತ್ತಾಂಶಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆಃ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗಗಳು. ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಬಿ. ಐ. ಎನ್. ಡಿ. ಯ ಮೂಲ ಅಂಶಗಳಾಗಿವೆ ಮತ್ತು 2 ಅಥವಾ ಅದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ವಸ್ತುಗಳು (ಎ ಮತ್ತು ಬಿ) ಪರಸ್ಪರ ಹೇಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತವೆ. ವಸ್ತುಗಳು ವಿವಿಧ ವಸ್ತುಗಳಾಗಿರಬಹುದುಃ ಡಿಎನ್ಎ, ಆರ್ಎನ್ಎ, ಜೀನ್ಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು, ಲಿಗಂಡ್ಗಳು ಅಥವಾ ಫೋಟಾನ್ಗಳು. ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ನಮೂದು ಅಣುವಿನ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ; ಇದು ಅದರ ಹೆಸರು ಮತ್ತು ಸಮಾನಾರ್ಥಕಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಅದು ಎಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ (ಉದಾ. ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿ ಎಲ್ಲಿ, ಯಾವ ಪ್ರಭೇದಗಳು, ಅದು ಯಾವಾಗ ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಇತ್ಯಾದಿ. ), ಮತ್ತು ಅದರ ಅನುಕ್ರಮ ಅಥವಾ ಅದರ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಎಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ನಮೂದು ವಿಟ್ರೊ, ರಾಸಾಯನಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ (ಥರ್ಮೋಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಕೈನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸೇರಿದಂತೆ) ನಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಗಮನಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ಸಹ ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಎರಡನೇ ವಿಧದ ಬೈಂಡ್ ನಮೂದುಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳಾಗಿವೆ. ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುವ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ ಒಂದು ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಣುಗಳ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆ ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ. ದಾಖಲೆಯು ವಿವಿಧ ಸಂವಹನಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಪಾತ್ರದ ಬಗ್ಗೆ ಕೆಲವು ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪ್ರವೇಶವು 2 ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂವಹನ ದಾಖಲೆಗಳಿಂದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸುತ್ತದೆ. ಬಿ. ಐ. ಎನ್. ಡಿ. ಯ ಮೂರನೇ ಅಂಶವು ಮಾರ್ಗ ದಾಖಲೆಯ ವಿಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಒಂದು ಮಾರ್ಗವು ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಜಾಲವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಭಾಗವು ಫಿನೋಟೈಪ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ರೋಗಗಳ ಬಗ್ಗೆಯೂ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಬಿಐಎನ್ಡಿಯಲ್ಲಿ ನಮೂದನ್ನು ರಚಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಕನಿಷ್ಠ ಮಾಹಿತಿಯೆಂದರೆ ಪಬ್ಮೆಡ್ ಪ್ರಕಟಣೆಯ ಉಲ್ಲೇಖ ಮತ್ತು ಮತ್ತೊಂದು ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿನ ನಮೂದು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಜೆನ್ಬ್ಯಾಂಕ್). ದತ್ತಾಂಶದೊಳಗಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ನಮೂದು ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕಾಗಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು/ಲೇಖಕರನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ನಿರಂತರವಾಗಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತಿರುವ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿರುವುದರಿಂದ, ಬಿಐಎನ್ಡಿಯ ಎಲ್ಲಾ ಘಟಕಗಳು ನವೀಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಟ್ರ್ಯಾಕ್ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಅಮೂರ್ತ ಸಿಂಟ್ಯಾಕ್ಸ್ ನೋಟೇಶನ್ 1 (ASN.1) ಭಾಷೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಬರೆಯಲಾದ ದತ್ತಾಂಶ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯು ತಮ್ಮ ಎಂಟ್ರೆಜ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಾಗಿ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವಾಗ <ಐ. ಡಿ. 1> ಅನ್ನು ಸಹ ಬಳಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ ಬಿ. ಐ. ಎನ್. ಡಿ. ಯು ದತ್ತಾಂಶ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯಕ್ಕಾಗಿ ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯಂತೆಯೇ ಅದೇ ಮಾನದಂಡಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ASN.1 ಭಾಷೆಗೆ ಆದ್ಯತೆ ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದನ್ನು ಇತರ ದತ್ತಾಂಶ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ ಭಾಷೆಗಳಿಗೆ ಸುಲಭವಾಗಿ ಅನುವಾದಿಸಬಹುದು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. XML), ಸಂಕೀರ್ಣ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸುಲಭವಾಗಿ ನಿಭಾಯಿಸಬಲ್ಲದು ಮತ್ತು ಎಲ್ಲಾ ಜೈವಿಕ ಸಂವಹನಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸಬಹುದು-ಕೇವಲ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಮಾತ್ರವಲ್ಲ. ಬೇಡರ್ ಮತ್ತು ಹಾಗ್ (2000) ಅವರು ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಬಳಸುವ ASN.1 ದತ್ತಾಂಶ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯ ಬಗ್ಗೆ ವಿವರವಾದ ಹಸ್ತಪ್ರತಿಯನ್ನು ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ. ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ದತ್ತಾಂಶ ಸಲ್ಲಿಕೆ ಮತ್ತು ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಬಳಕೆದಾರರ ಸಲ್ಲಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರೋತ್ಸಾಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಲು, ಒಬ್ಬರು ಸಲ್ಲಿಸಬೇಕುಃ ಸಂಪರ್ಕ ಮಾಹಿತಿ, ಪಬ್ಮೆಡ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವ ಎರಡು ಅಣುಗಳು. ದಾಖಲೆಯನ್ನು ಸಲ್ಲಿಸುವ ವ್ಯಕ್ತಿಯು ಅದರ ಮಾಲೀಕರಾಗಿರುತ್ತಾರೆ. ಎಲ್ಲಾ ದಾಖಲೆಗಳನ್ನು ಸಾರ್ವಜನಿಕಗೊಳಿಸುವ ಮೊದಲು ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಗುಣಮಟ್ಟದ ಭರವಸೆಗಾಗಿ ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಅನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಎರಡು ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆಃ ಹೈ-ಥ್ರೋಪುಟ್ (ಎಚ್. ಟಿ. ಪಿ) ಮತ್ತು ಲೋ-ಥ್ರೋಪುಟ್ (ಎಲ್. ಟಿ. ಪಿ). ಒಂದು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ವಿಧಾನದಿಂದ 40ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ವರದಿ ಮಾಡಿದ ಪ್ರಬಂಧಗಳಿಂದ ಎಚ್. ಟಿ. ಪಿ. ದಾಖಲೆಗಳು ಬಂದಿವೆ. ಎಚ್. ಟಿ. ಪಿ. ಕ್ಯುರೇಟರ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯ ಹಿನ್ನೆಲೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾರೆ. ಎಚ್. ಟಿ. ಪಿ ಕ್ಯುರೇಟರ್ಗಳು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ದತ್ತಾಂಶದ ಸಂಗ್ರಹಣೆಯ ಜವಾಬ್ದಾರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದಾರೆ ಮತ್ತು ಅವರು ಹೊಸ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಅನ್ನು ನವೀಕರಿಸಲು ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ರಚಿಸುತ್ತಾರೆ. ಎಲ್. ಟಿ. ಪಿ ದಾಖಲೆಗಳನ್ನು ಎಂ. ಎಸ್ಸಿ ಅಥವಾ ಪಿಎಚ್ಡಿ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ಸಂಶೋಧನೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಅನುಭವ ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತಾರೆ. ಎಲ್ಟಿಪಿ ಕ್ಯುರೇಟರ್ಗಳಿಗೆ ಕೆನಡಿಯನ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕಾರ್ಯಾಗಾರಗಳ ಮೂಲಕ ಹೆಚ್ಚಿನ ತರಬೇತಿಯನ್ನು ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕ್ಯೂರೇಟರ್ಗೆ ವಿಷಯದ ಬಗ್ಗೆ ಜ್ಞಾನವಿದೆ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತಾರೆ. ಪ್ರಕಟಿಸಿದಂತೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲು ಎಲ್ಟಿಪಿಯ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸುವುದು ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಕ್ಯುರೇಶನ್ನಿನ ಆದ್ಯತೆಯಾಗಿದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಎಚ್. ಟಿ. ಪಿ. ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆಯಾದರೂ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಎಲ್. ಟಿ. ಪಿ. ಅಧ್ಯಯನಗಳು ವರದಿಯಾಗುತ್ತಿವೆ ಮತ್ತು ಎರಡೂ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಗಳು ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ವರದಿ ಮಾಡುತ್ತಿವೆ. 2004ರಲ್ಲಿ, ಬಿಐಎನ್ಡಿ 110 ನಿಯತಕಾಲಿಕಗಳಿಂದ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿತು. ದತ್ತಸಂಚಯದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು ಅದರ ಪರಿಕಲ್ಪನೆಯ ನಂತರ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬೆಳೆದಿದೆ; ವಾಸ್ತವವಾಗಿ, ದತ್ತಸಂಚಯವು 2003 ಮತ್ತು 2004ರ ನಡುವೆ ನಮೂದುಗಳಲ್ಲಿ 10 ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಕಂಡಿದೆ. 2004ರ ಸೆಪ್ಟೆಂಬರ್ ವೇಳೆಗೆ, 100,000ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ದಾಖಲೆಗಳು ಇದ್ದವು (58,266 ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್, 4,225 ಜೆನೆಟಿಕ್, 874 ಪ್ರೋಟೀನ್-ಸಣ್ಣ ಅಣು, 25,857 ಪ್ರೋಟೀನ್-ಡಿಎನ್ಎ, ಮತ್ತು 19,348 ಬಯೋಪಾಲಿಮರ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ). ದತ್ತಸಂಚಯವು 31,972 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು, 4560 ಡಿಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು 759 ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಈ ನಮೂದುಗಳನ್ನು 11,649 ಪ್ರಕಟಣೆಗಳಿಂದ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗಿದೆ; ಆದ್ದರಿಂದ, ದತ್ತಾಂಶವು ದತ್ತಾಂಶದ ಪ್ರಮುಖ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ನಮೂದುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀವಿಗಳೆಂದರೆಃ ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯಾ, ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಮೆಲನೊಗಾಸ್ಟರ್, ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್, ಮಸ್ ಮಸ್ಕ್ಯುಲಸ್, ಸಿನೋರಹ್ಯಾಬಿಡಿಟಿಸ್ ಎಲಿಗನ್ಸ್, ಹೆಲಿಕೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಪೈಲೋರಿ, ಬೋಸ್ ಟಾರಸ್, ಎಚ್ಐವಿ-1, ಗ್ಯಾಲಸ್ ಗ್ಯಾಲಸ್, ಅರಾಬಿಡೋಪ್ಸಿಸ್ ಥಾಲಿಯಾನಾ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ, ಸೆಪ್ಟೆಂಬರ್ 2004 ರ ವೇಳೆಗೆ 901 ಟ್ಯಾಕ್ಸಾಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಅನ್ನು ಬಿಐಎನ್ಡಿ-ಮೆಟಾಜೋವಾ, ಬಿಐಎನ್ಡಿ-ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಮತ್ತು ಬಿಐಎನ್ಡಿ-ಟ್ಯಾಕ್ಸ್ರೂಟ್ ಎಂದು ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಲ್ಲಿರುವ ಮಾಹಿತಿಯು ನಿರಂತರವಾಗಿ ನವೀಕರಿಸಲ್ಪಡುವುದು ಮಾತ್ರವಲ್ಲ, ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಸ್ವತಃ ಹಲವಾರು ಪರಿಷ್ಕರಣೆಗಳನ್ನು ಕಂಡಿದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ನ ಆವೃತ್ತಿ 1 ಅನ್ನು 1999 ರಲ್ಲಿ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಬಳಕೆದಾರರ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಬಂಧಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ವಿವರಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಸ್ಥಳದ ಶ್ರೇಣೀಕೃತ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ಇದನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಯಿತು. 2ನೇ ಆವೃತ್ತಿಯು 2001ರಲ್ಲಿ ಬಿಡುಗಡೆಯಾಯಿತು ಮತ್ತು ಇತರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಮಾಹಿತಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕ ಕಲ್ಪಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ಆವೃತ್ತಿ 3 (2002) ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ಭೌತಿಕ/ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಸಂವಹನಗಳಿಂದ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಿತು. ಆವೃತ್ತಿ 3.5 (2004) ಮಾಹಿತಿಯ ಮರುಪಡೆಯುವಿಕೆಯನ್ನು ಸರಳಗೊಳಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಬಳಕೆದಾರ-ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. 2006 ರಲ್ಲಿ, ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಅನ್ನು ಬಯೋಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಬಿಒಎನ್ಡಿ) ಗೆ ಸೇರಿಸಲಾಯಿತು, ಅಲ್ಲಿ ಅದನ್ನು ನವೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಮತ್ತು ಸುಧಾರಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ವಿಶೇಷ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು ಒಂದು ಸ್ಕೀಮಾದಲ್ಲಿ ಜೈವಿಕ ಆಣ್ವಿಕ ಸಂವಹನಗಳು, ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಈ ರೀತಿಯ ಮೊದಲ ದತ್ತಸಂಚಯವಾಗಿದೆ. ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ 3ಡಿ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುವ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರದ ಮೇಲೆ ತನ್ನ ಮೂಲತತ್ವಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿದೆ. ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರವು ಆಣ್ವಿಕ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಪರಮಾಣು ಮಟ್ಟದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ವರೆಗೆ ವಿವರಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ಜೈವಿಕ ಆಣ್ವಿಕ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಪೂರ್ವಭಾವಿಯಾಗಿ ಸ್ಥಾಪಿಸಿ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೆಸರು ಅಥವಾ ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ನಮೂದಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಪ್ರೀಬಿನ್ಡ್ ಸಾಹಿತ್ಯವನ್ನು ಸ್ಕ್ಯಾನ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಹಿಂದಿರುಗಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಶ್ನೆಯಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಿದಂತೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಬೈಂಡ್ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಸಹ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಅನೇಕ ಇತರ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಒಳಗೊಂಡಿರದ ಹಲವಾರು "ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು" ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮದ ಲೇಖಕರು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳಿಗೆ ಸಂಭವಿಸುವ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಐಯುಪಿಎಸಿ ನಾಮಕರಣಕ್ಕೆ ವಿಸ್ತರಣೆಯನ್ನು ರಚಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಈ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಸೇರಿವೆಃ ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್, ಫಾರ್ಮೈಲೇಷನ್, ಮೀಥೈಲೇಷನ್, ಪಾಲ್ಮಿಟೋಯ್ಲೇಷನ್, ಇತ್ಯಾದಿ. ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಐ. ಯು. ಪಿ. ಎ. ಸಿ ಸಂಕೇತಗಳ ವಿಸ್ತರಣೆಯು ಈ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಒಂಟೊಗ್ಲಿಫ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ವಿಶಿಷ್ಟ ದೃಶ್ಯೀಕರಣ ಸಾಧನವನ್ನು ಸಹ ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ (ಜಿಒ) ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಆಂಟೊಗ್ಲಿಫ್ಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಮೂಲ ಜಿಒ ಮಾಹಿತಿಗೆ ಲಿಂಕ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಹಲವಾರು ಜಿ. ಓ. ಪದಗಳನ್ನು ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕಾರ್ಯ, ಬಂಧಿಸುವ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ ಅಥವಾ ಕೋಶದಲ್ಲಿನ ಸ್ಥಳೀಕರಣವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ಒಟ್ಟು 83 ಆಂಟೋಗ್ಲಿಫ್ ಅಕ್ಷರಗಳಿವೆ. ಅಣುವಿನ ಪಾತ್ರದ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ 34 ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಆಂಟೊಗ್ಲಿಫ್ಗಳಿವೆ (ಉದಾ. ಜೀವಕೋಶದ ಶರೀರಶಾಸ್ತ್ರ, ಅಯಾನು ಸಾಗಣೆ, ಸಂಕೇತ). ಅಣುವು ಏನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುವ 25 ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಆಂಟೊಗ್ಲಿಫ್ಗಳಿವೆ (ಉದಾ. ಲಿಗಂಡ್ಗಳು, ಡಿಎನ್ಎ, ಅಯಾನುಗಳು). ಇತರ 24 ಆಂಟೋಗ್ಲಿಫ್ಗಳು ಜೀವಕೋಶದೊಳಗಿನ ಅಣುವಿನ ಸ್ಥಳದ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್, ಸೈಟೋಸ್ಕೆಲಿಟನ್). ಹುಡುಕಾಟ ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಂದ ಕೆಲವು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ಅಥವಾ ಹೊರಗಿಡಲು ಒನ್ಟೊಗ್ಲಿಫ್ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ಕುಶಲತೆಯಿಂದ ನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು. ಒಂಟೊಗ್ಲಿಫ್ಗಳ ದೃಶ್ಯ ಸ್ವರೂಪವು ಹುಡುಕಾಟ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ನೋಡುವಾಗ ಮಾದರಿಯ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟಿಯೋಗ್ಲಿಫ್ಗಳು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸುವ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಚಿತ್ರಾತ್ಮಕ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯಗಳಾಗಿವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ನೇರ ಸಮತಲ ರೇಖೆಯಾಗಿ ಚಿತ್ರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲು ಗ್ಲಿಫ್ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಅದರ ಜೋಡಣೆಯ ಸಾಪೇಕ್ಷ ಸ್ಥಾನ ಮತ್ತು ಉದ್ದವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸಲು ಪ್ರತಿ ಗ್ಲಿಫ್ ಅನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಪ್ರವೇಶಿಸುವುದು ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಬಳಕೆದಾರ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ವೆಬ್ ಆಧಾರಿತವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪಠ್ಯ ಅಥವಾ ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆಗಳು/ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರಶ್ನಿಸಬಹುದು. ಬಾಂಡ್ನ ಇತರ ಘಟಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಅದರ ಏಕೀಕರಣವಾದಾಗಿನಿಂದ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಆಣ್ವಿಕ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗಗಳಿಗೆ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ. ದಾಖಲೆಗಳು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆಃ ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಐಡಿ, ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ/ಸಂಕೀರ್ಣ/ಮಾರ್ಗದ ವಿವರಣೆ, ಪ್ರಕಟಣೆಗಳು, ನವೀಕರಣ ದಾಖಲೆಗಳು, ಜೀವಿಗಳು, ಆಂಟೊಗ್ಲಿಫ್ಗಳು, ಪ್ರೋಟಿಯೋಗ್ಲಿಫ್ಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಕಂಡುಕೊಳ್ಳಬಹುದಾದ ಇತರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳ ಕೊಂಡಿಗಳು. ಬಿಐಎನ್ಡಿ ದಾಖಲೆಗಳು ವಿವಿಧ ವೀಕ್ಷಣೆಯ ಸ್ವರೂಪಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಎಚ್. ಟಿ. ಎಂ. ಎಲ್., <ಐ. ಡಿ. 1>, ಎಕ್ಸ್. ಎಂ. ಎಲ್., ಎಫ್. ಎ. ಎಸ್. ಟಿ. ಎ.), ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ರಫ್ತು ಮಾಡಲು ವಿವಿಧ ಸ್ವರೂಪಗಳು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ASN.1, XML, GI ಪಟ್ಟಿ, PDF), ಮತ್ತು ದೃಶ್ಯೀಕರಣಗಳು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಸೈಟೋಸ್ಕೇಪ್). ಯಾವ ರೀತಿಯ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಮರುಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದರ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ನಿಖರವಾದ ವೀಕ್ಷಣೆ ಮತ್ತು ರಫ್ತು ಆಯ್ಕೆಗಳು ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಬಳಕೆದಾರರ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು ಬಿಐಎನ್ಡಿ ಏಕೀಕರಣವಾದಾಗಿನಿಂದ ಬಿಡುಗಡೆಯಾಗದ ನೋಂದಾಯಿತರ ಸಂಖ್ಯೆ 10 ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ. 2006ರ ಡಿಸೆಂಬರ್ ವೇಳೆಗೆ ನೋಂದಣಿ 10,000ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆಯಾಯಿತು. ಬಾಂಡ್ನ ವಾಣಿಜ್ಯ ಆವೃತ್ತಿಗಳಿಗೆ ಚಂದಾದಾರರು ಆರು ಸಾಮಾನ್ಯ ವರ್ಗಗಳಲ್ಲಿ ಬರುತ್ತಾರೆ; ಕೃಷಿ ಮತ್ತು ಆಹಾರ, ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ, ಔಷಧೀಯ, ಮಾಹಿತಿಶಾಸ್ತ್ರ, ವಸ್ತುಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ. ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ವಲಯವು ಈ ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಅತಿ ದೊಡ್ಡದಾಗಿದ್ದು, ಶೇಕಡ 28ರಷ್ಟು ಚಂದಾದಾರಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಫಾರ್ಮಾಸ್ಯುಟಿಕಲ್ಸ್ ಮತ್ತು ಇನ್ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕ್ರಮವಾಗಿ ಶೇ 22 ಮತ್ತು ಶೇ 18ರಷ್ಟು ಪಾಲನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಯುನೈಟೆಡ್ ಸ್ಟೇಟ್ಸ್ ಈ ಚಂದಾದಾರಿಕೆಗಳ ಬಹುಪಾಲು, 69 ಪ್ರತಿಶತವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಬಾಂಡ್ನ ವಾಣಿಜ್ಯ ಆವೃತ್ತಿಗಳಿಗೆ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಇತರ ದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಕೆನಡಾ, ಯುನೈಟೆಡ್ ಕಿಂಗ್ಡಮ್, ಜಪಾನ್, ಚೀನಾ, ಕೊರಿಯಾ, ಜರ್ಮನಿ, ಫ್ರಾನ್ಸ್, ಭಾರತ ಮತ್ತು ಆಸ್ಟ್ರೇಲಿಯಾ ಸೇರಿವೆ. ಈ ಎಲ್ಲಾ ದೇಶಗಳು ಬಳಕೆದಾರರ ಪಾಲಿನಲ್ಲಿ ಶೇಕಡಾ 6ಕ್ಕಿಂತ ಕೆಳಗಿವೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು