Rubicon homology domain
ರುಬಿಕಾನ್ ಹೋಮೋಲಜಿ ಡೊಮೇನ್ (ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ) ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸುವ ಸುಮಾರು 250 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಆಟೋಫಾಗಿ ಮತ್ತು ಎಂಡೋಸೋಮಲ್ ಕಳ್ಳಸಾಗಣೆಯ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಹಲವಾರು ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳಿವೆ. ಎಲ್ಲಾ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಮಾನವ ರುಬಿಕಾನ್ ಮತ್ತು ಪಿಎಲ್ಇಕೆಹೆಚ್ಎಂ1 ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಕೊನೆಯ ಎಂಡೊಸೋಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಆಟೋಫಾಗೊಸೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಸಣ್ಣ ಜಿಟಿಪೇಸ್ ರ್ಯಾಬ್ 7 ನೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನವನ್ನು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು 16 ಸಂರಕ್ಷಿತ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಮತ್ತು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು ಅವು ಸತುವಿನ ಪರಮಾಣುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಕನಿಷ್ಠ 4 ಸತುವಿನ ಬೆರಳಿನ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ರುಬಿಕಾನ್ನ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಕಡೆಗೆ ಇರುವ ಅಮಿನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ರಬ್7ನೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವೆಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ರಚನೆ ರಬ್7 ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿರುವ ರುಬಿಕಾನ್ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ನ 3ಡಿ ಪರಮಾಣು ರಚನೆಯನ್ನು ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರದಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ನ ರಚನೆಯು "ಎಲ್" ಆಕಾರವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, "ಎಲ್" ನ ತಳವು ರಬ್ 7 ರ ಸ್ವಿಚ್ ಪ್ರದೇಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ರಚನೆಯು ಪ್ರಧಾನವಾಗಿ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕಲ್ ಆಗಿದ್ದು, ಸತು ಬೆರಳಿನ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳ ಸಮೀಪದಲ್ಲಿ ಸಣ್ಣ ಬೀಟಾ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಿವೆ. ರುಬಿಕಾನ್ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ರದೇಶವು ಎಫ್ವೈವಿಇ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಪಿಐ3ಪಿಯ ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್ ಎಫ್ವೈವಿಇ ಡೊಮೇನ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಮೂಲ ಅವಶೇಷಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿಲ್ಲ. ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಹಲವಾರು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳೆಂದರೆ (ಮಾನವರಲ್ಲಿ): ರುಬಿಕಾನ್, ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್-ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕುಟುಂಬದ ನಿರ್ಣಾಯಕ ಸದಸ್ಯ ಮತ್ತು ಆಟೋಫಾಗಿ ಪಿಎಲ್ಇಕೆಹೆಚ್ಎಂ1ನ ಋಣಾತ್ಮಕ ನಿಯಂತ್ರಕ, ಆಸ್ಟಿಯೊಪೆಟ್ರೋಸಿಸ್ ಪೇಸರ್ನಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್, ಆಟೋಫಾಗಿ ಡಿಇಎಫ್8ನ ಧನಾತ್ಮಕ ನಿಯಂತ್ರಕ, ಲೈಸೊಸೋಮ್ ಬಾಹ್ಯ ವಿತರಣೆಯ ನಿಯಂತ್ರಕ ಪಿಎಲ್ಇಕೆಹೆಚ್ಎಂ3, ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯು ವ್ಯತ್ಯಾಸದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದೆ.