PiggyBac transposon system
ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ (ಪಿಬಿ) ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಒಂದು ಚಲನಶೀಲ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶವಾಗಿದ್ದು, ಇದು "ಕಟ್ ಅಂಡ್ ಪೇಸ್ಟ್" ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದ ಮೂಲಕ ವಾಹಕಗಳು ಮತ್ತು ವರ್ಣತಂತುಗಳ ನಡುವೆ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ವರ್ಗಾವಣೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಳಾಂತರದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಪಿಬಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ವಾಹಕದ ಎರಡೂ ತುದಿಗಳಲ್ಲಿರುವ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು (ಐಟಿಆರ್) ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮೂಲ ತಾಣಗಳಿಂದ ವಿಷಯಗಳನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಚಲಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಟಿಟಿಎಎ ವರ್ಣತಂತು ತಾಣಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಪ್ರಬಲ ಚಟುವಟಿಕೆಯು ಪಿಬಿ ವಾಹಕದಲ್ಲಿನ ಎರಡು ಐಟಿಆರ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಆಸಕ್ತಿಯ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಗುರಿಯ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಸುಲಭವಾಗಿ ಸಜ್ಜುಗೊಳಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಟಿಟಿಎಎ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ ವೇಗವಾಗಿ ವಿವಿಧ ಪ್ರಭೇದಗಳ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಕೀಟಗಳ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಉಪಯುಕ್ತವಾದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಆಗುತ್ತಿದೆ. ಅವುಗಳನ್ನು 1989 ರಲ್ಲಿ ನೊಟ್ರೆ ಡೇಮ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದಲ್ಲಿ ಮಾಲ್ಕಮ್ ಫ್ರೇಸರ್ ಕಂಡುಹಿಡಿದರು. ಮೂಲ ಟಿ. ಟಿ. ಎ. ಎ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ, ಸಣ್ಣ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅಂಶಗಳು ಚಲನೆಯ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುವ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳ ಗುಂಪಾಗಿದೆ. ಈ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಮೂಲತಃ ಎಲೆಕೋಸು ಲೂಪರ್ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಇತರ ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಸಾಮಾನ್ಯವೆಂದು ತೋರುತ್ತದೆ. ಅವು ಕೀಟಗಳ ರೂಪಾಂತರಕ್ಕೆ ಉಪಯುಕ್ತ ಸಾಧನಗಳೆಂದು ಸಾಬೀತಾಗಬಹುದು. ಈ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಟಿಟಿಎಎ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಂಶಗಳ ಮೂಲ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯು ಇತರ ಕ್ಲಾಸ್ II ಮೊಬೈಲ್ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಸ್ವಲ್ಪ ಅಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಮಾರ್ಗದ ಮೂಲಕ ಬಂದಿತು. ಟಿಎನ್-368 ಜೀವಕೋಶದ ಸಾಲಿನಲ್ಲಿ ಈ ವೈರಸ್ಗಳ ಹರಡುವಿಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಬಾಕ್ಯುಲೋವೈರಸ್ಗಳ ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ಪ್ಲೇಕ್ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನದ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಉದ್ಭವಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಆನುವಂಶಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಆತಿಥೇಯ-ಪಡೆದ ಡಿಎನ್ಎಗಳ ಸಂಬಂಧಿತ ಒಳಸೇರಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದವು, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳಾಗಿ ಕಂಡುಬಂದವು. ಎಸಿಎಂಎನ್ಪಿವಿ ಮತ್ತು ಜಿಎಂಎಂಎನ್ಪಿವಿ ಎಂಬ ಬ್ಯಾಕ್ಯುಲೋವೈರಸ್ಗಳ ಕೆಲವು-ಪಾಲಿಹೆಡ್ರಾ (ಎಫ್ಪಿ) ಲೋಕಸ್ನೊಳಗೆ ಹಲವಾರು ವಿಭಿನ್ನ ಸಂಚಾರಿ ಆತಿಥೇಯ ಡಿಎನ್ಎ ಅಳವಡಿಕೆಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈಗ ಟಾಗಲಾಂಗ್ (ಹಿಂದೆ ಟಿಎಫ್ಪಿ3) ಮತ್ತು ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ (ಹಿಂದೆ ಐಎಫ್ಪಿ2) ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಲಾಗಿರುವ ಅಳವಡಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಈ ಅಳವಡಿಕೆಗಳು ಟಿಟಿಎಎ ಗುರಿ ತಾಣಗಳಿಗೆ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಆದ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ, ಅದು ವೈರಲ್ ಎಫ್ಪಿ-ಲೋಕಸ್ ಒಳಗೆ ಅಥವಾ ವೈರಲ್ ಜೀನೋಮ್ನ ಇತರ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸುತ್ತಿರಲಿ. ಈ ಎರಡೂ ಅಂಶಗಳು ಟಿಟಿಎಎ-ಗುರಿ ಸೈಟ್ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಳವಡಿಕೆ ಅಂಶಗಳ ಒಂದು ದೊಡ್ಡ ಕುಟುಂಬದ ಭಾಗವಾಗಿದ್ದು, ಇದರಲ್ಲಿ ಟಿ. ನಿ ವ್ಯುತ್ಪನ್ನವಾದ ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ ಮತ್ತು ಟಾಗಲಾಂಗ್ ಅಂಶಗಳು, ಸ್ಪೋಡೊಪ್ಟೆರಾ ಫ್ರುಗಿಪೆರ್ಡಾ ವ್ಯುತ್ಪನ್ನ ಅಂಶಗಳು IFP1.6 ಮತ್ತು ಕಾರ್ಸ್ಟೆನ್ಸ್ನ 290 ಬಿಪಿ ಅಳವಡಿಕೆ ಮತ್ತು ಆಟೋಗ್ರಾಫಾ ಕ್ಯಾಲಿಫೋರ್ನಿಕಾ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಪಾಲಿಹೆಡ್ರೋಸಿಸ್ ವೈರಸ್ನ ಇಕೋಆರ್ಐ-ಜೆ, ಎನ್ ಪ್ರದೇಶದೊಳಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ತರಹದ ಅಳವಡಿಕೆ, ಇದರ ಮೂಲವನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನಿಂದ ಪಡೆದ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಲೂಪರ್ ಎಂಬ ಪಳೆಯುಳಿಕೆ ಅಂಶದ 100 ರಿಂದ 500 ಪ್ರತಿಗಳು ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ, ಇದು ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ಗೆ ಅನುಕ್ರಮ ಹೋಲೋಲಜಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು 5 'CCY.GGG 3' ನಲ್ಲಿ ಕೊನೆಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ TTAA ಅಳವಡಿಕೆ ತಾಣಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಲೂಪರ್ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮವು ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಸರಾಸರಿ 77 ಪ್ರತಿಶತ ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಇದು ಕನಿಷ್ಠ 60 ದಶಲಕ್ಷ ವರ್ಷಗಳಷ್ಟು ಹಳೆಯದಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎರಡು ಇತರ ಟಿ. ಟಿ. ಎ. ಎ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪಳೆಯುಳಿಕೆ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ಅಂಶಗಳಿವೆ, ಎಂ. ಇ. ಆರ್. 75 ಮತ್ತು ಎಂ. ಇ. ಆರ್. 85 (ಪ್ರತಿ ಜೀನೋಮ್ಗೆ 2000 ಪ್ರತಿಗಳು ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ) ಇವು ಟಿ. ಟಿ. ಎ. ಎ ಅಳವಡಿಕೆ ತಾಣಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಟ್ಟುಕೊಂಡು 5 '<ಐ. ಡಿ. 1> 3' ನಲ್ಲಿ ಕೊನೆಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಪುರಾವೆಗಳು ಸಂಗ್ರಹವಾಗುತ್ತಿವೆ, ಇದು ಜೀವಿಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯಲ್ಲಿ ಟಿಟಿಎಎ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಚಾರಿ ಅಂಶಗಳ ಒಂದು ಸೂಪರ್ ಫಾಮಿಲಿಯು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ರಚನೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ತಲೆಕೆಳಗಾದ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳಿಂದ ಸುತ್ತುವರಿದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಪಿಬಿ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವೇರಿಯೇಬಲ್ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್, ವೇಗವರ್ಧಕ ಡಿಡಿಇ ಟ್ರೈಡ್ ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಲೋಕಲೈಸೇಶನ್ ಸಿಗ್ನಲ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ರದೇಶ. ಇದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ವ್ಯಾಪಕ ಶ್ರೇಣಿಯ ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಾಕುಪ್ರಾಣಿಗಳಾಗಿದ್ದು, ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೀಗಾಗಿ ಅದರ ಚಲನಶೀಲತೆಯನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರತಿಗಳು ಪಡೆಯುವ ಹೊಸ ಕಾರ್ಯಗಳು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಧನಾತ್ಮಕ ಅಥವಾ ಶುದ್ಧೀಕರಿಸುವ ಆಯ್ಕೆಯ ಚಿಹ್ನೆಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುವಷ್ಟು ಮಹತ್ವದ್ದಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಮಾನವರಲ್ಲಿ, ಈ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಹೀಗಿವೆಃ ಪಿಬಿಜಿಡಿ1, ಪಿಬಿಜಿಡಿ2 (ಮಾಮಲ್ಲಿಯನ್ ವಂಶಾವಳಿ), ಪಿಬಿಜಿಡಿ3, ಪಿಬಿಜಿಡಿ4 (ಪ್ರೈಮೇಟ್ಗಳು), ಪಿಬಿಜಿಡಿ5 (ಮಯೋಮೆರೋಝೋವಾ). ಚಟುವಟಿಕೆಯಲ್ಲಿ 20x ಹೆಚ್ಚಳದೊಂದಿಗೆ ಸಸ್ತನಿಗಳಿಗೆ (ಮೌಸ್) ಕೋಡಾನ್ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಉತ್ತಮಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಎಂಪಿಬಿ ಎಂಬ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಮತ್ತಷ್ಟು ರೂಪಾಂತರ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್ ಎಂಪಿಬಿಯ 10x ಚಟುವಟಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೈಪಿಬಿಯನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ. ಡಾಕ್ಸಿಕ್ಲಿನ್-ಇಂಡ್ಯೂಸಿಬಲ್ ಸಿಆರ್ಐಎಸ್ಪಿಆರ್ ಇಂಟರ್ಫರೆನ್ಸ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ನಂತಹ ದೊಡ್ಡ ಆನುವಂಶಿಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲು ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ನೊಟ್ರೆ ಡೇಮ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾನಿಲಯದ ಪ್ರಾಧ್ಯಾಪಕ ಡಾ. ಮಾಲ್ಕಮ್ ಫ್ರೇಸರ್ ಅವರು ಬಾಕುಲೋವೈರಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಅಳವಡಿಕೆ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಿದರು ಮತ್ತು ಮೂಲತಃ ಎಫ್. ಪಿ. ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಅಳವಡಿಕೆಗಾಗಿ ಐ. ಎಫ್. ಪಿ. ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಲಾಯಿತು. ನಂತರ ಈ ಹೆಸರನ್ನು ಎಫ್. ಪಿ. ಯಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಾಗಿ ಟಿ. ಎಫ್. ಪಿ. ಎಂದು ಬದಲಾಯಿಸಲಾಯಿತು. ಅಂತಿಮವಾಗಿ ಪ್ರೇಕ್ಷಕರ ಆಸಕ್ತಿಯನ್ನು ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಮತ್ತು ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ವಂಶವಾಹಿ ನಾಮಕರಣಕ್ಕೆ ಸ್ವಲ್ಪ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಲು ಪಿಗ್ಗಿಬ್ಯಾಕ್ ಎಂಬ ಹೆಸರನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಯಿತು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಸಂಚಾರಿ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳು