Small Molecule Pathway Database
ಸ್ಮಾಲ್ ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ ಪಾಥ್ವೇ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ) ಒಂದು ಸಮಗ್ರ, ಉತ್ತಮ ಗುಣಮಟ್ಟದ, ಮುಕ್ತವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ, 600 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆನ್ಲೈನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಆಗಿದೆ. ಮೆಟಬಾಲಿಕ್) ಮಾರ್ಗಗಳು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಮೆಟಾಬೊಲೊಮಿಕ್ಸ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೊಮಿಕ್ಸ್, ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಿಸ್ಟಮ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿಯಲ್ಲಿ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಬೆಂಬಲಿಸಲು ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಐದು ರೀತಿಯ ಸಣ್ಣ ಅಣು ಮಾರ್ಗಗಳ ವರ್ಣರಂಜಿತ, ವಿವರವಾದ, ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಹುಡುಕಬಹುದಾದ, ಹೈಪರ್ಲಿಂಕ್ಡ್ ರೇಖಾಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಭಾಗಶಃ ಇದನ್ನು ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆಃ 1) ಸಾಮಾನ್ಯ ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳು; 2) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ರೋಗ ಮಾರ್ಗಗಳು; 3) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಸಂಕೇತ ಮಾರ್ಗಗಳು; 4) ಔಷಧ-ಕ್ರಿಯೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳು ಮತ್ತು 5) ಔಷಧ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳು. ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಗೂಗಲ್ ನಕ್ಷೆಗಳಂತಹ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಂವಾದಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಬಹುದು, ವೀಕ್ಷಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಝೂಮ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಎಲ್ಲಾ ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ ಮಾರ್ಗಗಳು ಸಂಬಂಧಿತ ಅಂಗಗಳು, ಉಪಕೋಶೀಯ ವಿಭಾಗಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಳಗಳು, ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ಸ್ಥಳಗಳು, ರಾಸಾಯನಿಕ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ವಾರ್ಟರ್ನರಿ ರಚನೆಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ (ಚಿತ್ರ. 1). ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ ಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಸಣ್ಣ ಅಣುವು ಎಚ್. ಎಂ. ಡಿ. ಬಿ ಅಥವಾ ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್ನಲ್ಲಿರುವ ವಿವರವಾದ ವಿವರಣೆಗಳಿಗೆ ಹೈಪರ್ಲಿಂಕ್ ಆಗಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಕಿಣ್ವ ಸಂಕೀರ್ಣವು ಯುನಿಪ್ರೋಟ್ಗೆ ಹೈಪರ್ಲಿಂಕ್ ಆಗಿರುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಎಲ್ಲಾ ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ ಮಾರ್ಗಗಳು ವಿವರವಾದ ವಿವರಣೆಗಳು ಮತ್ತು ಉಲ್ಲೇಖಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿ ರೇಖಾಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ಚಿತ್ರಿಸಲಾದ ಮಾರ್ಗ, ಸ್ಥಿತಿ ಅಥವಾ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಅವಲೋಕನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಬಳಕೆದಾರರು ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. (ಚಿತ್ರ. 2) ಅಥವಾ ಪಠ್ಯ ಹುಡುಕಾಟದ ಮೂಲಕ ಅದರ ವಿಷಯಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಿ (ಚಿತ್ರ. 3), ಅನುಕ್ರಮ ಹುಡುಕಾಟ, ಅಥವಾ ರಾಸಾಯನಿಕ ರಚನೆಯ ಹುಡುಕಾಟ. ಜೀನ್ ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹೆಸರುಗಳು, ಔಷಧದ ಹೆಸರುಗಳು, ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ಹೆಸರುಗಳು, ಜೆನ್ಬ್ಯಾಂಕ್ ಐಡಿಗಳು, ಸ್ವಿಸ್-ಪ್ರಾಟ್ ಐಡಿಗಳು, ಏಜಿಲೆಂಟ್ ಅಥವಾ ಅಫಿಮೆಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಐಡಿಗಳ ಪಟ್ಟಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹುಡುಕುವುದು ಸೇರಿದಂತೆ ಹೆಚ್ಚು ಶಕ್ತಿಯುತವಾದ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳು ಸಹ ಸಾಧ್ಯವಿದೆ. ಈ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳ ಪಟ್ಟಿಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ಮಾರ್ಗ ರೇಖಾಚಿತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಅಣುಗಳನ್ನು ಹೈಲೈಟ್ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಜೀನ್, ಮೆಟಾಬೋಲೈಟ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಮೂಲಕ ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಬಹುದು. ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯು ಮೆಟಾಬೊಲೊಮಿಕ್ಸ್ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳ ಒಂದು ಭಾಗವಾಗಿದ್ದು, ಹ್ಯೂಮನ್ ಮೆಟಾಬೋಲೋಮ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್ ಮತ್ತು ಟಾಕ್ಸಿನ್ ಮತ್ತು ಟಾಕ್ಸಿನ್-ಟಾರ್ಗೆಟ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (ಟಿ3ಡಿಬಿ) ಗಳನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್ 7000 ಔಷಧಿಗಳು ಮತ್ತು> 4200 ಬೇಡದ ಔಷಧ ಗುರಿಗಳು, ಕಿಣ್ವಗಳು, ಸಾಗಣೆದಾರರು ಮತ್ತು ವಾಹಕಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದ್ದರೆ, ಎಚ್ಎಂಡಿಬಿ ಮಾನವ ದೇಹದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ 40,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಸಣ್ಣ ಅಣು ಚಯಾಪಚಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಈ ಸೂಟ್ ತನ್ನ 3100 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಷಕಾರಿ ಪದಾರ್ಥಗಳು ಮತ್ತು 1300 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಅನುಗುಣವಾದ ಟಾಕ್ಸಿನ್ ಗುರಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಟಿ3ಡಿಬಿ ಯಿಂದ ಪೂರಕವಾಗಿದೆ. ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯ ಮೊದಲ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು 2010ರ ಜನವರಿ 1ರಂದು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಈ ಬಿಡುಗಡೆಯು ಸಣ್ಣ ಅಣು ಮಾರ್ಗಗಳಿಗಾಗಿ 350 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಚಿತ್ರ-ನಕ್ಷೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ವೀಕ್ಷಕರ ಅಂತರಸಂಪರ್ಕವು 3-ಹಂತದ (ಸಣ್ಣ, ಮಧ್ಯಮ, ದೊಡ್ಡ) ಝೂಮಿಂಗ್ನೊಂದಿಗೆ ಸ್ಕ್ರಾಲ್-ಬಾರ್ ಇಮೇಜ್ ನ್ಯಾವಿಗೇಷನ್ಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿತ್ತು. ಈ ಮೊದಲ ಆವೃತ್ತಿಯಲ್ಲಿನ ಮಾರ್ಗಗಳು 1) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳು; 2) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ರೋಗ ಮಾರ್ಗಗಳು; ಮತ್ತು 3) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಸಂಕೇತ ಮಾರ್ಗಗಳಿಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿವೆ. ಎಸ್. ಎಂ. ಪಿ. ಡಿ. ಬಿ. ಯ ಎರಡನೇ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು 2014ರಲ್ಲಿ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಈ ಆವೃತ್ತಿಯು 620 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಸಣ್ಣ ಅಣು ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ಕ್ಲಿಕ್-ಎನ್-ಡ್ರ್ಯಾಗ್ ಇಮೇಜ್ ನ್ಯಾವಿಗೇಷನ್ ಮತ್ತು ಅನಿಯಮಿತ, ಸಂವಾದಾತ್ಮಕ ಝೂಮಿಂಗ್ನೊಂದಿಗೆ ಗೂಗಲ್-ಮ್ಯಾಪ್ ತರಹದ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ವೀಕ್ಷಕರ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಎರಡನೇ ಆವೃತ್ತಿಯ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನಂತೆ ವಿಸ್ತರಿಸಲಾಗಿದೆಃ 1) ಸಾಮಾನ್ಯ ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳು; 2) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ರೋಗ ಮಾರ್ಗಗಳು; 3) ಮಾನವ ಚಯಾಪಚಯ ಸಂಕೇತ ಮಾರ್ಗಗಳು; 4) ಔಷಧ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳು ಮತ್ತು 5) ಔಷಧ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳು. ಕೆ. ಇ. ಜಿ. ಜಿ. ಎಚ್. ಎಂ. ಡಿ. ಬಿ. ಡ್ರಗ್ ಬ್ಯಾಂಕ್ ರಿಯಾಕ್ಟೋಮ್ ಮೆಟಾಸೈಕ್ ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಮೆಟಾಬೊಲೊಮಿಕ್ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ವೈದ್ಯಕೀಯ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಜೈವಿಕ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.