TimeLogic
ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ ಎಂಬುದು ಆಕ್ಟಿವ್ ಮೋಟಿಫ್, ಇಂಕ್ನ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಕಂಪನಿಯ ಪ್ರಧಾನ ಕಛೇರಿಯು ಕ್ಯಾಲಿಫೋರ್ನಿಯಾದ ಕಾರ್ಲ್ಸ್ಬಾಡ್ನಲ್ಲಿದೆ. ಹೈ ಪರ್ಫಾರ್ಮೆನ್ಸ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಬಯೋಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ ಜೈವಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲಿಕೆಗಾಗಿ ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ ಎಫ್ಪಿಜಿಎ-ವೇಗವರ್ಧಿತ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ ಅನ್ನು 1981 ರಲ್ಲಿ ಜೇಮ್ಸ್ ಡಬ್ಲ್ಯೂ. (ಜಿಮ್) ಲಿಂಡೆಲೀನ್ ಅವರು ಸ್ಥಾಪಿಸಿದರು ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ಗಾಗಿ ಮೊದಲ ವಾಣಿಜ್ಯ ಯಂತ್ರಾಂಶ-ವೇಗವರ್ಧಿತ ಸಾಧನಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾದ ಸ್ಮಿತ್-ವಾಟರ್ಮ್ಯಾನ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನ ಎಫ್ಪಿಜಿಎ-ವೇಗವರ್ಧಿತ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದರು. ಫೀಲ್ಡ್ ಪ್ರೊಗ್ರಾಮೆಬಲ್ ಗೇಟ್ ಅರೇ (ಎಫ್. ಪಿ. ಜಿ. ಎ.) ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳಾದ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್, ಸ್ಮಿತ್-ವಾಟರ್ಮ್ಯಾನ್ ಮತ್ತು ಎಚ್. ಎಂ. ಎಂ. ಇ. ಆರ್. ಗಳ ವೇಗವರ್ಧಿತ ಅನುಷ್ಠಾನಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ ನ ಡಿಸೈಫರ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು ವಿಸ್ತರಿಸಿವೆ. 2003ರಲ್ಲಿ, ಇನ್ವಿಟ್ರೋಜನ್ ಸಹ-ಸಂಸ್ಥಾಪಕ ಜೋಸೆಫ್ ಫರ್ನಾಂಡೀಸ್ ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಕಾರಕ ಕಂಪನಿಯಾದ ಆಕ್ಟಿವ್ ಮೋಟಿಫ್, ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ಅನ್ನು ಸ್ವಾಧೀನಪಡಿಸಿಕೊಂಡಿತು. 2008ರಲ್ಲಿ, ಜೀನಿಯಸ್ ಪ್ರೊ ಅನ್ನು ಡಿಸೈಫರ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ವೇಗವರ್ಧಿತ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ ಬಯೋಮ್ಯಾಟರ್ಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಪಾಲುದಾರಿಕೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸಿತು. 2011ರಲ್ಲಿ, ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್, ವೇಗವರ್ಧಿತ ಗಣನೆಯ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಜಂಟಿಯಾಗಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಬೀಲೆಫೆಲ್ಡ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾನಿಲಯದ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ (ಸಿ. ಇ. ಬಿ. ಐ. ಟಿ. ಸಿ) ಯೊಂದಿಗೆ ಪಾಲುದಾರಿಕೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸಿತು. ಆಯ್ದ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಕೊಡುಗೆಗಳು ವೇಗವರ್ಧಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸಿವೆ, ಮತ್ತು ಕೆಳಗಿರುವ ಆಯ್ದ ಮೈಲಿಗಲ್ಲುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ 180 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪೀರ್-ರಿವ್ಯೂಡ್ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಂಶೋಧನಾ ಲೇಖನಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಆವಿಷ್ಕಾರಕ್ಕೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುವ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವಾಗಿ ಡಿಸೈಫರ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆಃ 1997 ರಲ್ಲಿ, ಇ. ಕೋಲಿ ಕೆ 12 ಜೀನೋಮ್ನ ಮೊದಲ ಸಂಪೂರ್ಣ ಅನುಕ್ರಮದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಹೊಸ ಅನುವಾದಿತ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಡಿಸೈಫರ್ ಸ್ಮಿತ್-ವಾಟರ್ಮ್ಯಾನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿತು. 2002ರಲ್ಲಿ, "ಇಂಡೆಲ್ಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಫ್ರೇಮ್ಶಿಫ್ಟ್ಗಳ ತಿದ್ದುಪಡಿಯನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ಮಾಡಲು" ಡಿಸೈಫರ್ ಫ್ರೇಮ್ ಸರ್ಚ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಂಡ ಮೊದಲ ಬೆಳೆಯಾದ ಅಕ್ಕಿ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಯಿತು. 2004ರಲ್ಲಿ, ಸಸ್ಯ-ಪರಾವಲಂಬಿ ನೆಮಟೋಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಮತಲವಾದ ಜೀನ್ ವರ್ಗಾವಣೆಯ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಡಿಸೈಫರ್ ಟೆರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ನಡೆಸಲಾಯಿತು, ಇದು ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ನ ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ ಅನುಷ್ಠಾನವಾಗಿದೆ. 2007ರಲ್ಲಿ, 1700 ಹೊಸ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಮತ್ತು ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ಈ ಹಿಂದೆ ಒ. ಆರ್. ಎಫ್. ಎನ್. ಗಳೆಂದು ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾದ 6000 ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವಂತೆ ಡಿಸೈಫರ್ ಎಚ್. ಎಂ. ಎಂ. ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸೋರ್ಸೆರೆರ್ II ಗ್ಲೋಬಲ್ ಓಷನ್ ಸ್ಯಾಂಪ್ಲಿಂಗ್ ಎಕ್ಸ್ಪೆಡಿಶನ್ (ಜಿ. ಓ. ಎಸ್.) ರಚಿಸಿದ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಎಚ್. ಎಂ. ಎಂ. ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ನಡೆಸಲಾಯಿತು. ಡಾ. ಕ್ರೇಗ್ ವೆಂಟರ್ ಅವರು ತಮ್ಮ ಜೀವನಚರಿತ್ರೆಯಲ್ಲಿ ಟೈಮ್ಲಾಜಿಕ್ಗೆ ಮನ್ನಣೆ ನೀಡಿದರು, ಡಿಸೈಫರ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು "ಮೊದಲು ಸಾಧಿಸಿದ್ದಕ್ಕಿಂತ ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದ ಕ್ರಮವನ್ನು" ನಿರ್ವಹಿಸಿದೆ ಎಂದು ಗಮನಿಸಿದರು. ಅಂತಿಮ ಗಣನೆಯು ಎರಡು ವಾರಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಂಡಿತು ಆದರೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಶತಮಾನಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಕಾಲ ನಡೆಯುತ್ತಿತ್ತು. 2007ರಲ್ಲಿ, ಡಿಸೈಫರ್ ಜೀನ್ ಡಿಟೆಕ್ಟಿವ್ನೊಂದಿಗೆ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಎಕ್ಸೋನಿಕ್ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸೋಯಾಬೀನ್ ರೋಗಕಾರಕ ಫ್ಯೂಸಾರಿಯಂ ವರ್ಗುಲಿಫಾರ್ಮ್ನ ಭೌತಿಕ ನಕ್ಷೆಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಯಿತು. 2011ರಲ್ಲಿ, ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ ತಾಣಗಳ ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಸ್ಥಾನಗಳನ್ನು ನಿಖರವಾಗಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಡಿಸೈಫರ್ ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಜಾನುವಾರುಗಳಲ್ಲಿನ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಜಾಗತಿಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನವನ್ನು ನಡೆಸಲಾಯಿತು. ಪ್ರಾಡಕ್ಟ್ಸ್ ಡಿಸೈಫರ್ ಸರ್ವರ್ ಡಿಸೈಫರ್ ಸಿಮಿಲಾರಿಟಿ ಸರ್ಚ್ ಎಂಜಿನ್ ಎಫ್ಪಿಜಿಎ-ಆಧಾರಿತ ವೇಗವರ್ಧಕವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಉನ್ನತ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಸರ್ವರ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಟೈಮಲಾಜಿಕ್ ನ ಎಲ್ಲಾ ವೇಗವರ್ಧಿತ ಹುಡುಕಾಟ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳನ್ನು ಚಲಾಯಿಸಲು ಮರುಪ್ರೋಗ್ರಾಮ್ ಮಾಡಬಹುದು. ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಒಂದು ವೇಗವರ್ಧಿತ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನುಷ್ಠಾನವಾಗಿದ್ದು, ಇದರಲ್ಲಿ ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್, ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್, ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್, ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ತೇರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಸೇರಿವೆ. ಟೆರಾ-ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಸಹ ಟೆರಾ-ಪ್ರೋಬ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಪ್ರೋಬ್ ವಿನ್ಯಾಸದ ಸ್ವಾಮ್ಯದ ಕ್ರಮಾವಳಿ. ಡಿಸೈಫರ್ ಸ್ಮಿತ್-ವಾಟರ್ಮ್ಯಾನ್ ವೇಗವರ್ಧಿತ ಸ್ಮಿತ್-ವಾಟರ್ಮ್ಯಾನ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನುಷ್ಠಾನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಫ್ರೇಮ್ ಸರ್ಚ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಡಿಸೈಫರ್ ಎಚ್ಎಂಎಂ ಒಂದು ವೇಗವರ್ಧಿತ ಎಚ್ಎಂಎಂಇಆರ್ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನುಷ್ಠಾನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಎಚ್ಎಫ್ಎಸ್ಟಿ, ಫ್ರೇಮ್ಶಿಫ್ಟ್ ಸಹಿಷ್ಣು ಎಚ್ಎಂಎಂ ಹುಡುಕಾಟವನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಜೀನ್ ಡಿಟೆಕ್ಟಿವ್ ಎಂಬುದು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಜೀನ್ಗಳು, ಇಂಟ್ರಾನ್, ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ತಾಣಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರಕ್ಕಾಗಿ ಇವಾನ್ ಬಿರ್ನಿಯ ಜೀನ್ವೈಸ್ನಂತೆಯೇ ವೇಗವರ್ಧಿತ ಅನುಷ್ಠಾನವಾಗಿದೆ. ಪೈಪ್ವರ್ಕ್ಸ್ ವೇಗವರ್ಧಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪೈಪ್ಲೈನ್ಗಳ ವಿನ್ಯಾಸಕ್ಕಾಗಿ ಡ್ರ್ಯಾಗ್-ಅಂಡ್-ಡ್ರಾಪ್ ಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಆಗಿದೆ. ಸಹ ನೋಡಿ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕಂಪನಿಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕಂಪನಿಗಳು ಕ್ಯಾಲಿಫೋರ್ನಿಯಾದ ಕಾರ್ಲ್ಸ್ಬಾಡ್ ಮೂಲದ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಸೈನ್ಸ್ ಕಂಪನಿಗಳು