Serratus (virology)
ಭೂಮಿಯ ವೈರೋಮ್ನ ಒಟ್ಟು ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಸೆರಾಟಸ್ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ವೈರೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವೇದಿಕೆಯಾಗಿದೆ. ಇತರ ಸಂಶೋಧಕರು ಪ್ರಾಸಂಗಿಕವಾಗಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಿರಬಹುದಾದ ಹೊಸ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವ ಗುರಿಯೊಂದಿಗೆ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡ ಈ ಯೋಜನೆಯು ವೈರಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಅವಲಂಬಿತ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ (ಆರ್ಡಿಆರ್ಪಿ) ಅನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುವ ಎಲ್ಲಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ವೈರಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳಲು ವಿಸ್ತರಿಸಿತು. 2020ರ ಅಂತ್ಯದ ವೇಳೆಗೆ, ಸಾರ್ವಜನಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಿಂದ ತಿಳಿದಿರುವ ಸರಿಸುಮಾರು 15,000 ವಿಭಿನ್ನ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವೈರಸ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿವೆ, ಇದನ್ನು ವಿಭಿನ್ನ ಆರ್. ಡಿ. ಆರ್. ಪಿ. ಯ ಸಂಖ್ಯೆಯಿಂದ ಅಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ (ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ 10 ಪ್ರತಿಶತಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸ). ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಕ್ಲೌಡ್ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ಗಾಗಿ ಆಪ್ಟಿಮೈಸ್ ಮಾಡಲಾದ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವರ್ಕ್ಫ್ಲೋವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಂಶೋಧನಾ ತಂಡವು ಕೇವಲ 11 ದಿನಗಳಲ್ಲಿ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೀಡ್ ಆರ್ಕೈವ್ (ಎಸ್ಆರ್ಎ) ನಲ್ಲಿ ಉಚಿತವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ 57 ಲಕ್ಷ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾಸೆಟ್ಗಳನ್ನು (20.4 ಪೆಟಾಬೈಟ್ ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ) ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದೆ ಮತ್ತು ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ವೆಚ್ಚ $23,900 ಆಗಿದೆ. ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು 132,000 ಹೊಸ ವೈರಲ್ ಆರ್. ಡಿ. ಆರ್. ಪಿ. ಯನ್ನು ನೀಡಿತು, ಇದು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವೈರಸ್ಗಳ ತಿಳಿದಿರುವ ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯದಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು ಪ್ರಮಾಣದ ಹೆಚ್ಚಳದ ಕ್ರಮವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ದತ್ತಸಂಚಯದೊಳಗೆ, ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವೈರಸ್ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಆರ್. ಡಿ. ಆರ್. ಪಿ. ಹಸ್ತಮುದ್ರೆಯ ಪ್ರಕಾರ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಒಂದು ರೀತಿಯ ಆಣ್ವಿಕ ಬಾರ್ಕೋಡ್ ಆಗಿದೆ. ಯಾವ ಎಸ್. ಆರ್. ಎ ಅನುಕ್ರಮವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆರ್. ಎನ್. ಎ ವೈರಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಹಸ್ತಮುದ್ರೆಯನ್ನು ಗಣನೆಯ ದಕ್ಷ ಸೂಚ್ಯಂಕವಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಅಂತಹ ಸೂಚ್ಯಂಕವು ಹೊಸ ಆರ್ಎನ್ಎ ವೈರಸ್ಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಬಹುದಾದ ಕಚ್ಚಾ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಾಂಶಗಳ ಉದ್ದೇಶಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಸೆರಾಟಸ್ನ ಎಲ್ಲಾ ದತ್ತಾಂಶಗಳು ಐ. ಎನ್. ಡಿ. ಎಸ್. ಸಿ. ಬಿಡುಗಡೆ ನೀತಿಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಉಚಿತವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಪಾಮ್ಐಡಿಃ ಆರ್ಡಿಆರ್ಪಿ ಅನುಕ್ರಮ ಹುಡುಕಾಟ ಸಾಧನ ಸೆರಾಟಸ್ ಕೋಡ್ ರೆಪೊಸಿಟರಿ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಬಯಾಲಜಿ ವೈರಾಲಜಿ ಅಧ್ಯಯನದ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳು