SEA Native Peptide Ligation
ಅಸುರಕ್ಷಿತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಭಾಗಗಳ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧನದಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಾಸಾಯನಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಜೀವಂತ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ಬಳಕೆಗೆ ಆಸಕ್ತಿದಾಯಕ ಪೂರಕ ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧನ ವಿಧಾನಗಳು ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ, ಇದು ಅಸುರಕ್ಷಿತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ವಿಭಾಗಗಳ ನಡುವೆ ಜಲೀಯ ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ಕೀಮೋಸೆಲೆಕ್ಟಿವ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಬಳಸುವ ತಂತ್ರವೆಂದರೆ ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬಂಧನ (ಎನ್. ಸಿ. ಎಲ್). ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪರ್ಯಾಯಗಳು ಹೊರಹೊಮ್ಮುತ್ತಿವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು ಎಸ್ಇಎ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧನವಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಇಎ ಗುಂಪು ಎನ್, ಎಸ್-ಆಸಿಲ್ ಶಿಫ್ಟ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಿಗೆ ಸೇರಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅದರ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕತೆಯು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ವಿಭಾಗದ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಕಾರ್ಬೊನಿಲ್ ಗುಂಪಿನ ಮೇಲೆ ಒಂದು ಎಸ್ಇಎ ಥಿಯೋಲ್ ಗುಂಪಿನ ಇಂಟ್ರಾಮೋಲಿಕ್ಯುಲರ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ಸೇರ್ಪಡೆಯಿಂದ ನಿರ್ದೇಶಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಇದು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯು ಸಾರಜನಕದಿಂದ ಗಂಧಕಕ್ಕೆ ಸ್ಥಳಾಂತರಗೊಳ್ಳಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಇಎ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧನದ ಒಟ್ಟಾರೆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಮೊದಲು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಥಿಯೋಸ್ಟರ್ನ ಇನ್ ಸಿಟು ರಚನೆಗೆ ಎನ್, ಎಸ್-ಅಸಿಲ್ ಶಿಫ್ಟ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ, ಥಿಯೋಲ್-ಥಿಯೋಸ್ಟರ್ ವಿನಿಮಯದ ನಂತರ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ರಚನೆಗೆ ಎಸ್, ಎನ್-ಅಸಿಲ್ ಶಿಫ್ಟ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಇಎ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ವಿವರಣೆಯು ಬಿಸ್ (2-ಸಲ್ಫಾನಿಲೆಥೈಲ್) ಅಮಿಡೋ (ಯೋಜನೆ 1) ನ ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತ ರೂಪವಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಇಎ ಬಂಧನವು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಬಿಸ್ (2-ಸಲ್ಫಾನಿಲೆಥೈಲ್) ಅಮಿಡೋ ಗುಂಪನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ನ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸಿಸ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ನೊಂದಿಗೆ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು ಬಹುಶಃ ಸ್ಕೀಮ್ 1 ರಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಕಾರ್ಬೊನಿಲ್ ಗುಂಪಿನ ಮೇಲೆ ಒಂದು ಎಸ್ಇಎ ಥಿಯೋಲ್ನ ಇಂಟ್ರಾಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ದಾಳಿಯಿಂದ ಪಡೆದ ಅಸ್ಥಿರ ಥಿಯೋಸ್ಟರ್ ಮಧ್ಯಂತರದ ರಚನೆಯ ಮೂಲಕ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ. ನಂತರ, ಥೈಯೊಎಸ್ಟರ್ ಥೈಯೋಲ್-ಥೈಯೊಎಸ್ಟರ್ ವಿನಿಮಯಗಳ ಸರಣಿಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಮರ್ಕ್ಯಾಪ್ಟೊಫೆನಿಲ್ ಅಸಿಟಿಕ್ ಆಸಿಡ್ (ಎಂ. ಪಿ. ಎ. ಎ) ನಂತಹ ಬಂಧನ ಮಿಶ್ರಣದಲ್ಲಿರುವ ಬಾಹ್ಯ ಥೈಯೋಲ್ಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಎರಡನೇ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ವಿಭಾಗದ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಥಿಯೋಲ್ ಗುಂಪಿನೊಂದಿಗೆ ವಿನಿಮಯವು ಅಸ್ಥಿರವಾದ ಥಿಯೋಸ್ಟರ್ ಮಧ್ಯಂತರಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬಂಧನಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ಇಂಟ್ರಾಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಎಸ್, ಎನ್-ಆಸಿಲ್ ಸ್ಥಳಾಂತರವನ್ನು ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಕ್ಕೆ ಮರುಹೊಂದಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಕಟಣೆ ಎಸ್ಇಎ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧನವನ್ನು ವಿವರಿಸುವ ಮೊದಲ ಪೀರ್ ಪರಿಶೀಲಿಸಿದ ಪ್ರಕಟಣೆಯನ್ನು ಮೆಲ್ನಿಕ್, ಒ. ಮತ್ತು ಇತರರು ಸಾವಯವ ಪತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟಿಸಿದರು. (ಒಲಿವಿಯರ್, ಎನ್.; ಧೀರ್, ಜೆ.; ಮಿಡಿಯಾ, ಆರ್.; ಬ್ಲಾನ್ಪೇನ್, ಎ.; ಮೆಲ್ನಿಕ್, ಓ., ಬಿಸ್ (2-ಸಲ್ಫಾನಿಲೆಥೈಲ್) ಅಮೈನೊ ಸ್ಥಳೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧನ. ಆರ್. ಜಿ. ಬಿಡಿ. 2010, 12, (22), 5238-41; ಪ್ರಕಟಣೆಯ ದಿನಾಂಕ (ವೆಬ್): ಅಕ್ಟೋಬರ್ 21,2010. ಕೆಲವು ವಾರಗಳ ನಂತರ, ಅದೇ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಲಿಯು, ಸಿ. ಎಫ್. (ಹೌ, ಡಬ್ಲ್ಯೂ.; ಜಾಂಗ್, ಎಕ್ಸ್.; ಲಿ, ಎಫ್.; ಲಿಯು, ಸಿ. ಎಫ್., ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಎನ್, ಎನ್-ಬಿಸ್ (2-ಮರ್ಕ್ಯಾಪ್ಟೋಥೈಲ್)-ಅಮೈಡ್ಗಳು ಸ್ಥಳೀಯ ರಾಸಾಯನಿಕ ಬಂಧನಕ್ಕಾಗಿ ಥಿಯೋಯೆಸ್ಟರ್ ಪ್ರಿಕರ್ಸರ್ಗಳಾಗಿ ಅದೇ ಜರ್ನಲ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಯಿತು. ಆರ್. ಜಿ. ಬಿಡಿ. 2011, 13, 386-389; ಪ್ರಕಟಣೆಯ ದಿನಾಂಕ (ವೆಬ್): ಡಿಸೆಂಬರ್ 22,2010). ಎಸ್ಇಎ ಆನ್/ಆಫ್ ಪರಿಕಲ್ಪನೆಯು ಎಸ್ಇಎ ಗುಂಪಿನ ರೆಡಾಕ್ಸ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಎಸ್. ಇ. ಎ. ಯ ಉತ್ಕರ್ಷಣವು ಎಸ್. ಇ. ಎ. ಆಫ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಆವರ್ತಕ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಎಸ್. ಇ. ಎ. ಆನ್ ನ ಸ್ವಯಂ-ಸಂರಕ್ಷಿತ ರೂಪವಾಗಿದೆ. ಸ್ಕೀಮ್ 2ರಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ ಕಡಿತ/ಆಕ್ಸಿಡೀಕರಣದ ಮೂಲಕ ಎಸ್ಇಎ ಆಫ್ ಮತ್ತು ಎಸ್ಇಎ ಆನ್ ಅನ್ನು ಸುಲಭವಾಗಿ ಪರಸ್ಪರ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು