Group III pyridoxal-dependent decarboxylases
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಗುಂಪು III ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-ಅವಲಂಬಿತ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ಗಳು ಆರ್ನಿಥೈನ್ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್, ಲೈಸಿನ್ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ ಮತ್ತು ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕಿಣ್ವಗಳ ಒಂದು ಕುಟುಂಬವಾಗಿದೆ. ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-5 '-ಫಾಸ್ಫೇಟ್-ಅವಲಂಬಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ಗಳನ್ನು ನಾಲ್ಕು ಗುಂಪುಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು. ಗುಂಪು III ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಆರ್ನಿಥೈನ್ ಮತ್ತು ಲೈಸಿನ್ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೈವಿಕ ವಿಘಟನೀಯ ರೀತಿಯ ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ರಚನೆ ಈ ಕಿಣ್ವಗಳು ಹಲವಾರು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಫ್ಲೇವೊಡಾಕ್ಸಿನ್ ತರಹದ ಪದರವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಒಟ್ಟಾರೆ 3ಡಿ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಅದರ ಸ್ಥಾನದಿಂದಾಗಿ ಇದನ್ನು "ವಿಂಗ್" ಡೊಮೇನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಲ್ಯಾಕ್ಟೋಬಾಸಿಲಸ್ 30ಎ (ಎಲ್30ಎ ಓರ್ನ್ಡಿಸಿ) ಯಿಂದ ಬರುವ ಆರ್ನಿಥೈನ್ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್, ಲೈಸಿನ್, ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಅಥವಾ ಆರ್ನಿಥೈನ್ ಮೇಲೆ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ದೊಡ್ಡ, ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-5 '-ಫಾಸ್ಫೇಟ್-ಅವಲಂಬಿತ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. L30a ಓರ್ನ್ಡಿಸಿಯ ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಯನ್ನು 3 ಎ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ಗೆ ಪರಿಹರಿಸಲಾಗಿದೆ. C6 ಸಮ್ಮಿತಿಯಿಂದ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆರು ಡೈಮರ್ಗಳು ಕಿಣ್ವದ ಸಕ್ರಿಯ ಡೋಡೆಕ್ಯಾಮರ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತವೆ (ಸರಿಸುಮಾರು 106 ಡಾ). L30a ಓರ್ನ್ಡಿಸಿಯ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಮೊನೊಮರ್ ಅನ್ನು ಐದು ಅನುಕ್ರಮ ಮಡಿಸುವ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಪರಿಭಾಷೆಯಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಬಹುದು. ಅಮೈನೊ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್, ಅವಶೇಷಗಳು 1 ರಿಂದ 107, "ವಿಂಗ್" ಡೊಮೇನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಐದು-ಎಳೆಗಳ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಪ್ರತಿ ಡೈಮರ್ನ ಎರಡು ರೆಕ್ಕೆಯ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಡೋಡೆಕ್ಯಾಮರ್ನ ಮಧ್ಯಭಾಗದ ಕಡೆಗೆ ಒಳಮುಖವಾಗಿ ಚಲಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಡೋಡೆಕ್ಯಾಮರ್ ಸ್ಥಿರೀಕರಣಕ್ಕೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತವೆ. ಪ್ರಮುಖ ಡೊಮೇನ್ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಲೈಸಿನ್ ಅವಶೇಷವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಗುಂಪಿನ ಲಗತ್ತಿಸುವ ಸ್ಥಳವಾಗಿದೆ. ಗ್ರೂಪ್ I ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-ಅವಲಂಬಿತ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ ಗ್ರೂಪ್ II ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-ಅವಲಂಬಿತ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ ಗ್ರೂಪ್ IV ಪಿರಿಡಾಕ್ಸಲ್-ಅವಲಂಬಿತ ಡಿಕಾರ್ಬೊಕ್ಸಿಲೇಸ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.