Rubicon (protein)
ರುಬಿಕಾನ್ (ರನ್ ಡೊಮೇನ್ ಬೆಕ್ಲಿನ್-1-ಇಂಟರಾಕ್ಟಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಸಿಸ್ಟೀನ್-ಸಮೃದ್ಧ ಡೊಮೇನ್-ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್) ಮಾನವರಲ್ಲಿ RUBCN ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಅನಗತ್ಯ ಅಥವಾ ಹಾನಿಗೊಳಗಾದ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಘಟಕಗಳನ್ನು ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸುವ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾದ ಆಟೋಫಾಗಿಯ ಕೆಲವು ನಕಾರಾತ್ಮಕ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳಲ್ಲಿ ರುಬಿಕಾನ್ ಒಂದಾಗಿದೆ. ಸಣ್ಣ ಜಿಟಿಪೇಸ್ ರ್ಯಾಬ್7ನೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ರುಬಿಕಾನ್ ಅನ್ನು ಅದರ ಕಾರ್ಯಸ್ಥಳಗಳಿಗೆ ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3-ಸಿ2 (ಕ್ಲಾಸ್ III ಫಾಸ್ಫಾಟಿಡಿಲಿನೊಸಿಟಾಲ್ 3-ಕೈನೇಸ್ ಕಾಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ 2) ಅನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಆಟೋಫಾಗೊಸೋಮ್-ಲೈಸೊಸೋಮ್ ಸಮ್ಮಿಳನ ಹಂತವನ್ನು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ರುಬಿಕಾನ್ನ ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಸಮನ್ವಯವು ವಯಸ್ಸಾದ ಮತ್ತು ವಯಸ್ಸಾದ-ಸಂಬಂಧಿತ ಕಾಯಿಲೆಗಳ ಕಡಿತದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆಃ ರುಬಿಕಾನ್ನ ನಾಕ್ಔಟ್ ರೌಂಡ್ವರ್ಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಣ್ಣು ಹಣ್ಣಿನ ನೊಣಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಿತಾವಧಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಮೂತ್ರಪಿಂಡದ ಫೈಬ್ರೋಸಿಸ್ ಮತ್ತು α-ಸಿನ್ಯೂಕ್ಲಿನ್ ಶೇಖರಣೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಆಟೋಫಾಗಿಯ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಜೊತೆಗೆ, ಎಲ್ಸಿ3-ಸಂಬಂಧಿತ ಫಾಗೋಸೈಟೋಸಿಸ್ (ಎಲ್ಎಪಿ) ಮತ್ತು ಎಲ್ಸಿ3-ಸಂಬಂಧಿತ ಎಂಡೋಸೈಟೋಸಿಸ್ (ಲ್ಯಾಂಡೋ) ಗೆ ರುಬಿಕಾನ್ ಅಗತ್ಯವೆಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅನೇಕ ಕೆಳಮುಖ ನಿಯಂತ್ರಕ ಅಣುಗಳೊಂದಿಗೆ ನೇರ ಸಂವಹನದ ಮೂಲಕ ಸಹಜ ರೋಗನಿರೋಧಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ರುಬಿಕಾನ್ ಋಣಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ರುಬಿಕಾನ್ 972 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ರನ್ ಡೊಮೇನ್, ಮಧ್ಯಮ ಪ್ರದೇಶ (ಎಂಆರ್) ಮತ್ತು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ರುಬಿಕಾನ್ ಹೋಮೋಲಜಿ (ಆರ್ಎಚ್) ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ರುಬಿಕಾನ್ ಹೋಮೋಲಜಿ ಡೊಮೇನ್ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಕನಿಷ್ಠ 4 ಡೈವಾಲೆಂಟ್ ಝಿಂಕ್ ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಝಿಂಕ್ ಬೆರಳಿನ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ರುಬಿಕಾನ್ ಮತ್ತು ಜಿಟಿಪಿ-ಬದ್ಧ ರ್ಯಾಬ್ 7 ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ರಚನಾತ್ಮಕ ಆಧಾರವನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗಿದೆ (ಪಿಡಿಬಿ ಐಡಿಃ 6ಡಬ್ಲ್ಯೂಸಿಡಬ್ಲ್ಯೂ). ಕಾರ್ಯ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ರನ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಕಾರ್ಯವು ತಿಳಿದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಆಟೋಫಾಗಿ ನಿಗ್ರಹಕ್ಕೆ ಇದು ಅಗತ್ಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಮಧ್ಯದ ಪ್ರದೇಶವು ಪಿಐ3ಕೆ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ (ಪಿಐಕೆಬಿಡಿ) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3-ಸಿ2 ಅನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ರುಬಿಕಾನ್ ಹೋಮೋಲಜಿ ಡೊಮೇನ್ ರಬ್ 7 ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನವನ್ನು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪಿಎಲ್ಇಕೆಹೆಚ್ಎಂ 1 ಮತ್ತು ಪೇಸರ್ (ರುಬಿಸಿಎನ್ಎಲ್, ರುಬಿಕಾನ್ ತರಹದ ಆಟೋಫಾಗಿ ಎನ್ಹಾನ್ಸರ್ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ) ಸೇರಿದಂತೆ ಇತರ ಆರ್ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್-ಹೊಂದಿರುವ ಆಟೋಫಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಂದ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಆಟೋಫಾಗಿ-ಅವಲಂಬಿತ ರುಬಿಕಾನ್ ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3-ಸಿ2 ಜೊತೆಗಿನ ಸಂಬಂಧ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಬಂಧದ ಮೂಲಕ ಆಟೋಫಾಗಿಯನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ರುಬಿಕಾನ್ ನೇರವಾಗಿ ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3-ಸಿ2ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬೆಕ್ಲಿನ್-1 ಉಪಘಟಕದ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಮನ್ವಯದ ಮೂಲಕ ಪೊರೆಯೊಳಗೆ ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3-ಸಿ2ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ. ಈ ಚಟುವಟಿಕೆಯು ಆಟೋಫಾಗೊಸೋಮ್ ಮೆಂಬರೇನ್ನಲ್ಲಿ ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3-ನಿರ್ದೇಶಿತ ಫಾಸ್ಫಾಟಿಡಿಲಿನೊಸಿಟಾಲ್ 3-ಫಾಸ್ಫೇಟ್ (ಪಿಐ3ಪಿ) ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆಟೋಫಾಗೊಸೋಮ್-ಲೈಸೊಸೋಮ್ ಸಮ್ಮಿಳನವನ್ನು ನಿರ್ದೇಶಿಸುವ ಯಂತ್ರೋಪಕರಣಗಳನ್ನು ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳುವಲ್ಲಿ ವಿಫಲವಾಗುತ್ತದೆ. ಕೊನೆಯ ಎಂಡೊಸೋಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಕೊನೆಯ ಆಟೋಫಾಗೊಸೋಮ್ಗಳನ್ನು ಅಲಂಕರಿಸುವ ರ್ಯಾಬ್ 7 ನೊಂದಿಗೆ ನೇರ ಸಂವಹನದ ಮೂಲಕ ರುಬಿಕಾನ್ ತನ್ನ ಕಾರ್ಯಸ್ಥಳವನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿರಿಸಿಕೊಂಡಿದೆ. ಎಲ್ಸಿ3-ಸಂಬಂಧಿತ ಫಾಗೋಸೈಟೋಸಿಸ್ (ಎಲ್ಎಪಿ) ಮತ್ತು ಎಲ್ಸಿ3-ಸಂಬಂಧಿತ ಎಂಡೋಸೈಟೋಸಿಸ್ (ಲ್ಯಾಂಡೋ) ಗೆ ಆಟೋಫಾಗಿ-ಸ್ವತಂತ್ರ ರುಬಿಕಾನ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಫಾಗೋಸೋಮ್ಗಳಿಗೆ ಪಿಐ3ಕೆಸಿ3 ಸ್ಥಳೀಕರಣದಲ್ಲಿ ರುಬಿಕಾನ್ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಮೆಂಬರೇನ್ನಲ್ಲಿ ಪಿಐ3ಪಿ ಉತ್ಪಾದನೆ ಮತ್ತು ಎನ್ಒಎಕ್ಸ್2 ಸೇರಿದಂತೆ ಡೌನ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಎಫೆಕ್ಟರ್ಗಳ ನೇಮಕಾತಿಗೆ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. ರುಬಿಕಾನ್ ಸಹಜ ರೋಗನಿರೋಧಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ವೈರಲ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯನ್ನು ಉಲ್ಬಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ರುಬಿಕಾನ್ NF-κB ಎಸೆನ್ಷಿಯಲ್ ಮಾಡ್ಯುಲೇಟರ್ (NEMO), ಇಂಟರ್ಫೆರಾನ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಟರಿ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ 3 (IRF3) ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಸ್ಪೇಸ್ ರಿಕ್ರೂಟ್ಮೆಂಟ್ ಡೊಮೇನ್-ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ 9 (CARD9) ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನದ ಮೂಲಕ ಸೈಟೋಕಿನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ. ವಯಸ್ಸಾದ ಮತ್ತು ಕಾಯಿಲೆಗಳಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರ ವಯಸ್ಸಾದ-ಸಂಬಂಧಿತ ರೋಗಗಳು ಇಲಿಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ವಯಸ್ಸಿನೊಂದಿಗೆ ರುಬಿಕಾನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಟ್ಟಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತವೆ, ಇದು ರುಬಿಕಾನ್ ವಯಸ್ಸಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆಟೋಫಾಗಿಯ ಇಳಿಕೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕಡಿಮೆ ಆಟೋಫಾಗಿಯು ವಯಸ್ಸಾದ ಮತ್ತು ವಯಸ್ಸಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕಾಯಿಲೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವುದರಿಂದ, ರುಬಿಕಾನ್ನ ಸಮನ್ವಯವನ್ನು ಸಂಭಾವ್ಯ ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಗುರಿಯಾಗಿ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ, ರುಬಿಕಾನ್ ನಾಕ್ಔಟ್ ಮೆದುಳಿನಲ್ಲಿ α-ಸಿನ್ಯೂಕ್ಲಿನ್ ಶೇಖರಣೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮೂತ್ರಪಿಂಡದಲ್ಲಿನ ತೆರಪಿನ ಫೈಬ್ರೋಸಿಸ್ ಅನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ವಯಸ್ಸಾದ ರುಬಿಕಾನ್ ನಾಕ್ಔಟ್ ಆಟೋಫಾಗಿಯ ಸಮನ್ವಯದ ಮೂಲಕ ರೌಂಡ್ವರ್ಮ್ಗಳಲ್ಲಿ (ಸಿ. ಎಲಿಗನ್ಸ್) ಜೀವಿತಾವಧಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೆಣ್ಣು ಹಣ್ಣಿನ ನೊಣಗಳಲ್ಲಿ (ಡಿ. ಮೆಲಾನೋಗಾಸ್ಟರ್) ಜೀವಿತಾವಧಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಮದ್ಯಸಾರರಹಿತ ಕೊಬ್ಬಿನ ಪಿತ್ತಜನಕಾಂಗದ ಕಾಯಿಲೆ (ಎನ್. ಎ. ಎಫ್. ಎಲ್. ಡಿ.) ರುಬಿಕಾನ್ ಮಟ್ಟವು ಮದ್ಯಸಾರರಹಿತ ಕೊಬ್ಬಿನ ಪಿತ್ತಜನಕಾಂಗದ ಕಾಯಿಲೆಯ (ಎನ್. ಎ. ಎಫ್. ಎಲ್. ಡಿ.) ಇಲಿ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ. ಹೆಪಟೋಸೈಟ್ಗಳಲ್ಲಿನ ರುಬಿಕಾನ್ನ ನಾಕ್ಔಟ್ ಯಕೃತ್ತಿನ ಸ್ಟೀಟೋಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಆಟೋಫಾಗಿಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ರುಬಿಕಾನ್ ಎನ್ಎಎಫ್ಎಲ್ಡಿ ರೋಗಕಾರಕಕ್ಕೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಚಯಾಪಚಯ ರೋಗ ಅಡಿಪೋಸ್ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿನ ರುಬಿಕಾನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ವಯಸ್ಸು-ಅವಲಂಬಿತ ಕುಸಿತವು ಅತಿಯಾದ ಆಟೋಫಾಗಿಕ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯಿಂದಾಗಿ ಚಯಾಪಚಯ ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಗಳನ್ನು ಉಲ್ಬಣಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಸಾಲಿಹ್ ಅಟಾಕ್ಸಿಯಾ (ಎಸ್ಸಿಎಆರ್15) ರುಬಿಕಾನ್ನೊಳಗಿನ ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯ ರೂಪಾಂತರವು ಸಾಲಿಹ್ ಅಟಾಕ್ಸಿಯಾಕ್ಕೆ (ಒಎಂಐಎಂ ಐಡಿಃ 615705) ಕಾರಣವಾಗಿದೆ. ಸಾಲಿಹ್ ಅಟಾಕ್ಸಿಯಾ (ಸ್ಪಿನೋಸೆರೆಬೆಲ್ಲಾರ್ ಅಟಾಕ್ಸಿಯಾ, ಆಟೋಸೋಮಲ್ ರಿಸೆಸಿವ್ 15 ಅಥವಾ ಎಸ್ಸಿಎಆರ್15 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ) ಎಂಬುದು ಸ್ಪಿನೋಸೆರೆಬೆಲ್ಲಾರ್ ಅಟಾಕ್ಸಿಯಾದ ಒಂದು ರೂಪವಾಗಿದೆ, ಇದು ಕೈಗಳು, ನಡಿಗೆ, ಮಾತು ಮತ್ತು ಕಣ್ಣಿನ ಚಲನೆಯ ಸಮನ್ವಯದ ಪ್ರಗತಿಶೀಲ ನಷ್ಟದಿಂದ ನಿರೂಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಅಲನೈನ್ 875 ರಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುವ ರುಬಿಕಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ನಲ್ಲಿ ಫ್ರೇಮ್ಶಿಫ್ಟ್ ರೂಪಾಂತರ ಮತ್ತು ತಪ್ಪಾದ ತೆರೆದ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು (c.2624delC p.Ala875ValfsX146) ಹೊಂದಿರುವ ಮಕ್ಕಳಲ್ಲಿ ಈ ರೋಗವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಉಂಟಾಗುವ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸುವಿಕೆಯು ರಾಬ್ 7 ಮತ್ತು ಕೊನೆಯ ಎಂಡೊಸೋಮ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ರುಬಿಕಾನ್ ಉಪಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳೀಕರಣವನ್ನು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಪಿಎಲ್ಇಕೆಹೆಚ್ಎಂ1 ರುಬಿಸಿಎನ್ಎಲ್ (ರುಬಿಕಾನ್ ತರಹದ) ಆರ್ಎಬಿ7ಎ ಬೆಕ್ಲಿನ್-1 ಉಲ್ಲೇಖಗಳನ್ನೂ ನೋಡಿ.