Human Metabolome Database
ಹ್ಯೂಮನ್ ಮೆಟಬೋಲೋಮ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ) ಮಾನವ ದೇಹದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಸಣ್ಣ ಅಣು ಚಯಾಪಚಯಗಳ ಸಮಗ್ರ, ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ, ಮುಕ್ತವಾಗಿ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದಾದ, ಆನ್ಲೈನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಆಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಜೀನೋಮ್ ಕೆನಡಾದಿಂದ ಧನಸಹಾಯ ಪಡೆದ ಹ್ಯೂಮನ್ ಮೆಟಾಬೋಲೋಮ್ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ರಚಿಸಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಮೊದಲ ಮೀಸಲಾದ ಮೆಟಾಬೊಲೊಮಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ. ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ಎನ್ಎಂಆರ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿ, ಜಿಸಿ-ಎಂಎಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಮತ್ತು ಎಲ್ಸಿ/ಎಂಎಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮಾನವ ಮೆಟಾಬೊಲೈಟ್ಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಮಾನವ ಮೆಟಾಬೊಲೊಮಿಕ್ಸ್ ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಆವಿಷ್ಕಾರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು, ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ಮೂರು ರೀತಿಯ ದತ್ತಾಂಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆಃ 1) ರಾಸಾಯನಿಕ ದತ್ತಾಂಶ, 2) ವೈದ್ಯಕೀಯ ದತ್ತಾಂಶ, ಮತ್ತು 3) ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ/ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರ ದತ್ತಾಂಶ (ಚಿತ್ರ. 1-3). ರಾಸಾಯನಿಕ ದತ್ತಾಂಶವು ಸುಮಾರು 10,000 ಎನ್ಎಂಆರ್, ಜಿಸಿ-ಎಂಎಸ್ ಮತ್ತು ಎಲ್ಸಿ/ಎಂಎಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರಾಗಳೊಂದಿಗೆ ವಿವರವಾದ ವಿವರಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ 41,514 ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ದತ್ತಾಂಶವು 10,000 ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್-ಬಯೋಫ್ಲೂಯಿಡ್ ಸಾಂದ್ರತೆ ಮತ್ತು 600 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ವಿವಿಧ ಮಾನವ ರೋಗಗಳ ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ದತ್ತಾಂಶವು 5,688 ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ) ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಈ ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ನಮೂದುಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವ 5,000ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ನಮೂದು 110 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ದತ್ತಾಂಶ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಅದರಲ್ಲಿ ಮೂರನೇ ಎರಡರಷ್ಟು ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ರಾಸಾಯನಿಕ/ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಮೀಸಲಿಡಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಉಳಿದ ಮೂರನೇ ಒಂದು ಭಾಗವನ್ನು ಕಿಣ್ವ ಅಥವಾ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಮೀಸಲಿಡಲಾಗಿದೆ. ಅನೇಕ ದತ್ತಾಂಶ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳು ಇತರ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಿಗೆ (ಕೆಇಜಿಜಿ, ಮೆಟಾಸೈಕ್, ಪಬ್ಚೆಮ್, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೇಟಾ ಬ್ಯಾಂಕ್, ಚಿಇಬಿಐ, ಸ್ವಿಸ್-ಪ್ರಾಟ್ ಮತ್ತು ಜೆನ್ಬ್ಯಾಂಕ್) ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗ ವೀಕ್ಷಣೆಯ ಆಪ್ಲೆಟ್ಗಳಿಗೆ ಹೈಪರ್ಲಿಂಕ್ ಆಗಿವೆ. ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ದತ್ತಸಂಚಯವು ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಪಠ್ಯ, ಅನುಕ್ರಮ, ವರ್ಣಪಟಲ, ರಾಸಾಯನಿಕ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರಶ್ನೆ ಹುಡುಕಾಟಗಳನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಮೆಟಾಬೊಲೊಮಿಕ್ಸ್, ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ, ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಡಿಸ್ಕವರಿ ಮತ್ತು ಜನರಲ್ ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಶಿಕ್ಷಣದಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ನಾಲ್ಕು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು, ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್, ಟಿ3ಡಿಬಿ, ಎಸ್ಎಮ್ಪಿಡಿಬಿ ಮತ್ತು ಫೂಡಿಬಿ ಸಹ ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳ ಸೂಟ್ನ ಭಾಗವಾಗಿವೆ. ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್ ~ 1,600 ಔಷಧ ಮತ್ತು ಔಷಧ ಚಯಾಪಚಯಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸಮಾನವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, T3DB 3,100 ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಷ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, SMPDB 700 ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಮತ್ತು ರೋಗ ಮಾರ್ಗಗಳಿಗೆ ಮಾರ್ಗ ರೇಖಾಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಆದರೆ FooDB ~ 28,000 ಆಹಾರ ಘಟಕಗಳು ಮತ್ತು ಆಹಾರ ಸೇರ್ಪಡೆಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸಮಾನವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿಯ ಮೊದಲ ಆವೃತ್ತಿಯು ಜನವರಿ 1,2007 ರಂದು ಬಿಡುಗಡೆಯಾಯಿತು, ನಂತರದ ಎರಡು ಆವೃತ್ತಿಗಳು ಜನವರಿ 1,2009 (ಆವೃತ್ತಿ 2), ಆಗಸ್ಟ್ 1,2009 (ಆವೃತ್ತಿ 2), ಸೆಪ್ಟೆಂಬರ್ 18,2012 (ಆವೃತ್ತಿ 3) ಮತ್ತು ಜನವರಿ 1,2013 (ಆವೃತ್ತಿ 3), 2017 (ಆವೃತ್ತಿ 4)., 2022 (ಆವೃತ್ತಿ 5). ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪ್ರಮುಖ ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ಆವೃತ್ತಿಗಳ ವಿವರಗಳನ್ನು (ಆವೃತ್ತಿ 5ರವರೆಗೆ) ಕೋಷ್ಟಕ 1ರಲ್ಲಿ ನೀಡಲಾಗಿದೆ. ವ್ಯಾಪ್ತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರವೇಶ ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿಯಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ದತ್ತಾಂಶವು ಸ್ವಾಮ್ಯರಹಿತವಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಸ್ವಾಮ್ಯರಹಿತ ಮೂಲದಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ಇದು ಉಚಿತವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ ಮತ್ತು ಯಾರಿಗಾದರೂ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, ಬಹುತೇಕ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ದತ್ತಾಂಶ ಐಟಂ ಅನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದು ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಮೂಲ ಮೂಲಕ್ಕೆ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ದತ್ತಾಂಶವು ಸಾರ್ವಜನಿಕ ವೆಬ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಮತ್ತು ಡೌನ್ಲೋಡ್ಗಳ ಮೂಲಕ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಕೆ. ಇ. ಜಿ. ಜಿ. ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್ ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಮೆಟಾಸೈಕ್ ಬೋವಿನ್ ಮೆಟಾಬೋಲೋಮ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಮೆಟಾಬೋಲೋಮ್ ಮೆಟಾಬೋಲೋಮಿಕ್ಸ್ ಜೈವಿಕ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಮೆಟಾಬೋಲೋಮಿಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು ವೈದ್ಯಕೀಯ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು ಜೈವಿಕ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು ಆಹಾರ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು ಮಾನವ ಮೆಟಾಬೋಲೋಮ್ಗಳು